研究动态
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Burns & Trauma
2023
LinHe,ChanZhu,Huicon...
Keloid Core Factor CTRP3 Overexpression Significantly Controlled TGF-β1-Induced Propagation and Migration in Keloid Fibroblasts.
Burns & Trauma
瘢痕增生瘤是一种良性纤维增生性肿瘤,其特征为过度瘢痕形成。已证实C1q/TNF相关蛋白3(CTRP3)具有抗纤维化作用。在这里,我们探讨了CTRP3在瘢痕增生瘤中的作用。在当前研究中,我们检查了CTRP3对瘢痕增生瘤成纤维细胞(KFs)的影响,并研究了潜在的分子机制。从10例瘢痕增生瘤患者中收集了KF组织标本和相邻的正常成纤维细胞(NF)。对于TGF-β1刺激组,KFs经过人重组TGF-β1处理。进行了pcDNA3.1-CTRP3或pcDNA3.1的细胞转染。CTRP3的siRNA(si-CTRP3)或阴性对照siRNA(si-scramble)被转染到KFs中。CTRP3在瘢痕组织和KFs中被下调。CTRP3过表达明显控制了TGF-β1诱导的KFs的增殖和迁移。TGF-β1刺激增强了Col I、α-SMA和纤维连接蛋白mRNA和蛋白水平,而CTRP3过表达则抑制了它们。相反,CTRP3敲除表现出相反的效应。此外,CTRP3削弱了TGF-β1诱导的KFs的TGF-β受体TRI和TRII。此外,CTRP3防止了TGF-β1刺激的smad2和smad3的核转位,并抑制了KFs中p-smad2和p-smad3的表达水平。CTRP3通过调节TGF-β1/Smad信号通路,在抑制KFs增殖,迁移和ECM累积方面发挥了抗纤维化作用。版权所有© 2023 Lin He等。
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Frontiers in Cell and Developmental Biology
2023
GaryRo-LinChang,Wei-...
Kefir peptides attenuate atherosclerotic vascular calcification and osteoporosis in atherogenic diet-fed ApoE -/- knockout mice.
Frontiers in Cell and Developmental Biology
目的:血管钙化(VC)和骨质疏松曾被认为是两种不同的疾病。然而,当前的理解表明它们具有共同的发病机制。治疗VC和骨质疏松的药物有限。我们以前证明了发酵乳肽(KPs)缓解了高脂肪饮食(HFD)诱导的apoE敲除小鼠动脉粥样硬化。本研究进一步研究了KPs对apoE敲除小鼠高胆固醇动脉粥样硬化饮食(AD)引起的VC和骨质疏松的预防作用。主要方法:7周龄的apoE敲除和野生型C57BL/6小鼠被随机分成五组(n=6)。经AD饲喂13周后,评估了KP处理的apoE敲除小鼠VC和骨质疏松的发展情况,并将其与饲喂标准饲料(CD)的C57BL/6和apoE敲除小鼠进行比较。主要发现:结果表明,KP处理的apoE敲除小鼠血清总胆固醇、氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)、丙二醛(MDA)水平和血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)和肌酸激酶(CK)活性降低,表明KPs预防了apoE敲除小鼠的高脂血症并可能对肝脏和肌肉产生损害。KPs减少了AD饲喂apoE敲除小鼠主动脉组织中肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和局部TNF-α、IL-1β和巨噬细胞特异性CD68标志物的表达,表明KPs抑制了AD饲喂apoE敲除小鼠的炎症反应。KPs减少了AD饲喂apoE敲除小鼠主动脉根部的脂质、胶原和钙矿质沉积,表明KPs抑制了动脉粥样硬化斑块的钙化进展。KPs在AD饲喂apoE敲除小鼠中表现出骨保护作用,这表现为骨吸收标志物CTX-1水平较低,骨形成标志物P1NP水平较高。KPs改善了股骨的皮质骨密度和骨体积,并减少了梭形骨的骨量减少。意义:本研究表明,KPs通过减少AD饲喂apoE敲除小鼠的氧化应激和炎症反应减轻了VC和骨质疏松。我们的研究为将KPs应用于预防高脂血症引起的血管和骨骼退化的治疗药物中做出了贡献。版权所有©2023昌,成,范,陈,兰,陈,颜和陈。
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Frontiers in Cell and Developmental Biology
2023
MenglingLi,BaosenZho...
An integrated bioinformatic analysis of bulk and single-cell sequencing clarifies immune microenvironment and metabolic profiles of lung adenocarcinoma to predict immunotherapy efficacy.
