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Frontiers in Pharmacology
2023

YuxuanXia,ShengJin,Y...
Small-molecule BCL6 inhibitor protects chronic cardiac transplant rejection and inhibits T follicular helper cell expansion and humoral response.
Frontiers in Pharmacology
背景:B细胞淋巴瘤6(BCL6)是调节体液免疫反应的T激活辅助细胞(Tfh)细胞重要的转录因子,通过支持生发中心B细胞和浆细胞的成熟来调节体液免疫反应。本研究旨在调查T激活辅助细胞的扩展以及BCL6抑制剂FX1在急性和慢性心脏移植排异模型中的效果。方法:建立了急性和慢性心脏移植排异的小鼠模型。移植后的不同时间点收集脾细胞,通过流式细胞术检测CXCR5+PD-1+和CXCR5+BCL6+ Tfh细胞。随后,我们使用BCL6抑制剂FX1处理心脏移植物,并记录移植物的存活情况。对心脏移植物进行了苏木精-伊红、Elastica van Gieson和Masson染色以进行病理学分析。此外,还通过流式细胞术检测脾脏中CD4+ T细胞,效应器CD4+ T细胞(CD44+CD62L-),增殖性CD4+ T细胞(Ki67+)和Tfh细胞的比例和数量,以及与体液反应有关的细胞(浆细胞,生发中心B细胞,IgG1+ B细胞)和特异性供体抗体。结果:我们发现Tfh细胞在移植后的第14天显著增加。在急性心脏移植排异期间,即使BCL6抑制剂FX1没有延长心脏移植物的存活时间或减轻免疫反应,也能抑制Tfh细胞的扩张。在慢性心脏移植排异期间,FX1延长了心脏移植物的存活时间,并防止了心脏移植物中血管的闭塞和纤维化。FX1还减少了慢性排斥小鼠脾脏中CD4+ T细胞,效应器CD4+ T细胞,增殖性CD4+ T细胞和Tfh细胞的比例和数量。此外,FX1还抑制了脾脏中浆细胞,生发中心B细胞,IgG1+ B细胞和特异性供体抗体的比例和数量。结论:我们发现BCL6抑制剂FX1可以保护慢性心脏移植排异,并抑制Tfh细胞和体液免疫反应的扩张,这表明BCL6是治疗慢性心脏移植排异的潜在治疗靶点。Copyright © 2023 Xia, Jin and Wu.
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CRITICAL CARE MEDICINE
2023 Apr 03

SamuelBSnider,Michae...
Clinical and Electroencephalographic Predictors of Seizures and Status Epilepticus in 12,450 Critically Ill Adults: A Retrospective Cohort Study.
CRITICAL CARE MEDICINE
癫痫状态(SE)的发病率和死亡率显著高于孤立性癫痫。我们的目标是确定与SE和癫痫相关的临床诊断和节律和周期性脑电图模式(RPP)。回顾性队列研究。三级护理医院。 12,450名成人住院患者在关键护理EEG监测研究联盟数据库的特定参与站点接受连续脑电图(cEEG)监测(2013年2月至2021年6月)。不适用。在cEEG的前72小时内,我们定义了一个顺序结果:无癫痫,孤立的癫痫而无SE,或SE(伴随孤立的癫痫或无癫痫)。组合组包括孤立的癫痫或SE(AnySz)和无癫痫或孤立的癫痫。在这个队列中(平均年龄:60±17岁),1,226名患者(9.8%)有AnySz,439名患者(3.5%)有SE。在多元模型中,独立与SE相关的因素包括心脏停搏(有SE的9.2%;调整后的几率比8.8 [6.3-12.1]),cEEG前的临床癫痫(5.7%;3.3 [2.5-4.3]),脑肿瘤(3.2%;1.6 [1.0-2.6]),侧化周期性放电(LPDs)(15.4%;7.3 [5.7-9.4]),短暂潜在的癫痫性节律放电(BIRDs)(22.5%;3.8 [2.6-5.5])和广泛性周期性放电(GPDs)(7.2%;2.4 [1.7-3.3])。所有上述变量和侧化节律性三角洲活动(LRDA)也与AnySz相关。同时增加SE和孤立性癫痫几率的因素包括心脏停搏(7.3 [4.4-12.1]),临床癫痫(1.7 [1.3-2.4]),GPDs(2.3 [1.4-3.5])和LPDs(1.4 [1.0-1.9])。与孤立性癫痫相比,LRDA的SE几率较低(0.5 [0.3-0.9])。RPP修饰物并未改善SE预测超出RPP存在/不存在的范围(p = 0.8)。利用现有最大的cEEG数据库,我们确定了SE(心脏停搏,cEEG前的临床癫痫,脑肿瘤,LPDs,GPDs和BIRDs)和癫痫(所有先前和LRDA)的特定预测因子。这些发现可用于为重症患者量身定制cEEG监测。版权所有©2023年由危重病医学协会和Wolters Kluwer Health,Inc.保留所有权利。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Apr 03

