研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 03
YousakuOzaki,PhilBro...
Integrating Omics Data and AI for Cancer Diagnosis and Prognosis.
Epigenetics & Chromatin
癌症是导致死亡的主要原因之一,因此及时诊断和预后非常重要。利用 AI(人工智能),医疗服务提供者能够以能够带来更好整体结果的方式组织和处理患者数据。这篇综述论文旨在探讨人工智能在诊断、预后和临床应用中的不同用途。利用 PubMed 和 EBSCO 数据库查找 2020 年 1 月 1 日至 2023 年 12 月 22 日期间的出版物。文章是使用“人工智能”和“机器学习”等关键搜索术语收集的。该集合中包括人工智能在使用多组学数据、放射组学、病理组学以及临床和实验室数据确定癌症诊断和预后方面的应用研究。由此产生的 89 项研究根据所使用的数据类型分为八个部分,然后进一步细分为分别侧重于癌症诊断和预后的两个小部分。八项研究整合了不止一种形式的组学,即基因组学、转录组学、表观基因组学和蛋白质组学。将人工智能与组学和临床数据一起纳入癌症诊断和预后代表着一项重大进步。鉴于人工智能在该领域的巨大潜力,持续的前瞻性研究对于增强算法的可解释性和确保安全的临床整合至关重要。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jun 29
EricFanchon,Angéliqu...
Is Cancer Metabolism an Atavism?
Epigenetics & Chromatin
癌症的返祖理论认为,癌症的出现和发展是通过细胞表型回复到更祖先的类型,基因组和表观遗传的变化使最近进化的遗传模块失活并激活古老的生存机制。该理论旨在解释已知的癌症特征以及尽管基因突变具有随机性,但癌症的可预测进展的悖论。 Lineweaver及其同事最近提出了串行返祖模型(SAM),这是返祖理论的增强版本,该模型表明癌症进展涉及多个返祖逆转,其中细胞在进化阶段中退化,首先失去最近进化的特征,然后重新激活原始特征。 Warburg 效应是 SAM 的关键特征之一,即癌细胞在有氧的情况下上调糖酵解和乳酸生成,而不是使用氧化磷酸化。它与大气氧化之前生活在地球上的古代细胞的新陈代谢有关。这篇综述解决了癌症代谢是否可以被视为返祖的问题。通过分析癌症代谢的几个已知特征,我们得出的结论是,这种版本的返祖理论没有为癌症研究提供足够的概念框架。癌症代谢跨越了整个代谢状态范围,这些状态不能通过依次回复到古代状态来完全解释。此外,我们探究癌症代谢的本质并在 SAM 框架内讨论其特征。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jul 07
AhmedMostafaIbrahimA...
Blockage of Autophagy for Cancer Therapy: A Comprehensive Review.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
癌症的发病率和死亡率不断增加,使其成为全球死亡的主要原因。手术、放疗和化疗等传统治疗方法由于治疗耐药性而面临很大的局限性。自噬是一种细胞自我降解机制,在癌症发展、耐药性和治疗中发挥着至关重要的作用。这篇综述研究了自噬抑制作为癌症治疗策略的潜力。从 1967 年到 2024 年,我们对 Embase、PubMed 和 Google Scholar 数据库进行了系统检索,以识别自噬抑制剂及其在癌症治疗中的机制的研究。该综述包括利用体外和体内实验方法、文献综述和临床试验的原创文章。使用的关键术语是“自噬”、“抑制剂”、“分子机制”、“癌症治疗”和“临床试验”。氯喹 (CQ) 和羟氯喹 (HCQ) 等自噬抑制剂通过抑制溶酶体酸化和防止自噬体降解,在临床前研究中显示出了良好的前景。其他抑制剂如渥曼青霉素和 SAR405 则针对自噬途径的特定成分。将这些抑制剂与化疗结合使用已证明疗效增强,使癌细胞更容易受到细胞毒性药物的影响。涉及 CQ 和 HCQ 的临床试验已显示出令人鼓舞的结果,但需要进一步研究以优化它们在癌症治疗中的应用。自噬在癌症中发挥双重作用,既作为生存机制,又作为细胞死亡途径。针对自噬为癌症治疗提供了一种可行的策略,特别是与现有治疗相结合时。然而,自噬调节的复杂性和潜在的副作用需要进一步研究以开发精确且针对具体情况的治疗方法。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jul 08
MuttiahBarathan,Ahma...
