前列腺癌基因组学研究对于理解前列腺癌生物学非常重要，它可以为临床提供相关的亚型分层、在精准医学背景下开发新的预后和预测标志物以及开发新的靶向治疗方案。近期研究提供了前列腺癌的基因组、表观遗传组和蛋白质组的详细见解，包括原发性和转移性去势抵抗型前列腺癌(mCRPC)。许多突变已被发现，包括早期的癌变和进展，以及在治疗影响下晚期导致耐药的突变。发现了大量特征性的突变信号通路，如发现DNA修复通路的突变在23％的mCRPC中，这表明可能对PARP抑制剂有响应。前列腺癌的多灶和肿瘤内基因组异质性使得基因组的临床应用变得复杂。尽管在理解前列腺癌基因组方面已经有了很大的进展，并且与其日常应用相关的临床研究正在进行，但前列腺癌基因组学仍需要在前列腺癌患者中找到其标准广泛的日常应用。

欧洲癌症研究利益相关者于2022年10月在德国海德堡举行第5届Gago欧洲癌症政策会议，讨论欧洲当前的癌症研究和癌症护理政策情况。与会者强调了现有欧洲癌症研究计划中存在的差距，包括欧洲癌症计划（ECBP）、癌症使命（MoC）、了解癌症（UNCAN.eu）和联合行动CRANE，并提出了下一个优先事项，形成了海德堡癌症研究宣言。本次会议报告呈现了所有讨论内容，重点关注了如何有效塑造翻译、预防、临床和结果癌症研究的基础设施，注重实施和可持续性，并同时参与患者和公众。此外，我们总结了有关如何引入欧洲癌症研究数字化框架的建议。最后，我们讨论了建立欧洲协作癌症研究环境所需的结构、承诺和资源，以实现创新所需的规模。本文受版权保护。保留所有权利。

早产儿患有神经发育障碍的风险增加，包括自闭症谱系障碍（ASD）。胎盘是神经发育过程的关键调节因子，尽管精确的分子机制尚不清楚。在这里，我们采用多组学方法，识别出与在儿童早产出生时与ASD诊断相关的胎盘转录组和表观遗传修饰。在极低孕龄（ELGAN）队列中开展工作，我们假设炎性胎盘环境将预测10岁时的ASD诊断。将368名ELGAN（28名ASD患者和340名无ASD的孩子）之间的胎盘信使RNA (mRNA)表达、CpG甲基化和microRNA (miRNA)表达进行比较。共有111个基因显示与ASD相关的胎盘表达水平。在这些ASD相关基因中，包含了一个ASD调控复合物，其中关键基因预测了ASD病例状态。预测ASD病例状态的表达基因包括Ewing 肉瘤断点区域1（EWSR1）（OR: 6.57（95% CI: 2.34, 23.58））和邻近锌指结构域2A的Bromodomain（BAZ2A）（OR：0.12（95% CI：0.03,0.35））。此外，111个ASD相关基因中，9个（8.1％）与CpG甲基化水平有关联，而14个（12.6％）与miRNA表达水平有关联。在其中，LRR结合FLII交互蛋白1（LRRFIP1）被发现受CpG甲基化和miRNAs的控制，显示OR为0.42（95％ CI：0.17,0.95）。这些其中的基因，以及被识别出具有功能表观突变的其他基因，在免疫系统调节和炎症反应中起着关键作用。总之，利用多组学方法识别出与早产儿ASD发展相关的胎盘功能表观突变，为未来干预提供了途径。 ©2023InternationalSocietyforAutismResearch and WileyPeriodicalsLLC。

越来越多的证据表明，异常表观遗传修饰与癌症的发生密切相关。因此，对表观遗传修饰的敏感和特异性检测可显著改进生物学研究和癌症精准医学。过去几年中，分子成像方法在癌症诊断和预后方面得到了快速发展。各种独特于表观遗传修饰的生物标志物和靶向成像探针已被表征和用于区分癌细胞和健康组织，以及评估治疗反应。在本研究中，我们总结了最新的与表观遗传修饰目标的光学分子成像相关的研究，如涉及 DNA 甲基化、组蛋白修饰、非编码 RNA 调控和染色体重塑等，并进一步回顾它们在癌症诊断和治疗上的临床应用。最后，我们还对癌症表观遗传修饰的精确成像提出了未来方向。在光学分子成像技术和表观遗传药物的有希望的临床和临床前研究的支持下，人们应更加认识和接受表观遗传修饰在癌症中的核心作用。©国际人类表型研究所（上海）2022。

