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GENES & DEVELOPMENT
2023 Mar 01

FangyuanZhao,MinoruM...
Racial Disparities in Pathological Complete Response Among Patients Receiving Neoadjuvant Chemotherapy for Early-Stage Breast Cancer.
GENES & DEVELOPMENT
在乳腺癌患者中,有关种族差异是否存在于新辅助化疗(NACT)后实现病理学完全缓解(pCR)的研究结果不一致。为了调查在实现pCR方面是否存在种族差异以及有哪些因素会导致种族差异,该单机构研究在芝加哥多种族流行病学乳腺癌队列(ChiMEC)的进行中确定了690名接受NACT的Ⅰ-Ⅲ期乳腺癌患者。包括2002年至2020年(中位随访时间:5.4年)之间被诊断的患者。186名ChiMEC患者的肿瘤-正常组织对的下一代测序数据得以获得,包括原发肿瘤和残留肿瘤样本。统计分析于2021年9月至2022年9月之间进行。分析了可能导致pCR差距的人口统计学、生物学和治疗因素。pCR定义为乳腺和腋窝结点中无侵袭性癌症,无论乳管内癌症如何。研究包括690名乳腺癌患者,平均年龄(SD)为50.1(12.8)岁。在355名白人患者中,有130人(36.6%)实现了pCR,而在269名黑人患者中,有77人(28.6%)实现pCR(P = 0.04)。未达到pCR与显着更差的总生存(校正危险比6.10;95%CI,2.80-13.32)有关。黑人患者与ERBB2+亚型的白人患者相比,实现pCR的可能性明显较低(校正比值比0.30;95%CI,0.11-0.81)。与ERBB2+疾病的白人患者相比,黑人患者更有可能具有MAPK通路变异(30.0%[20中的6]与4.6%[22中的1];P=0.04),这是一种可能导致抗ERBB2治疗耐药的机制。原发性肿瘤和残留肿瘤中的肿瘤突变负荷和几种基因的体细胞突变(例如,FGF4,FGF3,CCND1,MCL1,FAT1,ERCC3,PTEN)之间存在显着差异。本队列研究的结果表明,在不同类型的乳腺癌亚型中,NACT的反应存在种族差异,这种差异与生存率的差异相关。该研究强调了更好地理解原发性和残留肿瘤的生物学可能带来的潜在好处。
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Gastric Cancer
2023 Mar 30

SangjunLee,Han-Kwang...
Cross-phenotype association analysis of gastric cancer: in-silico functional annotation based on the disease-gene network.
Gastric Cancer
一个基因或变异体具有多效性作用,跨多个表型的遗传变异鉴定可以提供不同疾病或表型共享的生物通路的综合理解。发现与多种疾病相关的基因位点可以同时支持一般干预。几个元分析已经显示了与胃癌相关的遗传关联;然而,没有任何研究使用这种方法鉴定与其他表型的关联。
在这里,我们应用了疾病网络分析和基于基因的分析(GBA)来研究与胃癌相关的遗传变异体,同时与其他表型相关联。我们通过系统性全基因组关联研究(GWAS)与胃癌相关联的单核苷酸多态性(SNP)水平元分析和 GBA,将已发表的 SNP 变异体结果集成在一起,并将它们分成主要的与胃癌相关的基因。然后,我们进行疾病网络和表达性状定量基因位点(eQTL)分析,以评估跨表型关联和与胃癌相关的基因的表达水平。
共有七个基因(MTX1、GBAP1、MUC1、TRIM46、THBS3、PSCA 和 ABO)与胃癌以及血尿素氮(BUN)、肾小球滤过率(GFR)和尿酸(UA)相关联。此外,17 个 SNPs 调节了位于 1q22 上的基因的表达,24 个 SNPs 调节了位于 8q24.3 上的 PSCA 的表达,rs7849820 调节了位于 9q34.2 上的 ABO 的表达。此外,rs1057941 和 rs2294008 在 1q22 和 8q24.3 中具有最高的后验概率,成为潜在的影响性 SNP 候选。
这些发现确定了七个与胃癌相关的基因,表现出与 GFR、BUN 和 UA 的交叉关联。© 2023年。作者在国际胃癌协会和日本胃癌协会的独家许可下。
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EXPERT REVIEW OF MOLECULAR DIAGNOSTICS
2023 Mar 29

