研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Mar 22
LandenGozashti,Cedri...
Transposable element interactions shape the ecology of the deer mouse genome.
Cellular & Molecular Immunology
转座因子(TEs)的基因组景观在不同物种中变化巨大,有些TEs表现出比其他物种更容易在特定谱系上定殖的成功。 在哺乳动物中,LINE逆转录转座子通常比任何其他TE更常见。在这里,我们报告了鹿鼠Peromyscus maniculatus中TEs的异常基因组景观。与先前检查过的其他哺乳动物相比,LTR元素占鹿鼠基因组的比例更高(分别为11%和10%)。这种模式反映了相对较低的LINE活性和一次大规模的特定谱系内源性逆转录病毒(ERVs)入侵。鹿鼠ERVs具有各种起源,涵盖逆转录病毒分类学,表明它们一直是广泛的外源性逆转录病毒的宿主。值得注意的是,我们追溯了一条ERV谱系的起源,它约在5-18百万年前,源于猫白血病病毒的近亲,揭示了亚目间的水平传播。几个特定谱系的ERV亚科族群具有非常高的拷贝数,其中前五个最丰富的约占基因组的2%。我们还观察到Kruppel相关盒结构域含锌指基因(KZNFs)的大规模扩增,这些基因可能控制ERV活性,其扩张可能得到ERV之间的异位重组的促进。最后,我们发现ERV直接影响了LINE的进化轨迹,通过与它们竞争基因组位点并频繁破坏自主LINE拷贝。总之,我们的结果阐明了塑造独特鹿鼠TE景观的基因组生态学,揭示了导致哺乳动物基因组结构变异的进化过程。©作者(2023)。由牛津大学出版社代表分子生物与进化学会出版。
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Cellular & Molecular Immunology
2023 Mar 22
MdMasudAlam,TimothyG...
A Therapeutic Vaccine in Combination with Cyclic GMP-AMP Cures More Differentiated Melanomas in Mice.
Cellular & Molecular Immunology
我们已经发现了一种被称为TheraVac疫苗的组合免疫疗法,可以治愈多个大型的老鼠肿瘤,但它未能治愈小鼠黑色素瘤。TheraVac包含一个免疫刺激的臂,其中包括TLR4激动剂(HMGN1 [N1])和TLR7/8激动剂(R848),它们协同作用于激活肿瘤浸润性树突状细胞(DCs)并促进Th1免疫反应。第二臂使用免疫检查点阻滞,抗PDL-1,来减少肿瘤相关的免疫抑制作用。在本研究中,我们研究了TheraVac疫苗的一种辅助治疗,即IFN基因的刺激剂(STING)激动剂,环状鸟苷酸二磷酸腺苷(cGAMP),因为它们共同协同作用于激活DCs并产生更多的免疫刺激性IL-12p70和TNF-α细胞因子。DCS的协同激活和成熟取决于油罐结合激酶-1(TBK1)的活化。通过给予肿瘤内注射cGAMP和TheraVac来治疗三种不同的黑色素生成老鼠黑色素瘤(B16F1、M3和M4),可根除这些黑色素瘤的60-80%。TheraVac加cGAMP治疗的M3肿瘤的免疫谱显示,肿瘤中CD8+ CTLs和巨噬细胞增加。肿瘤中的CD4、CD8效应细胞和记忆T细胞也显著增加,并产生功能性的肿瘤特异性CTLs,这些CTLs定位于肿瘤引流淋巴结。结果是没有肿瘤的小鼠对同一种肿瘤的再次挑战有选择性的抵抗力,表明他们具有长期的肿瘤特异性保护性免疫力。总的来说,我们的发现对于临床试验具有重要意义,使用这些免疫治疗组合可以治愈生成黑色素的人体黑色素瘤,而无需外源性肿瘤抗原,在小鼠中也没有明显的毒性效应。
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CANCER RESEARCH
2023 Mar 22
AngelinaSBortoletto,...
KRAS Hijacks the MicroRNA Regulatory Pathway in Cancer.
