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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Apr 24

MiaoShi,WeiguoHan,Ol...
Initial development and testing of an exhaled microRNA detection strategy for lung cancer case-control discrimination.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
为了非侵入性地检测现场致癌过程,我们进行了呼气气溶胶微小RNA的早期技术开发和病例对照测试。在设计上,人类肺组织微小RNA-seq发现与TCGA和已发表的肿瘤识别微小RNA相协调,得出了一个由24个上调的微小RNA组成的面板。利用配对的EBC、上部和下部气道供体样本集,对呼出微小RNA的空气来源进行了地形“指纹”识别。通过定性RT-PCR对166例非小细胞肺癌病例和185例对照进行微小RNA面板的诊断性测试。数据采用逻辑回归(LR)和随机森林(RF)模型进行分析。进行了呼气微小RNA检测的可行性测试,包括优化的整体EBC提取,以及RT和定性PCR方法评估。在这种低模板设置下,基于内插剂的URT-PCR优于荧光探针PCR(TaqMan)。在应用中,调整后的逻辑回归模型确定了呼出miR-21、33b、212作为总体病例对照鉴别标志。联合临床+微小RNA模型的RF分析显示出了适度的额外鉴别能力(1.1-2.5%),超出了单独临床模型:所有受试者为1.1%(p = 8.7e-04);以前的吸烟者为2.5%(p = 3.6e-05);早期阶段为1.2%(p = 9.0e-03),使ROC AUC从0.74到0.83不等。我们得出结论,呼出微小RNA可以在定性上测量,部分反映下部气道特征;当这种技术得到进一步改进和量化时,可能有助于改善肺癌风险评估。©2023年,作者。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Apr 24

XiaofeiLi,ZanetaAndr...
Profiling spatiotemporal gene expression of the developing human spinal cord and implications for ependymoma origin.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
人类发育中的脊髓神经元命运特异性的时空调节仍然大部分未知。本研究通过整合单细胞和空间多组学数据,使用16个人类产前样本,创建了一个全面的发育细胞图谱,覆盖了孕周5-12的脊髓。这揭示了神经前体细胞的命运决策和空间定位如何被特定基因组的时空调节所控制。我们发现人类脊髓发育中的独特事件相对于啮齿类动物,包括较早期的活性神经干细胞静止期、细胞分化的差异调节以及不同的时空遗传调节和细胞命运选择。此外,通过将我们的图谱与小儿脑室管瘤的数据整合,我们确定了癌干细胞在进展过程中的特定分子标志和系谱特定基因。因此,我们勾画了人类脊髓发育的时空遗传调节并利用这些数据来获得疾病洞见。©2023.作者。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Apr 24

JessicaEBourne,Charl...
Study protocol for two pilot randomised controlled trials aimed at increasing physical activity using electrically assisted bicycles to enhance prostate or breast cancer survival.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2020年,全球诊断出了140万例前列腺癌和230万例乳腺癌。在英国,前列腺癌是最常见的男性癌症,而乳腺癌是最常见的女性癌症。参与体育活动是治疗的关键组成部分,但这些临床人群的体育活动率很低。本文描述了CRANK-P和CRANK-B两项试点随机对照试验的协议,这两项试验涉及电动自行车干预,旨在增加前列腺癌或乳腺癌患者的体育活动量。这两项试验都是单中心、分层、平行组、两臂随机等待对照试点试验,每组包括40名前列腺癌患者(CRANK-P)和40名乳腺癌患者(CRANK-B),以1:1的分配比例随机分配到电动自行车干预组或等待对照组。干预措施包括由认证的自行车教练进行电动自行车培训,并提供电动自行车12周。干预期结束后,电动自行车干预组的参与者将被引导参加社区倡议活动,以获得电动自行车的使用权。数据将在基线(T0)、干预后立即(T1)和3个月随访(T2)时收集。此外,在干预组中,将在干预期和随访期间收集数据。将采用定量和定性方法。主要目标是确定有效的招募策略、建立招募和同意率、研究中的依从性和保留率,以及确定研究流程和干预措施的可行性和可接受性。将评估干预措施对临床、生理和行为结果的潜在影响,以研究干预的潜在效果。数据分析将是描述性的。这些试验的结果将提供试验可行性和电动自行车作为一种积极影响前列腺癌和乳腺癌患者健康和行为的策略的潜力信息。如果合适,这些信息可用于设计和实施完全动力学的明确试验。CRANK-B:[ISRCTN39112034]。CRANK-P:[ISRCTN42852156]。注册于[08/04/2022] https://www.isrctn.com。© 2023年 作者。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Dec

