LSD1是一个重要的染色质调节因子，通过去甲基化H3K4me1/2而发挥致癌基因的功能。LSD1的稳定性由一个复杂且精细的过程控制，其中涉及泛素化和去泛素化。几种去泛素酶保持LSD1蛋白的水平。然而，LSD1降解的精确机制尚不清楚，这可能减轻其致癌功能。为了更好地理解LSD1的降解，我们进行了一项针对所有人类SCF家族E3连接酶的无偏siRNA筛选。我们的筛选发现FBXO24是一个真正的E3连接酶，可以泛素化和降解LSD1。结果表明，FBXO24抑制了LSD1诱导的肿瘤发生，并在乳腺癌细胞中作为肿瘤抑制基因发挥作用。此外，FBXO24与LSD1呈相反的相关性，并与乳腺癌患者样本的良好预后相关。综上所述，我们的研究揭示了FBXO24在通过降解LSD1阻碍乳腺肿瘤进展中的重要作用。意义：我们的研究全面描述了FBXO24在通过降解LSD1阻碍乳腺肿瘤进展中的重要作用。

有机锡(IV)配合物在癌症治疗中的药理活性被广泛认可，但它们的广泛应用受到其水溶性差的限制。因此，碳点，特别是氮掺杂石墨烯量子点(NGQDs)，可能是有效传递有机锡(IV)化合物的有前景的替代品，因为它们具有可观的水溶解度、良好的化学稳定性和非毒性，以及明亮的光致发光性能，使它们成为抗癌治疗领域的理想选择。基于两个有机锡类细胞毒化合物和对苯二甲酸醛缩合物(FBA)，构建了两种不同的多功能纳米体系，并对其进行了全面的表征。随后，对实现的多功能体系的治疗潜力和疗效诊断进行了体外确定。结果表明，NGQDs-FBA-Sn材料对乳腺癌细胞系(MDA-MB-231)具有较高的细胞毒性，对非癌细胞系(肾细胞，HEK293T)的影响较小。此外，由于它们的光学特性，这些碳点能够在细胞质区域进行荧光分子成像，表明其成功被癌细胞摄取，并释放金属药物(NGQDs-FBA-Sn)。© 2023 Wiley-VCH GmbH.

前哨淋巴结（SLN）活检在乳腺癌腋窝分期中发挥着关键作用。然而，传统的SLN映射不能准确识别转移性疾病的存在或缺失。对SLN转移的检测在很大程度上依赖于SLN活检后冰冻切片或石蜡包埋组织的检查。为了改善SLN转移的检测，我们开发了一种第二近红外（NIR-II）体内荧光成像系统，将基于钇的稀土金属纳米颗粒（ErNPs）与1556 nm的明亮下转换荧光配对。为了可视化携带乳腺癌的SLN，我们将ErNPs通过balixafortide（ErNPs@POL6326）进行修饰，这是一个化学因子受体CXCR4的肽拮抗剂。当通过皮下途径输送时，ErNPs@POL6326探针能够很容易地引流到SLNs，并通过CXCR4介导的内吞作用特异性地进入转移性乳腺肿瘤细胞。与肿瘤阴性SLN相比，近红外荧光信号在肿瘤阳性SLN中显著增加，能够准确判断SLN乳腺癌转移。在一个同种移植小鼠乳腺肿瘤模型和一个人类乳腺癌异种移植模型中，SLN转移的检测灵敏度分别为92.86%和93.33%，特异度分别为96.15%和96.08%。值得注意的是，这些探针可以准确检测到SLN的巨转移和微转移。总体而言，这些结果突出了ErNPs@POL6326用于SLNs实时可视化和体内SLN转移筛查的潜力。