CANCER RESEARCH
广泛的研究关注了癌症中单个 miRNA 的错调。最近,miRNA 的生物合成和加工机制的突变被认为与几种恶性肿瘤有关。这些突变可能导致全局 miRNA 错调,从而可能促进许多癌症的众所周知的特征。有趣的是,最近的证据也表明,致癌性 KRAS 突变在一定程度上通过调节 miRNA 调节通路中的成员的活动来发挥作用。在这里,我们强调了 miRNA 核心机制中的突变在促进恶性转化中的至关重要作用。此外,我们讨论了突变 KRAS 如何同时影响多个 miRNA 处理和功能步骤以促进肿瘤发生。虽然 KRAS 利用 miRNA 调节通路的能力增加了其致癌性的复杂性,但它也提供了一个尚未在临床上开发的潜在治疗途径。此外,同时针对突变 KRAS 和 miRNA 核心机制成员是治疗癌症的潜在策略。
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CANCER
2023 Mar 22
AakashDesai,NehaKRed...
Top advances of the year: Precision oncology.
CANCER
精准医学的出现改变了肿瘤生物标志物、药物发现、药物研发和更重要的是对癌症患者的治疗效果。精准肿瘤学包括对肿瘤进行基因组检测以检测可行的异常。通过肿瘤组织和液体活检中临床下一代测序技术的进步和有针对性治疗药物的可用性,已经迅速进入了主流临床实践。本文讨论了近期精准肿瘤学的主要进展,这些进展影响了癌症患者的治疗效果。快速的临床开发涉及各种基因突变谱,例如KRASG12C(被认为四十年来“无法药物治疗”)、Exon 20插入和RET基因突变。通过引入抗体药物结合物,精准化化疗的途径在对抗肺癌方面受到了赞赏。 © 2023美国癌症协会。
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Mar 15
Wen-YuYang,Li-PengLi...
[Clinical features and prognosis of juvenile myelomonocytic leukemia: an analysis of 63 cases].
Experimental Hematology & Oncology
调查幼年型髓系-单核细胞性白血病(JMML)的临床特征及其与预后的相关性。收集2008 年1 月至2016 年12 月收治的JMML 患儿的临床和预后数据,并分析影响预后的因素。共纳入63 名JMML 患儿,中位发病年龄为25 个月,男女比例为3.2∶1。54 名儿童进行了JMML 基因检测,其中PTPN11 突变最常见,23 名患儿(43%)具有该突变,其中19 名仅有PTPN11 突变,4 名有复合PTPN11 突变;NRAS 突变在14 名患儿(26%)中观察到,其中12 名仅有NRAS 突变,2 名有复合NRAS 突变。这些患有JMML 的儿童5 年总生存(OS)率仅为22%±10%。63 名患儿中,13 名(21%)接受了造血干细胞移植(HSCT)。HSCT 组5 年总生存率明显高于非HSCT 组(46%±14% 对29%±7%,P<0.05)。没有PTPN11 基因突变和有PTPN11 基因突变的患儿5 年总生存率之间没有显著差异(30%±14% 对27%±10%,P>0.05)。Cox 比例风险回归模型分析表明,诊断时血小板计数<40×109/L 是影响JMML 患儿5 年总生存率的因素(P<0.05)。JMML 中PTPN11 基因是最常见的突变基因。发病时的血小板计数与JMML 患儿的预后有关。HSCT 可以改善JMML 患儿的预后。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2023 Mar 22
MengshaTong,YuxiangL...