SeohyunSon,AhmedElka...
Development of new TAK-285 derivatives as potent EGFR/HER2 inhibitors possessing antiproliferative effects against 22RV1 and PC3 prostate carcinoma cell lines.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
表皮生长因子受体(EGFR)和人类表皮生长因子受体2(HER2)蛋白酪氨酸激酶在各种癌症中共同表达,例如卵巢、乳腺、结肠和前列腺亚型。在此,新的TAK-285衍生物(9a-h)被合成、表征并被作为双重EGFR/HER2抑制剂进行生物学评价。化合物9f对EGFR和HER2分别表现出2.3 nM和234 nM的IC50值,这是staurosporine的38倍和TAK-285对EGFR的10倍。在小激酶面板上测试时,化合物9f也表现出很高的选择性。化合物9a-h对PC3和22RV1前列腺癌细胞株的IC50值分别在1.0-7.3 nM和0.8-2.8 nM之间。细胞周期分析、凋亡诱导、分子对接、动力学和MM-GBSA研究证实了化合物9f作为强效EGFR/HER2双重抑制剂的可能机制,并对前列腺癌具有有效的抗增殖作用。
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GENOME BIOLOGY
2023 Apr 24

YuSun,XiangXu,LinLin...
A graph neural network-based interpretable framework reveals a novel DNA fragility-associated chromatin structural unit.
GENOME BIOLOGY
DNA双链断裂(DSBs)是最为有害的DNA损伤之一,如果未得到适当修复,则可能导致癌症。最近的染色体构象捕获技术,如Hi-C,已经使得能够确定3D染色质结构与DSBs之间的关系,但是从全局接触图来解释这些关系,尤其是它们对DSB形成的贡献,目前所知甚少。在此,我们提出了一种框架,该框架将图形神经网络(GNN)与先进的可解释技术GNNExplainer相结合,以揭示3D染色质结构与DSBs之间的关系。我们确定了一种名为DNA易损性相关染色质相互作用网络(Facin)的新染色质结构单元。 Facin是一种瓶颈式的结构,它有助于揭示一个通用形式,即一段DNA的易损性如何通过染色质相互作用受到整个基因组的影响。此外,我们证明,Facin中的瓶颈相互作用可以作为DSB形成的染色质结构决定因素。我们的研究提供了一种更系统化和精细化的视角,使人们更好地理解3D基因组背景下DSB形成机制的原理。© 2023. The Author(s)。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 May