ChristopherBusayoOlo...
Multi-regulator of EZH2-PPARs Therapeutic Targets: A Hallmark for Prospective Restoration of Pancreatic Insulin Production and Cancer Dysregulation.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
癌症和糖尿病统计数据的意外上升已成为重大的全球威胁,引发了针对各种生物标志物的不断研究,这些标志物可以作为创新的治疗靶点,用于管理这些疾病。最近发现了EZH2-PPARs的调节功能如何影响代谢和信号通路,从而促进了这种疾病,这是一项重大的突破,在GSK-126和贝嘌呤酸等抑制剂的协同作用下,用于治疗这些疾病。然而,并未报告有关参与相关副作用的其他蛋白质生物标志物的发现。由于这项虚拟研究,我们确定了EZH2-PPARs和其他调节胰腺癌和糖尿病病理的蛋白质生物标志物之间的基因疾病关联和蛋白质相互作用网络,ADME/毒性剖析,一些自然产物的配体模拟和密度泛函理论。结果表明,在调查的生物标志物中,肥胖和高血压疾病之间存在相关性。同时,预测的蛋白质网络验证了与癌症和糖尿病的联系,筛选出九种自然产物,具有多种靶点的结合能力。在所有自然产物中,植物内醇A在药物类似性轮廓的体外验证中表现优异,优于标准药物(GSK-126和贝嘌呤酸)。因此,这些自然产物被最终建议进行额外的实验筛选,以补充关于它们在针对EZH2-PPARs的新靶点进行糖尿病和癌症治疗的药物开发方面的实用性结果。©2023年。根据Springer Science+Business Media,LLC的独家许可,属于Springer Nature。
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Epigenetics & Chromatin
2023

BethanyCKennedy,Isaa...
Migration of stem-like CD8 T cells between tissue microenvironments underpins successful anti-tumour immune responses.
Epigenetics & Chromatin
免疫检查点阻断治疗在一些患者中取得了临床成功,改变了癌症治疗方法,并提供了持久的治愈反应的希望。根据对慢性感染的研究,现在已经详细描述了肿瘤浸润淋巴细胞的组成,特别是精疲力竭的CD8 T细胞的光谱,对其表型、功能、转录调控甚至表观遗传变化进行了轮廓。然而,仍不清楚肿瘤内免疫细胞如何与外围人群交互,不仅是在癌症中维持反应方面,还在于建立可以提供长期保护的系统性记忆反应。在这里,我们将简要回顾目前对抗肿瘤反应的理解,考虑支持关键细胞亚群的组织微环境,以及细胞之间的迁移对反应的影响程度。 ©作者(2023年)。由英国免疫学协会代表牛津大学出版社出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Apr

DanLiao,XiaomeiLiu,L...
Comprehensive bioinformatics analysis of the expression, prognostic value, and immune infiltration of chromobox family members in cervical cancer.
Epigenetics & Chromatin
宫颈癌(CC)是世界范围内女性第四常见的癌症类型,被认为是导致肿瘤相关死亡和恶性瘤的主要原因。作为表观遗传控制中复杂体的一部分,染色质盒(CBX)家族蛋白质已被发现在防止分化和增加增殖方面在恶性肿瘤的生长中发挥作用。在这里,通过彻底的调查,我们调查了患有CC的患者中CBX的表达、预后意义和免疫浸润。使用TIMER、Metascape、STRING、GeneMANIA、cBioPortal、UALCAN、The Human Protein Atlas、Gene Expression Profiling Interactive Analysis(GEPIA)和Oncomine,检查了患有CC的患者中CBX的差异表达、临床病理参数、免疫细胞浸润、富集分析、遗传改变和预后价值。在CC组织中,CBX 2/3/4/5和CBX 8的表达水平明显较高,而CBX 6/7的表达水平较低。在CC中,CBX 5/6/8启动子具有较高的甲基化水平。CBX 2/6/8的表达与病理分期有关。观察到不同表达CBX基因的37%突变率。此外,CBX的表达与免疫细胞浸润如T细胞CD4+、巨噬细胞、中性粒细胞、B细胞、T细胞CD8+和树突状细胞之间存在强相关性。研究发现CBX家族成员可能是CC患者的治疗靶点,并在CC肿瘤的发展中发挥重要作用。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Mar 15

