研究动态
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Protein & Cell
2023 Jul 25
NasimRahmani-Kukia,M...
ERMP1 Facilitates The Malignant Characteristics of Colorectal Cancer Cells through Modulating PI3K/AKT/β-Catenin Pathway and Localization of GRP78.
Protein & Cell
内质网金属肽酶1(ERMP1)参与细胞对氧化应激的反应。然而,它在癌细胞增殖和进展中的功能角色尚不清楚。本研究的重点是探讨ERMP1在正常和环境应激条件下调节结直肠癌(CRC)细胞增殖和进展的分子机制。在这个实验研究中,使用逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)评估了CRC细胞中ERMP1的表达。使用对HCT116细胞进行植入ERMP1特异性shRNA的慢病毒载体编码,降低了ERMP1的表达。使用通过脂质体转染方法将ERMP1过表达质粒转染入SW48细胞来上调ERMP1。为了评估ERMP1在细胞和环境应激条件下的作用,将降低ERMP1表达的细胞暴露于饥饿、无血清培养基以及红氧化剂或化疗药物处理72小时的应激条件中。通过Western blotting评估AKT、p-AKT、磷酸化哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(p-mTOR)、β-连环蛋白、p-β-连环蛋白、E-钙粘蛋白和葡萄糖调节蛋白78(GRP78)的表达。通过RT-qPCR评估ERMP1、CYCLIN D和c-MYC的表达。通过流式细胞术确定GRP78的细胞表面定位、细胞周期分布和凋亡。ERMP1的敲减减少了细胞增殖,使PI3K/AKT途径失活,促使G1阻滞,并减弱了自由β-连环蛋白和CYCLIN D的表达。ERMP1过表达细胞则得到相反的结果。ERMP1的敲减也减少了GRP78在细胞表面的定位。不同的环境应激条件对ERMP1下调的细胞产生不同的影响。ERMP1在CRC细胞中作为一个致癌基因通过促进恶性特性发挥作用。磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/AKT/β-连环蛋白途径和GRP78的定位与ERMP1的效应密切相关。因此,ERMP1可能被视为与CRC相关的治疗策略中的一个有前景的靶点。
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Aug 06
YutaSakurai,Shintaro...
Development of a prediction model for target positioning by using diaphragm waveforms extracted from CBCT projection images.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
为了使用从CBCT投影图像中提取出的膈波形开发目标定位的预测模型(PM),采用了19例肺癌患者进行了70秒的正交旋转kV X射线成像。将放置在其腹部表面上的IR标记和位于肿瘤最近位置的植入金标记分别视为外部替代物和目标。首先60秒内使用替代运动和目标位置训练了四种不同类型的基于回归的PM,如下:情景A:基于临床情况,使用从投影图像中提取的3D目标位置(PMCL)。情景B:通过对情景A中的目标位置进行平均,获得了展现八个目标位置的短弧4D-CBCT波形。该波形通过适应外部替代物的呼吸相在60秒内重复(W4D-CBCT)。W4D-CBCT被用作目标位置(PM4D-CBCT)。情景C:从正交投影图中提取了描绘膈运动的阿姆斯特丹披风(AS)信号,该信号在上下方向上。根据AS信号对W4D-CBCT的振幅和相位进行了校正。经过AS校正的W4D-CBCT被用作目标位置(PMAS-4D-CBCT)。情景D:从单个投影图中提取了AS信号。其它过程与情景C相同。计算剩余10秒内的预测误差。对于PM4D-CBCT,3D预测误差在3mm内为77.3%,比PMCL降低了12.8%。使用膈波形,误差在3mm内的百分比在情景C和D中分别提高了约7%,达到84.0%-85.3%的PMAS-4D-CBCT。预测误差的统计学上具有显著差异,PM4D-CBCT和PMAS-4D-CBCT之间。PMAS-4D-CBCT优于PM4D-CBCT,证明了基于AS信号的校正的有效性。PMAS-4D-CBCT可以在没有金标记的4D-CBCT图像中预测目标位置。© 2023 The Authors. Journal of Applied Clinical Medical Physics published by Wiley Periodicals, LLC on behalf of The American Association of Physicists in Medicine.
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Aug 06
IvanSKlyuzhin,Guilla...
