研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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ACTA PHARMACOLOGICA SINICA
2023 Mar 17
Wen-SiZhao,Kai-FengC...
Investigation of targets and anticancer mechanisms of covalently acting natural products by functional proteomics.
ACTA PHARMACOLOGICA SINICA
Eriocalyxin B(EB)、17-羟基-jolkinolide B(HJB)、parthenolide(PN)、xanthatin(XT)和andrographolide(AG)是供应多种有前途的抗肿瘤活性的萜类天然产物,它们通常具有亲电基(α,β-不饱和羰基和/或环氧化物)能够共价修饰蛋白质半胱氨酸残基。然而,它们的直接靶标和基础分子机制仍然不清楚,这限制了这些化合物的发展。在这项研究中,我们整合了活性蛋白质组学(ABPP)和定量蛋白质组学方法,系统地表征了这些天然产物的共价靶标和相关的细胞通路。我们首先证明了这五种化合物在三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231中的抗增殖活性。基于串联质谱标记(TMT)的定量蛋白质组学显示,这五种化合物通常影响泛素介导的蛋白质降解通路。 ABPP平台确定了EB和PN的特定修改靶点,这是两种具有高抗增殖活性的天然产物。生化实验表明,PN通过靶向泛素羧基末端酶10(USP10)抑制细胞增殖。总之,这项研究揭示了这些天然产物的共价修饰靶标和它们抗肿瘤活性的潜在分子机制。© 2023作者(专属于中国科学院上海药物研究所和中国药理学会)。
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Arthritis & Rheumatology
2023 Mar 17
ArturoGonzálezdelaAl...
Inhibition of LXR controls the polarization of human inflammatory macrophages through upregulation of MAFB.
Arthritis & Rheumatology
来源于单核细胞的巨噬细胞对炎症性疾病的发病起着贡献,它们的功效功能在很大程度上取决于优势的细胞外环境。M-CSF使巨噬细胞获取抗炎特征,而GM-CSF会驱动T细胞的刺激和促炎作用的巨噬细胞的生成。肝X受体(LXRα和LXRβ)是核受体,它们控制胆固醇代谢并调节组织驻留巨噬细胞的分化。类风湿关节炎和其他炎症病理学的巨噬细胞表现出富含的LXR途径,最近的报告表明LXR激活可以提高促炎效应并且有损M-CSF依赖的单核细胞来源的巨噬细胞(M-MØ)的获取抗炎特征。我们现在报道了LXR的抑制促进了在病理环境(类风湿关节炎患者的滑液)中以及人类单核细胞来源的巨噬细胞(GM-MØ)GM-CSF依赖分化时获取抗炎基因和功能特征的取得。机制上,LXR的抑制导致表达v-Maf鸟肌肉腱肌肉纤维肉瘤癌基因同源B(MAFB)转录因子更高的巨噬细胞,该转录因子统治着巨噬细胞的抗炎特征,以及MAFB调节的基因的过度表达。实际上,对人类巨噬细胞进行基因沉默实验表明MAFB对LXR抑制剂增强人类巨噬细胞的抗炎性是必需的。总之,我们的结果表明LXR抑制可以以MAFB依赖的方式促进人类巨噬细胞获取抗炎转录和功能特征,并提出使用LXR拮抗剂作为炎症反应期间巨噬细胞再编程策略的潜在治疗替代方案。© 2023.作者。
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Bone & Joint Journal
2023 Mar 17
FumiNakamura,Sachiko...
Progression to B acute lymphoblastic leukemia in 8p11 myeloproliferative syndrome with t(6;8)(q27;p12).
Bone & Joint Journal
8p11骨髓增生性肿瘤综合症是一种罕见的造血系统恶性肿瘤,由FGFR1易位引起。患者表现为骨髓增生性肿瘤,通常会演变成急性髓系白血病或T淋巴母细胞淋巴瘤/白血病。本文报道一例8p11骨髓增生性肿瘤综合症患者的分子研究,该患者发展为急性B淋巴母细胞白血病,然后转化为混合表型急性白血病。一名67岁的女性被诊断为具有t(6;8)(q27; p12)的骨髓增生性肿瘤,并接受了红细胞增多症的监测。四年后,她发展为急性B淋巴母细胞白血病,还有一个额外的染色体异常,即- 7。尽管接受了两个诱导疗程,但她未能实现完全缓解,白血病转化为混合表型白血病。对序列骨髓样本进行靶向测序,发现转化为B细胞白血病时存在RUNX1 L144R突变。在这两个诱导疗程之后,一些RUNX1突变阳性的白血病细胞获得了JAK2 V617F突变,这与髓系标记物的出现有关,包括髓过氧化物酶。©2023,作者。
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Bone & Joint Journal
2023 Mar 17
NoorAl-Jawuschi,Shiy...
