背景：虽然抗PD-1/PD-L1免疫疗法具有显著的生存益处，但非小细胞肺癌（NSCLC）仍然是全球最常见的肿瘤和癌症相关死亡的主要原因之一。因此，急需确定该难治性疾病的新治疗靶点。方法：本研究通过Venn图集成了微阵列数据集GSE27262，GSE75037，GSE102287和GSE21933。我们使用R进行功能聚类和通路富集分析。通过STRING数据库和Cytoscape，我们进行了蛋白质相互作用（PPI）网络分析，并确定了关键基因，这些基因通过GEPIA2和UALCAN门户网站进行了验证。通过定量实时聚合酶链式反应和Western blotting验证了肌动蛋白结合蛋白anillin（ANLN）。此外，使用Kaplan-Meier方法计算了存活分析。结果：共鉴定了126个差异表达基因，这些基因富集于有丝分裂核分裂、有丝分裂细胞周期G2/M转换、血管生成、纺锤体和过氧化物酶激活受体信号通路。在PPI网络复合物中鉴定了12个中心节点基因。存活分析显示，高转录水平与NSCLC患者劣质生存相关。进一步探讨了ANLN的临床意义；其蛋白表达呈逐渐增加的趋势，从一级到三级。结论：这些重要基因可能参与NSCLC的癌变和进展，可能为NSCLC的诊断和治疗提供有用的靶点。Copyright © 2023 Lai，Ren，Huai，Liu，Liu，Wang和Mei。

背景: 近年来，肿瘤免疫治疗已成为三阴性乳腺癌（TNBC）的可行治疗选择。其中，免疫检查点抑制剂（ICIs）在PD-L1阳性表达的晚期TNBC患者中表现出良好的疗效。然而，只有63％的PD-L1阳性个体从ICIs中获益。因此，寻找新的预测性生物标志物将有助于确定哪些患者可能从ICIs中受益。在本研究中，我们使用液体活检和下一代测序（NGS）动态检测接受ICIs治疗的晚期TNBC患者血液中的循环肿瘤DNA（ctDNA）的变化，并关注其潜在的预测价值。 方法：从2018年5月至2020年10月，在山东省肿瘤医院接受ICIs治疗的晚期TNBC患者进行了前瞻性纳入。患者的血液样本在治疗前基线、第一次反应评估和疾病进展时间点进行获取。此外，通过NGS评估了457个与癌症相关的基因，并确定了患者的ctDNA突变、基因突变率和其他指标，并与临床数据进行统计分析。 结果：本研究共纳入11例TNBC患者。总体客观缓解率（ORR）为27.3％，中位无进展生存期（PFS）为6.1个月（95％置信区间：3.877-8.323个月）。在11个基线血样本中，发现了48个突变，最常见的突变类型是移码插入/缺失、同义单核苷酸变异（SNVs）、移码插入/错义、剪接和启动子改变。此外，单变量Cox回归分析表明，携带12种突变基因之一（CYP2D6缺失和GNAS、BCL2L1、H3F3C、LAG3、FGF23、CCND2、SESN1、SNHG16、MYC、HLA-E和MCL1增益）的晚期TNBC患者使用ICI治疗的PFS较短（p <0.05）。在一定程度上，ctDNA的动态变化可能指示ICI的疗效。 结论：我们的数据表明，携带12种突变的ctDNA基因可能预测晚期TNBC患者的ICI疗效。此外，外周血ctDNA的动态变化可能用于跟踪晚期TNBC患者的ICI疗法的有效性。版权所有©2023 Tan、Chi、Su、Zhou、Zhou、Zheng、Man、Sun、Huang和Li。

