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Microbiome
2023 Apr 21

BaptisteOosterlinck,...
Mucin-microbiome signatures shape the tumor microenvironment in gastric cancer.
Microbiome
我们的目标是确定黏液-微生物群落特征对胃腺癌肿瘤微环境和临床结果的影响。我们使用经过验证的基于黏液的RT-qPCR技术对108例胃腺癌和20例功能性消化不良症状进行高通量黏液表型分析,并进行免疫组织化学验证,并将数据与临床结果参数进行相关性分析。通过16S rRNA基因测序评估胃微生物群落,确定分类和社区组成,分析微生物网络,并与黏液表型和表达相关的元基因组进行推断。具有肠道型黏液环境或高水平MUC13表达的胃腺癌与不良生存率相关。相反,胃MUC5AC或MUC6的丰度与更有利的结果相关。口腔菌群Neisseria、Prevotella和Veillonella在具有肠和混合黏液表型的肿瘤中具有中心性,并与MUC13过度表达相关,突出了它们在GC中潜在驱动因子的作用。此外,在肠和混合黏液表型肿瘤中观察到密集的细菌网络,而由于较高的幽门螺杆菌丰度导致更低的多样性,在null黏液表型肿瘤中显示了最低的社区复杂性。口腔或肠道微生物的富集取决于黏液表型。更具体地说,肠道黏液表型肿瘤有利于建立形成强大共存网络的促炎性口腔菌群。我们的结果强调了黏液在胃癌预后和微生物网络塑造中的关键作用。特别是与异常MUC13表达相关的富集口腔菌群可以作为预测疾病结果的潜在生物标志物。视频摘要。©2023作者。
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Bone Research
2023 Apr 21

EunJungLee,KyoungJin...
Mobilization of monocytic myeloid-derived suppressor cells is regulated by PTH1R activation in bone marrow stromal cells.
Bone Research
来自骨髓的抑制性免疫细胞 - 骨髓源性抑制性细胞(MDSCs)存在于肿瘤微环境中,但MDSC从骨髓中迁移的机制尚不清楚。我们研究了PTH1R激活BM基质细胞如何促进MDSC的迁移。甲状旁腺激素(PTH)或肿瘤来源的PTH相关肽(PTHrP)通过PTH1R激活,能使小鼠BM中单核细胞(M-MDSCs)迁移,而不增加免疫抑制活性。体外细胞结合实验表明,M-MDSCs和成骨细胞分别表达α4β1整合素和血管细胞黏附分子(VCAM)-1,这是M-MDSCs与成骨细胞结合的关键。激活PTH1R后,成骨细胞表达VEGF-A和IL6,导致M-MDSCs中的Src家族激酶磷酸化。Src抑制剂抑制了PTHrP诱导的MDSC迁移,而M-MDSC中的Src激活上调了两种蛋白酶ADAM-17和MMP7,导致VCAM1脱落,从而破坏了M-MDSC对成骨细胞的牵引。总之,我们的数据提供了M-MDSC在肿瘤宿主骨中迁移的分子机制。© 2023. The Author(s).
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JAMA Otolaryngology-Head & Neck Surgery
2023 Apr 20

TuleenSawaf,CelinaGV...
Association of Social-Ecological Factors With Delay in Time to Initiation of Postoperative Radiation Therapy: A Prospective Cohort Study.
JAMA Otolaryngology-Head & Neck Surgery
手术后放射治疗(PORT)的及时启动与头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的复发率降低和总体生存率提高有关。目前缺乏社会生态变量与PORT延迟关联的测量。本前瞻性队列研究旨在评估个体和社区层面的因素与HNSCC患者PORT延迟的相关性。该研究于2018年9月至2022年6月在一所高等医疗中心的前瞻性登记处登记未接受治疗的HNSCC成年患者进行。在基线访问时获得人口统计学信息和经过验证的健康素养自我报告测量。记录临床数据,利用参与者的地址计算区域剥夺指数(ADI),这是一种社区层面社会易损性的衡量标准。分析接受初次手术和PORT的参与者。进行单变量和多变量回归分析,以识别PORT延迟的风险因素。手术治疗和PORT。主要结局是PORT启动延迟(手术后>42天)。使用个体水平(人口统计学、健康素养和临床数据)和社区水平信息(ADI和城乡连续码)评估PORT启动延迟的风险。在171名患者中,104名患者(60.8%)出现了PORT延迟。参与者的平均(标准差)年龄为61.0(11.2)岁,161名为白人(94.2%),105名为男性(61.4%)。保险基于雇主或公共,分别为65名(38.5%)和75名(44.4%)。平均(标准差)ADI(全国百分位数)为60.2(24.4),其中71名(41.8%)居住在农村地区。肿瘤部位最常见的是口腔(123例[71.9%]),其中108例(63.5%)为4期。在多变量分析中,将个体水平因素和健康素养与社区层面因素相结合的模型最能预测PORT延迟(AOC=0.78;R2、0.18)。这项队列研究提供了对包括健康素养和社区层面措施的PORT延迟预测因素的更全面评估。综合多层次措施的预测模型表现优于仅包括个体水平因素的模型,可指导精准干预降低HNSCC高风险患者的PORT延迟。
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Immunity & Ageing
2023 Apr 21

