肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

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肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

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子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

Stem Cell Research & Therapy

YoungwooJeon,Tong-Yo...

Efficacy of ex vivo purging with CD34+ selection to maximize the effects of autologous stem cell transplantation in peripheral T-cell lymphoma patients.

Stem Cell Research & Therapy

外周T细胞淋巴瘤（PTCLs）是罕见且侵袭性的肿瘤，其最佳治疗方法尚不确定。本研究调查了CD34+选择性清除后，高剂量化疗（HDT）联合自体干细胞移植（ASCT）的临床疗效，纳入67例达到缓解状态并接受HDT/ASCT的PTCL患者进行回顾性分析。选择性清除CD34+细胞使用CliniMACS®进行（德国Bergisch Gladbach市Miltenyi Biotec公司）。评估了生存情况、移植、淋巴细胞亚群和病毒感染情况。与未清除的自体移植相比，选择性清除CD34+的自体移植显著提高了总生存率（满5年，73.3%对37.8%）和无病生存率（满5年，73.8%对33.4%）。清除组的复发累积发生率也较低（31.5%对73.3%）。亚组分析显示接受清除自体移植的高风险组获得了显著的生存益处。淋巴细胞亚群分析显示，在ASCT后，清除组的NK细胞计数增加。较高的ASCT后淋巴细胞与单核细胞比值（LMR）与改善的总生存率和无病生存率相关。CD34+选择性清除在接受HDT/ASCT的PTCL患者中改善了生存疗效，减少了复发风险。该程序增加了NK细胞计数和ASCT后的LMR。CD34+选择性清除可能减少自体移植肿瘤细胞污染，并增强T细胞淋巴瘤的疗效。版权信息：©2023国际细胞与基因治疗学会。Elsevier Inc.出版，保留所有权利。

Stem Cell Research & Therapy

FaezehDavoodiAsl,Sey...

Promising effects of exosomes from menstrual blood-derived mesenchymal stem cells on endometriosis.

Stem Cell Research & Therapy

子宫内膜异位症作为一种非恶性妇科疾病，会导致细胞凋亡、血管生成、迁移、增殖和炎症等多种细胞功能的紊乱。越来越多的证据揭示了月经血中内膜干细胞在反行方式下参与了内膜异位症病变的形成和进展的重要性。根据间充质干细胞通过旁分泌功能提供的治疗益处，我们使用月经血源干细胞（MenSCs）释放的外泌体来治疗内膜异位干细胞，以抑制病变的形成倾向。收集了健康和内膜异位症患者的月经血样本。通过浓度梯度离心法分离出MenSCs，并进行了流式细胞术鉴定。从健康的MenSCs（NE-MenSCs）中分离出的外泌体用于治疗内膜异位细胞（E-MenSCs）。治疗后的72小时，通过实时聚合酶链反应、酶联免疫吸附实验、免疫细胞化学、Annexin V/PI和划痕实验分析了包括炎症、增殖、凋亡、迁移和血管生成在内的不同机制和通路。外泌体治疗显著降低了在内膜异位症中异常表达的与炎症、增殖、迁移和血管生成相关的标志物的表达水平。此外，治疗后诱导了内膜异位细胞的凋亡，这在基因和蛋白水平上进行了评估。在本研究中，我们为MenSCs-Exo在改善内膜异位症中的潜力提供了初步证据。根据我们的结果，我们建议在相关临床试验之后，MenSCs来源的外泌体可以被认为是与常规治疗相比，改善内膜异位症的更好治疗选择，并展示其在内膜异位症修复中的潜力作为无细胞产品。©2023生殖生物学协会和波兰科学院奥尔什丁动物繁殖与食品研究所。Elsevier B.V.保留所有权利。

Stem Cell Research & Therapy

JiajunYap,JiminYuan,...

BRAF(V600E) mutation together with loss of Trp53 or pTEN drives the origination of hairy cell leukemia from B-lymphocytes.