背景：肿瘤免疫的特征之一是免疫抑制性肿瘤微环境（TME）。本研究使用TME基因签名来定义宫颈鳞状细胞癌（CESC）免疫亚型的特征并构建一个新的预后模型。方法：使用单样本基因集富集分析（ssGSEA）来量化通路活性。从癌症基因组图谱（TCGA）数据库获取了291个CESC的RNA-seq作为训练集。从基因表达编译（GEO）数据库获取了400个CESC的基于微阵列的数据作为独立验证集。参考以前的研究，29个与TME相关的基因签名被选中。采用Consensus Cluster Plus来鉴定分子亚型。使用单因素Cox回归分析和随机生存森林（RSF）来建立基于TCGA数据集的CESC免疫相关基因风险模型，通过GEO数据集验证预后预测的准确性。使用ESTIMATE算法对数据集进行了免疫和基质评分。结果：由于29个TME基因签名，TCGA-CESC筛选出3个分子亚型（C1、C2、C3）。其中，C3具有更好的生存结局，具有更高的免疫相关基因签名，而C1具有更坏的预后时间，具有增强的基质相关特征。C3中观察到增强的免疫浸润、抑制肿瘤相关通路、广泛的基因组突变和易感免疫治疗等现象。此外，构建了一个由五个免疫基因组成的签名，并预测了CESC的总体生存率，在GSE44001数据集中成功验证。观察到五个枢纽基因表达和甲基化之间存在积极的现象。类似地，高基质相关特征组富集了在低组富集了免疫相关基因签名。免疫细胞、免疫检查点基因表达水平与大多数TME基因签名与风险评分呈负相关，而高组更敏感于耐药性。结论：本文鉴定出三个不同的免疫亚型和一个由五个基因组成的签名，用于预测CESC患者的预后，为CESC提供了一个有前途的治疗策略。版权所有©2023年胡，张，张，黄和李。

目的：本研究旨在探讨玻璃化/复苏过程对人卵巢组织mRNA转录组的影响。设计：人卵巢组织经过玻璃化（T组）处理后，接受RNA测序（RNA-seq）分析、HE、TdT介导的dUTP末端标记（TUNEL）、实时定量PCR检测，并与新鲜组（CK组）进行结果比较。结果：共有12名年龄在15-36岁之间、平均反睾酮激素水平为4.57±3.31 ng/mL的患者被纳入研究。根据HE和TUNEL结果，玻璃化有效地保存了人卵巢组织。CK组和T组之间确定452个明显的基因失调（|log2FoldChange| > 1和p < 0.05）。其中，329种上调和123种下调。共有372种基因高度富集于43个通路（p < 0.05），主要与系统性红斑狼疮、细胞因子-细胞因子受体相互作用、TNF信号通路、MAPK信号通路相关。与CK组相比，T组中IL10、AQP7、CCL2、FSTL3和IRF7均显著上调（p < 0.01），而IL1RN、FCGBP、VEGFA、ACTA2和ASPN显著下调（p < 0.05），这与RNA-seq分析的结果相符。结论：这些结果首次表明，玻璃化可诱导人卵巢组织mRNA表达的变化。需要进行进一步的分子研究，以确定改变的基因表达是否会导致任何下游后果。版权所有 © 2023 Gu、Ge、Huang、Fu、Zhang、Wang、Xu、Li、Peng、Zou、Sun和Sun。

Tenascin-X（TNX）是一种细胞外基质糖蛋白，缺乏会导致隐性的经典型埃勒斯-丹洛斯综合症（clEDS），一种遗传性结缔组织紊乱，具有可伸展的皮肤、无萎缩疤痕、关节过度活动和易淤血的特征。值得注意的是，clEDS患者不仅患有慢性关节疼痛和慢性肌肉痛，还会出现神经系统异常，如周围神经痛和轴突多发性神经病高发率。最近，我们使用Tnxb - / -小鼠，这是一个已知的clEDS模型动物，表明Tnxb - / -小鼠对化学刺激过敏，并因髓鞘A-纤维的过敏和脊髓后角的激活而发展机械痛觉过敏。其他类型的EDS也会出现疼痛症状。首先，我们回顾了EDS的疼痛机制，特别是clEDS的机制。此外，已经报道了TNX作为癌症进展的肿瘤抑制蛋白的作用。最近的大规模数据库分析表明，TNX在各种肿瘤组织中下调，并且肿瘤细胞中TNX的高表达预后良好。我们描述了目前所知道的TNX作为肿瘤抑制蛋白的情况。此外，一些clEDS患者有延迟愈合的创伤。Tnxb - / -小鼠的角膜上皮愈合也受到损伤。TNX还参与肝纤维化。我们描述了由TNX的纤维蛋白原相关结构域肽和整合素α11表达诱导的COL1A1的分子机制。Copyright © 2023 Okuda-Ashitaka and Matsumoto.