背景：石斛（Dendrobium nobile, D. nobile）是一种传统中药，近年来作为抗肿瘤药物备受关注，但其机制仍不清楚。本研究采用网络药理学、生物信息学和体外实验，探讨D. nobile中活性成分石斛素A对胰腺导管腺癌（PDAC）的作用和机制。 方法：利用SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库获取石斛素A的潜在靶点，从The Cancer Genome Atlas和Genotype-Tissue Expression数据库获取PDAC与正常胰腺组织的差异表达基因（DEGs）。基于STRING数据库构建了石斛素A抗PDAC靶点的蛋白质相互作用（PPI）网络，采用分子对接评估石斛素A与抗PDAC靶点的结合情况。在临床组织芯片上免疫组化染色PLAU，其中PLAU是石斛素A抗PDAC的关键靶点之一。最后，利用体外实验验证石斛素A对PDAC细胞的PLAU表达、增殖、凋亡、细胞周期、迁移和侵袭的影响。 结果：筛选出90个石斛素A抗PDAC的基因，构建了石斛素A抗PDAC靶点的PPI网络。值得注意的是，PPI中的一个无标度模块包含19个基因，表明PPI非常可信。在这19个基因中，PLAU与癌性恶病质状态呈正相关，与PDAC患者总体生存率呈负相关。分子对接表明，石斛素A与PLAU结合，石斛素A处理导致PDAC细胞PLAU表达下降。基于临床组织芯片，PLAU蛋白在PDAC细胞中高表达，与PDAC分化和淋巴结转移状态有关。体外实验进一步显示，石斛素A处理显著抑制PDAC细胞的增殖、迁移和侵袭，诱导凋亡，阻滞PDAC细胞在G2/M期的细胞周期。 结论：石斛素A是D. nobile中有效的抗PDAC活性成分，通过靶向PLAU来抗击PDAC。我们的结果为基于D. nobile的未来PDAC治疗提供了基础。Copyright © 2023 Xu，Yu，Yang，Wang，Fan，Ruan，Zhang，Dai，Mei，Jie和Zheng。

溃疡性结肠炎（UC）是一种炎症性肠道疾病，通常以肠道的慢性、持续、反复和非特异性溃疡为特点。其主要临床表现包括腹痛、腹泻和带血便。这种疾病难以治愈，甚至有致癌风险。世界卫生组织已将其列为现代难治性疾病。虽然有大量药物可用于抑制UC，但常规治疗如氨基水杨酸、糖皮质激素、免疫抑制剂和生物制剂具有一定限制和严重副作用。因此，迫切需要安全有效的UC药物，天然来源的黄酮类和黄烷类化合物表现出巨大的潜力。本研究集中讨论了过去20年中食用和药用植物中天然来源的黄酮类和黄烷类化合物在UC疗法方面的进展。天然来源的黄酮类和黄烷类物质对UC的潜在药理作用与肠道微生物组的调节、肠道屏障功能、炎症反应、氧化应激和细胞凋亡密切相关。天然黄酮类和黄烷类化合物的优异疗效和安全性使其成为UC抑制的潜在药物候选者。版权所有©2023李，唐，叶，祖和卢。

骨髓纤维化（MF）是一种寿命缩短的骨髓增生性肿瘤，具有多种特征，如克隆增殖、纤维化和脾肿大。直到最近，Janus Kinase (JAK) 1/2 抑制剂鲁索利尼布是唯一一种被批准用于MF中无法进行移植的患者并需要治疗症状和/或脾肿大的靶向治疗。然而，鲁索利尼布在3至5年的停药率很高，主要是由于失去疗效或毒性，这些患者没有随后的治疗。在2019年8月，选择性JAK2抑制剂费特拉替尼被美国食品和药物管理局批准用于中度2或高危主要或继发性MF的治疗，无论是否先前接受JAK抑制剂治疗，并用于管理症状和脾肿大。在本文中，我们讨论了费特拉替尼的开发、药理学和药代动力学以及临床开发和未来方向。我们使用pubmed搜索与费特拉替尼和骨髓纤维化相关的文章。费特拉替尼为无法继续使用鲁索利尼布的MF患者提供了第二线治疗。新的JAK抑制剂与其他靶向治疗的组合是必不可少的，以改善MF的管理。

卵巢癌是全世界女性生殖系统最常见的恶性疾病之一，其中多数卵巢癌病例被诊断为腹腔转移。上皮间充质转化（EMT）在肿瘤细胞转移中发挥着重要作用。但目前还不清楚长链非编码RNA（lncRNA）是否涉及EMT，以及是否影响卵巢癌细胞的浸润和转移。本研究旨在调查lncRNA AC005224.4对卵巢癌的影响。使用实时定量聚合酶链反应（qRT-PCR）测定了卵巢癌和正常卵巢组织中lncRNA AC005224.4、miR-140-3p和蜗牛家族转录抑制因子2（SNAI2）的表达水平。使用Cell Counting Kit-8（CCK-8）和Transwell（迁移和浸润）实验测量了SKOV3和CAOV-3细胞的增殖和转移。使用Western blot检测了E-cadherin、N-cadherin、Snail和Vimentin的含量。使用裸鼠异种移植实验验证了AC005224.4在体内的影响。双荧光素酶报告基因实验确认了miR-140-3p与AC005224.4或SNAI2之间的靶向关系。卵巢癌组织和细胞中观察到了AC005224.4和SNAI2的上调以及miR-140-3p的下调。静默AC005224.4明显减轻了SKOV3和CAOV-3细胞的增殖、迁移、浸润和EMT过程，并在体内抑制了肿瘤发生。miR-140-3p是AC005224.4的靶点，其表达水平受AC005224.4介导下降。miR-140-3p模拟子降低了卵巢癌细胞的增殖、迁移和浸润。SNAI2被确定为miR-140-3p的新靶点，其表达水平可以通过AC005224.4过表达或miR-140-3p沉默来促进。SNAI2的过表达也促进了卵巢癌细胞的生存能力和转移。通过吸附miR-140-3p和促进SNAI2表达，AC005224.4被确认为一个癌基因，有助于更好地理解卵巢癌的发病机制，并为开发针对卵巢癌的新型lncRNA导向治疗提供了线索。版权所有©2023年中国医师协会，由Wolters Kluwer, Inc.根据CC-BY-NC-ND许可证生产。