PSMA-Hornet: Fully-automated, multi-target segmentation of healthy organs in PSMA PET/CT images.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
前列腺特异性膜抗原(PSMA)PET成像是反映疾病阶段、治疗反应率和治疗优化选择的宝贵信息来源,尤其在PSMA放射配体治疗中。从PSMA图像中量化放射药物在健康器官中的摄取量可以通过向放射剂量递送引导个体化治疗来减少毒性。然而,器官的分割和摄取量的定量化需要繁琐的器官划定工作,在临床中通常不可行,也无法适用于大规模临床试验。在这项工作中,我们开发和测试了PSMA健康器官分割网络(PSMA-Hornet),这是一个完全自动化的深度神经网络,可以同时分割代表正常[18 F]DCFPyL PET/CT图像的14个健康器官。我们还提出了修改后的U-net架构,一种用于PET/CT图像的自监督预训练方法,多目标Dice损失和多目标批次平衡,以有效地训练PSMA-Hornet和类似的网络。该研究使用了手动分割的100个受试者的[18 F]DCFPyL PET/CT图像,以及526个没有分割的类似图像。未分割的图像用于自监督模型的预训练。对于受监督训练,采用蒙特卡罗交叉验证评估网络性能,每次试验保留85个受试者用于模型训练,5个用于验证,10个用于测试。图像分割和定量评估指标是根据核医学医师手动划分的分割结果在测试折中进行评估,并与观察者间一致性进行比较。模型的分割性能还在一组具有高肿瘤负荷的19个图像上进行了评估。在我们的最佳模型中,测试集中亚舌下腺的最低平均Dice系数为0.826,肝脏的最高为0.964。舌下腺示踪物摄取量的最大平均误差为13.9%。自监督预训练改善了训练收敛性、训练-测试泛化性和分割质量。此外,我们发现多目标网络与单器官网络相比,产生了显著更高的分割准确性。所开发的网络可以用于自动获取PSMA图像分析任务中的高质量器官分割结果。它可以用于可重复提取成像数据,并有望应用于临床实践,如个性化放射治疗剂量计算和改进的放射配体治疗。© 2023年美国医学物理学家协会。
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Gastric Cancer
2023 Aug 06
JianchaoWang,Zhentia...
Collagen-related gene expression level predicts the prognosis and immune therapy response.
Gastric Cancer
由于缺乏生物标志物以指导治疗选择,胃癌患者对相同的治疗策略作出不同反应,并且存在各种预后。我们对一组包含103名患者的胃癌局部RNA数据进行了处理并用于探究潜在的治疗指导因素。我们采用非负矩阵分解进行了聚类分析。使用单一样本基因集富集分析(ssGSEA)评估了与胶原相关基因的表达水平,被称为胶原评分(CS)。利用来自TCGA、ACRG和免疫疗法队列的数据探究预后和疗效。通过利用诊断符图(nomogram)评估了CS的预后预测能力。 在我们的研究中,我们对局部RNA数据进行了聚类分析,并发现聚类2中的肿瘤浸润状态更差。GSEA结果显示,在两个聚类中胶原相关通路的激活水平有所差异。在TCGA和ACRG队列中,CS可以作为独立的预后因素(TCGA OS:p = 0.018,HR = 3.5; ACRG OS:p = 0.014,HR = 4.88)。一个免疫疗法队列显示,CS较高的患者具有显著较差的ORR(p = 0.0025)。高CS组中存在多个细胞死亡通路的下调,并且包含更差的肿瘤微环境。诊断符图展示了胶原评分的生存预测能力。 CS被验证为独立的预后因素,并且可能反映了免疫疗法的治疗效果。CS可以提供一种评估临床预后和响应信息的新方法,并有助于开发以胶原为靶点的治疗方法。 ©2023。本文作者独占许可给国际胃癌协会和日本胃癌协会。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Aug 06
KataAngyal,AnnaMandu...
[The most common gastrointestinal alterations in patients with post-COVID syndrome].
DIABETES & METABOLISM
COVID后综合征可能会影响胃肠道,然而,COVID后综合征的风险因素仍然未知。本研究旨在确定与COVID后综合征相关的最常见的胃肠道症状、异常实验室检测结果和风险因素。在这项回顾性研究中,我们纳入了2020年10月至2022年9月间在Semmelweis大学外科、移植和胃肠病学科就诊的79名患者。我们调查了临床数据和实验室检测结果,并确定了主要的风险因素。大部分患者为女性(46/79),平均年龄为47.6岁,患者超重(BMI:26.3 kg/m2)。最常见的合并症包括心血管疾病(21/79)、高血压(20/79)、糖尿病(11/79)和恶性肿瘤(9/79)。胃镜的典型适应证包括消化不良(16/79)和上腹痛(10/79)。结肠镜的最常见适应证是腹泻(29/79)和体重减轻(28/79)。在异常的实验室检测结果中,COVID后患者的肝酶水平(GOT:83.5 U/L,GPT:85 U/L,GGT:70 U/L)和铁蛋白(351.5 ng/mL)较高。通过胃镜、结肠镜和腹部超声检查诊断出的典型疾病包括胃食管反流病(11/26)、肠易激综合征(2/19)和弥漫性肝损害等。未接种COVID-19疫苗的患者数量较接种者更高(58% vs. 29%)。接种疫苗的患者中,有12名患者接种了mRNA疫苗(10名辉瑞-联合利华,2名摩德纳)和6名患者接种了病毒载体疫苗(2名阿斯利康,4名俄罗斯斯普京克V)。我们确定女性性别、肥胖、心血管疾病、癌症、高血压和糖尿病是COVID后综合征的主要风险因素。接种疫苗的状态可能可以预防COVID后胃肠道症状。《医学周报》. 2023; 164(31): 1206-1212.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2022 Dec 01
AlirezaHabibi,NesaBa...
