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Computational and Structural Biotechnology Journal
2023

Thi-OanhTran,ThanhHo...
ALDH2 as a potential stem cell-related biomarker in lung adenocarcinoma: Comprehensive multi-omics analysis.
Computational and Structural Biotechnology Journal
肺腺癌(LUAD)是最普遍的肺癌之一,也是导致死亡的主要原因之一。以往的研究发现肺腺癌与戊二醛脱氢酶2(ALDH2)存在联系,后者是醛脱氢酶基因超家族的一员。本研究通过分析LUAD患者ALDH2的表达水平、表观遗传机制和信号活动等,识别出了额外的用于早期LUAD识别和瞄准LUAD治疗的有用预测标志物。研究结果表明,ALDH2基因和蛋白表达在LUAD患者样本中显著下调。此外,美国癌症联合委员会(AJCC)报告认为,ALDH2表达降低与不同阶段的LUAD患者综合生存率密切相关。值得注意的是,ALDH2在LUAD癌症中存在异常的DNA甲基化状态。在多个细胞生物信号通路的蛋白组表达谱中,ALDH2被发现在干细胞相关的通路中下调。最后,报告了ALDH2活性与干细胞相关因子和免疫系统之间的关系。总之,ALDH2下调、DNA甲基化异常和干细胞信号通路缺失是LUAD相关的预测和治疗标志物。© 2023 The Author(s)。
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Frontiers in Endocrinology
2023

JiaojiaoMa,YuanWang,...
Contrast-enhanced ultrasound combined targeted microbubbles for diagnosis of highly aggressive papillary thyroid carcinoma.
Frontiers in Endocrinology
高侵袭性乳头状甲状腺癌(PTC)的准确诊断可以帮助避免PTC的过度诊断和过度治疗,但仍缺乏一种方便而准确的诊断方法。定向微泡是一种新兴的超声造影剂,具有准确诊断高侵袭性PTC的潜力。为了设计和制备一种特定对比增强超声(CEUS)成像高侵袭性PTC的定向微泡,本研究以高侵袭性PTC细胞表面过度表达的β-半乳糖苷结合蛋白酵母菌(Gal-3)为靶点,将与Gal-3具有高亲和力和特异性的C12多肽(ANTPCGPYTHDCPVKR)连接到脂质微泡表面,制备出定向微泡(Gal-3-C12@lipo MBs)。使用薄膜水合法和机械振荡法制备定向微泡,并通过荧光显微镜和AccuSizer研究微泡的形态、直径、浓度和稳定性。通过CCK8法研究微泡的生物安全性。应用共聚焦激光扫描显微镜和流式细胞术研究微泡的细胞摄取以研究对高侵袭性PTC的定向能力。最后,通过临床超声成像系统验证了定向微泡在携带皮下BCPAP肿瘤模型的小鼠中,对高侵袭性PTC的特异性对比增强超声成像。
成功制备了Gal-3-C12@lipo MBs,其显示出明确定义的球形形态,平均直径为1.598±0.848μm。经过制备后4小时,Gal-3-C12@lipo MBs表现出良好的稳定性,不会破裂。在细胞水平上,Gal-3-C12@lipo MBs表现出良好的生物安全性和对BCPAP细胞的优越定向能力,其细胞摄取率比非定向脂质微泡(Lipo MBs)高2.8倍。在动物水平上,Gal-3-C12@lipo MBs显着提高了高侵袭性PTC的对比增强超声成像质量,肿瘤的回声强度显着高于Lipo MBs。
我们设计和制备了一种新型的定向微泡,用于高侵袭性PTC的特定超声成像诊断。该定向微泡具有良好的稳定性、优越的生物安全性和高定向特异性,可以显著提高高侵袭性PTC的肿瘤信噪比,有望促进高侵袭性PTC的准确诊断。版权所有©2023 Ma、Wang、Xi、Tang、Wang、Wang、Wang、Liang和Zhang。
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Frontiers in Endocrinology
2023

