非角质化鼻咽癌（NK-NPC）与艾普斯坦-巴尔病毒（EBV）感染有很强的关联。 NK细胞在NK-NPC中的作用以及肿瘤细胞进化轨迹仍不清楚。本研究旨在通过单细胞转录组分析，蛋白质组学和免疫组织化学研究NK细胞的功能和NK-NPC中肿瘤细胞的进化轨迹。NK-NPC（n = 3）和正常鼻咽黏膜病例（n = 3）进行了蛋白质组分析。从Gene Expression Omnibus（GSE162025和GSE150825）中获得了NK-NPC（n = 10）和鼻咽淋巴增生症（NLH，n = 3）的单细胞转录组数据。质量控制，降维和聚类基于Seurat软件（v4.0.2）过程进行，并通过harmony（v0.1.1）软件消除了批处理效应。使用copykat软件（v1.0.8）识别鼻咽黏膜正常细胞和NK-NPC肿瘤细胞。使用CellChat软件（v1.4.0）探索了细胞间相互作用。使用SCORPIUS软件（v1.0.8）执行了肿瘤细胞进化轨迹分析。使用clusterProfiler软件（v4.2.2）执行蛋白质和基因功能富集分析。蛋白质组学（log2折叠变化> 0.5且P值<0.05）在NK-NPC（n = 3）和正常鼻咽黏膜（n = 3）之间获得了161种差异表达的蛋白质。大多数与自然杀伤细胞介导的细胞毒性通路相关的蛋白质在NK-NPC组中下调。在单细胞转录组学中，我们鉴定出三种NK细胞亚群（NK1-3），其中在NK3亚群中鉴定出NK细胞疲劳，具有高ZNF683表达（组织驻留性NK细胞的标志）的NK-NPC。我们证明了在NK-NPC中存在这种ZNF683 + NK细胞亚群但在NLH中不存在。我们还进行了TIGIT和LAG3的免疫组织化学实验，以确认NK细胞疲劳在NK-NPC中的存在。此外，轨迹分析揭示了NK-NPC肿瘤细胞的进化轨迹与EBV感染状态（活跃或潜伏）相关。细胞间相互作用分析揭示了NK-NPC中复杂的细胞间相互作用网络。本研究揭示了NK细胞的疲劳可能由于NK-NPC中NK细胞表面上抑制性受体的上调而诱导。逆转NK细胞疲劳的治疗可能是治疗NK-NPC的有前途的策略。与此同时，我们首次确定了NK-NPC中EBV感染状态活跃的肿瘤细胞的独特进化轨迹。我们的研究可能为NK-NPC中新的免疫治疗靶点和涉及肿瘤发生、发展和转移的新视线提供了。 © 2023年作者。

嗜酸性实质囊性肾细胞癌（ESC-RCC）是一种被低估的新型散发性肾肿瘤，被列为2022 WHO肾肿瘤分类中一种罕见的肾细胞癌。由于其特征不够清楚，易被误诊。我们报告了一例ESC-RCC的病例，患者是一名53岁的女性，临床检查发现右肾有一肿块，但无不适症状。我们泌尿科进行计算机断层扫描，显示右肾周围有一圆形软组织密度阴影。显微镜检查显示，肿瘤显示出嗜酸性细胞的实质囊性组成，具有独特的免疫组化标记（CK20阳性/CK7阴性）和TSC2基因的无意义突变。在肾肿瘤切除术后的十个月中，患者身体状况良好，没有复发或转移。我们在这里描述的ESC-RCC的明显形态、免疫表型和分子特征，基于我们的病例和相关文献，突出了这种新型肾肿瘤的病理学和鉴别诊断的关键点。因此，我们的研究将加深我们对这种新型肾肿瘤的理解，并有助于减少误诊。© 2023. 作者。

当前使用的除草剂的毒理学尚未得到充分探讨。一种被广泛使用但少有研究的除草剂是苯磺隆。在这里，我们从美国国家毒理学计划（NTP）挖掘高通量数据，以确定苯磺隆是否具有对人类细胞的雌激素能力。我们还评估了苯磺隆及其参考商业制剂Stomp Aqua对三种人类乳腺上皮细胞系（癌性MCF-7和非癌性MCF-10 A和MCF-12 A）的转录组谱的影响，以了解该化合物是否具有内分泌干扰作用，以及商业制剂中的共同配方成分是否会增强其毒性。从美国NTP数据库中挖掘的数据表明，苯磺隆在浓度约为10μM时可激活雌激素受体。将MCF-7、MCF-10A和MCF-12A细胞暴露于10μM的苯磺隆和Stomp Aqua的等效浓度。转录组分析显示基因表达模式的改变，暗示苯磺隆影响泛素介导的蛋白质降解和剪接体的功能。配制的苯磺隆制剂Stomp Aqua产生了可比较的效果，表明苯磺隆是观察到的转录组变化的原因。考虑到有关该农药的暴露缺乏信息，我们的研究促使需要进行生物监测研究，特别是在职业使用情况下，以了解低水平暴露于苯磺隆的人群是否可能对该化合物产生内分泌干扰作用。需要更深入地了解这种内分泌干扰性农药的暴露和作用机制。© 2023年作者。