在应用TP53作为肺腺癌（LUAD）中PD-(L)1单药治疗的预测生物标志物时，应考虑TP53突变的异质性。然而，是否应考虑TP53变体等位基因频率（VAF）仍然未知。将发表的研究和本地队列中的LUAD患者纳入其中，以发现和验证TP53 VAF与PD-(L)1抑制剂疗效之间的关系。癌症基因组图谱（TCGA）LUAD数据包含了基因组学、转录组学和肿瘤微环境分析。在发现队列的159名患者中，低TP53 VAF患者（VAF ≤ 25%）的无进展生存期（PFS）明显长于高TP53 VAF（5.4 vs. 3.3 月；p = .021）和TP53野生型患者（5.4 vs. 2.5 月；p = .011）。多变量Cox回归分析表明低TP53 VAF是较好疗效的独立生物标志物。在合并验证队列的50名患者中，低TP53 VAF患者的中位PFS也显著长于高TP53 VAF患者（12.0 vs. 2.1 月；p = .037）。通过对469个TCGA LUAD样本进行分析，发现低TP53 VAF与显著更高的PD-L1表达、与T细胞激活、T细胞介导的免疫以及干扰素-γ信号通路相关的基因集富集，与高TP53 VAF和TP53野生型相比，与更多肿瘤浸润的CD8+ T细胞相关。当使用TP53作为预测生物标志物时，还应考虑TP53 VAF。只有低TP53 VAF与抗PD-(L)1单药疗法的较好疗效独立相关，这可能是由于更高的PD-L1表达和更多肿瘤浸润的CD8+ T细胞。© 2023 American Cancer Society.

癌症的异质性为癌症治疗的精确治疗策略提出了巨大的挑战。癌症亚型的识别旨在检测具有不同分子特征的患者，并为有效的临床治疗提供新的线索。虽然已经进行了大量的努力，但是开发能够高效整合多组学数据集的强大计算方法仍然具有挑战性。在本文中，我们提出了一种名为Deep Multi-view Contrastive Learning（DMCL）的新型自监督学习模型用于癌症亚型识别。具体而言，通过将重建损失、对比损失和聚类损失结合到一个统一框架中，我们的模型将样本的判别信息编码到提取的特征表示中，并在嵌入空间中有效地保持样本的聚类结构。此外，DMCL是一个端到端的框架，癌症亚型可以直接从模型输出中获得。我们将DMCL与八种替代方法进行比较，涵盖了经典癌症亚型识别方法到最新发展的最先进系统，使用了10个广泛使用的癌症多组学数据集以及一个综合数据集进行实验，实验结果验证了我们方法优越的性能。我们进一步对肝癌进行了案例研究，分析结果表明不同的亚型对所选择的化疗药物可能有不同的反应。© 作者 2023。牛津大学出版社保留所有权利。请发送电子邮件至：journals.permissions@oup.com以获取权限。

双联测序技术已广泛应用于循环肿瘤脱氧核糖核酸（DNA）中低频突变的检测，但如何确定测序深度和其他实验参数以确保低频突变的稳定检测仍然是一个迫切需要解决的问题。双联测序的突变检测规则不仅限制了突变模板的数量，还限制了每个正向链和反向链的突变模板对应的突变支持读数的数量。为了解决这个问题，我们提出了一种用于稳定检测双联测序中低频突变的深度估计模型（DELFMUT），它利用零截尾负二项分布模拟了模板和读数之间的恒等对应关系和数量关系，而不考虑由碱基组成的序列。DELFMUT的结果通过实际双联测序数据进行了验证。在已知突变频率和突变检测规则的情况下，DELFMUT可以推荐DNA输入和测序深度的组合，以保证突变的稳定检测，它在指导双联测序技术的实验参数设置方面具有很大的应用价值。© 2023作者。牛津大学出版社版权所有。如需获取权限，请发送电子邮件至：journals.permissions@oup.com。

