研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Mar 30
XinnanLi,XiaotongZe,...
Discovery of a Novel, Potent, Orally Active, and Safe Inhibitor Targeting Human Mitochondrial RNA Polymerase.
GENES & DEVELOPMENT
高度氧化磷酸化(OXPHOS)发生在某些肿瘤中,这取决于OXPHOS作为能量供应来源,特别是在缓慢增生的肿瘤细胞中。因此,针对人类线粒体RNA聚合酶(POLRMT)以抑制线粒体基因表达成为一种潜在的治疗策略来根除肿瘤细胞。在这项工作中,第一类POLRMT抑制剂IMT1B和其SAR的探索和优化导致了新化合物D26的识别,对多种癌细胞产生了强大的抗增殖作用并降低了线粒体相关的基因表达。此外,机制研究表明,D26在A2780细胞中阻滞了G1期的细胞周期,并对凋亡、去极化的线粒体或反应性氧化应激产生没有影响。重要的是,D26在A2780异种移植裸鼠中表现出比IMT1B更强的抗癌活性,并且没有观察到毒性效应。所有结果都表明D26值得进一步研究成为一种有效且安全的抗肿瘤候选药物。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Mar 30
CaineLucasGrandt,Lar...
Gene expression variability in long-term survivors of childhood cancer and cancer-free controls in response to ionizing irradiation.
GENES & DEVELOPMENT
差异表达分析通常要进行调整以消除变异性。然而,大多数研究检查了表达变异性(EV)时使用了受低表达水平影响的计算方法,并未检查健康组织。本研究旨在计算和表征童年肿瘤幸存者和癌症免疫对照(N0)的无偏EV,以应对电离辐射。从KiKme病例对照研究中获得了52名童年初发性肿瘤(N1)的捐赠者、52名至少有一次第二原发肿瘤的捐赠者(N2+)以及52名N0的人类皮肤成纤维细胞,并暴露于高(2格雷)和低(0.05格雷)的X射线和假照射(0格雷)中。然后按照捐赠者组和辐射处理分类为hypo-,non-或hyper-variable,然后检查是否存在过度表示的功能特征。我们发现有22个基因在捐赠者组之间存在相当大的EV差异,其中11个基因与响应电离辐射、应激和DNA修复有关。在所有与变异分类组合唯一相关的基因中,N0检测到了最多的基因:在0格雷(n=49)、0.05格雷(n=41)和2格雷(n=38)之后的hypo-variable基因,以及在任何剂量后的hyper-variable基因(n=43)。在经过2格雷照射后,细胞周期的正向调节在N0中是hypo-variable的,而(成纤维细胞的)增殖在N1和N2+的hyper-variable基因中被过度表示。在N2+中,有30个基因在低剂量后被唯一分类为hyper-variable,并与ERK1 / ERK2级联有关。对于N1,在我们的数据中未检测到与辐射响应相关的专属基因集。N2+显示了细胞命运决策通路的高度变异性,这些通路可能通过增殖导致DNA损伤的传递和增殖,应该进行凋亡并移除损伤的基因组。这样的缺陷可能会导致对高剂量电离辐射的副作用产生更高的脆弱性,但在诊断中使用低剂量应用时也可能如此。©2023年作者(们)。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Mar 30
DavidBarua,AfrinSult...
RRM2 and CDC6 are novel effectors of XBP1-mediated endocrine resistance and predictive markers of tamoxifen sensitivity.
