研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Eur J Nucl Med Mol I
2023 Mar 16
ZhiyuanBo,BoChen,YiY...
Machine learning radiomics to predict the early recurrence of intrahepatic cholangiocarcinoma after curative resection: A multicentre cohort study.
Eur J Nucl Med Mol I
手术后早期复发(ER)会导致肝内胆管癌(ICC)的预后不良。我们旨在开发机器学习(ML)影像组学模型,以预测治愈性切除术后ICC的ER。从三个机构进行了回顾性招募经治性手术的ICC患者,并分配到训练和外部验证队列。进行前期动脉和静脉期对比增强计算机断层扫描(CECT)图像并进行分割。通过其重要性提取并排名放射组学特征。使用单变量和多变量逻辑回归分析来识别临床特征。使用各种ML算法构建基于放射组学的模型,并通过接受者操作特征曲线、校准曲线和决策曲线分析评估预测性能。共纳入127名患者进行分析:90名患者在训练组,37名患者在验证组。92名患者(72.4%)经历了复发,包括71名患者出现ER。男性、微血管侵犯、TNM分期和血清CA19-9被确定为ER的独立危险因素,相应的临床模型预测性能不佳(AUC为0.685)。识别出57个差异放射组学特征,并选用10个最重要的特征进行建模。开发了7个ML放射组学模型,平均AUC为0.87±0.02,高于临床模型。此外,临床 - 放射组学模型表现出与放射组学模型相似的预测性能(AUC为0.87±0.03)。基于CECT的ML放射组学模型对于预测ICC中的ER具有价值。 ©2023.作者(s),在Springer-Verlag GmbH Germany的独家许可下,属于Springer Nature的一部分。
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Environ Toxicol Phar
2023 Mar 13
ÉvilaPinheiroDamasce...
Assessing the impact of antineoplastic drugs in the aquatic environment: state of the art and future perspective for freshwater organisms.
Environ Toxicol Phar
自70年代末以来,药物在环境中不断输入引起了人类和环境健康相关化合物可能造成的潜在风险的关注。在环境影响方面,一大类药物是抗肿瘤药物(AAs)。本次研究采用系统回顾的方法,检索有关淡水物种抗肿瘤药物(AAs)的生态毒理学信息。在此分析中,从微生物到脊椎动物等多样的分类群,审视了不同层次的生物组织,包括细胞系。此外,本回顾将艾马替尼(IM)、顺铂(CisPt)和5-氟尿嘧啶(5-FU)的生态毒理学参数(EC50和LC50)汇总到物种敏感性分布曲线(SSD)中,估计了考虑到95%生态群落保护的危险浓度(HC5)。最后,我们提出了如何提高AAs的环境风险评估(ERA),包括潜在的可采用的毒性终点、测试持续时间、AAs代谢产物测试和AAs混合物暴露等方面。版权所有 © 2023,Elsevier B.V. 发布。
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ENVIRONMENTAL RESEARCH
2023 Mar 13
SangeetaYadav,SonamT...
Development of a biofilm-forming bacterial consortium and quorum sensing molecules for the degradation of lignin-containing organic pollutants.
ENVIRONMENTAL RESEARCH
由于与其他污染物一起存在的木质素使得制浆造纸厂排放的废水更加复杂。本研究探讨了从制浆造纸厂污染现场(PPMECSs)中分离出的生物膜形成菌对木质素的降解作用。通过16S rRNA基因测序鉴定了分离的具有生物膜形成和木质素降解能力的细菌种类为枯草芽孢杆菌、癌变肠杆菌和地衣芽孢杆菌。薄层液相色谱分析显示,这些细菌共生体产生了酰基-同半胱氨酸内酯(AHL)作为群体感应分子和外生聚合物物质(EPS),后者可在不利条件下保护细菌共生体。相比单一菌株,这个菌群共生体在pH 7.0和37 °C下以含kraft木质素和葡萄糖的最小盐培养基中培养8天后,能将木质素(900 ppm)降解73%。降解产物为酰胺,醇和酸。构建的菌群共生体处理废水后,可显著降低废水中的有机污染物,这证实了木质素的活性生物转化和生物降解。显微镜检查还表明有木质素诱导的生物膜形成。因此,基于群体感应构建的生物膜形成菌群提供了一种可持续和有效处理含木质素复杂污染物的解决方案。版权所有 © 2023 Elsevier Inc. 发布。
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DRUG DISCOVERY TODAY
2023 Mar 13
JasminGattringer,Chr...
Peptide modulators of cell migration: overview, applications and future development.
DRUG DISCOVERY TODAY
细胞迁移是多细胞生物发育和稳态的关键生理过程;这个复杂系统中的错误可能会触发癌症或炎症性疾病的发展。因此,调节细胞迁移提供了药物发现的机会。肽正在全球治疗市场上变得越来越重要,因为与已经确立的小分子药物或生物制剂相比,它们具有独特的特性。在本文中,我们鉴定了超过470种调节细胞迁移的肽,并分析了它们的特点。其中95%以上的肽处于发现或临床前阶段,因为肽药物的转化往往导致药物开发过程中的瓶颈。我们总结了在(临床前)临床开发中增强生物活性肽药物属性的化学策略。版权所有©2023作者。由Elsevier Ltd.出版。保留所有权利。
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Disease Models & Mechanisms
2023
QiWu,ZhouLiu,ZhijieG...
