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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Jan

IgpSukaAryana,SitiSe...
Indonesian Geriatrics Society Consensus on COVID-19 Management in Older Adults.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
80%以上的死亡病例和95%的重症COVID-19病例发生在60岁以上的患者身上。非典型的临床表现具有高发病率和高死亡率,进一步强调了COVID-19管理老年人的重要性。一些老年患者可能呈现无症状,而另一些患者可能出现急性呼吸窘迫综合症和多器官功能衰竭。可能出现发热、呼吸速率增加和 crackles。最常见的胸部X光检查发现是地面玻璃状的混浊。其他常用的成像方式包括肺部计算机断层扫描和肺部超声检查。老年人的COVID-19管理应该是全面的,从氧气、液体、营养、物理康复、药物和心理社会治疗开始。在这个共识中,我们还讨论了患有特殊情况的老年人的管理,例如糖尿病、肾脏疾病、恶性肿瘤、虚弱、谵妄、固定和痴呆症。在COVID-19后阶段,我们认为物理康复很重要,因为它有助于改善健康状况。
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Frontiers in Genetics
2023

SiShi,ShibinChen,Men...
Clinical relevance of RNA editing profiles in lung adenocarcinoma.
Frontiers in Genetics
背景:肺腺癌(LUAD)是全球发生率最高的肺癌,死亡率不断增加。它属于非小细胞肺癌(NSCLC)类型,与先前吸烟史有很强的关联。越来越多的证据表明,腺苷酸-肌醇转换RNA编辑(ATIRE)失调在癌症中的重要性。本研究旨在评估可能具有临床用途或肿瘤生成作用的ATIRE事件。
方法:为了探索与 LUAD 生存相关的 ATIRE 事件,我们从癌症基因组图谱(TCGA)和 synapse 数据库中下载其 ATIRE 概况、基因表达数据和对应患者的临床信息。我们在 TCGA 数据库中评估了 440 名 LUAD 患者的 10441 个 ATIRE。将 ATIRE 概况与 TCGA 生存数据合并。我们使用单因素 Cox 分析(p < 0.001)选择预后 ATIRE 位点。使用 Cox 比例风险回归和 Lasso 回归分析,确定与生存相关的 ATIRE 位点,为这些位点创建风险评分,并构建评估总生存期(OS)的预后模型和诊断表。预后模型构建使用了六个 ATIRE 位点,并将患者随机分为验证队列(n = 176)和训练队列(n = 264)。使用 “Pheatmap” 程序创建包括风险评分、生存时间和 ATIRE 位点表达的风险曲线。我们还确定了临床预测模型的区分能力。同时使用决策曲线分析和 1、2、3 年的校正曲线来评估诊断表。我们还评估了 ATIRE 位点数量与宿主基因表达之间的关系,以及 ATIRE 表达对转录组表达的影响。
结果:在预后模型构建中,使用了 pyroglutamyl-peptidase I(PGPEP1)chr19:18476416A > I、ankyrin repeat domain 36B pseudogene 1(ANKRD36BP1)(距离=3,795)、T-box 转录因子(TBX19)(距离=29815)chr1:168220463A>I、syntrophin beta 2(SNTB2)chr16:69338598A > I、hook 微管连接蛋白 3(HOOK3)chr8:42883441A > I、NADH 氧化酶黄素蛋白 3(NDUFV3)chr21:44329452A > I 和 FK506 结合蛋白 11(FKBP11)chr12:49316769A > I。高风险评分水平与较差的 OS 和无进展生存率显著相关。肿瘤分期和风险评分与 LUAD 患者的 OS 相关。预测因子包括预后诊断表模型的风险评分、年龄、性别和肿瘤分期。校准图和 C-index(0.718)显示,诊断表的预测具有显著准确性。ATIRE 水平在肿瘤组织中明显升高,在患者之间高度变异。
结论:与 LUAD 有关的 ATIRE 事件具有很高的功能和临床相关性。RNA 编辑基础模型为进一步研究非编码区域的 RNA 编辑功能提供了坚实的框架,并可用作预测 LUAD 存活的独特方法。版权所有©2023年Shi、Chen、Wang、Guo、He 和 Chen。
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Frontiers in Genetics
2023