Innovative Strategies to Combat 5-Fluorouracil Resistance in Colorectal Cancer: The Role of Phytochemicals and Extracellular Vesicles.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
结直肠癌 (CRC) 是一项重大的公共卫生挑战,5-氟尿嘧啶 (5-FU) 耐药性是有效治疗的主要障碍。尽管取得了进展,但由于药物转运的改变、细胞凋亡的逃避、细胞周期动力学失调、肿瘤微环境 (TME) 相互作用和细胞外囊泡 (EV) 介导的耐药途径等复杂机制,对 5-FU 的耐药性仍然很强大。传统化疗通常会导致高毒性,因此需要具有更好疗效和安全性的替代方法。植物化学物质 (PC) 和 EV 提供了有前景的 CRC 治疗策略。 PC 来自天然来源,通常表现出较低的毒性,并且可以针对涉及癌症进展和耐药性的多种途径。 EV 可以促进靶向药物输送、调节免疫反应并与 TME 相互作用以使癌细胞对治疗敏感。然而,PC 和工程化 EV 在克服 5-FU 耐药性和重塑 CRC 中免疫抑制性 TME 方面的潜力仍未得到充分探索。解决这一差距对于确定具有增强疗效和降低毒性的创新疗法至关重要。本综述探讨了结直肠癌中 5-FU 耐药的多方面机制,并评估了 PC 与 5-FU 联合使用的协同效应,以提高治疗效果,同时最大限度地减少不良反应。此外,它还研究了工程化 EV 通过充当药物输送工具和调节 TME 来克服 5-FU 耐药性。通过综合现有知识并弥补研究空白​​,本综述增强了对 CRC 5-FU 耐药性的学术理解,强调了涉及 PC 和 EV 的跨学科方法彻底改变 CRC 治疗的潜力。进一步的研究和临床验证对于将这些发现转化为改善的患者治疗结果至关重要。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jul 08
OvidiuBîcă,CarmenIul...
Diagnostic Value of SALL4 and OCT3/4 in Pediatric Testicular Tumors.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
睾丸肿瘤(TT)在儿童中很少见,给诊断和治疗带来了挑战。这项回顾性研究评估了 SALL4 和 OCT3/4 在儿科 TT 中的诊断和预后效用。我们使用免疫组织化学 (IHC) 分析了 18 例不同类型的 TT,以评估 SALL4(Spalt 样转录因子 4)和 OCT3/4(八聚体结合转录因子 3/4)的表达。 SALL4 在 83.3% 的肿瘤中呈阳性,而 OCT3/4 在 38.9% 的肿瘤中呈阳性,12-18 岁患者的患病率显着高于 0-11 岁患者(p = 0.013)。混合生殖细胞肿瘤与 OCT3/4 的相关性显着更高 (p = 0.003),并且主要在卵黄囊肿瘤和胚胎癌中观察到 SALL4 的高免疫染色表达。我们的研究结果表明,SALL4 和 OCT3/4 免疫染色可以帮助准确的诊断和治疗计划,并强调 OCT3/4 作为儿科睾丸肿瘤预测因素的重要性,强调其与肿瘤类型的显着相关性及其对治疗反应的影响。这些标志物可以指导个性化治疗策略,从而有可能改善患者的治疗结果。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jun 22
LucilliaBezu,DilaraA...
Perioperative Immunosuppressive Factors during Cancer Surgery: An Updated Review.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
原发肿瘤的手术切除是实体恶性肿瘤最常见和最有效的治疗方法。令人信服的证据表明,尽管手术具有有益效果,但它可能会通过引发免疫抑制性炎症应激反应来损害免疫监视,并通过刺激微小残留病而促进复发。此外,许多因素会在癌症手术前后干扰免疫效应器,例如营养不良、贫血或随后的输血。因此,围手术期在决定肿瘤结果方面发挥着关键作用,并且是通过使用协同药理学和非药理学方法支持免疫系统来规避麻醉和手术有害因素的短期阶段。与此相一致的是,越来越多的研究表明麻醉剂可以在癌症手术期间或之后驱动促肿瘤或抗肿瘤信号通路。虽然专注于麻醉剂对癌细胞行为影响的临床前研究非常有说服力,但研究其对生存和复发的影响的有限临床试验仍然没有结论。在此,我们重点介绍癌症手术围手术期发生的主要因素及其对免疫调节和癌症进展的潜在影响。我们还考虑了文献中的最新进展,讨论手术前和手术期间的患者管理。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jun 28
OmarSAl-Odat,EmilyNe...
