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CANCER
2023 Mar 31

JionghuiGu,JinhuaPan...
Prospective assessment of pancreatic ductal adenocarcinoma diagnosis from endoscopic ultrasonography images with the assistance of deep learning.
CANCER
内镜超声医师对胰管腺癌(PDAC)的诊断高度依赖。本研究的目的是基于内镜超声图像开发深度学习影像组学(DLR)模型,用于识别PDAC并探索其真正的临床效益。以包括PDAC和良性病变的内镜超声图像的回顾性数据集作为训练组(N = 368名患者),开发DLR模型,并使用前瞻性数据集作为测试组(N = 123名患者)来验证DLR模型的有效性。此外,七名内镜超声医师进行了两轮读者研究,在有或没有DLR辅助的情况下对测试组进行进一步评估DLR模型的临床适用性和真正效益。在前瞻性测试组中,DLR表现出0.936的受试者工作特征曲线下面积(95%置信区间[CI],0.889-0.976),敏感性分别为0.831(95% CI,0.746-0.913)和0.904(95% CI,0.820-0.980)。在DLR协助下,七名内镜超声医师的总体诊断表现有所改善:一名内镜超声医师实现了特异性显著扩展(p = 0.035),另一名实现了敏感性显著增加(p = 0.038)。在初级内镜超声医师组中,有DLR的诊断表现较高或可与无DLR协助的高级内镜超声医师组相媲美。前瞻性测试组验证了基于内镜超声图像的DLR模型有效识别PDAC。借助该模型的帮助,不同经验水平的内镜超声医师之间的差距缩小,内镜超声医师的准确性扩展。 ©2023美国癌症协会。
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Mar 31

GiovanniMarconi,Anna...
The baseline comorbidity burden affects survival in elderly patients with acute myeloid leukemia receiving hypomethylating agents: Results from a multicentric clinical study.
Experimental Hematology & Oncology
在年长的急性髓系白血病(AML)患者中,适应能力、预后和死亡风险的定义仍存在疑问。在本研究中,我们测试了疾病和患者相关参数对大量老年AML患者接受低甲基化剂(HMAs)治疗后生存率的影响。在131名年龄中位数为76岁的患者中,我们证实了早期反应(<0.001)和基于生物学的风险分类(p = 0.003)可以挑选出预测生存更好的患者。然而,完整的疾病定向模型在我们的患者分层方面存在局限性,促使我们基于并发症评分来研究基线并发症对总体生存率的影响。白蛋白水平(p = 0.001)和肺部疾病的存在(p = 0.013)对预后有单一变量的影响。基线并发症负担是患者脆弱性的一个强力预测因素,与不良事件(尤其是感染)发生率增加相关,并可预测总体生存率(p < 0.001)。除疾病生物学外,并发症负担可能对预后产生影响。虽然老年AML的治疗武库正在不断提高,但综合应用AML生物学和针对患者脆弱性的个体化干预可能会充分利用新药物的抗白血病潜力。© 2023 The Authors. Cancer Medicine published by John Wiley & Sons Ltd.
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Mar