Yong-QiangAo,JianGao...
Tumor-infiltrating CD36+CD8+T cells determine exhausted tumor microenvironment and correlate with inferior response to chemotherapy in non-small cell lung cancer.
Immunity & Ageing
CD36清道夫受体被报告在浸润肿瘤的CD8+ T细胞中高表达,但其临床作用仍不明确。本研究旨在探讨NSCLC患者中CD36+ CD8+ T细胞的浸润和临床价值。在中山医院的232名NSCLC患者中进行免疫组化和免疫荧光分析,并进行生存分析和免疫学评估。进行流式细胞仪分析以评估来自新鲜肿瘤样本、非肿瘤组织和外周血的免疫细胞。进行离体肿瘤浸润淋巴细胞培养以测试CD36阻断的效果。在NSCLC的肿瘤组织中,CD36+ CD8+ T细胞的积累与更进阶的阶段(p < 0.001)、更大的肿瘤大小(p < 0.01)和淋巴结转移(p < 0.0001)相关。此外,CD36+ CD8+ T细胞的高浸润程度预示着存活率和无复发生存率的不良预后以及劣质化疗反应。CD36+ CD8+ T细胞显示出降低的GZMB(p < 0.0001)和IFN-γ(p < 0.001)以及升高的PD-1(p < 0.0001)和TIGIT(p < 0.0001)。肿瘤浸润免疫细胞景观的分析揭示了CD36+ CD8+ T细胞与Tregs(p < 0.01)和M2极化的巨噬细胞(p < 0.01)之间的正相关,但与Th1(p < 0.05)呈负相关。值得注意的是,CD36的抑制部分恢复了CD8+ T细胞的细胞毒素功能,产生更多的GZMB和IFN-γ。CD36+ CD8+ T细胞表现出免疫功能受损,CD36+ CD8+ T细胞的高浸润程度提示NSCLC患者的不良预后和劣质化疗反应。CD36可能成为与NSCLC患者化疗相结合的治疗靶点。©2023年作者。
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Bone & Joint Journal
2023 Apr 21

XuhaiZhao,CongJiang
The prediction of distant metastasis risk for male breast cancer patients based on an interpretable machine learning model.
Bone & Joint Journal
这项研究旨在比较不同机器学习(ML)模型和名词图表对预测男性乳腺癌(MBC)患者的远处转移能力,并使用SHapley Additive exPlanations(SHAP)框架解释最优ML模型。使用来自SEER数据库2010年至2015年的男性乳腺癌(MBC)患者数据和我们医院2010年至2020年的MBC患者数据开发了四种强大的ML模型。使用曲线下面积(AUC)和Brier评分评估不同模型的能力。应用Delong测试比较模型的性能。使用逻辑回归进行单变量和多变量分析。分析了2351名患者,其中168名(7.1%)有远处转移(M1),117名(5.0%)有骨转移,71名(3.0%)有肺转移。诊断时的中位年龄为68.0岁。大多数患者未接受放疗(1723,73.3%)或化疗(1447,61.5%)。 XGB模型是预测MBC患者M1的最佳ML模型。在十倍交叉验证(AUC:0.884;SD:0.02)、训练(AUC:0.907;95%CI:0.899-0.917)、测试(AUC:0.827;95%CI:0.802-0.857)和外部验证(AUC:0.754;95%CI:0.739-0.771)集中显示了最大的AUC值。它还在预测骨转移(训练集AUC:0.880,95%CI:0.856-0.903;测试集AUC:0.823,95%CI:0.790-0.848;外部验证集AUC:0.747,95%CI:0.727-0.764)和肺转移(训练集AUC:0.906,95%CI:0.877-0.928;测试集AUC:0.859,95%CI:0.816-0.891;外部验证集AUC:0.756,95%CI:0.732-0.777)方面表现出强大的能力。 XGB模型的AUC值大于名词图表在训练(0.907比0.802)和外部验证(0.754比0.706)集中的AUC值。 XGB模型比其他ML模型和名词图表更好地预测MBC患者的远处转移,此外,XGB模型对于预测骨转移和肺转移也具有强大的模型能力。与SHAP值相结合,可以帮助医生直观地了解每个变量对结果的影响。 © 2023年,作者。
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Bone & Joint Journal
2023 Apr 21