Discovering Potential in Non-Cancer Medications: A Promising Breakthrough for Multiple Myeloma Patients.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
MM 是一种常见的癌症,不幸的是,每年都会导致大量死亡。大多数报告的多发性骨髓瘤病例都是在晚期才发现的,这给治疗带来了巨大的挑战。此外,所有 MM 患者最终都会产生耐药性或出现复发;因此,需要在治疗方面取得进展。然而,开发新的抗癌药物,特别是MM药物,需要大量的财政投入和漫长的开发过程。药物再利用的研究涉及探索现有药物用于新治疗用途的潜力。这可以显着减少时间和成本,而这通常是多发性骨髓瘤患者最关心的问题。考虑到其先前的临床前和临床开发,利用现有的非癌症药物进行各种骨髓瘤治疗是一种高效且具有成本效益的策略。这些药物在靶向与 MM 进展和耐药相关的关键途径方面显示出巨大的潜力。沙利度胺就是通过这一策略取得成功的例证。本综述深入探讨了当前的趋势、MM 传统疗法面临的挑战以及重新利用 MM 药物的重要性。这篇综述重点介绍了具有潜在显着抗骨髓瘤特性和抗肿瘤作用的传统疗法的不全面列表。此外,我们还提供有关资源的宝贵见解,有助于简化和加速 MM 领域的药物再利用工作。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jul 05
PrernaDabral,NobelBh...
Tumor-Derived Extracellular Vesicles as Liquid Biopsy for Diagnosis and Prognosis of Solid Tumors: Their Clinical Utility and Reliability as Tumor Biomarkers.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
早期癌症检测和准确监测对于确保提高患者生存率至关重要。最近的研究重点是开发非侵入性生物标志物,以低成本和低风险早期诊断癌症并监测疾病进展。细胞外囊泡(EV)是大多数细胞类型分泌到细胞外空间的纳米级颗粒,作为液体癌症活检的新型生物标志物候选者越来越受欢迎,因为它们可以将生物活性物质运输到远处并促进细胞间通讯。我们进行了文献检索,讨论了当前的 EV 分离方法以及使用 EV 相关蛋白、miRNA、mRNA、DNA 和脂质作为液体活检的进展。我们讨论了在临床应用中使用这些囊泡的优点和挑战。此外,还强调了机器学习作为肿瘤标志物发现新工具的最新进展。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jul 12
SébastienBenzekry,Mé...
Predicting Survival in Patients with Advanced NSCLC Treated with Atezolizumab Using Pre- and on-Treatment Prognostic Biomarkers.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
现有的生存预测模型仅依赖于基线或肿瘤动力学数据,缺乏机器学习集成。我们引入了一种新颖的动力学机器学习 (kML) 模型,该模型集成了基线标记物、肿瘤动力学和四种治疗中简单血液标记物(白蛋白、C 反应蛋白、乳酸脱氢酶和中性粒细胞)。 kML 是在三项 II 期试验(533 名患者)中针对非小细胞肺癌的免疫检查点抑制 (ICI) 开发的,并在一项 III 期试验(ICI 和化疗,377 名和 354 名患者)的两个组中进行了验证。它超越了当前最先进的个体预测,测试集 C 指数为 0.790,12 个月生存准确度为 78.7%,风险比为 25.2(95% CI:10.4-61.3,P < 0.0001)以确定长期幸存者。至关重要的是,kML 仅使用 25 周的研究数据就预测了​​ III 期试验的成功(预测 HR = 0.814 (0.64-0.994) 与最终研究 HR = 0.778 (0.65-0.931))。治疗中血液标记物建模与预测机器学习相结合,构成了支持个性化医疗和药物开发的宝贵方法。该代码可在 https://gitlab.inria.fr/benzekry/nlml_onco 上公开获取。© 2024 作者。临床药理学
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Jul 10
FengtingGuo,LanfangL...
Streptococcus anginosus: A new pathogen of superficial gastritis, atrophic gastritis and gastric cancer.
Cellular & Molecular Immunology
大量研究表明,浅表性胃炎(SG)和萎缩性胃炎(AG)是胃癌(GC)的先兆。虽然幽门螺杆菌 (H. pylori) 长期以来一直被认为是 GC 发展的关键参与者,但 Fu 等人的最新发现。已确定咽峡炎链球菌 (S.anginosus) 是一种新出现的病原体,可引发 SG、AG 和 GC。咽峡炎链球菌是一种革兰氏阳性球菌,利用其表面蛋白梅毒螺旋体膜蛋白 C (TMPC) 与胃上皮细胞的膜联蛋白 A2 (ANXA2) 受体结合,促进其在胃粘膜中的定植和侵袭。这导致促炎趋化因子 Ccl20 和 Ccl8 上调,对胃屏障功能和微生物群稳态造成长期影响,从而导致 SG。此外,这些细菌还激活丝裂原激活蛋白激酶 (MAPK) 信号通路,该通路与 AG 和 GC 的发育相关。重要的是,抑制 TMPC 或敲低 ANXA2 可以减少咽峡炎链球菌定植和侵袭,从而降低 SG、AG 和 GC 的机会。本文重点介绍了咽峡炎链球菌在 SG、AG 和 GC 中的分子机制,强调多病原体策略在胃病管理中的重要性以及进一步研究咽峡炎链球菌在 GC 进展中的作用的必要性。
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