Prioritizing prognostic-associated subpopulations and individualized recurrence risk signatures from single-cell transcriptomes of colorectal cancer.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
结直肠癌(CRC)是最常见的胃肠恶性肿瘤之一,但对于CRC患者的复发风险标志很少。单细胞RNA测序(scRNA-seq)为预测标志检测提供了高分辨率的平台,但由于成本高,大多数单细胞实验缺乏临床表型信息,因此在大型队列中不实用。少数研究报道使用带有生存时间的外部批量转录组指导scRNA-seq数据中关键细胞亚种的检测。我们提出了scRankXMBD,这是一个基于单细胞转录组中基因对的同一细胞相对表达顺序,优先考虑与预后相关的细胞亚群的计算框架。与五种现有方法相比,scRankXMBD具有更高的准确度和一致性。此外,我们开发了单细胞基因对标志,可预测患者的复发风险。我们的工作促进了基于秩的方法在scRNA-seq数据中预测生物标记物的发现和精准肿瘤学的应用。scRankXMBD可在https://github.com/xmuyulab/scRank-XMBD获得(XMBD:厦门大数据,中国厦门大学国家数据科学健康医学研究所的生物医学开放软件计划)。 ©作者2023年。由牛津大学出版。保留所有权利。如需获得许可,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
2023 Mar 22
SuheilAlbertAtallah-...
Post-transplant lymphoproliferative disorder: Update on treatment and novel therapies.
BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY
移植后淋巴增生性疾病(PTLD)是罕见和异质性的淋巴增生,由于实体器官移植(SOT)和造血干细胞移植(HSCT)后的免疫抑制而发生,其中大部分由EBV驱动。尽管某些组织学类似于免疫能力患者中观察到的淋巴肿瘤,但由于病理生物学差异和治疗并发症风险较高,PTLD的治疗可能不同。在未能减少免疫抑制(RIS)的SOT PTLD中,最常见的治疗方法考虑以基于第2期研究的利妥昔单抗+/-化疗的风险分层序列算法。在HSCT PTLD中,仅RIS和化疗通常无效,利妥昔单抗+/- RIS成为一线治疗的黄金标准。在本篇综述中,我们将介绍RIS以外的PTLD治疗更新情况。我们强调了最近尝试将更激进的化疗方案和新型治疗纳入传统的风险分层序列方法的研究。我们还探讨了EBV-细胞毒素T淋巴细胞在治疗EBV驱动的PTLD中的作用。此外,我们还将讨论其他有潜力在PTLD中发挥作用的新型药物,以及在这个人群中采用嵌合抗原受体T细胞疗法和免疫检查点抑制剂可能会带来的挑战。 ©2023 The Authors. British Journal of Haematology由英国血液学会和John Wiley&Sons Ltd.出版
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Brain Structure & Function
2023
ARCCForte,PHCLessa,A...
Oxidative stress and inflammatory process in borderline personality disorder (BPD): a narrative review.
Brain Structure & Function
边缘型人格障碍(BPD)是一种严重的精神疾病,影响了高达2.7%的人口,与功能障碍和自杀行为高度相关。尽管其严重性,对其病理生理知识的了解还非常缺乏。研究表明遗传因素和童年暴力可能是导致BPD发展的因素,然而,神经炎症在BPD中的作用仍然缺乏研究。本文旨在探索BPD的病理生理机制,根据脑源性神经营养因子(BDNF)、炎症细胞因子和加剧神经元损伤的氧化应激物质的水平。目前,这一主题的文章非常少。它们表明,BPD患者外周血中BDNF水平较低,而肿瘤坏死因子(TNF)-α和白细胞介素(IL)-6水平较高,与氧化应激标志物如丙二醛和8-羟基-2-脱氧鸟苷酸等增加的血浆水平相关。因此,有必要进一步研究该主题,主要集中在临床前和临床方面。
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Brain Structure & Function
2023 Mar 22
GeorgeHBGreenhall,Br...
Organ Transplants From Deceased Donors With Primary Brain Tumors and Risk of Cancer Transmission.