Frontiers in Cell and Developmental Biology
靶向肿瘤微环境越来越被认为是治疗晚期肺腺癌(LUAD)的有效方法。然而,很少有研究探讨免疫疗法对LUAD的有效性。在这里,提出了一种新的预测免疫疗法有效性的方法,该方法结合了单细胞和批量测序,以表征LUAD的免疫微环境和代谢特征。使用TCGA批量数据集将免疫亚型分成了两种:C1具有“冷”肿瘤特征,而C2具有“热”肿瘤特征,并且具有不同的预后。基于这两种免疫亚型的Scissor算法将GSE131907单个细胞数据集分成了两组上皮细胞,标记为Scissor_C1和Scissor_C2。富集表明,Scissor_C1的特征是缺氧,缺氧微环境是诱导肿瘤侵袭、转移和免疫治疗不应答的潜在因素。此外,进行单细胞分析以研究缺氧微环境在LUAD中诱导侵袭、转移和免疫治疗不应答的分子机制。值得注意的是,Scissor_C1细胞与T细胞和癌相关成纤维细胞(CAF)显著相互作用,并表现出上皮间质转化和免疫抑制特征。CellChat分析显示,Scissor_C1中的缺氧微环境上调了TGFβ信号通路,并诱导出ANGPTL4和SEMA3C分泌。与ANGPTL4的内皮细胞相互作用可增加血管通透性,在血管内皮细胞间实现远处转移。此外,肿瘤相关巨噬细胞(TAM)与Scissor_C1通过EREG/EFGR通路相互作用,在LUAD患者中诱导酪氨酸激酶抑制剂耐药性。此后,确定了一组CAF细胞,其特征与Scissor_C1相同,在肿瘤微环境中发挥免疫抑制功能。此外,探讨了Scissor_C1基因网络中的关键基因(EPHB2和COL1A1),并使用免疫组织化学验证了它们的表达。最后,确定了细胞之间代谢失调的交互作用,其中TAM通过SLC38A2转运葡萄糖胺,而Scissor_C1则通过摄取来诱导LUAD细胞对葡萄糖胺的依赖。总体来说,单细胞测序阐明了肿瘤微环境如何通过分子机制和生物过程影响免疫疗法的有效性,而批量测序则基于临床信息解释了免疫疗法的有效性。版权所有©2023 Li,Zhou和Zheng。
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Frontiers in Cell and Developmental Biology
2023
NaFan,YiZhang,SuyunZ...
Methylthioadenosine phosphorylase deficiency in tumors: A compelling therapeutic target.
Frontiers in Cell and Developmental Biology
蛋氨酸回收途径负责将含硫代谢物回收至蛋氨酸。这个回收途径发现与细胞凋亡、增殖、分化和炎症反应有关。甲基硫腺苷磷酸化酶(MTAP)催化可逆性磷酸解5'-甲基硫腺苷,这是多胺生物合成的副产物。MTAP基因位于周期蛋白依赖性激酶抑制剂2A基因旁边,与CDKN2A基因近15%的肿瘤同时缺失。此外,MTAP缺失的肿瘤细胞对蛋氨酸缺乏和嘌呤合成抑制剂更敏感。在本综述中,我们首先总结了MTAP在肿瘤中的分子结构和表达。此外,我们还讨论了PRMT5和MAT2A作为MTAP缺失肿瘤的潜在易感性。还讨论了MTAP在多种恶性肿瘤中的复杂和动态作用。最后,我们论证了治疗MTAP缺失肿瘤的意义。版权所有© 2023 Fan,Zhang和Zou。
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Gut Microbes
2023
JinhuanYang,QikuanHe...
A distinct microbiota signature precedes the clinical diagnosis of hepatocellular carcinoma.
Gut Microbes
口腔、肠道和肿瘤微生物群落已被认为是胃肠道恶性肿瘤的致癌和进展的重要调节因素。然而,很少有研究关注不同体部位居民微生物的存在和关联。本研究旨在揭示口腔-肠道-肿瘤微生物组的持久性和其在肝细胞癌(HCC)诊断中的表现。本研究包括两个队列:回顾性发现队列,包括364例HBV-HCC患者和160名具有口腔或粪便样本的对照组,前瞻性验证队列,包括91例病例和124名对照,以及48例HBV和39例HBV-肝硬化患者,通过16S rRNA基因测序检查肠道微生物群落。随机森林分析表明,在回顾性队列中,能区分HCC患者和对照组的10个口腔和9个肠道属,在前瞻性匹配的参与者中得到验证,其曲线下面积(AUC)值分别为0.7971和0.8084。当影响因子分类合并后,一致分类器的AUC增加至0.9405。与非胎盘球蛋白(AFP)血清水平相结合,性能继续提高至0.9811。具体而言,由链球菌代表的微生物生物标志物在疾病转化过程中呈持续上升的趋势。此外,在肝肿瘤和非肿瘤组织中,存在多种优势微生物物种,经荧光原位杂交(FISH)和5R 16S rRNA基因测序确认。总的来说,基于口腔、肠道和肿瘤微生物群落的发现提供了一种可靠的HCC早期诊断方法。
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Computational and Structural Biotechnology Journal
2023
Si-YuanLu,JieHua,Jia...
