腺癌不另分类（AC）和黏液腺癌（MC）具有不同的生物学行为和临床特征。我们利用之前的蛋白质组数据和公共转录组、单细胞转录组和空间转录组数据库，对MC、AC和正常结肠组织的肿瘤微环境进行了分子图谱分析。通过探索AC和MC的一般和特定分子特征，我们发现AC是免疫活性的，但暴露在缺氧微环境中。MC细胞可以保护DNA免受损伤，而微环境不利于白细胞經内皮细胞迁移。我们为未来研究确定了AC和MC的几个潜在分子和细胞靶点。我们还强调，AC和MC之间的主要区别可能不在于细胞类型和功能的多样性，而可能在于细胞相互作用。基质和上皮细胞的相互作用在MC和AC中发挥着重要作用，但涉及不同的调节途径。版权所有 © 2023 Xu，Zheng，Li，Shao和Yin。

支气管肺发育不良（BPD）是一种慢性肺部疾病，通常在早产儿中常见。它通常可以由数种病理过程引起，这些过程会危及长期的肺部发育，如炎症和免疫功能紊乱。本研究采用生物信息学方法鉴定差异表达的免疫相关基因（DEIRGs）。我们从基因表达聚合物（GEO）数据库下载了转录谱（GSE32472数据集），并进行了基因集富集分析（GSEA）。细胞类型通过估计RNA转录物的相对子集（CIBERSORT）、微环境细胞种群计数器（MCPcounter）和使用表达数据在恶性肿瘤组织中估计基质和免疫细胞（ESTIMATE）用于BPD的免疫细胞浸润景观分析。随后使用加权基因共表达网络分析（WGCNA）构建了一个加权共表达网络，以筛选候选的差异表达免疫相关基因（DEIRGs）。GSEA结果显示，免疫相关途径主要涉及BPD。在BPD和正常组之间观察到了10种显着不同的免疫细胞类型。共识模块中鉴定了228个DEGs，进一步鉴定了31个DEIRGs。集群差异化8α（CD8A）表达在BPD中下调，并通过GSE25286、GSE25293、GSE99633数据集和qRT-PCR验证了其表达。此外，CD8A表达与免疫细胞浸润，特别是T细胞CD8和中性粒细胞密切相关。BPD和正常组之间发现了不同的免疫细胞浸润景观。CD8A可以成为BPD的新型候选生物标志物，通过破坏免疫细胞的功能，在高氧相关的BPD的发生和进展中发挥重要作用。©2023 Du等。

miR-219-1基因的各种变体是文献中最早与非小细胞肺癌预后相关的基因之一。我们的目的是对miR-219-1基因的两种不同变体进行基因型分型，并研究其作为生物标志物在NSCLC的诊断和治疗中的应用。根据International NSCLC标准选择患者，并从血液（138名患者和100名健康个体）中分离出基因组DNA。然后应用qRT-PCR确定miR-219-1基因多态性的rs213210和rs421446变体。使用Pearson卡方检验和Fisher确切检验比较等位基因和基因型频率。我们发现，rs213210中的TT基因型（p=0.381）与CC基因型（p=0.165）以及rs421446中的CC基因型（p=0.823）与TT基因型（p=0.537）相比并没有显示出显著增加的NSCLC风险。miR-219-1的多态性与NSCLC的结果之间没有关系。miRNA单核苷酸多态性可用作预测癌症易感性、早期诊断和预后的遗传标记。我们的研究表明，miR-219-1的两种变体与土耳其人群中的NSCLC无关。这可能是由于种族、地区和人口背景的差异造成的，这些差异可能导致结果各异。

肿瘤细胞在低氧应激下存活后获得了推动癌症进展的能力。为了探索脱氢酶对低氧响应的贡献，我们使用siRNA靶向163个脱氢酶编码基因，并发现谷氨酸脱氢酶1（GDH1）在调节结直肠癌（CRC）细胞低氧存活方面发挥了关键作用。我们观察到GDH1缺陷对CRC发生具有抑制作用，并且即使在缺氧下，也会削弱缺氧诱导因子1-alpha（HIF-1α）的稳定性。机制上，低氧引发p300的招募到GDH1，促进其在K503和K527处的乙酰化。K527处GDH1的乙酰化诱导了GDH1与EGLN1/HIF-1α的复合物的形成。相比之下，K503处GDH1的乙酰化增强了其与α-酮戊二酸（αKG）和谷氨酸的亲和力。这样看来，αKG是GDH1在缺氧状态下的产物，但缺氧刺激通过EGLN1/HIF-1α复合物逆转了GDH1的酶活性，使αKG的消耗增加，提高了HIF-1α的稳定性，从而促进了CRC的进展。临床上，低氧调节的GDH1 AcK503/527可以作为CRC进展的生物标志物，并且是CRC治疗的潜在靶点。©2023作者们。