AliRashidi,LuciaBara...
Improved Detection of Bone Metastases in Children and Young Adults with Ferumoxytol-enhanced MRI.
Experimental Hematology & Oncology
目的 评估铁螯合素是否能够提高扩散加权(DW)MRI对小儿和青年癌症患者骨髓转移的检测能力。材料和方法 在一项获得机构审查委员会批准的前瞻性研究(ClinicalTrials.gov识别号NCT01542879)的二次分析中,于2015年至2020年间,26名年龄为2-25岁的儿童和青年患者(男性18人)接受了未增强或铁螯合素增强的全身DW MRI。两名评估人员使用Likert评分法确定骨髓转移的存在。另外一位评估人员测量了信噪比(SNR)和肿瘤与骨髓的对比度。氟18(18F)氟脱氧葡萄糖(FDG)PET和随访胸部CT、腹部和盆腔CT以及标准(非铁螯合素增强)MRI作为参考标准。使用广义估计方程、Wilcoxon秩和检验和Wilcoxon符号秩检验比较了不同实验组的结果。结果 在基线和化疗后,铁螯合素增强MRI下正常骨髓的SNR显著低于未增强MRI(分别为21.380 ± 19.878和102.621 ± 94.346;P = .03、20.026 ± 7.664和54.110 ± 48.022;P = .006)。这导致铁螯合素增强MRI扫描下的肿瘤与骨髓对比度增加,与未增强MRI扫描相比,在基线(1397.474 ± 938.576 vs 665.364 ± 440.576,P = . 07)和化疗后(1099.205 ± 864.604 vs 500.758 ± 439.975,P = .007)。因此,使用铁螯合素增强MRI与未增强MRI相比,检测骨髓转移的敏感性和诊断准确性分别为96%(98/94)和99%(297/293)与83%(127/106)和95%(390/369)。结论 使用铁螯合素有助于提高小儿和青年癌症患者骨髓转移的检测能力。关键词:小儿科,分子成像-癌症,分子成像-纳米颗粒,MR-扩散加权成像,MR成像,骨骼-附肢,骨骼-轴骨,骨髓,比较研究,癌症成像,铁螯合素,超顺磁性纳米粒子©RSNA,2023年ClinicalTrials.gov注册号NCT01542879。 本期评论可参见Holter-Chakrabarty和Glover的评论。
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Mar 31

RajendranSanalkumar,...
Highly connected 3D chromatin networks established by an oncogenic fusion protein shape tumor cell identity.
Experimental Hematology & Oncology
在胚胎发育过程中观察到的细胞命运转变涉及三维基因组组织的变化,这提供了适当的谱系特异性。是否类似的事件发生在肿瘤细胞中并有助于癌症演变仍未深入探讨。我们在儿童肿瘤尤文肉瘤中模拟了这个过程,并调查了与致癌融合蛋白EWS-FLI1相关的高分辨率环和大规模核构象变化。我们展示了肿瘤细胞中染色质相互作用主要由以EWS-FLI1结合位点为中心的高度连接的环状枢纽所支配,这直接控制了连接增强子和启动子的活性,以建立致癌表达程序。相反,EWS-FLI1消耗导致这些环状网络的解体和广泛的核再组织,通过建立新的环状模式和大规模区域配置,匹配了间充质干细胞中观察到的那些,这是尤文肉瘤祖细胞的候选。我们的数据表明,癌细胞核组织的主要建筑特征可以依赖于单一致癌基因,并可以很容易地逆转以重新建立潜在分化程序。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2023 Mar 30

JunWang,XiChen,Zheng...
Cooperative driver pathways discovery by multiplex network embedding.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
合作驱动通路发现有助于研究癌症的发病机制。然而,大多数发现方法主要关注基因组数据,并忽略已知的通路信息和其他相关的多种组学数据;因此,它们不能忠实地解读致癌过程。我们提出了CDPMiner(合作驱动通路挖掘器),通过多重网络嵌入发现合作驱动通路,可以共同建模多种分子的关系和属性信息。CDPMiner首先利用通路拓扑来量化不同通路中基因的权重,并优化基因与通路之间的关系。然后,它构建了一个由微型RNA、长非编码RNA、基因和通路组成的带属性的多重网络,通过深度联合矩阵分解嵌入网络,以挖掘更重要的通路级分析信息并重构通路交互网络。最后,CDPMiner利用重构的网络和突变数据来定义通路之间的驱动器权重,以发现合作驱动通路。乳腺浸润性癌和胃腺癌数据集上的实验结果表明,CDPMiner可以有效地融合多种组学数据以发现更多的驱动通路,这些通路确实合作触发癌症,并对癌症发生机理分析具有价值。消融研究证明CDPMiner能够更全面地分析通过融合多种组学数据的癌症。©作者(们)2023年。由牛津大学出版社出版。版权所有。有关权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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BREAST
2023 Mar 28