A new approach: Evaluation of necroptosis and immune status enables prediction of the tumor microenvironment and treatment targets in pancreatic cancer.
Computational and Structural Biotechnology Journal
越来越多的证据表明,坏死激活程序与胰腺癌之间存在潜在相关性,并且坏死激活程序、免疫浸润和胰腺癌微环境之间的关系越来越受到关注。然而,基于坏死激活程序和免疫力的二维表型和预后评估系统尚未被探索。在本研究中,我们探索了坏死激活程序相关分子的全癌基因组签名,确定了坏死激活程序相关分子的突变和表达谱,以及表达水平和甲基化/拷贝数变异水平之间的相关性。我们在胰腺癌中确定了独特的坏死激活程序状态和免疫状态,高坏死激活程序表型和高免疫表型均比低坏死激活程序表型和低免疫表型预示着更好的预后。我们构建的二维表型对胰腺癌预后、炎症和免疫微环境具有理想的识别效果。 “高坏死激活程序和高免疫(HNHI)”组显示了最佳预后和最高比例的浸润性免疫细胞。 NI评分可用于预测患者预后,并与免疫微环境评分、化疗药物IC50和肿瘤突变负荷相关。此外,它可能有助于预测个体化化疗和免疫治疗的效果。我们的研究还揭示了SLC2A1与坏死激活程序和免疫力均有关,它在胰腺癌中充当潜在的癌基因。总之,我们开发的二维表型和NI评分是临床多组学应用和预测化疗和免疫治疗反应的有希望的工具,并在胰腺癌患者的精准医学和个体化治疗决策方面带来好处。 © 2023 作者。
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Frontiers in Endocrinology
2023
JiWu,JiabinZhou,Yibo...
Novel prognostic features and personalized treatment strategies for mitochondria-related genes in glioma patients.
Frontiers in Endocrinology
胶质瘤是最常见的颅内神经系统肿瘤,高度恶性和侵袭性,线粒体是肿瘤细胞代谢重编程的重要标志,目前的组织病理学不能准确预测预后。因此,需要鉴定一个带有免疫相关特征的线粒体基因,可用于预测胶质瘤患者的预后。胶质瘤数据从TCGA数据库下载,线粒体相关基因从MITOCARTA 3.0数据集获得。使用CGGA,Kamoun和Gravendeel数据库作为外部数据集。应用LASSO(最小绝对值估计和选择算子)回归来确定预后特征,利用ROC曲线下的面积和评分表来评估模型的稳健性。采用单个样本基因组富集分析(ssGSEA)来探索模型基因与免疫浸润之间的关系,并使用药物敏感性来识别定位药物。然后进行细胞研究以证明药物对肿瘤的杀伤作用。COX组装线粒体蛋白同源物(CMC1),细胞色素C氧化酶蛋白20同源物(COX20)和细胞色素b-c1复合物亚基7(UQCRB)在胶质瘤中被鉴定为预后关键基因,其中UQCRB和CMC1随着风险评分的降低逐渐增加,而COX20则逐渐降低。TCGA训练集模型的ROC曲线分析显示,在1年、2年和3年生存方面,都可以获得>0.8的AUC(曲线下面积)值,该模型与CD8+T细胞和免疫检查点有关。最后,使用cellMiner数据库和分子对接验证了UQCRB通过位于78位的赖氨酸和82位的苏氨酸与Amonafide共价结合,而细胞实验表明Amonafide抑制胶质瘤的迁移和侵袭。我们的三个与线粒体基因组成相关的特征可以准确预测胶质瘤患者的预后,并且我们还提供了可能与线粒体相关的靶向胶质瘤化疗药物。版权所有©2023年Wu,Zhou,Chai,Qin,Cai,Xu,Lei,Mei,Li,Shen,Fang,Yang,Cai和Xiong。
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Frontiers in Endocrinology
2023
PrernaRNepali,Natash...
Anoikis in phenotypic reprogramming of the prostate tumor microenvironment.