MarinaASenchukova
Genetic heterogeneity of colorectal cancer and the microbiome.
Epigenetics & Chromatin
2020年,国际癌症研究机构和世界卫生组织的GLOBOCAN数据库将结直肠癌(CRC)评为全球第三大常见癌症。大多数CRC病例(> 95%)为散发性,来源于可以进展为粘膜内癌和CRC的结直肠息肉。越来越多的证据表明,肠道微生物群落在CRC的发生和进展以及CRC的治疗中可以发挥关键作用,作为重要的代谢和免疫调节因子。决定微生物群落在CRC致癌中的因素包括炎症、肠道干细胞功能的变化、细菌代谢产物对肠粘膜的影响、基因突变的积累和其他因素。在本文中,我讨论了散发性CRC发展的主要机制,提供了与CRC最常关联的细菌的详细特征,并分析了微生物组和微生物代谢产物在炎症启动、促进肠上皮和干细胞的增殖活动以及CRC遗传和表观遗传变化中的作用。我认为在这个方向上开展长期研究非常重要,因为它们为CRC的治疗和预防开辟了新的机会。©作者(们)2023。由百世登出版集团公司出版。版权所有。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Apr 03

MarikaFujita,Masanor...
Detection of CpG methylation level using methyl-CpG-binding domain-fused fluorescent protein.
Epigenetics & Chromatin
胞嘧啶在CpG二核苷酸上甲基化成5-甲基胞嘧啶,是与基因表达调控密切相关的表观遗传学修饰中最常研究的一种。正常组织中,组织特异性的CpG甲基化模式是在发育期间建立的。相反,异常细胞(如癌细胞)中观察到甲基化模式的改变。已经鉴定了癌症特定的CpG甲基化模式,并被用作癌症诊断的生物标志物。在本研究中,我们开发了一种基于杂交的CpG甲基化水平传感系统,使用一个甲基化CpG结合结构域(MBD)融合的荧光蛋白质。在这个系统中,目标DNA通过互补的甲基化探针DNA捕获。当目标DNA被甲基化时,在双链DNA中形成对称甲基化的CpG。MBD特异性识别双链DNA上对称甲基化的CpG,因此通过测量绑定MBD融合荧光蛋白质的荧光强度来量化甲基化水平。我们制备了MBD-AcGFP1融合蛋白质,并使用MBD-AcGFP1量化了针对SEPT9、BRCA1和长间隔核元素-1(LINE-1)的目标DNA的CpG甲基化水平。这一检测原理可以应用于同时并全基因组修饰碱基检测系统,使用融合于荧光蛋白质的修饰碱基结合蛋白质的微阵列。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Apr 03

JinchengLiu,YunhaoYo...
WTAP-Mediated m6A RNA Methylation Regulates the Differentiation of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells via the miR-29b-3p/HDAC4 Axis.
Epigenetics & Chromatin
甲基化N6-腺嘌呤(m6A)是一种众所周知的修饰方式,具有新的表观遗传学功能,并已被报道参与骨质疏松症(OP)的进展,为OP的发病机制提供了新的见解。然而,作为m6A甲基化的关键组分,威廉姆斯瘤1相关蛋白(WTAP)尚未在OP中进行研究。在这里,我们探讨了WTAP在OP和骨髓间充质干细胞(BMMSCs)分化中的生物学作用和潜在机制。我们证明了WTAP在患有OP和去卵巢小鼠的骨标本中表达水平较低。在功能上,WTAP在体内外促进了BMMSCs的成骨分化并抑制了脂肪分化。此外,微RNA-29b-3p(miR-29b-3p)被鉴定为WTAP的下游靶标。WTAP介导的M6A修饰导致miR-29b-3p表达增加。WTAP与microprocessor蛋白DGCR8相互作用并以m6A依赖的方式加速pri-miR-29b-3p的成熟。目标预测和双荧光素酶报告分析确定miR-29b-3p与组蛋白去乙酰化酶4(HDAC4)的直接结合位点。WTAP介导的m6A修饰通过miR-29b-3p/HDAC4轴促进BMMSCs的成骨分化并抑制脂肪分化。此外,WTAP介导的m6A甲基化负向调节成骨细胞的分化。综上,我们的研究首次确定了WTAP介导的m6A甲基化在BMMSC分化中的关键作用,并将WTAP作为OP治疗的潜在治疗靶点。©作者(S)2023年,由牛津大学出版社出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Apr 03