DamianoGentile,Andre...
Pathologic response and residual tumor cellularity after neo-adjuvant chemotherapy predict prognosis in breast cancer patients.
BREAST
新辅助化疗(NAC)后残余肿瘤细胞百分率(RTC)和病理完全缓解(pCR)是与乳腺癌(BC)良好预后相关的预后因素。然而,大多数患者只达到部分病理反应(pPR),且RTC模式与预后之间没有明确的相关性。我们的目的是确定pCR的预测因素,并比较不同RTC模式的pCR或pPR患者的不同预后情况。我们从机构数据库中记录了基线和NAC后的人口学特征、临床病理特征、手术后数据、生存和复发状态。使用logistic回归模型进行多因素分析以确定pCR的独立预测因子。使用Kaplan-Meier方法进行无病生存期(DFS)、远处无病生存期(DDFS)和总生存期(OS)分析。在495名患者中,148名(29.9%)达到了pCR,347名(70.1%)有pPR,中位RTC为40%。多因素分析确定了3个独立的pCR预测因子: NAC前肿瘤分期(cT1-2 84.5% vs cT3-4 15.5%)、BC亚型(HER2阳性54.7% vs 三阴性29.8% vs 延续型15.5%)和血管侵犯(缺席98.0% vs 存在2.0%)。我们发现,具有pCR和RTC <40%的患者在DFS、DDFS和OS方面具有显着更长的生存时间;RTC <40%组和RTC ≥40%组之间在OS方面没有差异。NAC前肿瘤分期、BC亚型和血管侵犯是与pCR相关的重要而独立的因素。与pPR患者相比,具有pCR和RTC <40%的患者具有更长的DFS、DDFS和OS。版权所有©2023年作者。由Elsevier Ltd.出版。保留所有权利。
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Brain Structure & Function
2023 Mar 23

HugoNoelle,OliviaPér...
Occupational asbestos exposure and survival among lung cancer patients.
Brain Structure & Function
本研究调查了职业石棉暴露(OAE)与组织学证实的肺癌(LC)患者的生存率之间的关联。该单中心研究在法国里昂的Léon Bérard综合癌症中心进行。自2014年以来,使用自评问卷对所有在多学科LC委员会从2014年到2019年期间诊断出组织学证实的LC的新患者进行了职业致癌物暴露的系统筛查。当医生怀疑问卷中包括工作史的与工作相关的暴露时,进行职业致癌监测以详细评估致癌物曝露情况并评估LC是否与工作有关。从医疗记录中提取人口统计学、临床特征和生存数据。通过Cox比例危险回归估计石棉暴露与总生存期(危险比和95%置信区间)之间的关联。总共有702名患者符合本研究条件,其中包括180名OAE患者。在粗略分析中,与没有OAE或对OAE归因度较低的LC相比,被评估为中度或高度归因于OAE的LC与较低的总生存率相关(HR = 1.32,95%CI 1.04-1.67)(中位随访28.8个月)。调整混淆因素(诊断时的年龄、吸烟状况、分期、脑转移和组织学)后,OAE与总生存期的关联不再具有统计学意义(HR = 1.21,95%CI 0.94-1.56)。与未暴露于石棉的LC患者相比,职业石棉暴露的LC患者的总生存期可能会降低,需要在更大的研究中进行进一步调查。版权所有© 2023 Elsevier B.V.
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BLOOD
2023 Mar 31

XiaolingXie,WujuZhan...
TREM2 acts as a receptor for IL-34 to suppress acute myeloid leukemia in mice.
BLOOD
骨髓微环境支持白细胞动员和分化并控制包括急性髓性白血病(AML)在内的白血病的发展。我们发现,具有骨吸收细胞Tsc1缺失的小鼠AML异种移植的发展被抑制。Tsc1缺陷骨吸收细胞释放大量的IL-34,有效诱导AML细胞分化,并在各种临床前模型中阻止AML进展。相反,IL-34缺乏的小鼠AML的发展加速。有趣的是,IL-34独立于其已知的受体抑制AML,而是直接结合到表达于髓系细胞上的关键信号中心——诱导受体表达的髓系细胞2(TREM2)。TREM2缺失的AML细胞和正常髓系细胞对IL-34治疗具有抗性。在机械上,IL-34-TREM2结合迅速磷酸化Rasal3,以消除ERK1/2信号并刺激分化,从而防止AML细胞增殖。此外,TREM2在AML患者中下调并与不良预后相关。该研究确定了TREM2作为IL-34的新受体,为克服AML患者中的AML分化阻断提供了有望的策略。 Copyright © 2023 American Society of Hematology。
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BLOOD
2023 Mar 31