Self-Assembly-Driven Bi2S3 Nanobelts Integrated a Silk-Fibroin-Based 3D-Printed Aerogel-Based Scaffold with a Dual-Network Structure for Photothermal Bone Cancer Therapy.
Bone & Joint Journal
多功能一体化生物材料在交叉学科研究中广受欢迎,可提供连续的肿瘤治疗和组织再生功能。本研究成功地制备出一种三维(3D)基于气凝胶的双网络结构复合支架,通过自组装和光交联产生,具有光热触发的控制性抗癌药物释放和光热癌细胞消融的综合性能。该复合支架的制备包括丝素甲基丙烯酸甲酯(SF-MA)生物高分子和水热驱动硫化铋(Bi2S3)甲基丙烯酸盐纳米带的自组装,然后进行光交联辅助的3D打印过程。开发的支架具有层次结构的孔隙率和优良的光热转换性能,得益于支架基质中含有的Bi2S3纳米带强烈的近红外光子吸收。通过激光照射在支架内产生的热量,不仅触发了抗癌药物的可控和持久释放,还显著地消融了附着在支架上的骨癌细胞。此外,这种开发的3D复合支架在不同介质中展示了有机和无机网络成分的优异生物降解性,使它们成为潜在的植入物,可被新生组织所代替。结合化疗和光热疗法,这种多功能的3D打印复合气凝胶支架预计将成为一种在骨组织工程中的出色的可植入材料,用于连续癌症治疗和组织再生。
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Cell Death & Disease
2023 Mar 17
XiaoShen,NathanObore...
The Role of Ferroptosis in Placental-Related Diseases.
Cell Death & Disease
自噬、坏死、凋亡及化脓性细胞死亡是一些已知的程序化细胞死亡方式,最近还发现了一种新的程序化细胞死亡方式——铁死亡。它通过红氧铁离子依赖的多不饱和脂肪酸(PUFA)含磷脂的羟基过氧化反应和损失脂质过氧化修复能力来定义。铁死亡最近与多种人类疾病(如肿瘤、缺血再灌注损伤、急性肾损伤、神经系统疾病和哮喘等)有关。有趣的是,铁死亡与胎盘生理和滋养层损伤相关。在胎盘发育过程中,由于缺氧再灌注和滞氧再氧合等原因引起的脂质活性氧(ROS)在滋养层中累积,滋养层的铁和PUFA丰富,以及生理子宫收缩或病理胎盘床灌注不足等其他原因也使得滋养层易受铁死亡的影响。滋养层的铁死亡会导致胎盘功能异常,可能涉及孕期糖尿病、先兆子痫、胎儿生长受限、早产和流产等胎盘相关疾病的发生和发展。滋养层铁死亡的调节机制仍需进一步探究。在本文中,我们总结了关于胎盘相关疾病滋养层铁死亡研究的最新进展,为深入理解其发病机制提供参考,并提出了预防和治疗胎盘相关疾病的新策略。©2023作者,独家授权给生殖研究协会。
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Cell Death & Disease
2023 Mar 08
YuxinGuo,XinpingZhan...
Metal-Phenolic Network-Facilitated "Foe-to-Friend" Conversion of Melittin for Cancer Immunotherapy with Boosted Abscopal Effect.
Cell Death & Disease
作为一种天然的溶血肽,蜂毒素(Mel)具有强烈的细胞溶解活性,并是一种强效的癌症治疗肽。然而,Mel的严重溶血活性在很大程度上阻碍了其临床应用。在本研究中,基于蛋白质/肽和多酚之间的强相互作用,我们开发了一种以丹宁酸-Fe3+ 金属-酚网络(MPN)为基础的策略,可以通过屏蔽其正电荷和减少其溶血活性,将Mel从敌人转化为朋友。此外,我们还引入了一种免疫佐剂resiquimod(R848)用于免疫刺激,提供最终的Mel和R848共载纳米药物。Mel引起的膜破坏可以诱导免疫细胞死亡用于免疫刺激,R848可以作为免疫佐剂进一步促进免疫刺激效应,而丹宁酸-Fe3+ MPN介导的费托反应可以产生反应性氧化物用于癌症治疗。进一步的实验表明,纳米药物能够有效地诱导肿瘤细胞的免疫细胞死亡,并引起强烈的肿瘤内和系统性抗肿瘤免疫刺激。在双侧肿瘤携带的小鼠模型中,纳米药物能够显著破坏原发性肿瘤,并提高远处肿瘤的造影效果。总之,MPN促进的“敌人变朋友”策略可以促进Mel的实际应用,并促进癌症免疫治疗的发展。Copyright © 2023 Yuxin Guo等人。
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PLoS Computational Biology
2023 Mar 17
HuiPeng,LimsoonWong,...
ProInfer: An interpretable protein inference tool leveraging on biological networks.