XuwenLi,SongXiao,Yue...
Robotic-assisted laparoscopic adrenalectomy (RARLA): What advantages and disadvantages compared to retroperitoneal laparoscopic adrenalectomy (RLA)?
Frontiers in Endocrinology
比较机器人辅助腹腔镜肾上腺切除术和后腹腔镜肾上腺切除术的优缺点。我们检索了2021年1月至12月期间在我们医院接受后腹腔镜肾上腺切除术(RLA)(n = 75)或机器人辅助腹腔镜肾上腺切除术(RARLA)(n = 26)的101名肾上腺肿瘤患者的回顾性资料,并比较了患者的人口统计学、肿瘤特征和围手术期指标。连续变量采用t检验进行统计分析,分类变量则采用Pearson卡方检验或Fisher精确检验。我们发现,RARLA组的出血量显著少于RLA组(66.9 ± 35.5毫升 vs 91.5 ± 66.1毫升,p = 0.020)。RARLA组的胃肠道功能恢复时间显著短于RLA组(19.9 ± 6.9小时 vs 32.0 ± 9.0小时,p < 0.001)。然而,与RLA组相比,RARLA组的手术时间、引流管插入时间和术后住院时间显著较长(149.6 ± 53.4分钟 vs 118.7 ± 41.2分钟,p = 0.003;4.9 ± 2.0天 vs 3.6 ± 1.1天,p = 0.004;6.4 ± 1.8天 vs 4.6 ± 1.6天,p < 0.001)。RARLA组的住院费用显著高于RLA组(59284 ± 8724元 vs 39785 ± 10126元,p < 0.001)。我们发现两组患者术后并发症的发生率没有显著差异。然而,两组病理类型存在显著性差异。RLA组患者的肾上腺皮质腺瘤比例较高,而RARLA组患者的嗜铬细胞瘤比例较高。与传统的腹腔镜肾上腺切除术相比,机器人辅助腹腔镜肾上腺切除术可以显著减少术中出血量并加速术后胃肠道恢复。我们致力于研究如何减少RARLA的住院时间和住院费用,以便使RARLA更广泛地应用。版权所有 © 2023 Li、Xiao、Yu、Liu、Xi、Wang和Zhou。
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Frontiers in Endocrinology
2023

BoXiao,MingweiLi,Min...
A large-scale screening and functional sorting of tumour microenvironment prognostic genes for breast cancer patients.
Frontiers in Endocrinology
本研究旨在系统地建立一个综合性的肿瘤微环境(TME)相关预后基因和靶向miRNA网络,以应用于乳腺癌患者。基于大规模筛选TME相关预后基因(760个基因)进行预后模型的建立。主要TME预后基因从构建数据库中挑选,并在测试数据库中验证。深入探究TME潜在预后基因与乳腺癌患者预后之间的内部关系。生成与TME预后基因相关的miRNA,并研究每个主要TME成员在乳腺癌细胞系中的功能。与兄弟对照组相比,乳腺癌患者表现出55个差异表达的TME预后基因,其中31个被认为是保护性基因,而其余24个基因被认为是风险基因。根据LASSO Cox分析的lambda值,15 个潜在的TME预后基因为:ENPEP、CCDC102B、FEZ1、NOS2、SCG2、RPLP2、RELB、RGS3、EMP1、PDLIM4、EPHA3、PCDH9、VIM、GFI1和IRF1。其中,CCDC102B存在着显著的线性内部关系,但其他TME预后基因与乳腺癌患者预后之间存在非线性关系。借助siRNA技术,我们沉默了每个TME预后基因的表达。其中7个TME预后基因(NOS2、SCG2、RGS3、EMP1、PDLIM4、PCDH9和GFI1)参与增强乳腺癌细胞的增殖、破坏细胞凋亡、促进细胞侵袭或迁移。另外6个TME预后基因(CCDC102B、RPLP2、RELB、EPHA3、VIM和IRF1)有利于维持细胞侵袭或迁移。只有两个TME预后基因(ENPEP和FEZ1)有利于细胞增殖和凋亡过程。本整合研究提出了一个创新的与TME相关的遗传功能网络,用于乳腺癌患者的应用。测量这些TME预后基因与疾病之间的外部关系,同时也研究了内部分子机制。版权所有©2023年Xiao、Li、Cui、Yin和Zhang。
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Frontiers in Endocrinology
2023