TIIonova,DMBuzanakov...
Quality of life in patients with primary hyperparathyroidism before and after parathyroidectomy: long term single center experience.
Bone & Joint Journal
原发性甲状旁腺功能亢进症(PHPT)是一种常见的内分泌失调,由于甲状旁腺肿瘤或增生引起,常伴有生活质量(QoL)受损。甲状旁腺切除术(PTX)是PHPT患者的首选标准治疗。在这项单中心研究中,我们旨在评估PHPT对患者QoL的影响,并在手术后的早期和长期随访中确定QoL的变化。所有患者均接受常规PTX,并切除疑似过度活跃的甲状旁腺(腺)组织。患者填写了通用的QoL调查问卷RAND SF-36、特定的PHPQoL问卷和特定的症状评估问卷PAS。在手术前入院时,手术后3个月、12个月和24个月,完成问卷调查。共纳入了92例PHPT患者(中位年龄为56岁,95.7%为女性)。在PTX手术前,患者的SF-36评分比健康对照组明显低(p<0.01)。近40%的患者QoL较差或非常较差。PAS在手术前的最常见症状如下:疲劳(97.8%的患者)、虚弱(94.6%)、健忘(94.6%)、情绪变化(90%)、感到“沮丧”/抑郁(88%)、关节疼痛(83.3%)、头痛(80.2%)、持续烦躁(77.2%)、骨痛(75%)、口渴(70.7%)和起床困难(67.4%)。一半的患者具有中度到严重(≥ 40分)的疲劳、虚弱、关节疼痛、健忘以及情绪变化。在72名患者中分析了术后QoL变化。与手术前相比,手术后所有SF-36问卷的评分(除了身体疼痛)和PHPQoL总分显着改善(GEE,p<0.01)。与基线值相比,疲劳、情绪变化、虚弱和健忘的严重程度在手术后显着减少(GEE,p<0.05)。 PHPQoL的心理成分降低(OR=0.927,95% CI=0.874-0.984,p=0.013)可预测手术后QoL的改善。PHPT患者身体、心理和社交功能明显受损,并经历了一系列常见的PHPT症状。成功的PTX伴随着显着的QoL改善和术后至少24个月的主观症状减轻。 © 2023年作者(们)。
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Protein & Cell
2023 Apr 22

ShaozhenXing,YuminZh...
Cell-free RNA for the liquid biopsy of gastrointestinal cancer.
Protein & Cell
胃肠道(GI)癌症包含许多癌症类型,如食管癌、肝癌、胃癌、胰腺癌和结直肠癌。作为GI癌症个体化医学的基石,基于非侵入性生物标志物的液体活检为早期诊断和动态治疗管理提供了有希望的机会。最近,越来越多的研究表明,游离RNA(cfRNA)作为一种新型的身体液体生物标志物具有潜力,如血液、唾液和尿液等。同时,基于高通量RNA检测技术的转录组不断发现新的cfRNA生物标志物。在本综述中,我们介绍cfRNA的起源和应用,描述其在液体活检中的检测和合格方法,并总结不同GI癌症类型中的广泛cfRNA生物标志物列表。此外,我们还讨论了cfRNA未来的研究,以克服其在临床应用中的局限性。该文章归类于:疾病和发展中的RNA > 疾病中的RNA。©2023 Wiley Periodicals LLC.
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Cell Death & Disease
2023 Apr 19

YiLi,ZhongminFan,QiJ...
Chaperone-mediated autophagy (CMA) alleviates cognitive impairment by reducing neuronal death in sepsis-associated encephalopathy (SAE).
Cell Death & Disease
脓毒症相关脑病(SAE)是脓毒症的常见且严重的并发症之一,会引起长期的神经系统缺陷,如认知损伤。尽管进行了广泛的研究,但仍缺乏治疗SAE的特定方法。伴随细胞自噬(CMA)是自噬的一种选择性类型,已被报道与许多神经退行性疾病中的认知功能障碍相关。本研究旨在调查SAE小鼠海马中CMA活性的变化,并探索增强CMA的神经保护作用。采用盲肠结扎穿孔(CLP)诱导SAE。在情境恐惧条件反射测试中,CLP小鼠的冻结时间比Sham组小鼠显著降低,表明SAE小鼠存在认知障碍。SAE小鼠海马神经元中的溶酶体相关膜蛋白2A(Lamp2a)和分子伴侣热休克型同源物71kDa蛋白(Hsc70),是CMA活性的阳性标志物,其表达下降。虽然通过腺相关病毒注射方式在海马神经元中过表达Lamp2a对脓毒症小鼠的生存率影响很小,但该干预措施显著缓解了情境恐惧条件反射测试、Y迷宫测试和新物体识别测试中的记忆障碍,并减轻了SAE小鼠中观察到的神经死亡。我们进一步证明,在海马中过表达Lamp2a增加了磷酸化环磷酸腺苷反应元件结合蛋白(p-CREB)、脑源性神经营养因子(BDNF)和B细胞淋巴瘤-2(Bcl-2)的表达,并抑制了cleaved caspase-3的表达。综上所述,我们的研究结果表明,上调CMA活性通过p-CREB-BDNF/Bcl-2信号转导途径部分缓解了SAE小鼠的认知障碍和神经元死亡,为SAE提供了潜在的治疗靶点。版权所有©2023 Elsevier Inc.
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Cell Death & Disease
2023 Apr 21