Stem Cell Research & Therapy

毛发细胞白血病（HCL）是由BRAF（V600E）突变诱导的B淋巴瘤。然而，将BRAF（V600E）引入B淋巴细胞中未能诱导血液系统恶性肿瘤，这表明BRAF（V600E）需要同时发生其他突变才能推动HCL的发生。为了解决这个问题，我们对人类HCL基因组测序数据进行了调查。结合之前的报告，我们推测肿瘤抑制因子TP53，P27或PTEN限制了BRAF（V600E）在B淋巴细胞中的致癌能力，因此它们的失活有利于BRAF（V600E）驱动的HCL发生。通过使用基因改造的小鼠模型，我们证明了BRAF(V600E)KI和Trp53KO或pTENKO在B淋巴细胞中共同诱导慢性淋巴瘤，并具有类似于人类HCL的病理特征。为了进一步了解HCL发生必需的细胞程序，我们对来自BRAF(V600E)KI和Trp53KO或pTENKO小鼠的白血病细胞的基因表达进行了分析，发现它们具有类似但不同的基因表达特征，类似于M2或M1巨噬细胞。此外，我们还检查了这些白血病细胞中对生发中心反应和记忆B细胞与浆细胞分化所需的转录因子/调控因子的表达特征，发现大多数对这些程序至关重要的转录因子/调控因子被严重抑制，说明为什么毛发细胞停留在活化B细胞和记忆B细胞之间的过渡阶段。总的来说，我们的研究揭示了HCL发生所需的同时发生的突变，揭示了毛发细胞的B细胞起源，研究了该疾病独特病理特征的分子基础，对HCL研究和治疗具有重要意义。 © 2023. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.

CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY

ChiaraLambona,Clemen...

Histone deacetylase 10: A polyamine deacetylase from the crystal structure to the first inhibitors.

CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY

多胺脱乙酰酶活性在40多年前被发现，但是负责这一活性的组蛋白脱乙酰酶10（HDAC10）直到最近才被描述。HDAC10是一个IIb类HDAC，与其最近的亲缘物质α-乙酰化α-小管蛋白酶HDAC6一样。过去两年间，HDAC10因其在疾病特别是癌症中的作用而受到关注。本文综述了化学和结构生物学方法在研究HDAC10方面的应用。我们将阐明近年来对HDAC10复杂结构生物学的理解取得的最新进展，以及第一批高选择性HDAC10抑制剂的发现。版权所有© 2023 作者。由Elsevier Ltd.出版。保留所有权利。

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

ZhenLiu,YongjinLuo,L...

Identification of immunogenic cell death-related subtypes used for predicting survival and immunotherapy of endometrial carcinoma through a bioinformatics analysis.

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

免疫原性细胞死亡（ICD）是一种独特的现象，可以通过损伤相关分子模式触发全面的适应性免疫反应，为肿瘤免疫治疗提供了有前景的途径。然而，与子宫内膜癌（EC）这种最常见的妇科恶性肿瘤相关的ICD相关基因的作用仍不清楚。本研究检查了从癌症基因组图谱数据库获得的EC的遗传、转录和临床数据。利用无监督聚类分析根据ICD相关基因的表达识别出不同的ICD聚类。关于不同的聚类，进行了生存分析，免疫微环境评估，免疫细胞浸润，免疫检查点分析和肿瘤突变负荷分析。此外，使用单变量Cox回归和最小绝对收缩和选择算子分析建立了ICD风险签名。采用卡方检验研究了ICD得分与临床特征之间的关系。使用多种计算分析工具评估了不同ICD得分组的免疫注释，体细胞突变，肿瘤突变负荷以及对免疫治疗和化疗药物的反应。鉴定了两个ICD聚类，表明ICD高聚类与良好预后，丰富的免疫细胞浸润以及与免疫激活相关的通路富集有关。此外，ICD风险签名在EC的免疫微环境，免疫治疗反应，化疗敏感性和预后方面具有预测价值。我们的发现为EC患者个体化治疗策略提供了新的见解。版权所有 © 2023作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 发布。

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

JianjunZou,ShidongCh...

Telomere maintenance genes-derived prognosis signature characterizes immune landscape and predicts prognosis of head and neck squamous cell carcinoma.