MiaomiaoWang,Yinzhon...
Diagnostic and predictive value of liquid biopsy-derived exosome miR-21 for breast cancer: a systematic review and meta-analysis.
EXPERT REVIEW OF MOLECULAR DIAGNOSTICS
研究表明,在乳腺癌患者中,miR-21表达异常,提示miR-21可能作为一种可能的诊断生物标记物被利用于临床应用。为了提供研究支持的临床证据,我们在本研究中调查了miR-21在乳腺癌诊断中的效用。自创建以来至2022年1月23日,我们检索了PubMed、EMBASE、Web of Science、Cochrane Library和Scopus数据库的所有相关英文文献。使用QUADAS-2评估文献质量,使用GRADE评估证据等级。使用R 4.0.1和Revman 5.3进行统计分析。使用Stata 15.1软件对结果进行验证。还根据miR-21和miR-21组合的来源进行亚组分析。共回顾了9篇文献,涉及2048名患者。所有纳入的研究均为中高质量。使用混合效应模型进行了荟萃分析。汇总敏感度、特异度、诊断比值比(DOR)、阴性似然比(NLR)和阳性似然比(PLR)分别为0.91 [95% CI (0.86, 0.95)]、0.85 [95% CI (0.77, 0.91)]、56.62 [95% CI (21.00, 184.83)]、0.11 [95% CI (0.05, 0.18)]和6.35 [95% CI (3.66, 11.16)]。miR-21的GRADE分类为A,表明强烈推荐用于乳腺癌筛查。现有证据表明,miR-21作为乳腺癌生物标志物具有足够的诊断价值。通过与其他miRNA结合,其诊断精度可以进一步提高。基于GRADE综述,强烈推荐miR-21用于乳腺癌筛查。
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EUROPEAN RADIOLOGY
2023 Mar 30

HaimingLi,SongqiCai,...
Prediction of platinum resistance for advanced high-grade serous ovarian carcinoma using MRI-based radiomics nomogram.
EUROPEAN RADIOLOGY
该研究旨在探讨放射组学诊断模型的价值,以识别铂抗性并预测晚期高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)患者的无进展生存期(PFS)。这项多中心回顾性研究对301名患有高级别HGSOC的患者进行放射组学特征提取,从增强T1WI和T2WI获得了整个原发肿瘤的放射组学特征。使用基于支持向量机的递归特征消除方法选择放射组学特征,然后生成放射组学标志。进一步通过多元逻辑回归将放射组学标志和临床特征结合起来建立了放射组学诊断模型。采用接受者操作特征曲线分析来评估其预测性能。使用净再分类指数(NRI)、综合判定提升(IDI)和决策曲线分析(DCA)来比较不同模型的临床效用和益处。选择5个特征与铂抗性显著相关来构建放射组学模型。结合FIGO分期、CA-125和残留肿瘤等三个临床特征,生成了放射组学诊断模型,其面积ROC曲线下面积(AUC)较单独的临床模型高(AUC:0.799 vs 0.747),且NRI和IDI为阳性。放射组学诊断模型的净效益通常高于单独的临床模型和放射组学模型。卡帕兰梅尔生存分析表明,在晚期HGSOC患者中,放射组学诊断模型定义的高风险组的PFS比低风险组短。放射组学诊断模型可以识别铂抗性并预测PFS,有助于进行个体化治疗管理。•基于放射组学的方法有潜力识别铂抗性,并有助于进行高级别HGSOC的个体化治疗管理。•放射组学-临床诊断模型在预测铂抗性HGSOC方面表现出更好的性能。•提出的诊断模型在预测训练和测试集中低风险和高风险HGSOC患者的PFS时间方面表现良好。©2023年。作者,独家许可欧洲放射学会(ESR)。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Mar 28

MonuKumarKashyap,Aka...
The Cell Death and Signal Transduction Mechanisms in Colorectal Carcinogenesis: Recent Advances.
Disease Models & Mechanisms
在欠发达国家,结肠直肠癌(CRC)是一个重要的健康问题。它是癌症死亡的第三大原因。尽管有多种治疗选择,但需要新药物来减轻这种病情的严重程度。在结肠中,腺瘤性息肉是CRC的最常见原因,在45%的病例中出现,尤其是在60岁以上的患者中。炎性息肉在CRC中越来越受欢迎,炎症似乎在这种疾病中起着作用,根据越来越多的研究。 Azoxymethane,Dimethyl hydrazine,APCmin / +小鼠模型以及由葡聚糖,硫酸化和二甲基肼组成的硫酸酯多糖的组合是用于研究CRC的动物实验模型之一。随着CRC的进展,许多信号转导通路被牵涉其中。 p53,TGF-β,Delta-Notch,Salvador-Warts-Hippo(SWH)和Kelch-like ECH assocd。蛋白1通路是关键的信号转导途径之一。为了决定细胞命运,几个信号通路与细胞凋亡模式(如自噬,坏死和凋亡)并行工作。在我们的实验室中,我们花了很多时间研究CRC中的细胞信号和细胞死亡机制。这项研究总结了CRC的发病机制及其相关的细胞死亡和细胞信号通路。版权所有©Bentham Science Publishers;有任何疑问,请发送电子邮件至epub@benthamscience.net。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Mar 30