肝细胞癌是最常见的肝癌类型，具有较高的发病率和死亡率。传统的肝细胞癌诊断方法主要基于临床表现、影像特征和组织病理学。随着人工智能（AI）的快速发展，其越来越广泛地用于肝细胞癌的诊断、治疗和预后预测，自动化的肝细胞癌状态分类方法表现出了很大的前景。AI整合了标记的临床数据，训练相同类型的新数据并执行解释任务。一些研究表明，AI技术可以帮助临床医生和放射科医生更有效率地工作并降低误诊率。然而，AI技术的涵盖范围使得在特定问题和情况下选择哪种类型的AI技术变得困难。解决这个问题，可以显著减少确定所需医疗方法所需的时间并为不同问题提供更精确和个性化的解决方案。在我们的研究综述中，我们总结了现有的研究成果，根据DIKW框架对这些结果进行了比较和分类。版权所有©2023 Shen、Wu、Su、Yao、Huang、Zhang、Jiang、Yu和Li。

先进的基因组和分子分析技术加速了对癌症发展和进展背后的调控机制以及患者定向治疗的认识。近年来，大量的生物信息研究推动了分子生物标志物的发现。癌症是全球主要死亡原因之一。阐明乳腺癌（BRCA）基因组和表观遗传因子可以提供揭示疾病机制的路线图。因此，揭示-组学数据类型之间可能的系统联系及其对BRCA肿瘤进展的贡献至关重要。在这项研究中，我们开发了一种基于机器学习（ML）的多组学数据分析集成方法。这种集成方法结合了基因表达（mRNA）、微型RNA（miRNA）和甲基化数据的信息。由于癌症的复杂性，这种集成数据有望通过这三组学数据集之间仅可用的模式来改善疾病的预测、诊断和治疗。此外，所提出的方法弥合了驱动疾病发病和进展的疾病机制之间的解释差距。我们的基础贡献是三组学集成工具（3Mint）。该工具旨在使用生物学知识进行分组和打分。另一个重要目标是通过检测新的交叉组学生物标志物组来改善基因选择。 3Mint的性能使用不同的度量进行评估。我们的计算性能评估显示，与使用miRNA和mRNA基因表达谱的miRcorrNet工具相比，3Mint仅使用较少的基因对BRCA分子亚型进行分类，具有类似的性能度量（95%的准确性）。3Mint加入甲基化数据可以得到更加聚焦的分析。 3Mint工具以及所有其他附加文件均可在https://github.com/malikyousef/3Mint/上获得。Copyright © 2023 Unlu Yazici, Marron, Bakir-Gungor, Zou and Yousef.