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

已经确定了端粒酶功能失调作为多种癌症，包括头颈部鳞状细胞癌 (HNSCC) 进展的生物标志物。本研究旨在确定 HNSCC 的端粒酶维护基因 (TMG) 相关的预后和治疗反应特征。HNSCC 的转录组和临床数据分别来自癌症基因组图谱 (TCGA) 和 Gene Expression Omnibus 数据库。使用非负矩阵分解 (NMF) 来鉴定基于 TMG 的分子亚型，利用基因集富集分析 (GSEA) 来分析亚型之间的差异表达途径，并建立了一个基于 TMG 的风险评分模型。采用 Kaplan-Meier 生存分析评估亚组间预后特征，并评估 TMG 相关的分子亚型和风险评分模型与免疫浸润、免疫治疗和化疗敏感性之间的相关性。基于 59 个与 TMG 相关的基因，确定了两种 HNSCC 亚型，在预后、免疫细胞浸润和治疗反应方面存在显著的异质性。此外，还开发了一个由 9 个基因组成的 TMG 相关风险签名，用于评估 HNSCC 患者的预后。该签名对 HNSCC 预后具有显著的预测能力，与免疫细胞浸润和免疫治疗反应显著相关。构建了一个集成风险签名、N 分期和放疗的图谱来预测 HNSCC 患者的 1、3、5 年总生存期 (OS)，其性能优于其他预后模型，并包括基于 TMG 的风险评分、放疗和 N 分期。本研究确定了 HNSCC 中的 TMG 相关分子亚型，并开发了一种新的预后评分模型，突显了 TMG 在 HNSCC 预后和免疫治疗中的潜在价值。版权所有 © 2023 作者。 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版。

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

QunZheng,ShuaiShi,Ni...

A novel cuproptosis-related genes model in breast cancer prognosis.

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

乳腺癌（BRCA）是一种高度异质性的恶性肿瘤，迫切需要建立一个合适的模型来预测其预后。铜死亡是一种最近发现的细胞死亡方式，介导蛋白脂酰化并且与线粒体代谢密切相关。铜死亡相关基因（CRGs）在乳腺癌中的作用尚待探索。我们旨在通过对公共数据库中获取的信使RNA剖析和临床数据进行生物信息学分析，研究CRGs在不同临床情境中（包括化疗和免疫疗法）在乳腺癌预后中的应用。通过一致性聚类分析对CRGs进行了分子亚型划分。确定了不同CRG簇之间的差异表达基因。然后，利用最小二乘收缩选择算子回归使用差异表达基因构建了风险评估模型，以预测乳腺癌患者的生存。随后，使用来自乳腺癌分子分类国际联合会、GSE96058和GSE20685的数据对模型进行了验证。通过比较高风险组和低风险组，分析了体细胞突变、拷贝数变异、标志性通路、药物反应以及免疫疗法和化疗的预后差异。高风险评分的患者显示出更差的总体生存率。结果表明，两组间存在免疫相关生物学途径和不同的免疫状态。它还暗示了两组对化疗的敏感性差异。CRGs模型显示了预测乳腺癌患者预后的前景，并为其治疗提供了线索。版权所有 © 2023 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 发布。

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

JiyuMeng,XuelianRuan...

High expression of ENPP2 is an independent predictor of poor prognosis in liver cancer.

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

核酸酶（ENPP2）已被确定为肺癌和前列腺癌的潜在生物标志物，然而其在肝细胞癌（HCC）中的表达和临床相关性尚不完全了解。本研究使用生物信息学方法全面评估了ENPP2在多种癌症中的表达。我们使用TCGA数据库的数据，分析了ENPP2 mRNA在原发性肝癌及其相邻组织中的表达。使用Cox回归和Kaplan-Meier方法鉴定与生存相关的临床病理因素，并使用受试者工作特征曲线分析评估ENPP2表达的诊断价值。我们还通过对临床肝癌样本进行实时PCR验证了我们的发现。此外，我们还使用癌症基因组图谱数据集进行基因集富集分析，以了解ENPP2在HCC中的生物学意义。HCC患者ENPP2高表达与性别和临床分期有关，并且是预后较差的重要预后指标。ENPP2表达是两个队列中无进展生存和疾病特异性生存的独立危险因素，表明其作为HCC生物标志物的潜力。受试者工作特征曲线下的面积为0.806验证了ENPP2在HCC患者中的诊断价值。实时PCR分析验证了临床肝癌组织中ENPP2表达的增加。基因集富集分析确定了在ENPP2高表达的HCC患者中富集的通路，包括与细胞周期、MTOR和T细胞受体信号传导以及磷脂酰肌醇信号传导系统相关的通路。我们证明了ENPP2在HCC中高表达，并且是HCC诊断和预后的潜在独立分子标记物。版权所有 © 2023 作者。Wolters Kluwer Health, Inc.出版。

Epigenetics & Chromatin

AkshayPramodWare,Kap...