Brain Structure & Function
癌症传播是器官移植受者所面临的已知风险。很多人等待合适的移植物已经等了很久,但有些人可能永远没有机会接受移植。虽然患有脑肿瘤的病人可以捐赠器官,但人们对于捐赠的风险意见不一。本研究的主要目的是确定来自在世脑肿瘤患者的器官移植与癌症传播的风险,其次目标则是研究捐献者脑肿瘤与器官使用和移植后存活之间的关系。 本研究为英格兰和苏格兰的队列研究,从2000年1月1日至2016年12月31日进行,后续调查到2020年12月31日。本研究使用了来自英国移植登记处、英格兰国家癌症登记与分析服务以及苏格兰癌症登记处的有效国家身份证号的死亡捐赠者和实心器官移植受者的链接数据。次要分析中,对比组匹配了可能影响器官使用或移植失败概率的因素。本研究的数据统计分析从2021年10月1日至2022年5月31日进行。 本研究通过疾病代码在全部三个数据来源中确定了器官捐献者的原发性脑肿瘤史。本研究的主要结果为,来自器官捐赠者的脑肿瘤传播到移植受者的情况很少见。次要结果为器官使用(即接受提供的器官的移植),以及肾脏、肝脏、心脏和肺移植及其受者的存活。捐献者中的主要协变量为肿瘤等级和治疗史。 本研究共纳入了282位捐献者(年龄中位数[IQR]为42[33-54]岁;女性154位[55%])及其887个移植,其中778个(88%)参与了主要结果的分析。这些移送来自262位高级别捐献者以及494位之前进行过神经外科手术或放射治疗的捐献者。移植受者的中位(IQR)年龄为48(35-58)岁,其中476(61%)为男性。在79位接受来自脑肿瘤患者捐赠的移植物的移植受者中,68位在6(3-9)年中出现了83个移植后恶性肿瘤(不包括非黑色素皮肤癌),但没有发现与捐献者脑肿瘤组织类型相匹配的恶性肿瘤。移植存活率与比较组相当。与比较组相比,肾脏、肝脏和肺器官使用率较低。 本队列研究的结果表明,来自原发性脑肿瘤死亡捐献者的器官移植传播癌症的风险比先前预估的要低,即使是来自高危捐献者的情况也一样。长期移植结果是有利的。这些结果表明,可能可以安全地扩展这些捐献者群体的器官使用。
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Brain Structure & Function
2023 Dec
ZifaZhang,ShumingLiu
The interaction between ASF1B and TLK1 promotes the malignant progression of low-grade glioma.
Brain Structure & Function
低级别胶质瘤(LGG)是成年人第二常见的脑恶性肿瘤,严重威胁患者健康并有高复发率。组蛋白H3/H4伴侣抗沉默功能1B(ASF1B)与肿瘤的启动和发展紧密相关。讨论了ASF1B在LGG中的表达和调节机制。GEPIA数据库预测了LGG患者中ASF1B的表达以及ASF1B与LGG患者的总生存率和无病生存率的关联。TCGA数据库研究了ASF1B在LGG患者中的独立预后价值。采用RT-qPCR和Western blot评估了LGG细胞系中ASF1B的表达。抑制ASF1B表达后,CCK8和集落形成实验评估细胞增殖。流式细胞术分析和TUNEL实验评估细胞周期和凋亡。创口愈合和转移实验测量细胞迁移和侵袭能力。西方印迹测试增殖、周期、凋亡和转移相关蛋白的表达。STRING和GeneMANIA数据库预测了ASF1B和发缭样激酶1(TLK1)之间的关系。ChIP实验证实了ASF1B与TLK1的亲和力。随后,过度表达TLK1并干扰ASF1B表达,执行功能实验。发现ASF1B在LGG组织和细胞中增加,提示LGG患者预后不良。ASF1B不是LGG的独立预后因素。ASF1B缺陷阻碍了LGG细胞的增殖、周期和转移,并诱导细胞死亡,可能是通过与TLK1的相互作用实现的。ASF1B和TLK1之间的相互作用促进了LGG的恶性进展。要点TLK1与ASF1B相互作用。干扰ASF1B抑制了LGG细胞的增殖、侵袭和迁移能力,并诱导了细胞周期阻滞,同时引起了凋亡。ASF1B和TLK1之间的相互作用促进了LGG的恶性进展。
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