IonaraRodriguesSique...
Potential involvement of circulating extracellular vesicles and particles on exercise effects in malignancies.
Frontiers in Endocrinology
身体活动和锻炼已被广泛认为能预防、治疗和控制多种非传染性疾病。在这个背景下,不计其数的临床和预临床证据显示了锻炼潜在的作用,不仅能预防和生存癌症,还包括改善生活质量,包括心理成分、骨健康和癌症幸存者的消瘦。本文综述了循环细胞外和颗粒泡(EVP)载体作为显化素,在邻近或远处的组织(如肿瘤、免疫、骨和肌肉细胞)中发挥多种积极作用的潜在作用。我们强调了在锻炼诱导的EVPs变化中,微RNA的新角度及其在肿瘤预防中的益处,因为微RNA可以与错综复杂的生理病理过程有关。在这篇文章中,我们指出了以下潜在的微RNA:miR-150-5p、miR-124、miR-486和miRNA-320a,它们在临床结果和肿瘤微环境的参与中均有先前的发现,能调节细胞间的通讯和肿瘤生长。例如,高强度间歇有氧运动计划似乎能增加正常体重或超重女性循环的EVP中miR-150的含量。根据循环EVPs中miR-150-5p的含量与结直肠癌预后密切相关,miR-150的异位表达可能会减少细胞增殖、侵袭和转移。除了生物活性miRNA参与循环EVPs中及其途径与临床和预临床发现相关的作用,本篇综述还旨在支持EVPs货运和锻炼对肿瘤学的影响的进一步研究。版权所有©2023 Siqueira、Batabyal、Freishtat和Cechinel。
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Frontiers in Endocrinology
2023

XinghaoWang,JingSun,...
Bidirectional Mendelian randomization study of insulin-related traits and risk of ovarian cancer.
Frontiers in Endocrinology
众所周知,卵巢癌的发生和发展与患者体重以及体内各种内分泌因素密切相关。使用遗传随机化(MR)分析胰岛素相关特征和卵巢癌之间的双向关系。有关胰岛素相关特征的数据来自于来自10项研究的高达5567名无糖尿病患者,主要包括空腹胰岛素水平、胰岛素分泌速率、峰值胰岛素反应等。对于卵巢癌,选择了2021年新更新的英国生物库数据,其中相关的基因数据来自于199741名欧洲人。选择了遗传随机化方法,以反向方差加权(IVW)为主要估计,同时使用MR Pleiotropy,MR Egger,加权中位数和其他方法来检测数据的异质性以及是否存在多重有效性影响结论。在所有胰岛素相关指标(空腹胰岛素水平、胰岛素分泌速率、峰值胰岛素反应)中,选择了胰岛素分泌速率与卵巢癌发生之间存在因果关系(IVW,P < 0.05),即卵巢癌的风险随着胰岛素分泌速率的降低而增加。同时,我们测试了这个指标的异质性和多态性,结果不存在,保证了分析结果的准确性。反向因果分析显示两者之间不存在因果效应(P > 0.05)。胰岛素分泌速率的损伤对卵巢癌风险有因果关系,这一点已被门德尔随机化证实。这表明以胰岛素分泌为代表的人类葡萄糖代谢循环在卵巢癌的发病机制中起着重要作用,为预防卵巢癌的释放提供了新思路。版权所有©2023王、孙、李、蔡、陈、王、杨、刘、吕和王。
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Frontiers in Endocrinology
2023

QinTang,QinhuiLiu,Ya...
CRELD2, endoplasmic reticulum stress, and human diseases.
Frontiers in Endocrinology
CRELD2是囊泡蛋白家族囊泡蛋白质富含表皮生长因子样结构域(CRELD)蛋白质家族的成员,既是内质网(ER)驻留蛋白质,也是一种分泌因子。ER应激可以显著诱导CRELD2的表达和分泌。CRELD2在多种组织中广泛表达且表达水平不同,这表明它在不同组织中发挥着重要和多样化的作用。最近的研究表明,CRELD2与软骨/骨代谢平衡以及涉及ER应激的疾病,如慢性肝脏疾病、心血管疾病、肾脏疾病和癌症等有关。在本文中,我们首先总结ER应激,然后批判性地回顾CRELD2在各种人类疾病中的特性和功能的最新进展。此外,我们重点介绍了面临的挑战,并提出了未来探明CRELD2在人类健康和疾病中作用的方向。版权所有©2023 Tang, Liu, Li, Mo和He。
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Frontiers in Immunology
2023