YipingHao,MutangalaM...
Construction of a prognostic model based on eight ubiquitination-related genes via machine learning and potential therapeutics analysis for cervical cancer.
Frontiers in Genetics
介绍:泛素化参与了许多生物过程,其对宫颈癌预后的预测价值仍不清楚。方法:为了进一步探索泛素化相关基因的预测价值,我们从泛素和泛素样共轭数据库中获取URGs,并分析来自TCGA和GEO数据库的数据集,然后选择正常和癌组织之间差异表达的泛素化相关基因。然后,通过单变量Cox回归选择与总生存率有显著关联的DURGs。进一步使用机器学习选择DURGs。然后,我们通过多元分析构建并验证了一个可靠的预后基因签名。此外,我们预测了签名基因的底物蛋白质,并进行功能分析以进一步了解分子生物学机制。该研究为评估宫颈癌预后提供了新的指导,并提出了药物开发的新方向。结果:通过分析TCGA和GEO数据库中的1,390个URGs,我们获得了175个DURGs。结果显示,有19个DURGs与预后有关。最终,通过机器学习确定了8个DURGs,以构建第一个泛素化预后基因签名。患者被分为高危和低危两组,并且高危组的预后更差。此外,这些基因蛋白质水平与其转录水平大多数是一致的。根据底物蛋白质的功能性分析,这些签名基因可能通过转录因子活性和经典P53通路的泛素化相关信号通路参与癌症的发展。此外,还确定了71种小分子化合物作为潜在药物。结论:我们系统地研究了泛素化相关基因对宫颈癌预后的影响,通过机器学习算法建立了预后模型,并验证了它。此外,我们的研究为宫颈癌提供了新的治疗策略。版权所有©2023 Hao,Guy,Liu,Li,Mao,Jiang,Wang,Cui和Zhang。
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Frontiers in Genetics
2023

QuanGong,XiandaHuang...
Construction and validation of an angiogenesis-related lncRNA prognostic model in lung adenocarcinoma.
Frontiers in Genetics
背景:越来越多的证据表明,长非编码RNA(lncRNA)可以作为癌症潜在的预后因子。本研究旨在使用与血管生成相关的长非编码RNA(lncRNA)作为潜在预后因子来开发肺腺癌(LUAD)的预后模型。 方法:分析The Cancer Genome Atlas(TCGA)和Gene Expression Omnibus(GEO)中的转录组数据,以确定在LUAD中异常表达的与血管生成相关的lncRNA。使用差异表达分析、重叠分析、Pearson相关分析和Cox回归分析构建了一个预后签名。使用K-M和ROC曲线评估模型的有效性,并在GSE30219数据集中进行独立外部验证。确定了预后性lncRNA-microRNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。还分析了免疫细胞浸润和突变特征。使用定量实时PCR(qRT-PCR)基因芯片定量了四个人类血管生成相关的lncRNA的表达。 结果:在LUAD中确定了26个异常表达的与血管生成相关的lncRNA,并构建了一个基于LINC00857、RBPMS-AS1、SYNPR-AS1和LINC00460的Cox风险模型,这可能是LUAD的独立预后预测因子。低风险组具有显着更好的预后,并且与更高丰度的休息免疫细胞和较低的免疫检查点分子表达相关。此外,基于这四个预后性lncRNA预测了105种ceRNA机制。 qRT-PCR结果显示,LINC00857、SYNPR-AS1和LINC00460在肿瘤组织中显著高表达,而RBPMS-AS1在癌旁组织中高表达。 结论:本研究确定的四个血管生成相关的lncRNA可能作为LUAD患者的有前途的预后生物标志物。 版权所有 ©2023 Gong,Huang,Chen,Zhang,Zhou,Li,Song和Zhuang。
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Frontiers in Genetics
2023