MareikeTometten,Mart...
Identification of Adult Patients With Classical Dyskeratosis Congenita or Cryptic Telomere Biology Disorder by Telomere Length Screening Using Age-modified Criteria.
Cellular & Molecular Immunology
端粒生物学失调症(TBD)由与端粒维持相关基因的致病性生殖细胞变异导致的早期端粒缩短所致。在成人中,TBD的特征为单/少症状临床表现(隐性TBD),这导致其被严重低估。我们呈现了一项前瞻性的多机构队列研究,在该研究中对新诊断出的再生障碍性贫血(AA)患者或临床医生怀疑存在TBD的患者进行了端粒长度(TL)筛查。通过流式荧光原位杂交(FISH)测量了262个样本的TL,并将TL视为可疑,一旦低于正常个体的第10百分位(标准筛查)或在40岁以上的患者中低于6.5 kb(扩展筛查)。在TL缩短的情况下,进行TBD相关基因的下一代测序(NGS)。被介绍的患者分为6个不同的筛查类别:(1)AA / 原发性夜间血红蛋白尿,(2)未解释的细胞减少症,(3)角化不良症,(4)骨髓增生异常综合征/急性髓性白血病,(5)间质性肺病,以及(6)其他疾病。总的来说,在120名患者中(n = 86标准筛查和n = 34扩展筛查),发现TL缩短。在76名标准患者中,17名有足够材料进行NGS,并确定了一种致病/可能致病的TBD相关基因变异。在76名标准和29名扩展筛查的患者中,检测到17名不确定意义的变异(22.4%的标准和20.7%的扩展筛查)。意料之中的是,突变主要发现在TERT和TERC中。总之,由流式FISH测量的TL代表了一种强大的体内功能筛查工具,用于筛查潜在的TBD,并且应该在每个新诊断的AA患者以及有临床怀疑存在潜在TBD的儿童和成人中进行。版权所有©2023作者。 Wolters Kluwer Health, Inc.代表欧洲血液学会发布。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 May 02

WDHu,BLi,SFSu,YFLiu,...
[Prognostic analysis of children with Philadelphia chromosome-like acute lymphoblastic leukemia common genes].
Cellular & Molecular Immunology
目的:总结费城染色体样急性淋巴细胞白血病(Ph-like ALL)常见基因患儿的临床数据和预后。方法:这是一项回顾性队列研究。收集了2017年1月至2022年1月在郑州大学第一附属医院、河南省儿童医院、河南省肿瘤医院和河南省人民医院治疗的56名Ph-like ALL常见基因病例的临床数据(Ph-like ALL阳性组),同时选择了69名相同年龄的其他高危B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)患儿作为阴性组。回顾性分析了两组的临床特征和预后。使用Mann-Whitney U检验和χ2检验进行组间比较。采用Kaplan-Meier方法绘制生存曲线,采用Log-Rank检验进行单因素分析,采用Cox回归模型进行多因素预后分析。结果:在56名Ph-like ALL阳性患者中,有30名男性和26名女性,15例年龄超过10岁。Ph-like ALL阴性组有69名患者。与阴性组相比,阳性组中的儿童年龄更大(6.4(4.2,11.2)岁vs.4.7(2.8,8.4)岁),高白细胞症(≥50×109/L)更常见(25%(14/56)vs.9%(6/69)),差异具有统计学意义(P <0.05)。在Ph-like ALL阳性组中,32例为IK6阳性(1例与IK6和EBF1-PDGFRB共表达),24例为IK6阴性,其中9例为CRLF2阳性(包括2例P2RY8-CRLF2和7例CRLF2高表达),5例为PDGFRB重排,4例为ABL1重排,4例为JAK2重排,1例为ABL2重排,1例为EPOR重排。Ph-like ALL阳性组的随访时间为22(12,40)个月,阴性组为32(20,45)个月。阳性组的3年总生存率(OS)显著低于阴性组((72±7)%vs.(86±5)%,χ2=4.59,P <0.05)。与24名IK6阴性患者相比,32名IK6阳性患者的3年无事件生存率(EFS)高,差异具有统计学意义((88±9)%vs.(65±14)%,χ2=5.37,P <0.05)。多元Cox回归分析显示,骨髓最小残留病(MRD)在第一次诱导结束时未转阴(HR=4.12,95%CI 1.13~15.03),是Ph-like ALL常见基因患儿的独立预后风险因素。结论:患有Ph-like ALL普通基因的儿童诊断时年龄较大,白细胞计数高,生存率较低。骨髓MRD在第一次诱导结束时未转阴是Ph-like ALL常见基因患儿的独立预后风险因素。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Jun 13