聚乙二醇化精氨酸去亚氨基酶（ADI-PEG20；pegargiminase）能够耗尽精氨酸，并改善缺乏精氨酰琥珀酸合酶1（ASS1）的恶性胸膜间皮瘤（MPM）患者的生存结果。优化基于ADI-PEG20的治疗需要更深入地了解抵抗机制，包括肿瘤微环境介导的机制。在这里，我们试图反向翻译通过PEGargiminase治疗复发的ASS1缺乏的MPM患者中增加的肿瘤巨噬细胞浸润。通过流式细胞术分析了ADI-PEG20处理的巨噬细胞-MPM肿瘤细胞系（2591、MSTO、JU77）共培养。对ADI-PEG20处理的MPM肿瘤细胞进行了基因表达谱分析的微阵列实验，并使用qPCR、ELISA和LC/MS验证巨噬细胞相关的基因“突变”。使用PEGargiminase治疗的MPM患者的血浆进行细胞因子和精氨酰琥珀酸分析。我们发现ASS1表达的巨噬细胞促进了ADI-PEG20处理的ASS1阴性MPM细胞系的存活能力。微阵列基因表达数据揭示了ADI-PEG20处理的MPM细胞系中一种优势的CXCR2依赖性趋化表征和VEGF-A和IL-1α的共表达。我们确认巨噬细胞中的ASS1是IL-1α诱导的，并且亚氨基琥珀酸浓度在细胞上清中翻了一倍，足以在ADI-PEG20的共培养条件下恢复MPM细胞的存活。为进一步验证，我们检测到PEG-ARG银杏酸治疗的MPM患者的血浆VEGF-A和CXCR2依赖性细胞因子升高，以及亚氨基琥珀酸的增加。最后，在MSTO异种移植小鼠模型中，脂质体克洛德龙可以减少ADI-PEG20驱动的巨噬细胞浸润，并显著抑制生长。总之，我们的数据表明，ADI-PEG20可诱导的细胞因子通过巨噬细胞协同精氨酰琥珀酸燃料来对抗ASS1缺失的间皮瘤。这种新型的基质介导的抵抗途径可以被用来优化针对间皮瘤和相关精氨酸依赖性癌症的精氨酸剥夺疗法。 2023 年。作者。

具有抗癌特性的天然化合物对癌症治疗非常有吸引力。然而，这些化合物的低溶解度和生物利用度限制了它们作为高效抗癌药物的使用。为了避免这些缺点，利用单亚油酸甘油酯和聚氧乙烯辛醇混合物的均质化技术，将这些化合物纳入到立方纳米颗粒（cubosomes）中。从无花果中分离出的天然抗癌化合物茄烯素被用于制备立方纳米颗粒。这些cubosomes的大小、zeta势、包埋效率、小角度X射线衍射、体外释放、体外细胞毒性、细胞吸收和抗肿瘤活性等进行了表征。cubosomes的粒径为220±3.6 nm，zeta势几乎为中性，为-5±1.2 mV，X射线测试证实存在立方结构。此外，超过90%的天然抗癌药物被包埋在cubosomes中。这些cubosomes获得了持续30小时的释放。最后，与自由的天然抗癌化合物相比，这些cubosomes表现出更高的体外细胞毒性和体内肿瘤抑制作用。因此，cubosomes可能是提高该天然化合物抗肿瘤效果的有前途的载体。© 2023 Controlled Release Society。

Chimeric antigen receptor (CAR) T-细胞疗法是针对癌细胞的新型免疫治疗方法，已被证明可以在某些难治性血液恶性肿瘤中引起持久缓解。然而，CAR T-细胞疗法有不良影响，如细胞因子释放综合征（CRS），免疫效应相关神经毒性综合征（ICANS），肿瘤溶解综合征（TLS）和急性肾损伤（AKI）等。很少有研究探讨CAR T-细胞疗法对肾脏的影响。在本综述中，我们总结了有关CAR T-细胞疗法在存在肾功能不全/AKI和由CAR T-细胞疗法引起的AKI患者的安全性资料。CAR T-细胞后30％的患者发生AKI，其中包括CRS、血液噬细胞淋巴组织细胞增生症（HLH）、TLS、血清细胞因子和炎症生物标志物等多种病理生理机制参与。但是，CRS通常报告为潜在机制。总体而言，在我们包括的研究中，18％的患者接受CAR T-细胞疗法后出现AKI，大多数情况可以通过适当治疗得以逆转。虽然一期临床试验排除了存在显著肾毒性的患者，但Mamlouk等人和Hunter等人的两项研究报告了对难治性弥漫性大B细胞淋巴瘤透析依赖患者的成功治疗，并证明CAR T-细胞疗法和淋巴减毒（Flu/Cy）可以安全地使用。©2023年作者。