PuLei,MengzhaoZhang,...
High GTSE1 expression promotes cell proliferation, metastasis and cisplatin resistance in ccRCC and is associated with immune infiltrates and poor prognosis.
Frontiers in Genetics
背景:清除型肾癌是肾癌中最常见、最致命的一种形式,占新病例的80%。虽然报道称GTSE1在多种肿瘤中高表达,并与恶性进展和不良临床预后有关,但其在ccRCC中的临床意义、与免疫细胞浸润的相关性以及生物学功能仍不清楚。方法:使用多个数据库,包括TCGA、GEO、TIMER和UALCAN Kaplan-Meier生存分析,基因集富集分析、基因本体富集Gene Ontology和京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行GTSE1的基因表达、临床病理特征和临床意义的分析。使用TCGA-KIRC剖面提取和分析肿瘤浸润免疫细胞和免疫调节因子。使用STRING网站构建蛋白质-蛋白质相互作用。采用ccRCC组织芯片进行免疫组化检测ccRCC患者的GTSE1蛋白水平。最后进行MTT测定、集落形成实验、细胞流式细胞术分析、EdU染色实验、创伤愈合实验以及Transwell迁移和侵袭实验,评估GTSE1在体外的生物学功能。结果:GTSE1在ccRCC组织和细胞中高表达,GTSE1过表达与不良临床病理因素和不良临床预后相关。同时,功能富集分析表明,GTSE1及其共表达的基因主要与细胞周期、DNA复制和免疫反应相关,如T细胞激活和先天性免疫应答,通过多种信号通路,包括P53信号通路和T细胞受体信号通路。此外,我们观察到GTSE1表达与ccRCC浸润免疫细胞水平之间存在显著关系。生物学功能研究表明,GTSE1可以通过促进细胞增殖、细胞周期转变、迁移和侵袭能力,以及降低ccRCC细胞对顺铂的敏感性,促进ccRCC的恶性进展。结论:我们的结果表明,GTSE1作为一个潜在的癌基因,可以促进ccRCC的恶性进展和顺铂耐药性。此外,高GTSE1表达有助于增加免疫细胞浸润水平,并与更差的预后有关,提供了ccRCC肿瘤治疗的潜在靶点。Copyright © 2023 Lei、Zhang、Li和Wang。
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Frontiers in Genetics
2023

ChenyangBi,ZheWang,Y...
I kappa B kinase interacting protein as a promising biomarker in pan-cancer: A multi-omics analysis.
Frontiers in Genetics
背景:人类染色体12中含有I kappa B激酶相互作用蛋白(IKBIP),也常被称为IKIP。IKBIP在肿瘤生长中的作用只在少数出版物中被讨论。
目的:探讨IKBIP在各种肿瘤发展以及肿瘤免疫微环境中的作用。
方法:使用UALCAN、HPA、基因型组织表达、癌症基因组地图和其他数据集来分析IKBIP表达。我们深入研究了IKBIP在泛癌症、临床特征和遗传异常中的预测重要性。研究是否存在IKBIP和免疫相关基因、微卫星不稳定性(MSI)以及肿瘤突变负荷(TMB)发生率之间的链接。使用ImmuCellAI、TIMER2和早期研究的免疫细胞浸润数据考察免疫细胞浸润和IKBIP表达之间的关系。最后,进行基因集富集分析(GSEA)以确定与IKBIP相关的信号通路。
结果:IKBIP在大多数癌症中高表达,并且与数种主要癌症类型的预后呈负相关。此外,IKBIP表达与13种癌症的TMB和7种癌症的MSI有关联。另外,IKBIP与众多免疫和促癌通路相关。同时,各种癌症类型具有独特的肿瘤浸润免疫细胞谱系。
结论:IKBIP具有作为泛癌症癌基因的潜力,对肿瘤发生和免疫都至关重要。提高的IKBIP表达意味着免疫抑制环境,并且可以用作预后生物标志物和治疗靶点。
版权所有©2023 Bi,Wang,Xiao,Zhao,Guo,Xiong,Ji,Li,Li和Qin。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Mar 29

ParthRPatel,KishoreK...
Nanotheranostics for Diagnosis and Treatment of Breast Cancer.
Cellular & Molecular Immunology
最近,乳腺癌的发病率在所有报道癌症中达到最高水平,其变异型之一,称为三阴性乳腺癌(TNBC),与其他类型的乳腺癌相比由于缺乏可行的诊断技术更具致命性。纳米技术的进展为制定多种纳米载体铺平了道路,这些载体能够有效地选择性地将抗癌药物传递给癌细胞,最小化对非癌细胞的副作用。纳米治疗学是一种新颖的方法,可用于疾病诊断以及治疗效果。目前,各种成像剂,如有机染料、放射性剂、上转换纳米颗粒、各种对比剂、量子点等,正在探索内部器官成像或检查药物分布。此外,具有靶向配体的纳米载体,具有针对癌症部位的潜力,正在用作癌症治疗诊疗应用的先进代理,包括癌性肿瘤的各种转移部位的识别。本综述文章讨论了乳腺癌治疗学中治疗诊断应用的需求、各种成像技术、最新的乳腺癌纳米治疗载体以及相关的安全和毒性问题,并强调了纳米治疗学在乳腺癌中的重要性,这有助于解密与纳米治疗系统相关的问题。版权所有© Bentham Science Publishers;如有任何问题,请发送电子邮件至epub@benthamscience.net。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Feb 28