MengLiu,QinLiu,Qiang...
The composition and roles of gastric stem cells in epithelial homeostasis, regeneration, and tumorigenesis.
Epigenetics & Chromatin
胃部上皮内衬经历了快速更新过程以维持其结构和功能完整性,这一过程由驻留在幽门和胃体腺中的长寿命干细胞推动。已经确定了几个不同亚群的胃干细胞,它们的表型和功能多样性与干细胞微环境的时空规范有关。我们在此回顾胃干细胞在不同位置的家庭平衡状态下的生物特征,这一特征是由报告小鼠、谱系追踪和单细胞测序所证明的。我们还回顾了胃干细胞在应对损伤时上皮再生中所扮演的角色。此外,我们还讨论了新兴证据表明,胃干细胞中癌基因驱动器的累积或干性信号通路的改变会促进胃癌的发生。鉴于微环境的基本作用,本文强调了在病理条件下重编程干细胞命运的微环境构成和信号通路在控制干细胞命运方面的作用。提出了几个未解决的问题,如干细胞的异质性和可塑性以及表观遗传调控机制与幽门螺杆菌感染引发的变态反应-癌变级联的相关性等。随着时空基因组学、转录组学和蛋白质组学的发展,以及多重筛选和追踪方法,我们预计在不久的将来将更精确地定义和表征胃干细胞及其与它们的微环境的相互作用。合理地开发和正确地转化这些发现可能带来用于上皮细胞再生和癌症治疗的新方法。©2023 Springer Nature Switzerland AG。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Mar 15

Yi-BingZhang,Yong-Ru...
Possible mechanisms associated with immune escape and apoptosis on anti-hepatocellular carcinoma effect of Mu Ji Fang granules.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
肝细胞癌(HCC)是全球死亡率较高的常见消化系统癌症之一。木香芳颗粒剂(MJF)的主要成分为生物碱、黄酮类和多糖类。 MJF已经在临床治疗乙型肝炎、肝硬化和肝细胞癌方面使用了30多年。以往的研究很少关注MJF在治疗肝细胞癌的肿瘤免疫学机制。本研究旨在探讨MJF在肝细胞癌治疗中对肿瘤免疫学的作用机制。使用分子网络相关的高性能液相色谱-电子喷雾离子化-飞行时间-质谱法鉴定MJF的可吸收成分,并利用网络药理学和通路富集分析筛选出潜在的抗HCC靶点。将40只雄性小鼠在口服应用MJF7天后随机分为空白组、模型组和MJF组(1.8、5.4和10.8 g / kg / d)。计算平均体重增长量、脾脏和胸腺指数。用苏木精和伊红染色肿瘤组织,并用酶联免疫吸附试验测量干扰素γ(IFN-γ)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素-2、天冬氨酸氨基转移酶、丙氨酰转移酶、甲胎蛋白(AFP)、Fas和FasL等指标。利用实时荧光定量PCR评估相关Bax和Bcl2 mRNA表达,利用Western印迹评估转化生长因子β1(TGF-β1)和Decapentaplegic同源蛋白4(SMAD4)等蛋白的表达。将HepG2细胞系用10mg/mL、20mg/mL、30mg/mL、40mg/mL的MJF处理,另外3个组用TGF-β1抑制剂(LY364947)和不同剂量的MJF处理。利用实时荧光定量PCR评估相关的TNF-α、IFN-γ、Bax和Bcl2 mRNA表达,利用Western印迹评估TGF-β1、SMAD2、p-SMAD2、SMAD4和SMAD7等蛋白的表达。MJF可以提高H22肿瘤负荷小鼠的体重增长和肿瘤抑制率,保护免疫器官和肝功能,降低HCC指标AFP,影响免疫和细胞凋亡,通过增加TGF-β1、SMAD2、p-SMAD2和SMAD4的相对表达和降低SMAD7来上调TGF-β1 / SMAD信号通路,减少免疫因子TNF-α和IFN-γ,减少凋亡因子Fas、FasL和Bcl2 / Bax,并抑制HepG2细胞中LY364947的效应。MJF通过激活TGF-β1 / SMAD信号通路,影响免疫和凋亡细胞因子来抑制HCC,这可能是MJF调节免疫逃避和细胞凋亡。 ©作者(s) 2023。 百世登出版集团股份有限公司。版权所有。
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