YangyihuaZhou,GuiqiQ...
The application of Interleukin-2 family cytokines in tumor immunotherapy research.
Frontiers in Immunology
白细胞介素2家族包括6种细胞因子,即IL-2、IL-15、IL-4、IL-7、IL-9和IL-21,所有这些细胞因子都共享一个γ链。 IL-2家族的许多细胞因子已被报道为免疫细胞活化的驱动力。因此,研究人员长期以来一直尝试各种方法研究细胞因子的抗肿瘤效果。然而,由于细胞因子的半衰期短、稳定性差、容易导致炎症风暴和治疗安全窗口狭窄,这一领域一直不温不火。近年来,随着蛋白质工程技术的快速发展,一些经过改造的细胞因子在肿瘤免疫治疗中具有显著的效果,显示出不可抗拒的发展趋势。在本文中,我们将讨论IL-2家族的当前研究,主要关注经过改造的细胞因子在肿瘤免疫治疗中的应用和成就。 版权所有©2023 Zhou、Quan、Liu、Shi、Wu、Zhang、Gao和Luo。
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Frontiers in Immunology
2023

TingWang,LinHuang,Ji...
Systematic integration of machine learning algorithms to develop immune escape-related signatures to improve clinical outcomes in lung adenocarcinoma patients.
Frontiers in Immunology
免疫逃避最近成为肺腺癌(LUAD)免疫治疗效果的障碍之一。然而, LUAD中免疫逃逸标志物的临床意义和功能大多未被澄清。在本研究中,我们通过系统集成10种机器学习算法,构建了一个稳定准确的免疫逃避评分(IERS)。为了探索潜在的机制,我们进一步研究了不同IERS亚型的临床意义,功能状态,TME相互作用和基因组改变。此外,我们通过细胞实验验证了模型中最重要的变量。IERS是全生存的独立风险因素,优于传统的临床变量和已发布的分子标志物。基于IERS的风险分层可很好地应用于LUAD患者。此外,高IERS与更强的肿瘤增殖和免疫抑制有关。低IERS表现出丰富的淋巴细胞浸润和活跃的免疫活性。最后,高IERS对LUAD的一线化疗更为敏感,而低IERS对免疫治疗更为敏感。总之,IERS可能作为一个有前途的临床工具,以改善个体LUAD患者的风险分层和临床管理,并增进对免疫逃避的理解。版权所有© 2023 Wang、Huang、Zhou和Li。
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Frontiers in Immunology
2023

FukaiWen,FanshuaiMen...
Characterization of prognostic value and immunological roles of RAB22A in hepatocellular carcinoma.
Frontiers in Immunology
编码蛋白基因RAB22A属于RAS癌基因家族,在某些癌症中会被扩增或过度表达。然而,它在肝细胞癌(HCC)中的作用机制仍不清楚。本研究旨在探讨RAB22A与HCC生存预后的关系,以及RAB22A的生物学意义。我们进行了基于数据库的广泛癌症表达分析,评估RAB22A表达与HCC生存预后的关联。采用基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)以及基因集富集分析(GSEA)等方法,发现RAB22A在HCC中的各种潜在生物学功能和调控途径。采用单样本基因集富集分析(ssGSEA)法研究肿瘤免疫浸润。通过TCGA队列验证了N6-甲基腺苷酸修饰和有竞争的内源性RNA(ceRNA)的调节网络。RAB22A在HCC样本和细胞系中升高。HCC中RAB22A高表达与性别、种族、年龄、体重、TNM分期、病理分期、肿瘤状态、组织学分级、TP53突变状态和α胎儿蛋白(AFP)水平密切相关。RAB22A过表达表示不良预后,与总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)和无进展生存期(PFI)有关。GO和KEGG分析表明,与RAB22A相关的差异表达基因可能涉及蛋白酶体蛋白降解过程、ncRNA加工、核糖体亚基、蛋白丝/苏氨酸激酶活性、蛋白丝/苏氨酸激酶活性、内吞作用和非酒精性脂肪性肝病。GSEA分析表明,与RAB22A相关的差异表达基因可能涉及T细胞受体、共翻译蛋白、结合膜、轴突导向、核糖体、吞噬作用和真核生物翻译起始等。RAB22A在HCC中与N6-甲基腺苷酸表达相关,并建立了与RAB22A相关的ceRNA调节网络。最后,RAB22A表达与T辅助细胞、Tcm细胞和Th2细胞的浸润水平呈正相关,相反地,我们观察到与细胞毒性细胞、DCs和pDCs细胞的负相关。此外,RAB22A表达与HCC中的各种免疫标记组之间存在强相关性。RAB22A是改善HCC预后的潜在治疗靶点,并与免疫细胞浸润密切相关。 ©2023 Wen, Meng, Li, Li, Liu, Zhang, Zhao, Zhang, Wang, Ju, Cui and Lu.
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