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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Mar 18

WeiWei,JuanhongWang,...
Tumor necrosis factor-α induces proliferation and reduces apoptosis of colorectal cancer cells through STAT3 activation.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
肿瘤坏死因子-α(TNF-α)是一种强有力的促炎症因子,在建立炎症和癌症之间复杂联系方面起着重要作用。根据许多研究,TNF-α促进了肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭和血管生成。研究表明,另一种重要的炎症细胞因子的下游转录因子STAT3在不同肿瘤特别是结肠直肠癌发展和进展中发挥了显著作用。在本研究中,我们研究了TNF-α通过STAT3激活在结肠直肠癌细胞的增殖和凋亡中的作用。本研究使用HCT116细胞系作为人类结肠直肠癌细胞。主要的实验包括MTT实验、逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)、流式细胞术分析和酶联免疫吸附实验(ELISA)。结果显示,与对照组相比,TNF-α显著增加了STAT3的磷酸化和与细胞增殖、生存和转移相关的所有STAT3靶基因的表达。此外,我们的数据显示,在存在TNF-α + STA-21的情况下,STAT3的磷酸化和靶基因的表达显著降低,与TNF-α治疗组相比,这表明基因表达的增加部分是由于TNF-α诱导的STAT3激活。另一方面,在存在TNF-α + IL-6R的情况下,STAT3的磷酸化和靶基因的mRNA水平部分降低,支持通过诱导肿瘤细胞产生IL-6的间接途径来激活TNF-α引起的STAT3的机制。鉴于日益增多的证据表明STAT3是炎症引起结肠癌的关键调节因子,我们的发现支持进一步研究STAT3抑制剂作为潜在的癌症治疗方法。©2023年该作者(作者)独家许可Springer-Verlag GmbH Germany部分Springer Nature。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Mar 18

YingYe,MenghanWang,G...
lncRNA miR4458HG modulates hepatocellular carcinoma progression by activating m6A-dependent glycolysis and promoting the polarization of tumor-associated macrophages.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
长链非编码RNA(lncRNA)在癌症不同生物学功能中发挥重要作用。然而,在人类肝细胞癌(HCC)患者的葡萄糖代谢中,它们的功能仍然大多未知。本研究利用HCC及配对完好的肝组织,通过qRT-PCR检测miR4458HG表达,并利用人类HCC细胞系,在转染siRNAs靶向miR4458HG或miR4458HG载体后,检测细胞增殖、集落形成和糖酵解。通过原位杂交、Western印迹、qRT-PCR、RNA pull-down和RNA免疫沉淀分析明确miR4458HG的分子机制。结果表明,miR4458HG影响了HCC细胞增殖,激活了糖酵解途径,在体内外模型中促进了肿瘤相关巨噬细胞的极化。miR4458HG通过结合IGF2BP2(关键的RNA m6A阅读器)并促进IGF2BP2介导的目标mRNA稳定性,包括HK2和SLC2A1(GLUT1),从而改变了HCC的糖酵解和肿瘤细胞生理。同时,HCC来源的miR4458HG可以包装在外泌体中,通过增加ARG1表达促进肿瘤相关巨噬细胞的极化。因此,miR4458HG在HCC患者中是致癌性的。为了开发有效的HCC治疗策略,医生应关注miR4458HG及其途径。 © 2023作者,独家许可Springer Nature Switzerland AG。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Mar 18

HuiZhang,Hong-RuiZha...
Discovery of novel S6K1 inhibitors by an ensemble-based virtual screening method and molecular dynamics simulation.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
核糖体蛋白S6激酶β-1(S6K1)被认为是治疗肥胖症、2型糖尿病和癌症等多种疾病的潜在靶点。开发新型的S6K1抑制剂是药物化学家们的紧急和重要任务。本研究应用一种有效的集合虚拟筛选方法,包括共通特征药效团模型、3D-QSAR药效团模型、朴素贝叶斯分类器模型和分子对接,从Biodeiversity数据库的29,158个化合物中发现了潜在的S6K1抑制剂。最终,7个命中物表现出可观的特性,被认为是抗S6K1的潜在抑制剂。此外,仔细分析这7个命中物与S6K1活性位点的关键残基之间的相互作用,并将其与参考化合物PF-4708671进行比较,发现有2个命中物呈现出更好的结合模式。为了进一步研究这两个命中物与在模拟生理条件下的S6K1之间的相互作用机制,进行了分子动力学模拟。S6K1-Hit1和S6K1-Hit2的ΔGbind能量分别为-111.47±1.29和-54.29±1.19 kJ/mol。此外,对这些结果的深层次分析表明,Hit1是最稳定的复合物,它可以稳定地结合到S6K1活性位点,与所有关键残基相互作用,并诱导H1、H2和M环区域的改变。因此,鉴定出的Hit1可能是开发新型S6K1抑制剂治疗各种代谢性疾病的有前途的先导化合物。©2023年作者,由Springer-Verlag GmbH Germany 的独家许可,属于Springer Nature的一部分。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Mar 18