GENES & DEVELOPMENT
内分泌耐药性乳腺癌表达XBP1高水平,它通过控制其靶基因的表达来促进内分泌耐药性。尽管对XBP1在ER阳性乳腺癌的生物功能有深入的了解,但XBP1下游的内分泌耐药性效应物还不清楚。本研究的目的是在乳腺癌中鉴定由XBP1调控的基因对内分泌耐药性的贡献。使用CRISPR-Cas9基因敲除策略在MCF7细胞中生成XBP1缺失子克隆,并使用Western blot和RT-PCR进行验证,用MTS和集落形成实验评估细胞存活率和细胞增殖,用流式细胞术确定细胞死亡和细胞周期分析,利用转录组数据分析来鉴定XBP1调控的靶标,并用Western blot和qRT-PCR评估靶基因的差异表达。采用慢病毒和逆转录病毒转染生成RRM2和CDC6过表达的克隆。采用Kaplan-Meier生存分析分析XBP1基因签名的预后价值。XBP1的删除削弱了内质网应激(EnR)条件下UPR靶基因的上调作用,并增加了细胞对EnR应激诱导的细胞死亡的敏感性。MCF7细胞中的XBP1丢失降低了细胞生长,减弱了雌激素响应基因诱导并增加了对抗雌激素药物的敏感性。在多种ER阳性乳腺癌细胞中,删除/抑制XBP1会显著降低细胞周期相关基因RRM2、CDC6和TOP2A的表达。RRM2、CDC6和TOP2A的表达在雌激素刺激下和携带ESR1点突变(Y537S,D538G)的细胞中增加,在无固醇条件下。RRM2和CDC6的异位表达增加了细胞生长并扭转了XBP1 KO细胞对他莫昔芬的高敏感性,从而提供内分泌耐药性。重要的是,XBP1基因签名的增加与ER阳性乳腺癌的恶性结果和他莫昔芬治疗的疗效降低有关。我们的结果表明,XBP1下游的RRM2和CDC6对ER阳性乳腺癌的内分泌耐药性做出了贡献。XBP1基因签名与ER阳性乳腺癌的恶性结果和对他莫昔芬的反应有关。 ©2023年作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Mar 30
AierpatiMaimaiti,Zha...
N7-methylguanosin regulators-mediated methylation modification patterns and characterization of the immune microenvironment in lower-grade glioma.
GENES & DEVELOPMENT
N7-甲基鸟嘌呤(m7G)修饰特征最近成为肿瘤进展和治疗的关键调节因子。然而,有关低级别胶质瘤(LGGs)的基因组剖析与m7G甲基化修饰基因在肿瘤生成和进展中的功能的相关信息有限。本研究采用生物信息学方法对中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)和癌症基因组图谱(TCGA)中的LGG个体进行m7G修饰特征的表征。我们使用基因集富集分析(GSEA),单样本GSEA (ssGSEA),CIBERSORT算法,ESTIMATE算法和TIDE评估m7G修饰模式、肿瘤微环境 (TME)细胞浸润特性和免疫浸润标志物之间的关系。利用主成分分析(PCA)和m7G评分方案定量研究m7G修饰模式。我们运用免疫组化、western-blotting和qRT-PCR检测m7G修饰中心基因在正常样本、难治性癫痫样本和LGG样本中的表达水平。研究发现根据m7G特征的属性,LGG个体可以分为两组(高和低): 高m7G分数与抗-PD-1队列中的显著临床受益和延长生存期相关,而低m7G分数则与改善预后结果和抗-PD-L1队列中的完全或部分反应性增加相关。不同的m7G亚型也表现出不同的肿瘤突变负担(TMB)和免疫特征,并可能对免疫疗法产生不同的反应。此外,我们还确定了五个与m7G评分特征指数高度相关的潜在遗传标志物。这些发现为m7G甲基化修饰的特征和分类提供了洞察,并有助于改善LGG的临床结果。©2023年作者。
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EUROPEAN JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY
2023 Mar 30
SungHyeKong,Joon-Hyo...
In-depth Proteomic Signature of Parathyroid Carcinoma.