XiyunJin,YidengCai,G...
Identification of shared characteristics in tumor-infiltrating T cells across 15 cancers.
Cellular & Molecular Immunology
浸润瘤的T细胞是瘤免疫治疗中不可或缺的角色。在T细胞异质性的研究中取得了巨大进展。然而,关于不同癌症中浸润瘤T细胞的共同特征仍知之甚少。在本研究中,我们对15种癌症中的349,799个T细胞进行了泛癌症分析。结果表明,同一类型的T细胞在不同癌症中由特定的转录因子(TF)调控其表达模式。在癌症中,多种T细胞类型的转换路径是一致的。我们发现,与CD8+ T细胞相关的TF调控途径转化为终末分化的效应记忆(Temra)或疲劳(Tex)状态,与患者的临床分类有关。我们还观察到,浸润瘤T细胞之间的细胞间相互作用途径在所有癌症中都是普遍激活的,其中一些途径在特定细胞类型中特别调节信息传递。此外,在可变区和连接区基因方面,TCR的一致特征在不同癌症中被发现。总的来说,我们的研究揭示了不同癌症中浸润瘤T细胞的共同特点,并为有针对性的治疗开辟了未来途径。© 2023作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Sep

ZhenYang,BinWang,Wei...
In situ self-assembled organoid for osteochondral tissue regeneration with dual functional units.
Cellular & Molecular Immunology
由于难以诱导间充质干细胞(MSCs)空间、定向和可控地分化成软骨和骨分区,因此分级骨软骨单位的再生具有挑战性。新兴的器官样技术为骨软骨再生提供了新的机遇。在本研究中,我们开发了基于明胶的微小冰冻凝胶,并分别使用透明质酸(HA)和羟基磷灰石(HYP)进行定制,以通过在体内自组装成骨软骨器官(分别表示为CH-Microcryogels和OS-Microcryogels)诱导软骨和骨再生。 定制的微型冰冻凝胶显示出良好的细胞相容性,诱导 MSCs 的软骨和骨形成分化,并展示了自组装成双相软骨-骨结构中不脱层的骨软骨器官的能力。 mRNA-seq分析表明,CH-Microcryogels促进了软骨形成分化并抑制了炎症,而OS-Microcryogels通过调节特定的信号通路促进了骨形成分化并抑制了免疫反应。最后,在犬骨软骨缺损的体内移植预分化的定制微冰冻凝胶导致软骨和下软骨骨的同时再生。总之,利用量身定制的微冰冻凝胶生成自组装骨软骨器官的新方法,为组织工程领域的进展提供了高度有前途的道路。©2023年作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Dec

XiaopengPeng,ZiwenYu...
Discovery of novel benzohydroxamate-based histone deacetylase 6 (HDAC6) inhibitors with the ability to potentiate anti-PD-L1 immunotherapy in melanoma.
Cellular & Molecular Immunology
在这项研究中,发现了一系列新型的组蛋白去乙酰化酶6(HDAC6)抑制剂,其中含有多环芳烃环,并对它们的药理活性进行了评估。最有效的化合物10c表现出高水平的HDAC6抑制活性(IC50 = 261 nM)和极佳的HDAC6选择性(HDAC6与HDAC3比值为109)。10c在体外还显示出较好的抗增殖活性,对四种癌细胞株的IC50为7.37-21.84 μM,与tubastatin A(平均IC50 = 6.10 μM)相当。进一步的机制研究发现,10c有效地诱导了B16-F10细胞的凋亡和S期阻滞。此外,在体内外,10c显著增加了乙酰化-α-微管蛋白的表达,而不影响乙酰化H3的水平(HDAC1抑制的标志)。此外,10c(80mg/kg)在黑色素瘤模型中表现出中等的抗肿瘤功效,其肿瘤生长抑制率(TGI)为32.9%,与tubastatin A(TGI = 31.3%)相当。重要的是,10c与我们之前发现的小分子PD-L1抑制剂NP19的联合应用显著降低了肿瘤负荷(TGI% = 60.1%),比单一治疗组更有效。此外,10c与NP19的联合使用增强了抗肿瘤免疫应答,通过降低PD-L1表达水平和增加抗肿瘤CD8 + T细胞在肿瘤组织中的浸润来介导。综上所述,10c代表了一种新型的HDAC6抑制剂,值得进一步研究作为潜在的抗癌药物。
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