ElenaPapaleo,MatteoT...
TRAP1 S-nitrosylation as a model of population-shift mechanism to study the effects of nitric oxide on redox-sensitive oncoproteins.
Cell Death & Disease
S-亚硝基化是一种后翻译修饰,在此修饰中,一氧化氮(NO)与半胱氨酸的巯基结合,生成S-亚硝基硫醇(SNO)加合物。S-亚硝基化具有不同的生理作用,并且其改变还与越来越多的病理学联系在一起,包括癌症。SNO可以影响不同蛋白质的功能和稳定性,例如线粒体伴侣蛋白TRAP1。有趣的是,TRAP1的SNO位点(C501)靠近另一个半胱氨酸(C527)。这个特征表明S-亚硝基化的C501可以与TRAP1中的C527形成二硫键,类似于S-亚硝基化半胱氨酸与邻近半胱氨酸解离成二硫键的能力。我们使用增强采样模拟和体外生化分析来探究TRAP1 S-亚硝基化诱导的结构机制。我们表明,SNO位点诱导了邻近半胱氨酸的构象变化,并有利于产生适于二硫键形成的构象。我们使用高通量结构分析来研究4172个已知的S-亚硝基化蛋白质。此外,我们使用粗粒度模型对44个蛋白质靶标进行蛋白质柔性建模。这导致了1248个邻近半胱氨酸的鉴定,它们可以感知SNO位点的氧化还原状态,为氧化还原开关的生物学效应开辟了新的视角。此外,我们设计了两个生物信息学工作流程(https://github.com/ELELAB/SNO_investigation_pipelines),以确定伴随有结构注释的邻近半胱氨酸或邻近半胱氨酸对于一个SNO位点。最后,我们分析了与S-亚硝基化诱导的构象转换相关的肿瘤抑制因子或致癌基因的突变。我们将这些变异分类为中性、稳定、或不稳定,以考察其S-亚硝基化的倾向和群体转变机制。本文所采用的方法为未来新蛋白质候选者、突变分类的高通量研究提供了全面的工具箱,并为NO领域的研究社区提供了丰富的数据源。©2023年作者。
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Cell Death & Disease
2023 Apr 21

YuliThamiresMagalhae...
Downregulation of the Rho GTPase pathway abrogates resistance to ionizing radiation in wild-type p53 glioblastoma by suppressing DNA repair mechanisms.
Cell Death & Disease
胶质母细胞瘤(GBM)是最常见的侵袭性脑肿瘤,其特征为快速细胞浸润,通常采用电离辐射(IR)治疗,但治疗抗性不可避免地复发。胶质母细胞瘤细胞的肌动蛋白细胞骨架提供了其高侵袭性,但尚不清楚Rho GTP酶是否调节DNA损伤修复和治疗敏感性。在此,我们用不同p53状态的胶质母细胞瘤细胞照射,并探讨了Rho通路抑制对澄清肌动蛋白细胞骨架失调如何影响DNA损伤反应和修复途径的影响。p53野生型和p53突变型细胞经过C3毒素治疗的Rho GTP酶通路调节;沉默mDia-1、PFN1和MYPT1;或用F-肌动蛋白聚合抑制剂进行治疗。 Rho抑制通过增加DNA双链断裂的数量,并延迟p53野生型细胞的非同源末端连接DNA修复来增加胶质瘤细胞对IR的敏感性。p53沉默通过减少p21表达和Rho信号活性来逆转这种表型,而用PRIMA-1处理p53突变型细胞重新激活p53可以逆转这些效应。 p53和Rho之间的相互依赖基于通过G-肌动蛋白促进的核p53转位和IR增强的转位。单独的IR耐药p53野生型细胞表现出改变的形态和增加的应力纤维形成:Rho或肌动蛋白聚合抑制可以以p53依赖的方式降低细胞存活率并逆转耐药表型。 p53沉默逆转了Rho抑制诱导的IR耐药细胞的敏感化。Rho抑制还损害了3D球体模型中IR损伤DNA的修复。 Rho GTP酶活性和肌动蛋白细胞骨架动力学是GBM肿瘤野生型p53获得性耐药性逆转的敏感靶标。 ©2023年作者。
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