由于多种致命疾病，数百万人失去生命。癌症是其中一种最致命的疾病，可能与肥胖、酒精摄入、感染、紫外线辐射、吸烟和不健康的生活方式有关。癌症是机体内异常和不受控制的组织生长，可能会扩散到非原发部位的其他人体部位。因此，在早期诊断癌症以提供正确和及时的治疗非常重要。此外，手动诊断和诊断错误可能导致许多患者死亡，因此正在对癌症早期自动和准确检测进行大量研究。 本文我们对使用传统机器学习（ML）和深度学习（DL）模型进行各种癌症类型的诊断和最新进展进行了比较分析。在这项研究中，我们包括了四种癌症类型，即脑、肺、皮肤和乳腺，并使用ML和DL技术进行了它们的检测。在广泛的文献回顾中，我们包括了共130篇文献，其中56篇基于ML，74篇基于DL的癌症检测技术。仅打算分析近五年（2018年至2023年）发表的经过同行评议的研究论文，根据参数、出版年份、所使用的特征、最佳模型、数据集/图像使用情况以及最佳准确性进行分析。我们分别评估了基于ML和DL的癌症检测技术，并将准确性作为性能评估指标，以维持分类器效率的同质性。 在所有回顾的文献中，DL技术的准确性最高，达到了100%，而ML技术的准确性为99.89%。DL和ML方法的最低准确性分别为70%和75.48%。在皮肤癌检测中，最高和最低性能模型之间的准确性差异约为28.8%。此外，还提出了使用ML和DL技术进行每种癌症检测的关键发现和挑战。为了未来的研究目的，提供了最佳性能模型和最差性能模型之间的比较分析，同时呈现了总体关键发现和挑战。尽管该分析基于准确性作为性能指标和各种参数，但结果显示在分类效率方面有很大的改进空间。 本文得出结论，ML和DL技术在各种癌症类型的早期检测方面具有前景。然而，该研究确定了需要解决的具体挑战，以便在临床环境中广泛应用这些技术。所呈现的结果为癌症检测的未来研究提供了有价值的指导，强调了在ML和DL技术应用方面持续进步的必要性，以提高诊断准确性并最终拯救更多生命。 © 2023年该作者/作者在Springer Nature下的独家许可下，授权给Springer-Verlag GmbH Germany部分所有。

高级别胶质瘤（HGG）是最常见的原发性脑恶性肿瘤，占所有恶性原发性脑肿瘤的一半以上。2021年新版世界卫生组织分类将成人HGG分为四个亚型：3级寡突胶质瘤（1p/19位点共删失、IDH基因突变型）；3级IDH基因突变型星形细胞瘤；4级IDH基因突变型星形细胞瘤；以及4级IDH野生型脑胶质母细胞瘤（GB）。放疗（RT）和化疗（CTX）是新发HGG患者的当前标准治疗。最近已经发现了几种在诊断和预后中有临床相关性的分子标记。复发高级别胶质瘤的治疗尚未明确，决策通常基于先前的策略以及一些临床和影像学因素。对于GB的预后是可怕的（5年生存率为5-10%），而其他高级别胶质瘤的预后通常较好，取决于肿瘤的分子特征。神经功能缺陷和癫痫的存在会显著影响生活质量。©2023年。作者。

70kDa的主要应激诱导（应激）蛋白70（Hsp70）在高度侵袭性肿瘤细胞中经常过度表达，因此可能作为侵略性疾病和/或治疗耐药性的肿瘤特异性生物标志物。我们先前证明，与正常细胞相反，肿瘤细胞在其细胞膜上表现出Hsp70。为了阐明细胞内、与细胞膜结合以及细胞外Hsp70作为癌症潜在肿瘤标志物的作用，本文描述了用免疫组织化学染色法对脑胶质母细胞瘤患者的肿瘤福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）切片中的细胞质Hsp70进行染色的协议，用多参数流式细胞术（cmHsp70.1单克隆抗体）检测由多种癌细胞衍生的细胞膜结合Hsp70的表达，并使用独特的酶联免疫吸附测定（ELISA）在癌症患者循环中测量自由和囊泡相关的Hsp70。© 2023. 作者，在Springer Science+Business Media, LLC的独家许可下，属于Springer Nature的一部分。

人类的健康状况受到基因（G）和环境（E）的共同决定。这一点在同一环境因素下暴露的个体群体中表现出不同反应的情况下得到了清晰的证明。对于基因-环境相互作用（GxE）的量化测量尚未开发出来，在某些情况下，甚至都没有对该概念达成明确共识；例如，癌症主要是由“厄运”还是“不良生活方式”所致仍存在争议。在本文中，我们提供了一系列GxE相互作用作为病因的例证。我们强调表观遗传调控可以作为分子基础的一个共同联系方面。我们的论点聚焦于GxE记录在细胞表观基因组中，这可能是解析这些多维纠缠的调控层的关键。开发一种解读这一表观遗传信息的关键将为疾病风险提供量化测量。类似于用于估计生物年龄的表观时钟，我们大胆地提出了一个理论概念，即“表观评分器”，用于估计疾病风险。© 2023 The Authors. Published under the terms of the CC BY 4.0 license.