JakobaJohannaEertink...
Baseline PET radiomics outperform the IPI risk score for prediction of outcome in diffuse large B-cell lymphoma.
BLOOD
本研究旨在对HOVON-84试验中开发的临床PET模型进行外部验证,并比较我们的临床PET模型与国际预后指数(IPI)的模型表现。共纳入1195例弥漫性大B细胞淋巴瘤患者,其中887例来自6项外部验证数据集。主要结局为2年无进展生存(PFS)和2年进展时间(TTP)。提取代谢性肿瘤体积(MTV)、最大病变和另一病变之间的最大距离(Dmaxbulk)和峰值标准摄取值(SUVpeak)。测试IPI和HOVON-84临床PET模型(MTV、Dmaxbulk、SUVpeak、表现状态和年龄)的预测价值。使用曲线下面积(AUC)评估模型表现,并使用阳性预测值(PPV)评估诊断表现。以2年PFS为结局,IPI的AUC为0.62(范围:0.51-0.65)。临床PET模型的AUC显著更高,为0.71(范围:0.59-0.75,p<0.001)。2年TTP也得到了类似的结果。高危IPI患者的2年PFS为61.4%,而高危临床PET患者为51.9%,PPV分别从35.5%升至49.1%。高危IPI患者中有66.4%无进展或复发,而高危临床PET患者中为55.5%,PPV分别从33.7%升至44.6%。在6项独立的一线DLBCL研究中,HOVON-84数据集中开发的临床PET模型仍具有预测结局的能力,并且在所有研究中比目前使用的IPI具有更高的模型表现。版权所有 © 2023美国血液学会。
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BLOOD
2023 Mar 31

ZhenhuaLi,Ti-ChengCh...
Genomic landscape of Down syndrome-associated acute lymphoblastic leukemia.
BLOOD
Trisomy 21是唐氏综合症的遗传原因,是最常见的先天性染色体异常。在儿童期,它与急性淋巴细胞白血病(ALL)的风险增加20倍,导致独特的白血病生物学。为了全面定义DS-ALL的基因组景观,我们对295个案例进行了全基因组测序和整个转录组测序(RNA-Seq)。我们的综合基因组分析鉴定了15个DS-ALL分子亚型,与2257个非DS-ALL案例相比,CRLF2-r,IGH :: IGF2BP1和C / EBP修改(C / EBPalt)亚型显著富集。我们观察到CEBPD,CEBPA和CEBPE基因的异常激活在10.5%的DS-ALL案例中存在,通过各种基因组机制,包括染色体重排和导致增强子劫持的非编码突变。42.3%的C / EBP激活型DS-ALL还具有FLT3点突变或插入/缺失相伴,而其他亚型仅占4.1%(P = 7.2×10 -6)。CEBPD的过表达增强了小鼠造血祖细胞向前B细胞的分化,特别是在DS遗传背景下。值得注意的是,RAG介导的体细胞基因组异常在DS-ALL中很常见,占结构性改变的中位数的27.5%,而在非DS-ALL中仅占7.7%(P = 2.1×10-12)。 CRLF2重组DS-ALL的非监督分层聚类分析发现该组内存在显著的异质性,其中BCR :: ABL1-like子集与较差的事件无病生存相关(危险比= 5.27,P = 9.3×10-8),即使在调整已知临床危险因素后(危险比= 4.32; P = 0.0020)。这些结果提供了对DS-ALL生物学的重要见解,并指向针对性治疗和治疗个性化的机会。版权所有©2023年美国血液学会。
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