EUROPEAN JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY
诊断甲状旁腺癌(PC)是复杂且有争议的,早期诊断和干预常常很难。因此,我们旨在通过定量蛋白质组分析阐明PC的蛋白质标志物,以帮助早期和准确诊断PC。回顾性队列研究。我们使用离子层析 - 质谱法对福尔马林固定石蜡嵌 embedded样品进行了分析。对于这些分析,我们收集了来自韩国南部的6家三级医院的23个PC和15个甲状旁腺腺瘤(PA)组织。患者的平均年龄为52岁,63%为女性。蛋白质组表达谱揭示了304个不同表达蛋白质(DEPs),其截止值为p <0.05,叠加变化> 1.5。在DEPs中,我们确定了一组5种蛋白质,可以将PC与PA区分开来:碳酸酐酶4 [CA4],alpha / beta水解酶结构域含蛋白14B [ABHD14B],层粘连素亚单位beta-2 [LAMB2],CD44抗原[CD44]和alpha-1酸性糖蛋白1 [ORM1],其在神经网络模型中表现出最高的曲线下面积0.991。免疫组织化学中CA4和LAMB2的核占比在PC组织中明显低于PA(CA4:2.77±1.96%、26.2±3.45%,p <0.001;LAMB2:6.86±3.46%、38.54±4.13%,p <0.001)。PC中最丰富的经典通路包括糖蛋白-6信号和哺乳动物雷帕霉素(mTOR)。我们使用甲状旁腺肿瘤的蛋白质组分析确定了PC和PA之间的关键蛋白质差异表达。这些发现可能有助于准确诊断PC,并阐明潜在的治疗靶点。©2023年作者(S),由牛津大学出版社代表(ESE)欧洲内分泌学会发表,版权所有。有关权限,请发送电子邮件至journals.permissions@oup.com。
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ENVIRONMENTAL RESEARCH
2023 Mar 28
RuqayahAliGrmasha,Cs...
Ecological and human health risk assessment of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAH) in Tigris river near the oil refineries in Iraq.
ENVIRONMENTAL RESEARCH
2014年和2015年伊拉克针对ISIS的战斗导致多个炼油厂基础设施被摧毁或严重损毁。这与其他因素一起导致了各种危险化学物质的排放和积累,例如多环芳香烃(PAH)。因此,第一次进行了为期六个月的全面16种PAH测量活动,覆盖了底格里斯河和其河口附近的炼油厂。检测了以下炼油厂的水面和沉积物中的16种PAH浓度:白吉、柯尔库克、阿尔-西尼亚、凯亚拉、阿尔-卡萨克、道拉、南方炼油公司和迈赞。总体研究结果表明,水中的16种PAH浓度范围为567.8至3750.7 ng/L,沉积物中为5619.2至12795.0 ng/g。南方炼油公司的水样记录了最高的PAH浓度,而白吉炼油厂则记录了沉积物样品中最高的PAH浓度。水和沉积物样品中高分子量PAH(5-6环)的百分比是最高的,分别占总PAH的49.41%至81.67%和39.06%至89.39%。底格里斯河水和沉积物样品中大部分的16种PAH都是由热源产生的。根据沉积物质量指南(SQG),大多数地点的所有沉积物样品中的大多数PAH浓度可能产生偶尔的生物影响。计算出的增量寿命癌症风险(ILCR)值为高风险,具有不良健康影响,包括癌症。版权所有©2023,由Elsevier Inc.出版。
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ENDOCRINE REVIEWS
2023 Mar 30
GraemeEisenhofer,Chr...
Biochemical Assessment of Pheochromocytoma and Paraganglioma.