DanielWhite,Munawwar...
Targeting translation: a review of preclinical animal models in the development of treatments for chemotherapy-induced peripheral neuropathy.
Disease Models & Mechanisms
化疗在癌症的治疗中的扩大应用,同时导致了一个人数庞大且不断增加的癌症幸存者队伍,他们因为化疗引起的周围神经病变(CIPN)而长期残疾。白金类药物,紫杉醇,长春碱,硼替佐米和沙利度胺等常规药物与CIPN有关。这些不同类别的化疗药物,具有各种神经毒性机制,通常会导致患者患上广泛的神经病理症状,包括慢性麻木,感觉异常,丧失本体感知或振动感觉和神经痛。多年来,许多研究小组对这种疾病进行了大量研究,提供了重要见解。尽管有了这些进展,目前对CIPN没有有效的治疗方法,只有双重血清素-去甲肾上腺素再摄取抑制剂度洛西汀被临床指南推荐作为治疗疼痛性CIPN的症状性治疗。在本综述中,我们研究当前的预临床模型,分析其转化相关性和价值。动物模型对于更好地理解CIPN的发病机理起到了关键作用。然而,研究人员开发适当的预临床模型以发现可转化的治疗方法是具有挑战性的。进一步发展目标是转化相关性的预临床模型,将会促进在CIPN研究中的预临床结果的价值。本文章受版权保护。所有权利已保留。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Mar 30

JiahuiYang,FangliWu,...
Incidence and risk outcomes of second primary malignancy of patients with post-operative colorectal cancer.
Disease Models & Mechanisms
本研究旨在调查肠癌幸存者中二次原发恶性肿瘤(SPMs)发生率及其危险因素。进行了大规模人群队列研究。从1990年1月至2017年12月,从Surveillance、Epidemiology和End Results数据库的8个癌症登记处识别和提取了诊断为肠癌的患者数据。感兴趣的结果是一次发生肠癌之后SPM发病的百分比和常见部位。也报告了累计发病率和标准化发病率(SIRs)。然后,我们使用多变量竞争风险和Poisson回归模型估计了SPM发生的亚分布危险比(SHRs)和相对风险(RRs)。分析了152,402例肠癌患者。总体而言,23,816例肠癌幸存者(15.6%)报告了SPM发生。所有幸存者中,一次肠癌后SPMs发展的最高比例是第二个CRC,其次是肺和支气管癌。此外,CRC幸存者更容易发生第二个胃肠癌(GICs)。此外,与没有RT治疗的组相比,接受RT的患者中盆腔癌的比例相对较高。所有SPMs发病的累计发病率在近30年的随访中为22.16%(95% CI:21.82-22.49%)。一些因素,包括年龄较大,男性,已婚状态和CRC的局部分期与SPMs发生的高风险相关。在治疗特异性分析中,RT与SPMs发生率较高相关联(所有SPMs:14.08%vs. 8.72%;GICs:2.67%vs. 2.04%;CRC:1.01%vs. 1.57%;所有p<0.01)。此外,接受RT的患者中发生SPMs的风险高于NRT组内的患者(SHR:1.50,95% CI:1.32-1.71,p<0.01;RR:1.61,95% CI:1.45-1.79,p<0.01)。本研究描述了CRC幸存者中SPM的发病模式,并确定了SPM发生的危险因素。对于这些患者,肠癌诊断后的RT治疗可能会增加SPMs发生的风险。这些发现表明这些患者需要长期的随访监测。©2023年。作者(们)以Springer-Verlag GmbH德国的独家许可证,隶属于Springer Nature。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Mar 30

