个体贫困与接受急性淋巴细胞白血病（ALL）维持治疗的儿童复发之间的关联仍不清楚。在COG-AALL03N1的二次分析中，我们使用来自美国人口普查局的数据将生活在年度特定联邦贫困门槛以下的患者进行分类，计算时使用自报的年度家庭收入和家庭规模。生活在联邦贫困门槛以下120%的参与者被归类为极端贫困。在调整相关预测因素后，我们使用多变量比例次分布危险回归法估计在接受ALL维持治疗期间生活在极端贫困中的患者的复发风险。在这项分析中的592位患者中，12.3%的患者生活在极端贫困中。在平均随访7.9年后，生活在极端贫困中的被研究者中，3年内复发的累积发生率明显较高（14.3%，95%置信区间[CI]=7.3-23.6），与未生活在极端贫困中的被研究者（7.6%，95%CI=5.5-10.1，P=0.04）相比。多变量分析显示，与未生活在极端贫困中的患者相比，生活在极端贫困中的儿童复发的危险性增加了1.95倍（95% CI=1.03-3.72，P=0.04）；加入种族/族裔后，这种关联得到缓解（危险比=1.68，95% CI=0.86-3.28，P=0.1），这可能是由于种族/族裔与贫困之间存在共线性。生活在极端贫困中的儿童中有更大比例的非遵从性硫唑嘌呤（57.1% vs 40.9%，P=0.04），然而，不良遵从并不能完全解释贫困和复发风险之间的关联。未来的研究需要了解极端贫困与复发风险之间的关联机制。临床试验号：NCT00268528。版权所有©2023美国血液学会。

使用新颖的工具，对影响部分肾切除（PN）后功能恢复的因素进行更严格的评估，这些工具允许分析更多的患者并提高评估实质体积损失的精度，从而揭示了继发因素（如缺血）的潜在影响。在进行PN（2012-14）的1140名患者中，有影像学和血清肌酐水平的670人（59％）符合纳入标准。恢复-缺血定义为同侧肾功能得到保存的GFR除以实质体积得到保存。通过Spectrum-Score评估急性肾损伤，该评分可量化暴露于缺血条件下的急性同侧肾功能障碍的程度，而这种障碍在对侧肾时可能被掩盖。采用多元回归分析以识别Spectrum-Score和恢复-缺血的预测因素。麻醉前热/冷/零缺血患者分别为409/189/72人，其中冷缺血和热缺血的中位缺血时间分别为30（IQR=25-42）和22（IQR=18-28）分钟。全局术前GFR和新基线GFR（NBGFR）的中位数分别为78（IQR=63-92）和69（IQR=54-81）毫升/分钟/1.73平方米。同侧肾的术前GFR和NBGFR的中位数分别为40（IQR=33-47）和31（IQR=24-38）毫升/分钟/1.73平方米。功能恢复与保留实质体积密切相关（r=0.83，p<0.01）。与PN相关的同侧肾GFR中位数下降为7.8（IQR=4.5-12）毫升/分钟/1.73平方米，其中81%的损失是由实质的丢失掉导致。冷/热/零缺血组的中位恢复-缺血分别为96（IQR=90-102）％，95（IQR=89-101）％和97（IQR=91-102）％。Spectrum-Score的独立预测因素是缺血时间，肿瘤复杂度和术前全局GFR。恢复-缺血的独立预测因素是胰岛素依赖性糖尿病，难治性高血压，热缺血和Spectrum-Score。PN后功能恢复的主要决定因素是实质体积的保留。更加稳健和严谨的评估使我们能够确定继发因素，包括合并症、增加的肿瘤复杂度和缺血相关因素，它们也独立地与功能恢复不良相关，但总体而言，它们的影响要小得多。本文受版权保护。版权所有。