EvanCCumpston,Steven...
Advances in Targeted Therapy for Neurofibromatosis Type 2 (NF2)-Associated Vestibular Schwannomas.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
神经纤维瘤病 2 型(NF2)是一种常染色体显性遗传疾病,其特征为双侧前庭神经鞘瘤(VS)、脑膜瘤、室管膜瘤、脊柱和周围神经鞘瘤、视神经胶质瘤和青少年白内障。正在进行的研究为 NF2 基因和梅林在 VS 肿瘤发生中的作用提供了新的见解。随着对 NF2 肿瘤生物学的了解日益加深,针对特定分子途径的治疗已经开发并在临床前和临床研究中进行了评估。NF2 相关VS是重要的致病因素,目前的治疗方法包括手术、放射治疗和观察。目前,没有经FDA批准的针对VS的医疗治疗方法,有选择性的治疗方法的开发是一个高优先级的问题。本文综述了 NF2 肿瘤生物学以及目前正在研究用于治疗 VS 患者的现有治疗方法。© 2023年,作者(S)独家授权Springer Science+Business Media,LLC,隶属于Springer Nature。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Mar 18

FionnualaCrowley,Son...
Adherence to NCCN Genetic Testing Guidelines in Pancreatic Cancer and Impact on Treatment.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
国家综合癌症网络(NCCN)2019年指南建议对胰腺癌(PC)患者进行全面的生殖细胞系列(GL)检测,因为不考虑癌症家族史的个体可能会以相似的发生率存在生殖系列突变(gMut)发生。对转移性疾病患者的肿瘤分子分析也是推荐的。我们的目的是确定我们机构进行遗传测试的比率、与测试相关的因素以及接受测试的患者的结果。我们检查了在2019年6月至2021年6月间,接受过2次以上访问的非内分泌性PC诊断患者中GL和体细胞检测的频率,并记录了临床病理学变量和治疗结果。总共有149名患者符合包含标准。其中66名患者(44%)接受了GL测试:42人(28%)在诊断时进行了测试,其余在治疗过程中进行了测试。GL测试的比率每年都在增加: 2019年为33%,2020年为44%,2021年为61%。癌症家族史是决定是否进行GL检测的唯一变量。8名患者(测试患者的12%)有病理gMut:BRCA1(1)、BRCA2(1)、ATM(2)、PALB2(2)、NTHL1(1)、CHEK2和APC(1)。除1名gBRCA患者外,均未接受PARP抑制剂,其余所有患者均接受了一线铂类治疗。98名患者(65.7%)进行了分子肿瘤检测(转移患者的66.7%)。2名持有BRCA2体细胞突变的患者没有进行GL测试。3名患者接受了靶向治疗。基于提供者的谨慎考虑进行的遗传测试会导致GL测试的低比率。遗传测试的早期结果可以对治疗决策和疾病轨迹产生影响。需要采取措施增加测试,但必须在现实世界的诊所环境中可行。©作者(2023) 。由牛津大学出版社出版。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Mar 18

XinWang,AndreaBeharr...
Feasibility of Point-of-Care Genomic Profiling in the Diagnosis and Treatment of Cancer of Unknown Primary.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
原句:Cancer of unknown primary remains a challenging clinical entity. Despite receiving empiric chemotherapy, median overall survival is approximately 6-12 months. Site-specific therapy based on molecular characterization has been shown to improve outcomes; however, feasibility outside of clinical trials, especially in community centers, is lacking. This study explores the application of rapid next-generation sequencing in defining cancer of unknown primary and to identify therapeutic biomarkers.
来源:这项研究探讨了快速下一代测序技术在定义原发癌未知的肿瘤(Cancer of unknown primary,CUP)和鉴定治疗生物标志物方面的应用。尽管接受了经验证的化疗,CUP的中位总生存期约为6-12个月,这仍然是一个具有挑战性的临床实体。基于分子特征的部位特异性治疗已被证明可以改善预后,但在临床试验以外,特别是在社区中心的可行性仍然不足。
翻译:原发癌未知的肿瘤仍然是具有挑战性的临床实体。尽管接受了经验证的化疗,中位总生存期约为6-12个月。基于分子特征的部位特异性治疗已被证明可以改善预后,但在临床试验以外,特别是在社区中心的可行性仍然不足。本研究探讨了快速下一代测序技术在定义原发癌未知的肿瘤和鉴定治疗生物标志物方面的应用。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Mar 18