ENDOCRINE REVIEWS
PPGL(嗜铬细胞瘤和副神经节瘤)需要及时考虑和高效诊断和治疗以最小化相关的发病率和死亡率。一旦考虑到,适当的生化测试是诊断的关键。对儿茶酚代谢的理解的进步澄清了为什么测量甲基化的儿茶酚代谢物而不是儿茶酚本身对有效诊断至关重要。这些代谢物,正甲基肾上腺素和甲基肾上腺素,分别从去甲肾上腺素和肾上腺素产生,可以在血浆或尿液中测量,根据可用的方法或患者的表现选择。对于具有儿茶酚过量症状的患者,任何一种测试都将不可避免地确诊,而对于因偶然发现或遗传倾向而进行筛查的患者,与尿甲基肾上腺素相比,血浆测试为小肿瘤或无症状表现的患者提供更高的敏感性。测量血浆甲氧基酚胺可以对某些肿瘤,如副神经节瘤和风险转移疾病患者的监测,也很重要。避免虚假阳性测试结果最好通过适当的参考间隔和前分析预防措施,在完全平卧的姿势下采集血样来实现。对于阳性结果的跟踪,包括优化重复测试的预分析或决定直接进行解剖成像或确认性可乐定试验,取决于测试结果的性质,这些结果还可以提示可疑肿瘤的大小,肾上腺与肾上腺外位置,潜在的生物学或甚至转移性累及。现代生化测试现在使PPGL的诊断相对简单。人工智能的整合应该可以使这些进步得到精细调整。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Mar 30
StanleyFayn,APadenKi...
Site-Specifically Conjugated Single-Domain Antibody Successfully Identifies Glypican-3-Expressing Liver Cancer by Immuno-PET.
Disease Models & Mechanisms
原发性肝癌是癌症相关死亡的第三大原因,在全球范围内其发病率和死亡率都在增加。肝细胞癌(HCC)占原发性肝癌病例的80%。Glypican-3(GPC3)是一种肝细胞癌组织病理学的定量硫酸肝蛋白聚糖,代表一种有吸引力的肿瘤选择性标记物,可用于辐射药物成像和治疗该疾病。单域抗体由于其良好的药物动力学性质、良好的肿瘤穿透能力和肾清除能力而成为一种有前途的成像支架。虽然常规的赖氨酸定向生物偶联可用于产生全长抗体的共轭物以进行放射性标记,但这种随机方法可能会对较小的单域抗体的靶结合产生负面影响。为了解决这一挑战,已经探索了位点特异性方法。在这里,我们使用常规和基于sortase的位点特异性偶联方法来设计GPC3特异性人单域抗体(HN3)PET探针。 方法:使用双功能巯基丁二酸(DFO)异硫氰酸盐合成本体HN3(nHN3)-DFO。通过使用包含LPETG C端标签的triglycine-DFO螯合剂和HN3的sortase介导的偶联来工程特定位点修饰的HN3(ssHN3)-DFO。两种共轭物均用89Zr标记,并在体外测定了它们的结合亲和力和对GPC3阳性(GPC3+)肿瘤的靶位点接合。 结果:体外细胞实验表明,两种共轭物都具有纳摩尔级别的GPC3结合亲和力。在携带等基因A431和A431-GPC3+异种移植物以及HepG2肝癌异种移植物的小鼠中进行生物分布和PET / CT图像分析表明,两种共轭物仅能识别GPC3+肿瘤。 89Zr-ssHN3表现出更有利的生物分布和药代动力学性质,包括更高的肿瘤摄取和更低的肝脏积累。使用18F-FDG和89Zr-ssHN3对小鼠进行比较PET / CT研究表明,单域抗体共轭物具有更一致的肿瘤积聚,进一步证明了其PET成像的潜力。 结论: 在异种移植模型中, 89Zr-ssHN3在肿瘤摄取和肿瘤-肝脏信号比方面相对于定向修改的89Zr-nHN3具有明显的优势。我们的研究结果建立了基于HN3的单域抗体探针在GPC3定向的肝癌PET成像中的潜力。Copyright © 2023 by the Society of Nuclear Medicine and Molecular Imaging, Inc.
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Disease Models & Mechanisms
2023 Mar 30
MeganCEdmonds,Bassam...
Surveillance Mammography Behaviors in Black and White Breast Cancer Survivors: Behavioral Risk Factors and Surveillance System, 2016.