针对临床(c)T4前列腺癌患者进行评估，这些患者是异质且研究不足的人群，通常出现局部晚期疾病和阻塞性症状，导致重大的病死率。我们分析了接受明确的局部治疗是否影响症状和肿瘤学结果。回顾性分析了1996-2020年在一家医疗机构接受治疗的154名cT4前列腺癌患者。采用有或无局部治疗（手术、放疗或两者）的系统治疗。采用Cox回归对临床病理特征（包括阻塞性症状）和接受局部治疗对总生存（OS）和疾病控制的关联进行了一元和多元分析。中位随访时间为5.9年。大多数患者是腺癌（88％），格里森9-10（77％）和中位基线前列腺特异性抗原（PSA）为20 ng / mL；大多数（54％）患有转移性cT4N0-1M1疾病； 24％的区域晚期cT4N1M0和22％的局部cT4N0M0疾病。局部治疗包括放疗（n = 44）、手术（n = 28）或两者（n = 9）。局部治疗与改善OS（危险比[HR] 0.3，P <0.001）、更长的局部复发自由期（HR 0.39，P = 0.002）、更少的局部进展（HR 0.41，P = 0.02）、发展中的阻塞性症状更少（HR 0.31，P = 0.01）以及死于局部疾病更少（HR 0.25，P = 0.002）有关。在多元分析中，局部治疗与改善生存有关（HR 0.58，P = 0.02），而转移性疾病（HR 2.93，P <0.001）或高风险病理（HR 2.05，P = 0.03）与生存较差有关。对于cT4前列腺癌的明确局部治疗即使对于具有转移性疾病的男性，也与改善症状结果和生存有关。在进行前瞻性评估之前，这些发现支持在特定情况下采用局部治疗进行cT4疾病的明确治疗。本文章受版权保护。保留所有权利。

差异转录使用(DTU)发生在同一基因产生的多个转录本的相对表达在不同条件下发生变化时。现有的检测DTU的方法通常依赖于计算过程，当样本数量增多时会出现速度和可伸缩性问题。在这里，我们提出了一种新的方法CompDTU，它使用组成回归来建模DTU分析中所感兴趣的每个转录本的相对丰度比例。这个过程利用了快速基于矩阵的计算使它非常适合于大样本量的DTU分析。此方法还允许测试和调整多个分类或连续协变量。此外，许多已有的DTU方法忽略了RNA测序数据中每个转录本的表达估计中的量化不确定性。我们扩展了CompDTU方法，结合RNA-seq表达量评估工具的常见输出，引入一种新的方法CompDTUme来整合量化不确定性。通过几个功率分析，我们展示了CompDTU具有良好的敏感性，并且相对于现有的方法减少了假阳性结果。此外，当对于具有高量化不确定性的基因有足够的样本量时，CompDTUme的表现也优于CompDTU，同时保持较快的速度和可伸缩性。我们使用癌症基因组图谱乳腺浸润性癌数据集的数据来激励我们的方法，具体使用740名乳腺癌患者的原发性肿瘤的RNA-seq数据。我们展示了我们的新方法大大减少了计算时间，以及在不同乳腺癌亚型之间检测数个显著DTU的新基因的能力。 ©由牛津大学出版社出版，版权所有。请发送电子邮件至journals.permissions@oup.com获得权限。

癌症是一种异质性疾病。有限混合回归（FMR）作为一种重要的异质性分析技术，在癌症研究中得到广泛应用，揭示了癌症结果/表型与协变量之间的重要差异。癌症FMR分析基于临床、人口统计学和组学变量。最近，另一种数据来源是组织病理学图像。组织病理学图像长期以来一直用于癌症诊断和分期。最近，已经证明使用自动数字图像处理管道提取的高维组织病理学图像特征对于建模癌症结果/表型是有效的。组织病理学成像环境交互作用分析已经得到进一步发展，以扩展癌症建模和基于组织病理学成像的分析范围。在癌症FMR分析的重要性和对更有效方法仍然有强烈需求的情况下，本文采用自然的下一步并基于低维临床/人口统计学/环境变量、高维成像特征及其交互开展了癌症FMR分析。与许多现有研究相辅相成，我们开发了一种贝叶斯方法，以适应高维度、筛选噪声、识别信号和尊重“主要效应、交互作用”变量选择层次。我们还开发了有效的计算算法，模拟显示提议方法的优势性能。在肺鳞状细胞癌的癌症基因组图谱数据分析中，我们得出了与替代方法不同的有趣结论。© 作者2021。由牛津大学出版社出版。保留所有权利。有关权限，请发送电子邮件至：journals.permissions@oup.com。

由于缺乏更安全、更有效的治疗方法，癌症仍然是世界范围内的主要死因。从新抗原开发的癌症疫苗是促进抗癌免疫反应的新兴策略。糖组学和糖蛋白组学的进步揭示了几个癌症特异性的糖基签名，这对提高有效的癌症糖基疫苗的潜力有着巨大的作用。然而，肿瘤的免疫抑制性质是疫苗免疫治疗的一个主要障碍。肿瘤相关的糖基的化学修饰、连接具有免疫原性的载体和与有力的免疫佐剂联合使用是应对这一瓶颈的新兴策略。此外，新型疫苗载体已经优化，以增强对原本免疫原性差的癌症表位的免疫反应。纳米载体已经显示出在淋巴结和肿瘤中对抗原呈递细胞（APCs）具有更高的亲和力，同时减少治疗毒性。利用APCs识别的糖基的设计进一步增强了抗原负荷的传递，提高了糖基疫苗诱导先天性和获得性免疫反应的能力。这些解决方案有望减少肿瘤负担，并产生免疫记忆。基于这一理由，我们提供了新兴癌症糖基疫苗的全面概述，强调纳米技术在这种情况下的潜力。我们还提供了一份向临床实施的路线图，展望了基于糖基的免疫调节癌症医学的进展。版权所有©2023 Elsevier Inc.