PLoS Computational Biology
在基于质谱分析(MS)的蛋白质组学中,从已鉴定的肽段(蛋白质碎片)推断蛋白质是关键的一步。我们提出了一种新颖的蛋白质组装方法,名为ProInfer(蛋白质推断),利用生物网络中的信息。ProInfer能够恢复仅由不确定性肽段(映射到多个蛋白质候选物的肽段)支持的蛋白质,并增强由唯一肽段和不确定性肽段同时支持的蛋白质的统计置信度。因此,ProInfer能够挽救支持较弱的蛋白质,从而提高蛋白组覆盖率。在THP1细胞系、肺癌和RAW267.4数据集上的评估中,与流行的蛋白质推断工具Fido、EPIFANY和PIA相比,ProInfer总是推断出最多的真阳性。ProInfer还擅长检索差异表达的蛋白质,标志着它在功能分析和表型分析方面的有用性。ProInfer的源代码可在https://github.com/PennHui2016/ProInfer获得。版权所有:©2023 Peng等人。本文是一篇开放获取文章,依照创作共用许可,允许在任何媒介上无限制使用、分发及复制,前提是保留原作者和出处的署名。
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PLoS Computational Biology
2023 Mar 17
LiangjieSun,YushanQi...
PCB: A pseudotemporal causality-based Bayesian approach to identify EMT-associated regulatory relationships of AS events and RBPs during breast cancer progression.
PLoS Computational Biology
乳腺癌转移期间,上皮间质转化(EM)发育过程异常激活。调控EM转化的转录调节网络已经得到良好的研究;然而,替代性RNA剪接在此过程中也扮演着关键的调控角色。替代剪接已被证明能够控制EM转化过程,RNA结合蛋白被确定为其中的调节剪接因子。对于EM转化期间替代剪接和RNA结合蛋白以及它们的动态作用对于乳腺癌的全面理解仍然相对缺乏。为了精确地研究动态调控关系,EM转化过程的时间序列数据是必不可少的。然而,目前仅有上皮和间质标本的横断面数据可用。因此,我们开发了一种伪时间因果贝叶斯(PCB)方法来推断替代剪接事件和RNA结合蛋白之间的动态调控关系。我们的研究为识别重要的RNA结合蛋白或靶向替代剪接事件进行癌症诊断或治疗的调节网络方法提供了帮助。 PCB的数据和代码可在以下网址获取:http://hkumath.hku.hk/~wkc/PCB(data+code).zip。版权所有:©2023 Sun等人。本文是以开放获取方式发表的文章,允许在任何媒介上无限制使用、分发和复制,前提是保留原作者和资料来源的署名权。
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PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Mar 17
WaliedMAlarif,DoaaFB...
The pro-apoptotic activity of sinueracasbanone D isolated from Sinularia Leptoclados in hepatocellular carcinoma cells.
PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
Sarcophyton和Sinularia属(Alcyoniidae)的软体珊瑚以卡斯班和棕榈二萜类二萜化合物被广泛认知,且具有显著的抗肿瘤效果。从红海软珊瑚Sinularia leptoclados和Sarcophyton glaucum的有机萃取物中,分离出两种卡斯班型二萜化合物(1、2)和四种棕榈二萜型二萜化合物(3-6),它们都可以抑制Huh-7、SNU 499和HepG2三种肝细胞癌细胞,以及EA.hy 926正常细胞的增殖。其中Sinueracabanone D(1)对这些癌细胞株具有显著的抗增殖作用,特别是对HepG2细胞具有IC50为4.0±0.37 μM的抑制效果。细胞周期分析显示,化合物1可导致HepG2细胞在G2/M期积累。此外,化合物1表现出显著的促细胞凋亡作用,可通过annexin V染色、增强Bax、细胞色素C和caspase 3的mRNA表达,并抑制Bcl2的表达,从而表明它在HepG2细胞中产生显著的促细胞凋亡效应。同时,化合物1的加入可以增强活性氧分子的产生并降低线粒体膜电位。总之,化合物1具有强大的抗HepG2细胞增殖作用,这些抗增殖作用是通过诱导细胞凋亡、线粒体功能障碍和氧化应激等方式实现的。©2023 Springer Nature,作者独家授权Springer-Verlag GmbH Germany发布。
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PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Mar 15
AmandaLabora,HaileyL...
Generation of liver metastases in a mouse model using ultrasound-guided intravenous injection.
PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
我们在这里介绍一种通过超声引导直接将肿瘤细胞注入门静脉制作肝转移小鼠模型的方案。我们详细说明了动物和细胞准备步骤,以及注射肿瘤细胞的两种技术。其中一种技术是手持自由注射,另一种技术是使用三维打印的原型装置进行辅助注射。最后,我们介绍了生物发光成像进行肿瘤监测的方法。版权所有©2023作者。由Elsevier出版发行,保留所有权利。
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