Iron Oxide Nanoparticles Conjugated to Thiosemicarbazone Reduce the Survival of Cancer Cells by Increasing the Gene Expression of MicroRNA let-7c in Lung Cancer A549 Cells.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
癌细胞对铁的需求较高,以促进生长和增殖。合成了一种新的铁纳米颗粒和硫脲半胱氨酸酮复合物。确认测试包括紫外可见光谱、扫描电子显微镜(SEM)、能量散射X射线分析(EDX)、傅里叶变换红外光谱(FTIR)、X射线衍射(XRD)和电泳电势测定。MTT测定、流式细胞术和实时定量PCR(qRT-PCR)用于研究抗增殖效应、凋亡数量以及Fe3O4 @Glu/BTSC对microRNA let-7c(let-7c)基因表达的影响。Fe3O4 @Glu/BTSC的规格在5纳米处得到确认。对A549细胞而言,Fe3O4 @Glu/BTSC比BTSC和Fe3O4更有效(IC50=166.77 µg/mL),但其对正常细胞的影响较小(CC50=189.15 µg/mL)。药物选择性指数(SI)计算为1.13。Fe3O4 @Glu/BTSC的初始凋亡率为46.33%,BTSC为28.27%,Fe3O4为26.02%。BTSC和Fe3O4抑制了细胞周期在亚G1和S期的进展。与对照组相比,处理细胞中let-7c表达量增加了6.9倍。与对照组相比,BTSC的表达率为2.2倍,Fe3O4为1.6倍。Fe3O4 @Glu/BTSC通过增加let-7c的表达并抑制细胞周期的凋亡激活途径,对肺癌细胞具有适当的抗增殖效应。©2022作者(们)。本文为开放获取文章,根据创作共用署名4.0许可证(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)进行使用、传播和再现,只要原始作品得到适当的引用。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2022 Dec 01
ZahraFiroozi,ElhamMo...
Altered Expression of hsa_circ_0001445 and hsa_circ_0020397 in Breast Cancer Representing Associations with BMI and Reproductive Factors.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
环形RNA(circRNAs)是非编码RNA(ncRNAs)的最近子类之一,在基因表达调控中发挥关键功能,并在恶性肿瘤中包括乳腺癌(BC)中具有重要作用。本研究旨在评估hsa_circ_0001445和hsa_circ_0020397在BC中的表达和作用,以及在这些环境中环RNA/miRNA/mRNA的潜在相互作用。使用定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)对50例乳腺肿瘤和50例肿瘤旁正常组织中的hsa_circ_0001445和hsa_circ_0020397的表达进行了调查。最后,利用生物信息学分析揭示了hsa_circ_0001445、hsa_circ_0020397-miRNA-mRNA潜在的调控网络。与其正常对照组相比,恶性组织中hsa_circ_0001445的表达显著下调(P=0.020),而hsa_circ_0020397呈上调模式(P<0.001)。此外,观察到hsa_circ_0001445的高表达与避免染发(P=0.034)和正常体重指数(BMI)(P=0.016)有显著相关性,而hsa_circ_0020397的过度表达与缺乏维生素D摄入(P=0.039)有重要关联。另一方面,hsa_circ_0001445的低表达与月经初潮年龄˂14岁显著相关(P=0.027)。我们的研究还揭示了这两个环RNA在竞争性内源RNA(ceRNA)网络中具有调控关键mRNA和miRNA的潜力能力。研究表明,hsa_circ_0001445和hsa_circ_0020397在BC发展中可能通过吸附某些调控ceRNA网络的miRNAs发挥了两个相反的作用。然而,它们的分子相互作用需要通过进一步的功能研究进行验证。© 2022作者。本文为开放获取文章,根据创作共用协议(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0)在任何媒介中允许无限制使用、分发和复制,前提是原始作品被正确引用。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Aug 02
Tian-TianZhao,Hao-Ji...