糖基化介导的蛋白质后翻译修饰对调节许多基本过程至关重要，如细胞分裂、分化、免疫应答和细胞间相互作用。调控蛋白质的N-或O-糖基化模式的改变，如转录因子或细胞受体，会导致许多疾病，包括癌症。这些变化导致肿瘤细胞的微观和宏观异质性。本文回顾了O-和N-糖基化在自身免疫和癌症中的调控作用和异常糖基化的研究。细胞糖复合物的变化可能来自于糖苷酶或糖基转移酶（如N-乙酰葡糖胺转移酶V、FUT8、ST6Gal-I、DPAGT1等）的表达变化，影响目标蛋白质的糖基化，导致细胞转化。此外，糖基基因的突变会影响免疫细胞上的糖基化模式，导致其他相关表现，如促炎症或抗炎症作用。近年来，对糖复合物与癌症的了解表明，它既可用于诊断/预后，也可用于免疫治疗。涉及到患者样本和癌症模型的蛋白组质谱学、位点和结构特异性的糖蛋白组学，以及转录组/基因组研究揭示了糖基化调控在癌症生物学中的重要性。新兴技术的发展，如凝集素微阵列，已经促进了糖类和糖基化结构与功能的研究。新开发的设备可以实现高通量、高速度和精确的异常糖基化研究。本文还讨论了糖基化的新兴技术和临床应用。版权所有©2023 Elsevier Inc.

需要对前列腺癌（PCa）患者进行盆腔淋巴结转移病（pN1）的术前评估，以确定是否有资格接受扩展盆腔淋巴结清扫（ePLND）。使用术前临床和组织病理学参数、磁共振成像（MRI）和前列腺特异性膜抗原（PSMA）正电子发射断层扫描（PET）开发一种新的直观预后评分表，用于预测初诊局部PCa患者的病理淋巴结（pN）状态。总共有700名接受机器人辅助根治性前列腺切除术和ePLND的符合条件的患者被包括在模型建立队列中。外部验证队列包括305名接受手术治疗的患者。采用逐步回归法选择变量，构建Amsterdam-Brisbane-Sydney评分表。使用接受者操作特征曲线下面积（AUC）、校准图和决策曲线分析评估最终模型的性能。模型随后在外部人群中得到验证。Amsterdam-Brisbane-Sydney评分表包括最初的前列腺特异性抗原值、MRI T分期、最高活检等级组（GG）、活检技术、临床意义PCa的系统性发现核心的百分比（GG≥2），以及PSMA-PET上的淋巴结状态。预测pN状态的AUC为0.81（95%置信区间[CI] 0.78-0.85）。在外部验证中，Amsterdam-Brisbane-Sydney评分表显示出比Briganti-2017和Memorial Sloan Kettering Cancer Center（MSKCC）评分表具有更优越的判别能力（AUC 0.75 [95% CI 0.69-0.81] vs 0.67 [95% CI 0.61-0.74]和0.65 [95% CI 0.58-0.72]，p<0.05），并且与Briganti-2019评分表的判别能力相似（AUC 0.78 [95% CI 0.71-0.86] vs 0.80 [95% CI 0.73-0.86]；p=0.76）。Amsterdam-Brisbane-Sydney评分表在外部验证中的校准表现出色，在阈值概率≥4%时具有增加的净收益。验证过的Amsterdam-Brisbane-Sydney评分表的性能优于Briganti-2017和MSKCC评分表，与Briganti-2019评分表相似或更好。此外，它适用于所有新诊断的不利中高危PCa患者。我们开发并验证了Amsterdam-Brisbane-Sydney评分表，用于预测手术前前列腺癌的淋巴结转移。该评分表的表现与目前所有可用的评分表相似或更优。版权所有©2023作者。Elsevier B.V.保留所有权利。