睾丸生殖细胞瘤（TGCT）是年轻男性最常见的诊断癌症。尽管这些肿瘤通常预后良好且易治疗，但临床医生和病理学家仍面临与这种肿瘤模型固有的特定困境，这在很大程度上是由于其发育起源而引起的。本文介绍了关于TGCT生物标志物目前可用和未来前景的广泛评论。 TGCT生物标志物的领域在过去十年中得到了广泛研究。尽管这些患者通常预后良好，但仍需要新型生物标志物来补充临床中已经使用的标志物。这些问题包括临床一期患者的随访方法，最小残留病的检测，瘤性胚细胞的正确鉴定以及根据其固有抗性选择化疗患者的合适选择。

在单克隆抗体治疗策略方面已取得重大进展。这些进展包括修改它们的格式、生产和功能化，进一步提高了它们的功效，特别是在肿瘤学方面，帮助克服了几个限制。然而，抗体药物复合物的疗效和安全性还不够理想。本文主要总结了在肿瘤学中开发抗体药物复合物的各种策略需要解决的挑战。作者还提供了他们的专业意见和未来展望。解决本文讨论的挑战，如改进靶向癌细胞的特异性、将细胞毒性药物选择性地位点特异性地结合到抗体上，并开发不同的策略来克服药物耐受性问题，可能会产生一类新的ADC，并为ADC的概念带来更多价值，特别是在肿瘤患者的治疗方面。

许多致癌物的风险评估涉及对动物研究所使用的剂量水平和较低的人类接触水平进行巨大的外推。1,4-二噁烷是如此，它在雄鼠和雌鼠的肝脏中都有一致的致癌作用。在某些情况下，这些数据已应用于风险评估，假设低剂量线性外推，但在其他情况下则使用非线性或阈值模型。这个选择取决于我们对1,4-二噁烷致癌机制的理解。尽管1,4-二噁烷在标准测试电池中不具有遗传毒性和非线性毒代动力学，但其致癌作用机制仍未知，并且是一个活跃的研究领域。本综述总结了该化学物质的可能作用方式，数据空缺以及应用于风险评估的情况。我们发现细胞毒性/增生和代谢饱和假说不能解释致癌反应，并且不能考虑1,4-二噁烷诱导自身代谢，导致慢性暴露期间饱和可能性降低。有证据表明存在其他机制，特别是与CYP2E1诱导和体内遗传毒性相关的氧化应激，这在体外不可见。与1,4-二噁烷致癌剂量反应的时间和剂量反应相比，需要进一步探索这些效应。另一个考虑因素是这些1,4-二噁烷作用方式可能如何增强天然存在和导致人类肝癌增长率上升的与疾病相关的过程。这些因素增加了使用非阈值线性方法对该致癌物进行低剂量外推的合理性，这与没有明确定义的作用方式的致癌物的默认方法相一致。

在原发性脑肿瘤中，胶质瘤与不良预后相关，并且中位生存期因肿瘤分级和亚型而异。作为胶质瘤中最恶性的形式，胶质母细胞瘤（GBM）构成了重要的健康问题。已经证明，颗粒素（GRN）的改变是一些疾病的原因。然而，GRN与GBM之间的关系仍不清楚。我们通过癌症基因组图谱（TCGA）数据库评估了GRN在GBM中的作用。首先，我们通过GEPIA数据库评估了GRN与GBM之间的关系。接下来，通过逻辑回归和多元Cox分析方法分析了GRN与GBM预后之间的关系。我们还利用CIBERSORT和GEPIA相关模块研究了癌症中GRN与免疫浸润之间的联系。使用TCGA数据，进行了基因集富集分析（GSEA）。我们还利用肿瘤免疫评估资源（TIMER）检查了GRN表达和免疫浸润水平在GBM中的数据集，并研究了GBM中的累积生存率。最后，我们通过Western blotting、RT-qPCR和免疫组织化学验证了来自GBM患者的组织。通过逻辑回归的单因素研究，显示GRN表达增加与肿瘤分级显著相关。此外，多元回归分析揭示了GRN表达下调是有利预后的独立预测因素。GRN表达水平与浸润GBM的CD4+ T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞（DC）的数量呈正相关。GSEA还发现，高GRN表达表型途径富集了与免疫应答分子介导物的生产、淋巴细胞介导的免疫、细胞因子介导的信号转导途径、白细胞增殖、细胞趋化和CD4+ alpha beta T细胞的激活有关的基因。在基因组物质代谢通路，Kyoto的基因与基因组百科全书（KEGG）中富集的不同途径包括溶酶体、细胞凋亡、原发性免疫不良、趋化因子信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒作用和B细胞受体信号通路。验证结果表明，GRN在GBM组织中上调。这些结果表明，GRN是GBM状态的潜在指标。GRN是一种预后生物标记物，并与GBM中的免疫浸润相关。版权所有 © 2023 Xu、Xiao、Hu、Zhong、Zeng、Wu、Li和Song。