Integrated multiomics analysis of chromosome 19 miRNA cluster in bladder cancer.

Epigenetics & Chromatin

拥有46个微小RNA（miRNA）串联嵌入的长度约为100 kb，19号染色体微小RNA簇（C19MC）是人类基因组中最大的miRNA簇。C19MC从一个长链非编码基因组区域转录，并通常同时高水平表达。因此，我们进行了综合多组学数据分析，以研究C19MC的调控、表达模式及其对膀胱癌（BCa）的影响。我们发现，C19MC的43个成员在BCa中高度表达。然而，它与经常复发的拷贝数变异（CNV）增益的共定位在统计上不显著，无法证明其上调。有报道称，C19MC的表达受到一个位于转录起始位点的17.6 kb上游的已建立的CpG岛的调控，但我们发现该岛上的CpG探针为低甲基化，在BCa队列中没有统计学上的显著性。此外，C19MC的启动子区域受到七种转录因子（NR2F6、SREBF1、TBP、GATA3、GABPB1、ETV4和ZNF444）和五种染色质修饰因子（SMC3、KDMA1、EZH2、RAD21和CHD7）的强调控。有趣的是，我们发现这12个基因在BCa患者中过表达。此外，C19MC与42个TSG（tumor suppressor gene，抑癌基因）靶点对应且被下调，其中15个与患者生存显著相关。我们的发现表明，启动子区域的转录因子和染色质修饰因子可能调控C19MC的过表达。过表达的C19MC成员、转录调控因子和TSG基因可进一步作为潜在的诊断和预后指标，以及BCa的治疗管理策略。©2023年。作者。

Epigenetics & Chromatin

MikaHosokawa,SekaiTe...

3-deazaneplanocin A, a histone methyltransferase inhibitor, improved the chemoresistance induced under hypoxia in melanoma cells.

Epigenetics & Chromatin

实体肿瘤的一项普遍特征是低氧水平，即所谓的缺氧，它在化学耐药中扮演着关键角色。表观遗传机制，如DNA甲基化和组蛋白修饰，参与了癌症的发展和进展。有大量证据表明，表观遗传药物在正常氧气水平下（即常氧）可以逆转癌细胞获得的耐药性。然而，尚不清楚表观遗传药物是否可以改善缺氧条件下获得的耐药性。本研究旨在探讨表观遗传药物是否可以改善缺氧条件下癌细胞的耐药性。我们在小鼠黑色素瘤B16-BL6（B16）细胞中发现，在缺氧条件下（1％O2），低氧诱导因子1α（HIF-1α）及其靶基因的表达增加。在B16细胞中，缺氧条件下对7-乙基-10-羟基紫杉醇替诺酮盐（SN-38，即伊立替康的活性代谢产物）的耐药性也得到了获得。此外，作为表观遗传机制，增强子酶同源物2（EZH2）的蛋白表达和其靶基因组蛋白H3赖氨酸27位点的三甲基化（H3K27Me3）水平在缺氧条件下增加。H3K27Me3的诱导在缺氧条件下被EZH2小RNA和3-deazaneplanocin A（DZNep，EZH2抑制剂）所抑制。此外，EZH2小RNA和DZNep在SN-38处理后显著降低了细胞存活率，并在缺氧条件下改善了对SN-38的耐药性。这些结果表明，缺氧条件下对SN-38的耐药性可能源于表观遗传机制，即由于EZH2的诱导而导致H3K27Me3的升高。总之，组蛋白甲基转移酶EZH2抑制剂DZNep能够通过抑制在缺氧肿瘤微环境中引起的组蛋白甲基化来解决获得性耐药性问题。版权所有 © 2023 Elsevier Inc.。保留所有权利。