JuliaYCo,JessicaAKle...
Toward Inclusivity in Preclinical Drug Development: A Proposition to Start with Intestinal Organoids.
Epigenetics & Chromatin
在药物开发过程中代表来自不同背景的人类是推进健康平等的关键,虽然临床试验设计近年来取得了更大的包容性进展,但在临床前药物开发方面仍然存在困难。其中一个包容性的障碍是当前缺乏强健、已建立的体外模型系统,能够同时捕捉人类组织的复杂性和代表病人多样性。在这里,提出使用原代人类肠器官模型作为推进包容性临床前研究的机制。这种体外模型系统不仅重新演绎了组织功能和疾病状态,还保留了捐献者的基因身份和表观基因组签名。因此,肠器官是捕捉人类多样性的理想体外原型。在这一观点中,作者呼吁整个行业努力利用肠器官作为起点,积极有意识地将多样性纳入临床前药物计划中。©2023 Genentech,Inc.由Wiley-VCH GmbH出版的Advanced Biology。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Mar 14

NadiahAbu,NurulAinaa...
Methylation Profile of Cancer Testis Antigens in Colorectal Cancer.
Epigenetics & Chromatin
背景:肿瘤抗原(CTA)是一类在许多癌症类型中经常过度表达的免疫刺激性抗原。CTA的使用作为免疫治疗靶点已在不同癌症中广泛研究,包括黑色素瘤、血液恶性肿瘤和结直肠癌。研究表明,CTA的表达受到其表观遗传调控的影响,如甲基化状态。然而,有关CTA甲基化状态的报告存在矛盾。CTA的一般甲基化特征,特别是在结直肠癌中的特征,仍然不明确。
目的:确定我们结直肠癌患者中所选CTA的甲基化特征。
方法:使用Infinium人类甲基化450K微阵列芯片对总共54对结直肠癌样本的DNA甲基化特征进行了分析。
结果:我们发现大多数CTA为低甲基化状态,而CCNA1和TMEM108基因是少数几个高甲基化的CTA之一。
结论:总体而言,我们的简要报告已经显示了结直肠癌中200多个CTA的甲基化特征,这可以用于进一步精细化免疫治疗靶点。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Mar 18

NikianaSimigdala,Ann...
Loss of Kmt2c in vivo leads to EMT, mitochondrial dysfunction and improved response to lapatinib in breast cancer.
Epigenetics & Chromatin
人类肿瘤的深度测序揭示了表观遗传调节因子在肿瘤发生过程中之前未被完全认识的作用。H3K4甲基转移酶KMT2C/MLL3在多种实体恶性肿瘤中发生突变,其中包括10%以上的乳腺肿瘤。为了研究KMT2C在乳腺癌中的抑癌作用,我们使用Cre重组酶将Kmt2c基因位点特异性敲除在小鼠乳腺腔上皮细胞系中,生成了Erbb2/Neu、Myc或PIK3CA驱动的肿瘤发生的小鼠模型。Kmt2c敲除小鼠的肿瘤早期发生,不受致癌基因的影响,将KMT2C划分为乳腺肿瘤发生的真正抑癌基因。Kmt2c丧失会引起广泛的表观遗传和转录改变,导致ERK1/2活性增加、细胞外基质重构、上皮-间充质转化和线粒体功能障碍,后者与增加的活性氧自由基产生有关。Kmt2c敲除使Erbb2/Neu驱动的肿瘤对拉帕替尼更具响应性。公开的临床数据集揭示了Kmt2c基因表达下调与更好的长期预后之间的关联。综上所述,我们的研究结果巩固了KMT2C在乳腺癌中的抑癌作用,并发现了可供治疗的依赖性。© 2023. 作者(们)。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Mar 18

GeorgiaPennarossa,Sh...
Combination of epigenetic erasing and mechanical cues to generate human epiBlastoids from adult dermal fibroblasts.
Epigenetics & Chromatin
本研究旨在开发一种新的协议,将表观遗传提示和机械刺激相结合,组装3D球形结构,任意定义为“epiBlastoids”,其表型与自然胚胎非常相似。使用三步方法生成epiBlastoids。在第一步中,成人皮肤成纤维细胞转化为滋养层(TR)样细胞,结合5-azacytidine的使用,抹去原有表型,与特定的诱导协议相结合,推动细胞向TR谱系发展。在第二步中,再次应用表观遗传抹去与机械感应相关提示相结合,生成内细胞团(ICM)样器官。具体而言,抹去的细胞被封装到微生物反应器中,以促进3D细胞重新排列和提高多能性。在第三步中,TR样细胞与ICM样的球体在同一微小反应器中共同培养。随后,新生成的胚囊体被转移到微孔中,以促进epiBlastoid的形成。成人皮肤成纤维细胞成功转移向TR谱系。经过表观遗传抹去和封装到微生物反应器中重新排列成3D ICM样结构的细胞。在同一微小生物反应器和微孔中共培养TR样细胞和ICM样球体会导致形成单一的结构,其形状均匀,类似于体内胚胎。CDX2 +细胞位于球体的外层,而OCT4 +细胞位于结构的内部。TROP2 +细胞显示YAP核积累,并积极转录成熟的TR标记物,而TROP2-细胞显示YAP细胞质分区,并表达多能性相关基因。我们描述了生成epiBlastoids的过程,它可能在辅助生殖领域找到有用的应用。 ©2023.作者(们)。
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