骨肿瘤中最常见的是恶性程度较高的骨肉瘤。然而，骨肉瘤中血清素蛋白家族的特征尚未明确。本研究从癌基因组图谱(GEO)和肿瘤基因组图谱(TCGA)中探索了血清素超家族在骨肉瘤中的预测意义。结果发现，SERPINH1是骨肉瘤中的一个重要的生物标志物。经过CCK-8、EdU、Transwell和IHC实验观察，SERPINH1可能促进骨肉瘤的增殖和迁移，并在肿瘤样本中表达较高而健康样本中表达较低。SERPINH1也可以预测免疫治疗的效果。另外，高SERPINH1水平的骨肉瘤通过检查点、细胞因子和生长因子通路与免疫细胞进行互动。基于SERPINH1的模型成功预测了骨肉瘤患者的生物学功能、免疫特性和治疗反应(包括免疫治疗和化疗)。SERPINH1和与其相关的分数可以预测骨肉瘤的凋亡方式(Ferroptosis/ pyroptosis/ apoptosis/ necroptosis)。SERPINH1相关分数是确定骨肉瘤患者对免疫治疗和化疗反应的有效方法，并且可以预测这些患者的生存结果。版权所有©2023 Xia, Wu, Luo和Cui。

作为对抗病原体的第一道防线的一部分，巨噬细胞具有分化成不同表型以及各种不同功能的能力。这些细胞改变特性的过程，通常被称为巨噬细胞极化。这允许它们变成广泛的促炎（M1）或抗炎（M2）亚型，取决于极化刺激物。巨噬细胞表型的失调可能导致不同的病理变化或影响某些疾病的性质，如癌症和动脉粥样硬化。因此，需要更好地了解相关模型中的巨噬细胞表型转换，以阐明其在疾病中的潜在作用。然而，在多细胞环境中跟踪巨噬细胞变化的探针很少。在本研究中，我们基于RAW264.7细胞中的诱导型一氧化氮合酶（iNos）启动子活性生成了一个eGFP报告基因细胞系（RAW:iNos-eGFP）。iNos与巨噬细胞活化到促炎状态有关，与免疫抑制状态下的细胞有所下降。我们通过细胞因子介导的极化验证了报告基因对iNos的准确度，并确认报告基因细胞与母细胞表现相似。然后，我们使用RAW:iNos-eGFP细胞跟踪不同体外乳腺癌模型中的巨噬细胞响应，并使用一种先前报道的嘧啶并（5,4-b）吲哚小分子PBI1，将它们从抗炎表型重新学习为促炎表型。使用两种小鼠乳腺癌细胞株4T1和EMT6，通过条件培养基、二维/单层共培养以及三维球体模型评估了对巨噬细胞的影响。虽然来源于4T1或EMT6细胞的条件培养基以及每种癌细胞与RAW:iNos-eGFP细胞的单层共同培养都导致荧光下降，但趋势和影响程度不同。我们还观察到，与基于4T1或EMT6的球体共同培养的巨噬细胞中iNos-eGFP信号下降。随后，我们展示了这些癌症模型中使用PBI1增强iNos的生产，跟踪增加的荧光信号。总体而言，这项研究证明了这种基于报告基因的方法提供了一种简便的方法，可以研究复杂、多组分环境中的巨噬细胞响应。除了此处所介绍的初始研究外，该平台可以与各种体外模型一起使用，并扩展到体内应用中进行活体成像。 版权所有 © 2023 Mas-Rosario、Medor、Jeffway、Martínez-Montes和Farkas。