CD5分子样物（CD5L）在脂质代谢和免疫调节中起重要作用。本研究旨在探讨CD5L在肝肝细胞癌（LIHC）中的作用。我们分析了基于癌症基因组图谱和基因表达 omnibus 数据库的 CD5L mRNA 表达及其潜在预后价值。采用免疫组化分析研究 LIHC 组织中的 CD5L 水平。采用酶联免疫吸附测定法检测 LIHC 患者血清中的 CD5L 水平。使用细胞计数试剂盒-8（CCK-8）试剂探究 CD5L 处理对 HepG2 和 QSG-7701 细胞增殖的影响。基于 LinkedOmics 挖掘与 CD5L 表达相关的基因。进行与 CD5L 相关的基因 的基因本体论和京都基因与基因组百科全书分析。使用肿瘤免疫估计资源（TIMER）2.0 分析 CD5L 与肿瘤免疫浸润之间的相关性。与非肿瘤对照组组织相比，CD5L mRNA 和蛋白水平在 LIHC 肿瘤组织中显著降低。此外，LIHC 患者血清中的 CD5L 水平显著低于健康受试者。基因表达分析交互式分析筛选 2 和 Kaplan-Meier 生存分析表明，高 CD5L 表达与 LIHC 患者良好的总体生存率相关，除了患有肝炎病毒的 LIHC 患者。 CCK-8 结果表明，CD5L 治疗显著抑制了 HepG2 细胞的浓度依赖性增殖，并且 CD5L 治疗对非肿瘤肝细胞系 QSG-7701 的增殖没有影响。 CD5L 关联基因富集在免疫应答生物过程中，CD5L 表达水平与 CD8+ T 细胞和 M1巨噬细胞的免疫浸润呈正相关，而与 CD4+ T 细胞和 M0巨噬细胞的浸润呈负相关。外源性 CD5L 抑制肝细胞癌细胞增殖。 CD5L 可作为一种预后标志物的角色。版权所有©2023年中国医学会，由 Wolters Kluwer 公司根据 CC-BY-NC-ND 许可发布。

肿瘤细胞和肿瘤微环境（TME）的异质性与尿路上皮癌（UC）患者的临床结果和治疗反应显著相关。综合评估恶性细胞和TME之间的细胞多样性和相互作用，可以阐明UC进展的机制并指导新疗法的开发。本研究旨在扩展我们对UC内肿瘤异质性和免疫抑制TME的了解，并为开发新的UC疗法提供基础支持。研究对象包括在2020年7月至2020年10月间在我们医院接受根治手术的7名UC患者。我们在7个肿瘤和6个匹配的邻近正常组织中进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析，并将结果与两个公共scRNA-seq数据库集成。对单个细胞的功能特性和细胞间相互作用进行了表征，并使用多重免疫荧光染色、流式细胞术和大量转录组数据集对结果进行了验证。通过双边检验的R软件包进行了所有统计分析，合适地使用了威尔科克森秩和检验、对数秩检验、单因素方差分析（ANOVA）检验和皮尔逊相关分析。 无监督的t分布随机近邻嵌入聚类分析在尿路上皮组织中确定了十个主要细胞子簇。其中，注意到了七个上皮亚型，恶性上皮细胞具有增加的细胞增殖和降低的免疫原性。CD8+T细胞亚群在UC组织中表现出增强的细胞毒性活性以及增加的疲劳程度标志，CD4+T调节细胞的招募在肿瘤组织中也增加了。对于髓样细胞，浸润的中性粒细胞、极化的M2型巨噬细胞和LAMP3+树突状细胞的协调重编程有助于UC组织中的免疫抑制TME。肿瘤组织表现出由KDR+内皮细胞和RGS5+/ACTA2+平滑肌细胞介导的增强血管生成。通过解卷积分析，我们确定了多个细胞亚型可能影响UC患者的PD-L1免疫疗法反应。 我们的scRNA-seq分析证明了UC组织内的异质性，并描述了其促肿瘤和免疫抑制的微环境，从而为发现新的治疗靶点提供了可能。 版权所有©2023中国医师协会，由Wolters Kluwer，Inc.根据CC-BY-NC-ND许可证生产。