前列腺根治术后宏观局部复发（MLR）的治疗是一项具有挑战性的情况，不存在标准化的方法。我们的研究目的是评估功能影像引导的挽救性放疗（SRT）在前列腺床MLR患者中的疗效和安全性。在这个跨16个欧洲中心的国际多中心回顾性研究中，符合条件的患者最初接受了前列腺根治术（RP），用于治疗前列腺腺癌的局部或局部晚期腺癌，可选进行盆腔淋巴结清扫或不进行。术后4周检查前列腺特异性抗原（PSA）<0.1 ng/ml。所有患者均出现了生化复发，其定义是在两次测量中PSA水平增加≥0.2 ng/ml。只有在功能成像（多参数磁共振成像、正电子发射断层显像/计算机断层扫描[ PET / CT ]胆碱或PET / CT前列腺特异性膜抗原）可见的前列腺切除术床位MLR病变的患者有资格参加研究。在重新分期影像（CT和/或骨扫描和/或磁共振成像和/或PET）中，有淋巴结、骨或内脏转移的患者被排除在外。剂量升级的定义是在MLR床位或MLR处处方剂量>66 Gy。毒性使用不良事件终末点评分表第4.03版分类。主要终末点评价进展生存期（PFS）。次要结局是无转移生存期（MPFS）、生化进展生存期和总生存期。对生殖泌尿系统（GU）和胃肠道（GI）毒性进行了分析。2000年1月至2019年12月期间，310名患者至少接受了一次MLR剂量升级，而25名患者没有接受任何剂量升级。SRT前的中位PSA水平为0.63 ng/ml（四分位距[IQR]，0.27-1.7）。中位随访时间为54个月（IQR，50-56）。5年的PFS和MPFS分别为70%（95%置信区间[CI]：[64；75]）和84%（95% CI：[78；88]）。43例（12%）患者出现≥2级的GU和11例（3%）患者出现≥2级的GI迟发性毒性。当MLR病变处方剂量≥72 Gy时，接受至少一次剂量升级的患者5年PFS的改善发现（73% [95% CI：65-79] vs。[95% CI：48；70]; p = 0.03）。在这个集成功能成像数据的当代研究中，我们发现对于前列腺床MLR患者，在接受剂量升级≥72 Gy的情况下，SRT具有潜在的疗效和可接受的毒性。期望探索这种MLR剂量升级策略的前瞻性数据。本报告研究了在欧洲大规模人群中挽救性放疗用于前列腺癌和宏观复发的结果。我们发现，前列腺特异性抗原复发、格里森分数和剂量升级的结果不同。我们发现挽救性放疗在前列腺床宏观复发的剂量升级的潜在疗效，具有可接受的毒性剖面。版权所有©2023年欧洲泌尿科协会。由爱思唯尔出版有限公司出版。保留所有权利。

尽管针对编程死亡配体1和其受体的新型免疫检查点抑制剂已显示出对尿路上皮和肾细胞癌的适度反应，但前列腺癌患者的反应率仍然很低。目前尚未解决使用新型免疫治疗的患者的亚最优结果背后的因素。我们进行了一项非系统的协作叙述性综述，以突出最近的进展，以及导致泌尿生殖（GU）癌症抗肿瘤适应性免疫的关键调节因子的当前知识状态。此外，我们讨论了与三种癌症类型之一独特或具有重叠的临床相关性的治疗前和治疗后免疫学事件的发现。免疫功能下降是导致接受传统和新型免疫治疗的患者表现出亚最优结果的主要因素之一。与GU癌症中低响应相关的其他肿瘤免疫生物学方面包括总体肿瘤突变负荷，特定肿瘤抑制基因/DNA损伤修复基因（KDM6A、PTEN、STAG2、TP53、ATM和BRCA2）的突变以及多种功能状态的适应性免疫细胞的丰富程度及其在肿瘤免疫微环境中的时空定位。了解这些机制可能会导致预测和预测生物标志物（如免疫细胞浸润剖面和第三淋巴结结构（TLSs）），这些生物标志物与新型免疫治疗方法的性质有关，从而导致可变临床结果。实施更新的免疫监测技术和改进的临床前模型系统将增强我们对与免疫治疗反应性的差异贡献的宿主和肿瘤内在因素的了解。尽管在对肿瘤免疫景观中动态和静态适应性免疫元素的理解方面取得了巨大进展，但仍存在一些知识空白。因此，全面掌握的知识将导致精准免疫疗法、改进的药物序列和治疗反应。我们进行了一个多样化的领域专家的协作审查，研究了癌细胞与患者免疫系统之间的事件和交流，这些事件和交流与新型免疫治疗的反应相关。在治疗前后的肿瘤内在和宿主相关的免疫变化不断更新的理解将有助于发现免疫治疗反应的有希望的标志物，以及开发用于管理泌尿生殖系统癌症的独特治疗方法。 2023年 The Author(s) 版权所有，由 Elsevier B.V. 发布。保留所有权利。