Exploring the mechanism of the PTP1B inhibitors by molecular dynamics and experimental study.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B)已被证明是治疗癌症、糖尿病和其他疾病的一个有吸引力的靶点。尽管已经开发了许多具有不同框架的PTP1B抑制剂,但仍然缺乏具有高特异性和可接受的药理特性的PTP1B抑制剂。因此,迫切需要开发更多的方法来研究PTP1B的复杂作用机制和设计理想的PTP1B调节剂的配体。在这项工作中,我们开发了一种潜在的分子动力学(MD)分析模式,从不同的角度分析了化合物6a和6e对PTP1B的作用机制,包括配体和蛋白质的稳定能力、相互作用和结合位点、结合能、残基之间的相对运动以及蛋白质内部相互作用的变化。模拟结果表明,由于其较小的分子体积(326 Å3)、匹配的电负性和增强了残基的正相关运动,化合物6a与PTP1B的活性口袋结合更为稳定,尤其是WPD环和P环。最后,通过酶动力学测定验证了化合物6a作为PTP1B的竞争性抑制剂。这项工作成功地从多个方面研究了化合物6a对PTP1B的作用机制,丰富了PTP1B与抑制剂之间相互作用模式的分析。总之,我们希望这项工作能为未来设计和开发更多的新型理想PTP1B抑制剂提供更多理论信息。版权所有 © 2023 Elsevier Inc. 发布。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug
NilanjanaChatterjee,...
Prevalence of novel gamma HPV types 223 and 225 in oral cavity and skin of Indian normal and neoplastic participants.
Epigenetics & Chromatin
尽管传统上被归类为皮肤病毒,对γ-乳头状瘤病毒(γ-HPV)的实际组织瘤型尚未大量研究。本研究旨在评估两种新型HPV 223和225在226名男性和女性受试者口腔黏膜和角化上皮的组织特异性患病率,这些受试者患有或不患有口腔或子宫颈的肿瘤/ 不典型增生病变。通过聚合酶链反应(PCR)使用针对特定型别的HPV引物检测γ-HPV 223和225 DNA的存在,并通过Sanger测序进行确认。使用绝对实时定量方法确定了HPV 223和HPV 225阳性样本中的病毒载量。为了确定共感染状态,还在口腔黏膜中检测了α-HPV DNA的患病率。新型HPV 223在受试人群的4.4%(10/226)口腔黏膜样本中存在;有趣的是,所有这些样本都是女性,相应的皮肤拭子样本中没有发现患病率。然而,HPV 225的患病率在28.2%(N = 37/131)女性和17.9%(N = 17/95)男性参与者的皮肤和口腔黏膜中发现。此外,发现HPV 223在疾病参与者的口腔黏膜中的病毒载量明显较高(p = 0.02 < 0.05),而HPV 225的病毒载量在正常参与者的口腔黏膜中较高。我们的结果表明,γ-HPV 223仅在口腔黏膜上皮中有患病率,而HPV 225在黏膜和角化皮肤上皮中均有患病率,表明它具有双组织瘤型性质。© 2023 Wiley Periodicals LLC.
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Journal of the International Society of Sports Nutrition
2023 Dec
CairongWu,JieDeng,Ch...
Effects of pre-sleep protein supplementation on plasma markers of muscle damage and inflammatory cytokines resulting from sprint interval training in trained swimmers.
Journal of the International Society of Sports Nutrition
表明,在夜间睡前的补充蛋白质已被证明能够增强运动引起的肌肉损伤的夜间恢复效果。至于这种方法是否对间歇训练(SIT)的恢复产生影响尚未明确。本研究调查了每晚睡前补充蛋白质对创造酸激酶(CK)和炎症细胞因子(包括白细胞介素-6和-10(IL-6和IL-10)以及肿瘤坏死因子α(TNFα))的早期(SIT后45分钟)和晚期(SIT后24和48小时)反应的影响。二十名受训游泳者进行了为期两周的游泳SIT(每组12次全力游泳,每次间隔1:1恢复和组间休息3分钟),并随机分为两个干预组,每晚睡前分别摄入0.5克/千克/天的蛋白饮料(PRO组)或相同量的碳水化合物(CHO组)。初次和最后一次训练会话中,CK和细胞因子的反应在不同的时间点进行了分析,包括休息、完成后立即、SIT后45分钟以及SIT后24和48小时。CK浓度在PRO组和CHO组均从休息点升高到SIT后24和48小时(p<0.05)。在两个训练组中,IL-6和IL-10的峰值观察到在两个场合的SIT后45分钟。TNFα水平在休息期间显著升高,然后在两组和两个场合恢复到基线值(p<0.001)。在两个组中,游泳SIT还将细胞因子反应在运动48小时后转变为抗炎状态,通过降低最后一次训练会话中IL-6与IL-10的比值(p<0.04)。补睡前的蛋白质摄入未能改善血液肌肉损伤指标。两周游泳SIT后,不论是补充蛋白质还是碳水化合物摄入,细胞因子的晚期抗炎状况和运动引起的肌肉损伤得到了改善。
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