HainingGan,HuiyingXi...
Effect of long non-coding RNA 114227 on gastric cancer cell proliferation and migration.
Cellular & Molecular Immunology
胃癌是消化系统中常见的癌症。长链非编码RNA(lncRNA)在胃癌的形成和发展中发挥重要作用。本研究旨在研究长链非编码RNA114227对胃癌细胞生物行为的影响。实验分为4组:阴性对照(NC)组、lncRNA114227小干扰(si-lncRNA114227)组、空载体(Vector)组和过表达载体(OE-lncRNA114227)组。通过实时荧光定量PCR(real-time RT-PCR)测定了胃粘膜和胃癌组织、胃粘膜上皮细胞和不同胃癌株中的lncRNA114227表达水平。通过CCK-8检测法检测了胃癌细胞增殖率。Transwell实验、划痕愈合实验和Western blotting实验皆应用EMT技术测定了胃癌细胞的上皮间充质转化能力。通过裸鼠体内肿瘤携带实验检测了lncRNA114227对胃癌细胞增殖的影响。结果表明,在胃癌组织中,lncRNA114227的表达水平显著低于胃粘膜组织,在4种胃癌株中也均显著低于胃粘膜上皮细胞(P <0.01)。在体外实验中,经过表达lncRNA114227后,胃癌细胞的增殖和迁移能力明显降低,而经过沉默lncRNA114227后,细胞增殖和迁移能力增强(P <0.05)。裸鼠皮下肿瘤发生实验的结果显示,携带OE-lncRNA114227群组的肿瘤小鼠的肿瘤体积显著小于Vector组的肿瘤体积,并且肿瘤形态较差(P < 0.05),表明lncRNA114227抑制了肿瘤形成。lncRNA114227的表达在胃癌组织和细胞系中均有下调。lncRNA114227可能通过EMT过程抑制胃癌细胞的增殖和迁移。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Feb 28

QiJia,XiaohongXian,Y...
Research progress in effects of MAGE-A family on gastric cancer.
Cellular & Molecular Immunology
胃癌(GC)是全球最常见的恶性肿瘤之一,大多数患者在晚期诊断。治疗选择多样化,其中免疫疗法在其中扮演着越来越重要的角色。黑色素瘤抗原相关基因A(MAGE-A)家族是一种癌胚抗原。除了睾丸的生殖细胞和胎盘的滋养层细胞之外,MAGE-A家族在癌组织中高表达,并参与各种生物过程,如癌细胞增殖、分化和转移。此外,癌胚抗原具有良好的免疫原性,可引起体液和细胞免疫应答,在免疫治疗中是一个良好的靶点,具有良好的在胃癌的诊断、治疗和预后上的应用价值。基于MAGE-A的多种靶向治疗药物正在进行Ⅰ或Ⅱ期临床试验,具有良好的安全性和潜在的临床应用价值。随着对MAGE-A靶点在GC临床转化和免疫治疗方面基础研究和临床试验的不断进展,未来将为MAGE-A在胃癌的免疫治疗提供理论基础。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Mar 31

IslamSMarae,RaedMMak...
Thieno[2,3-c]isoquinolines: A novel chemotype of antiproliferative agents inducing cellular apoptosis while targeting the G2/M phase and Tubulin.
Cellular & Molecular Immunology
在现代合成方法和先进的生物评估技术时代,考虑到肝细胞癌(HCC)的臭名昭著历史,对于新型生物活性化合物的期望大幅增长。在药物发现研究中广泛应用的多种主题包括异喹啉和噻吩[2,3-b]吡啶。本文中,将这两种主题分子合并,形成噻吩[2,3-c]异喹啉,作为一种新型抗增生的生物活性化合物,并针对HCC进行了深入研究。因此,合成了4、5、7和8号化合物系列,并对HepG2细胞系进行了生物评估。通过生物研究,成功确定了C7-Ac/C8-OH取代基、C8-C9不饱和度、C1-NH2的1H-吡咯-1-基环闭合和C6-Ph p-卤代取代基的作用,并成功得到了安全的5b先导物。进一步,通过流式细胞术和Annexin V-FITC / PI凋亡生物研究,发现5b显著抑制G2 / M期细胞周期,并且凋亡增加了60倍。采用DFT构象研究和分子对接技术,结合分子力学/广义Born表面积评分发现,5b在可可碱结合位点具有潜在的微管目标作用,实验证明了这一点(可可碱抑制性IC50 = 71µM,而可可碱为14µM)。因此,在保留C7-乙酰和优化卤位置的同时,保留[6S,7R]-立体化学对于最佳结合微管的可可碱结合位点至关重要。 ©2023 Wiley Periodicals LLC.
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