乳房植入物相关淋巴瘤（BIA）是一种罕见的癌症，发生在纹理乳房植入物周围的液体和纤维包膜中。最近，2022年世界卫生组织第五版血液肿瘤分类（WHO HAEM5）和2022年成熟淋巴细胞肿瘤国际共识分类（22ICC）均承认乳房植入物相关的异型大细胞淋巴瘤（BIA-ALCL）为一个确定的实体，定义为成熟的CD30阳性T细胞淋巴瘤，在乳房植入物设置中受纤维囊膜限制。目前文献中只报道了几种B细胞淋巴瘤与乳房植入物相关。在这里我们报告了两例与乳房植入物有关的EB病毒阳性弥漫性大B细胞淋巴瘤（EBV + DLBCL），二者均表达CD30和EBV潜伏性类型3。两个病灶均被认为是与慢性炎症相关的DLBCL（CI-DLBCL），但一个呈现为7厘米实性肿块，而另一个呈现为一名HIV患者的纤维素相关的DLBCL（FA-DLBCL）。临床上，在胶囊切除和移植物摘除6个月或更长时间后，两者均完全缓解，无需额外化疗。这种以大型CD30阳性细胞为特征的病例在细胞起源未进一步确定的情况下很容易误诊为BIA-ALCL。因此，诊断面板包括特异性B和T细胞标记物以及EBER原位杂交必不可少，以认识到这种罕见实体、理解淋巴瘤的发生机制、预测预后和定义临床治疗方法。©2023年作者。

患者间的差异以及健康干细胞和白血病干细胞（LSC）的相似性妨碍了急性髓细胞白血病（AML）中LSC的表征和其分化景观的研究。在这里，我们介绍了一种新型方法CloneTracer，它可以将克隆分辨率添加到单细胞RNA-seq数据集中。将其应用于19名AML患者的样本中，CloneTracer揭示了白血病分化的路线。尽管残留的健康和早期白血病细胞主导了休眠干细胞区域，但活性LSC类似于其健康对应物，并保留了红细胞的能力。相比之下，下游髓系祖细胞构成了高度异常的、定义疾病的区域：它们的基因表达和分化状态影响了化疗反应以及白血病到正常转录组单核细胞分化的能力。最后，我们证明了CloneTracer识别特定于白血病细胞的表面标志物的潜力。综上所述，CloneTracer揭示了一种与其健康对应部分相似的分化景观，并可能决定AML的生物学和治疗反应。版权所有©2023 Elsevier Inc.

移植后环磷酰胺（PTCy）是靠抑制供体来源的异反应性T细胞在同种异基因造血干细胞移植（HSCT）中预防移植物抗宿主病（GVHD）的有效预防方法。移植物抗白血病效应（GVL）是由供体来源的异反应性T细胞诱导的抗白血病效应，类似于GVHD，然而，没有研究证明PTCy后供体来源的异反应性T细胞动态与HSCT后GVL效应受损之间的关联。我们在小鼠HSCT模型中评估了带有功能标记的细胞死亡程序-1（PD-1）的供体来源T细胞的动态。我们显示PTCy与造血干细胞移植模型中的白血病细胞的发展和生存概率下降相关，而在没有白血病细胞的造血干细胞移植模型中，PTCy可以改善GVHD并提高生存概率。我们揭示了供体来源CD8+/CD4+异反应性T细胞中表达PD-1功能标记的细胞的百分比在接受者脾脏中被PTCy抑制，CD44+记忆T细胞除外，并且在PTCy后早期供体T细胞嵌合水平降低。我们的结果表明，PTCy通过抑制HSCT后表达PD-1的供体来源CD8+/CD4+异反应性T细胞来影响GVL效应和改善GVHD。版权所有©2023 Elsevier Inc.