MilenaKlippelBessa,G...
Kefir as a therapeutic agent in clinical research: a scoping review.
DIABETES & METABOLISM
越来越多的研究针对益生菌在疾病治疗中的作用进行。Kefir是一种安全、低成本的益生菌发酵牛奶饮品,在许多体外和动物研究中被研究,但人体疗效剂量或治疗时间的参数尚未确定。为对使用Kefir作为治疗剂的临床研究进行范围性回顾,并编制结果以支持和指导进一步研究。该回顾基于Joanna Briggs研究所的指导方针,包括涉及人类Kefir发酵牛奶效应的研究。使用KEFIR一词,在主要国际数据库中搜索英语、西班牙语或葡萄牙语的研究,直到2022年3月9日。共确定了4个数据库中的5835篇文章,其中44篇符合分析条件。研究领域包括代谢综合征和2型糖尿病、胃肠健康/疾病、孕产妇健康和儿科、牙科、肿瘤学、妇女和老年人健康以及皮肤学。研究限制较多,阻碍了结果的一般化。小样本量、方法学差异以及Kefir类型、剂量和治疗时间的差异阻碍了对其特定疾病益处的清晰结论。我们建议按体重以毫升为单位使用传统制备的标准治疗剂量,使日常消费更为可行。研究表明,Kefir对未患有严重疾病的人群是安全的。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Mar 30

EdouardLFu,AndrewSLe...
Accuracy of GFR Estimating Equations in Patients with Discordances Between Creatinine and Cystatin C-Based Estimations.
DIABETES & METABOLISM
囊型蛋白酶抑制剂C(cystatin C)被推荐作为证实试验估算肾小球滤过率(eGFR)的一种方法,尤其是在需要更精确的估算以作出临床决策时。尽管基于肌酸酐和囊型蛋白(Creatinine and Cystatin)的eGFR(eGFRcr-cys)在研究中是最准确的估算,但在现实世界情况下,尤其是在基于肌酸酐(eGFRcr)和囊型蛋白C(eGFRcys)的eGFR不一致时,其是否准确仍然不确定。我们在瑞典斯德哥尔摩对6,185名成年人进行了测量静脉注射iohexol清除的GFR的参考,这些人同时也测量了肌酸酐、囊型蛋白C、和iohexol清除的9,404个值。我们评估了eGFRcr、eGFRcys和eGFRcr-cys与mGFR之间的表现,包括中位数偏差、P30和正确分类的GFR类别。我们将分析结果分为三个类别:eGFRcys比eGFRcr低20%以上(eGFRcyseGFRcr)。结果:在4,226个样本(样本总数的45%)中,eGFRcr和eGFRcys相似,三个估算公式表现相似。相比之下,当估算不一致时,eGFRcr-cys更准确。例如,当eGFRcyseGFRcr(样本总数的8%)时,中位数偏差分别为-4.5、8.4和1.4 ml/min/1.73m2。这些发现在患有心血管疾病、心力衰竭、糖尿病、肝病和癌症的个体中都是一致的。在临床实践中,当eGFRcr和eGFRcys差异较大时,eGFRcr-cys比eGFRcr或eGFRcys更准确。版权所有©2023年美国肾脏学会。
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DIABETES & METABOLISM
2023 Mar 30

AlexeyRaevsky,Oksana...
Developing a comprehensive solution aimed to disrupt LARS1/RagD protein-protein interaction.
DIABETES & METABOLISM
氨酰-tRNA合成酶是参与蛋白质合成和各种细胞生理反应的关键酶。除了它们标准的将氨基酸连接到相应的tRNA上的作用之外,它们还通过控制细胞内可溶性氨基酸的水平影响蛋白质稳态。例如,亮氨酰-tRNA合成酶(LARS1)充当哺乳动物雷帕霉素靶复合物1(mTORC1)的亮氨酸传感器,并可能作为mTORC1的异源激活因子RagD亚基的可能的GTP酶激活蛋白(GAP)。反过来,mTORC1调节细胞过程,如蛋白质合成、自噬和细胞生长,并涉及各种人类疾病,包括癌症、肥胖症、糖尿病和神经退行性疾病。因此,mTORC1抑制剂或破坏的mTORC1通路可提供潜在的癌症治疗方案。在本研究中,我们探究了阻止LARS感应和信号传递到mTORC1的结构要求。基于最近关于亮氨酸激活的mTORC1调节研究,我们奠定了针对mTORC1开发化学治疗剂的基础,这些化学治疗剂可克服对雷帕霉素的耐药性。使用组合的计算机模拟方法来开发和验证一种替代的互作模型,并讨论其优点和进展。最后,我们确定了一组化合物可供测试,以防止LARS1 / RagD蛋白质相互作用。我们为创建针对mTORC1的化学治疗药物奠定了基础,这可以征服对雷帕霉素的耐药性。我们利用计算机模拟方法生成和验证了一种替代的互作模型,概述了其优点和改进,并确定了一组新的物质可以防止LARS1 / RagD的相互作用。
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