Frontiers in Endocrinology
前列腺癌是男性中最常见的恶性肿瘤之一,约有8分之1的男性在其余生期内被诊断出患有该疾病。寻找新的治疗干预方法的紧急性与去势抵抗前列腺癌的治疗耐受性和死亡率相关。不附着在细胞外基质(ECM)上的正常上皮或内皮细胞所发生的细胞凋亡现象称为解离性凋亡。失去与 ECM 的连接的肿瘤细胞可以通过凋亡而死亡,或通过解离性凋亡耐受性而幸存并逃避到远处器官进行转移。本综述讨论了我们对前列腺癌中解离性凋亡信号效应物的最新进展及将这些机制洞察转化成治疗益处以减少致命疾病结果(通过克服解离性凋亡耐受性)的方法。前列腺肿瘤微环境是一个高度动态的景观,其中雄激素信号、细胞系谱变化、上皮间质转化(EMT)、细胞外基质相互作用、肌动蛋白细胞骨架重塑以及代谢变化之间的平衡,赋予了解离性凋亡耐受性和转移扩散的特性。因此,这些机制也提供了独特的分子治疗标志,利用这些标志可以为前列腺肿瘤诱导解离性凋亡提供高度相关的译码意义。版权所有©Nepali 和 Kyprianou。
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Frontiers in Endocrinology
2023
JinxingWei,XiaoMingW...
Spatial heterogeneity and Immune infiltration of cellular lysosomal pathways reveals a new blueprint for tumor heterogeneity in esophageal cancer.
Frontiers in Endocrinology
食管鳞状细胞癌(ESCC)是消化道常见恶性肿瘤,可能与溶酶体途径有关。本研究旨在探讨溶酶体途径与ESCC免疫浸润之间的相关性。通过单细胞数据进行ESCC患者的细胞类型注释和其基因标记的分布分析。根据溶酶体途径的表达分组,进行基因集变异分析(GSVA)富集途径评分,使用Cellchat细胞通信对不同细胞群体的肿瘤相关途径评分和相互作用进行分析。使用算法筛选相关差异基因,构建预后风险标记,并直接评估溶酶体途径相关的基因风险评分与免疫浸润和肿瘤治疗药物敏感性之间的关联。在细胞实验中,采用qPCR和流式细胞术评估溶酶体途径基因MT1X在肿瘤细胞发展中的作用。通过t-sne降维分析,将ESCC单细胞数据注释为7个聚类簇。Cellchat分析显示,“MIF”细胞通信网络是ESCC细胞中溶酶体途径的主要通信模式。在训练和验证组中发现,溶酶体途径遗传风险模型与ESCC预后显著不同。使用oncopredict R包,发现溶酶体途径基因风险模型与ESCC患者的治疗耐药有关。使用MCPcounter方法评估了溶酶体差异表达基因的表达与肿瘤免疫浸润和免疫细胞类型之间的相关性。细胞实验显示,溶酶体途径基因MT1X在食管癌细胞中的表达量低于正常食管上皮细胞。MT1X的敲除显著促进了食管癌细胞的生长速度。基于单细胞测序技术和转录组分析,我们确认了ESCC的溶酶体途径与免疫浸润和治疗敏感性之间的密切关联,这可能是ESCC疗法新方向的潜在靶标。版权所有©2023 Wei,Wu,Wang,Liu和Gao。
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OncoImmunology
2023
PengZhang,YanZhao,Xi...
Expression of OLR1 gene on tumor-associated macrophages of head and neck squamous cell carcinoma, and its correlation with clinical outcome.
OncoImmunology
头颈鳞状细胞癌(HNSCC)是免疫浸润最重的人类肿瘤之一,具有不同分子特征和临床结果相关的不同免疫亚型。由肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)主导的HNSCC肿瘤微环境(TME)具有相对较差的预后。氧化低密度脂蛋白受体1(OLR1)的高表达水平与多种癌症的更具侵袭性和转移性特征相关。然而,OLR1表达与TME的免疫抑制之间的联系以及控制肿瘤内TAM行为的分子机制仍不清楚。在此,我们基于头颈鳞状细胞癌的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集进行转录分析,并发现OLR1表达特别富集在TAMs上。评估原发性HNSCC患者样本的组织切片中的蛋白表达显示,OLR1和CD68在巨噬细胞上具有共表达模式。我们还分析了The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库中498例HNSCC患者的肿瘤样本。值得注意的是,HNSCC组织中OLR1表达显著高于相邻正常组织,而OLR1表达水平高的患者相比于低表达水平的患者有明显不利的总体生存率(风险比=1.724,对数秩和P值=0.0066)。总之,我们报告了OLR1特异性表达于TAM上,与不良生存结果显著相关,揭示了OLR1可能作为头颈鳞状细胞癌免疫治疗潜在的预后标志和有希望的靶点。© 2023作者。在Taylor&Francis Group,LLC授权下发表。
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