结直肠脑转移瘤(CBMs)罕见且预后不良。对于多发或不可切除的CBM仍然没有标准的全身治疗方法。我们的研究旨在探讨抗VEGF疗法对CBM患者的总生存期、脑特异性疾病控制和神经症状负担的影响。共有65名接受治疗的CBM患者被回顾性地纳入研究，并分为抗VEGF基础全身治疗组和非抗VEGF基础治疗组。共有25名接受至少3个疗程的抗VEGF药物治疗的患者和40名未接受抗VEGF治疗的患者被分别分析了总生存期(OS)、无进展生存期(PFS)、颅内无进展生存期(iPFS)和无神经原性事件的生存期(nEFS)等终点指标。利用NCBI的数据分析了原发性转移性结肠癌(mCRC)、肝、肺和脑转移的基因表达，并使用顶级基因本体论(GO)和cBioPortal进行了分析。接受抗VEGF治疗的患者在总生存期(19.5 vs. 5.5个月，P=0.009)、iPFS(14.6 vs. 4.1个月，P<0.001)和nEFS(17.6 vs. 4.4个月，P<0.001)方面表现出明显更长的时间。在任何疾病进展之后接受抗VEGF治疗的患者的总生存期更好(19.7 vs. 9.4个月，P=0.039)。顶级GO和cBioPortal分析显示了颅内转移瘤中更强的血管生成的分子功能。抗VEGF基础全身治疗表现出有利的疗效，这反映在CBM患者的更长总生存期、iPFS和nEFS上。版权所有©2023作者。Elsevier Inc.保留所有权利。

小细胞肺癌（SCLC）是一种高度致命的恶性肿瘤，约占新诊断肺癌的15％。长链非编码RNA（lncRNA）可以通过与微小RNA（miRNA）的相互作用调节基因表达并促进肿瘤发生。然而，在SCLC中，有关lncRNA，miRNA和mRNA表达谱的研究还很有限。此外，与SCLC中的竞争性内源RNA（ceRNA）网络相关的差异表达的lncRNA，miRNA和mRNA的作用仍不清楚。在本研究中，我们首先对来自SCLC患者的六对SCLC肿瘤和相邻非癌组织进行了下一代测序（NGS）。总体上，在SCLC样本中发现29个lncRNA，48个miRNA和510个mRNA差异表达（|log2 [倍数变化] |> 1; P <0.05）。进行了生物信息学分析，预测并构建了lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络，其中包括9个lncRNA，11个miRNA和392个mRNA。选择了ceRNA调节途径中的四个上调lncRNA和相关mRNA，并进行了定量PCR验证。此外，我们还研究了最上调lncRNA TCONS_00020615在SCLC细胞中的作用。我们发现，TCONS_00020615可能通过TCONS_00020615-hsa-miR-26b-5p-TPD52通路调节SCLC肿瘤发生。我们的研究对SCLC肿瘤和相邻非癌组织的lncRNA，miRNA和mRNA表达谱进行了全面分析。我们构建了ceRNA网络，这可能为SCLC的潜在调节机制提供新的证据。我们还发现，lncRNA TCONS_00020615可能调节SCLC的癌变发生。©2023年。作者（们）。

癌症是人类面临的致命疾病，然而，癌症基因经常被报道为处于正向选择下，这表明一个进化遗传学的悖论存在于癌症进化与人类选择之间。然而，对癌症驱动基因进化的系统研究较为薄弱。本研究通过比较基因组分析、群体遗传学分析和计算分子进化分析，评估了66种癌症类型的568个癌症驱动基因在两个层面上的进化：人类早期进化的选择（长期的人类谱系选择，即数百万年），以及现代人类群体中的近期选择（~100,000年）。结果显示，涵盖11种癌症类型的8个癌症基因在人类谱系（长期选择）中处于正向选择下，涵盖47种癌症类型的35个癌症基因在现代人类群体中（近期选择）处于正向选择下，尤其是在东亚和欧洲人群中，3个甲状腺癌驱动基因（CUX1，HERC2和RGPD3）所关联的SNP处于正向选择下，与这些人群中甲状腺癌的高发病率相一致。这些发现表明，在人类的适应性变化中，癌症可以被进化出来。不同种群的同一位点可能受到不同的选择压力，因此应在精准医学中予以考虑，尤其是针对特定人群的靶向医疗。© 2023年，作者。

临床显著性门脉高压（CSPH）已被确认为在接受根治性治疗的肝细胞癌（HCC）患者中的重要预后因素。本研究旨在评估PH估计作为免疫治疗下HCC患者的预后因素。包括在2016年至2021年期间在我们的三级医疗中心接受第一或后续行治疗的HCC患者（n = 50）。使用成熟的非侵入性PH评估预处理CT数据的PH得分进行CSPH诊断（截止值≥4）。在单变量和多变量分析中评估PH对总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）的影响。根据PH评分，有26名患者（52.0％）被认为患有CSPH。治疗开始后，患有CSPH的患者的中位OS（4.1 vs 33.3个月，p <0.001）和中位PFS（2.7 vs 5.3个月，p = 0.02）明显受损。在多变量Cox回归中，当调整成熟的风险因素时，CSPH仍与生存率显着相关（HR 2.9，p = 0.015）。使用常规CT数据的非侵入性评估CSPH为HCC和免疫治疗患者提供了独立的预后因素。因此，它可能作为一种额外的影像标志物，用于检测生存不良的高风险患者，并可能用于治疗决策的制定。