Disease Models & Mechanisms
对于乳腺癌幸存者,建议每年进行监测乳腺X线摄影来及早发现疾病复发,但与白种女性相比,黑种女性的监测乳腺X线摄影的国家率较低,导致这一不平等的因素尚不清楚。本研究的目的是评估健康保健、社会经济状况和健康状况对乳腺癌幸存者坚持进行监测乳腺X线摄影的贡献。 这是一项在2016年行为风险因素监测系统(BRFSS)国家调查中完成乳腺手术和辅助治疗的黑人和白人女性(年龄 ≥ 18岁,并报告乳腺癌诊断)的横断面调查的二次分析。独立变量(如健康保险、婚姻状况等)的双变量关联(卡方、t检验)与国家建议的监测指南的坚持定义为两个级别: 坚持(在最近12个月内接受了乳腺X线摄影),与不坚持("在最近2-5年、5年以上或不确定地接受了乳腺X线摄影")。多变量 logistic 回归模型用于评估研究变量与坚持的关系,同时调整潜在混杂因素。 在963位乳腺癌幸存者中,91.7%为白人女性,平均年龄为65岁。71.7%的幸存者在过去12个月内进行了监测乳腺X线摄影,而28.2%没有。被诊断时间 > 5年(p < 0.001)、在12个月内没有进行常规体检(p = 0.045)、由于费用无法就医(p = 0.026)与幸存者的不坚持监测乳腺X线摄影指南显著相关。在种族和居住地区之间发现了一个显著的相互作用(p < 0.001)。与白人女性相比,居住在大都市/郊区的黑人女性更有可能接受监测指南(OR: 3.77;95% CI: 1.32-10.81); 然而,居住在非大都市地区的黑人女性接受监测乳腺X线摄影的可能性较白人女性低(OR: 0.04; 95% CI: 0.00-0.50)。 我们研究的发现进一步解释了社会经济差异对乳腺癌幸存者使用监测乳腺X线摄影的种族差异的影响。居住在非大都市县的黑人女性是未来研究和筛查和导航干预的重要亚组。©2023作者。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Mar 30
RossLawrenson,Chunhu...
Impact of diabetes on surgery and radiotherapy for breast cancer.
DIABETES & METABOLISM
本研究旨在检验糖尿病是否对治疗局部乳腺癌女性中手术和辅助放疗的使用产生影响。从特雷希塔·马泰·乌泰泰-新西兰全国乳腺癌基金会登记簿中筛选出2005年至2020年诊断为I-III期乳腺癌的女性,使用新西兰虚拟糖尿病登记处确定其糖尿病状况。检测的癌症治疗包括乳腺部分切除术(BCS)、乳腺切除术、乳腺切除术后的乳房重建和BCS后的辅助放疗。使用逻辑回归模型估计患有糖尿病的患者与未患糖尿病的患者在癌症治疗和治疗延迟(>31天)方面的调整后比值比(OR)和95%置信区间(95% CI)。我们在2005年至2020年期间确定了25,557名诊断为I-III期乳腺癌的女性,其中包括2906名(11.4%)患有糖尿病的女性。在调整其他因素后,总体而言,患有糖尿病的女性无手术风险差异(OR 1.12,95% CI 0.94-1.33)大,但糖尿病组I型疾病患者未接受手术更有可能(OR 1.45,95% CI 1.05-2.00)。与非糖尿病组相比,患有糖尿病的患者更有可能手术延迟(调整后的OR为1.16,95% CI为1.05-1.27),并且不太可能在乳腺切除术后进行重建,调整后的OR为0.54(95% CI为0.35-0.84),II型为0.50(95% CI为0.34-0.75),III型为0.48(95% CI为0.24-1.00)。糖尿病与接受手术的可能性降低以及手术延迟增加有关。患有糖尿病的女性也较少在乳腺切除术后进行重建。在考虑可能影响患有糖尿病女性的结局因素时,这些差异需考虑,特别是针对毛利、太平洋和亚洲女性。©2023年。作者(们)。
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