KLF5 inhibition potentiates anti-PD1 efficacy by enhancing CD8+ T-cell-dependent antitumor immunity.
Disease Models & Mechanisms
背景:免疫检查点阻断剂(ICBs)对于癌症的疗法是一项革命性的策略,但大多数实体瘤患者对ICBs仍然具有抗药性,部分原因是由于难以逆转高度免疫抑制的肿瘤微环境(TME)。开发肿瘤免疫治疗策略高度依赖于发现肿瘤免疫逃逸分子机制和潜在治疗靶点。Krüppel-like Factor 5(KLF5)是一种内源性致癌基因,能促进肿瘤的形成。然而,KLF5对于抑制癌症免疫反应的细胞外影响尚不清楚。 方法:我们分析了具有KLF5删除/过度表达的肿瘤细胞移植到小鼠模型中的KLF5的免疫抑制作用。我们进行了RNA测序、免疫组织化学、西方印迹、实时荧光定量PCR、ELISA、荧光素酶检测、染色质免疫沉淀(ChIP)和流式细胞术,以证明KLF5对CD8+T细胞浸润和相关分子机制的影响。单细胞RNA测序和空间转录组学分析被应用于进一步解读KLF5表达与浸润免疫细胞的关联。探索KLF5/COX2抑制剂与抗程序性细胞死亡蛋白1(anti-PD1)治疗的联合效力于临床前模型。最后,建立了一个基于KLF5/COX2轴和相关免疫标志物的基因表达签名来预测患者的存活。 结果:KLF5失活以CD8+T细胞为依赖关系减缓了基底样乳腺肿瘤的生长。转录组学分析表明,肿瘤中KLF5缺失增加了T淋巴细胞的数量和活化功能。在机械上,KLF5结合到COX2基因的启动子并促进COX2的转录,随后,KLF5的缺失通过减少COX2表达降低了PGE2从肿瘤细胞中的释放。抑制KLF5/COX2轴使肿瘤内抗肿瘤T细胞的数量和功能增加,以增强抗PD1治疗的抗肿瘤效应。在单细胞和空间分辨率下进行患者数据集分析显示,低KLF5表达与免疫支持型TME相关。 最后,我们生成了一个基于KLF5/COX2关联的免疫得分(KC-IS)来预测患者的生存。 结论:我们的研究结果确定了KLF5介导TME免疫抑制的新机制,针对KLF5/COX2/PGE2轴是一种重要的免疫治疗敏化剂。©作者。
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Disease Models & Mechanisms
2022 Jun
VictoriaHoskin,AbdiG...
Targeting the Ezrin Adaptor Protein Sensitizes Metastatic Breast Cancer Cells to Chemotherapy and Reduces Neoadjuvant Therapy-induced Metastasis.
Disease Models & Mechanisms
癌症相关死亡的主要原因是癌细胞向远处器官的扩散。尽管现代化疗策略在原发肿瘤阶段获得成功,但在治疗转移性疾病方面却显得无效,主要是因为耐药性的发展。适配器蛋白ezrin在多种临床前模型中被证实能够促进癌细胞转移,并与多种癌症类型,包括乳腺癌,的不良预后有关。Ezrin促进了生存信号的传递,特别是在散布的癌细胞中,以促进转移性扩展。然而,ezrin在乳腺癌化疗耐药性中的作用尚未完全了解。在本研究中,我们展示了上调或下调ezrin表达会改变体外乳腺癌细胞对多柔比星和多西他赛处理的敏感性,并与PI3K/Akt和NFκB通路激活的改变相关。此外,我们测试了小分子ezrin抑制剂NSC668394的全身治疗效果,作为单药治疗或与蒽环类或紫杉醇基化疗联合治疗的组合疗法,对体内肺转移负担的影响。我们展示了抗ezrin治疗单独降低了转移负担,并显著增强了转移灶对多柔比星或多西他赛的敏感性,无论是新辅助还是新辅助加辅助治疗模型都适用。综上所述,我们的研究结果展示了抗ezrin治疗在调节乳腺癌细胞对化疗的应答以及在减少转移负担方面与化疗联合治疗的有效性。这项研究为将抗ezrin治疗与化疗相结合,作为一种新的策略有效地靶向转移提供了临床前证据,尤其是在新辅助治疗的情况下。©2022作者;由美国癌症研究协会出版。
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Disease Models & Mechanisms
2023
RenyuanZhang,Shalini...
Rate of castration-induced prostate stroma regression is reduced in a mouse model of benign prostatic hyperplasia.
Disease Models & Mechanisms
良性前列腺增生症(BPH)是一种非肿瘤增生性疾病,会产生与增大的前列腺相关的下尿路症状。BPH在病理上以上皮和基质组织的过度增生为特征。雄激素信号对前列腺功能至关重要,雄激素阻断是缓解BPH症状的第二线药物治疗。本研究检测了使用前列腺素基因启动子驱动泌乳素(Pb-PRL)转基因小鼠获得的前列腺,这是一种强大的BPH模型,能自发地发展为前列腺肿大,以研究手术阉割后前列腺的消退反应。连续超声成像显示出Pb-PRL前列腺体积的非常均匀、自限制性增长,这与BPH的温和、有限细胞增殖特征一致,并与小鼠前列腺癌模型高度可变的指数增长形成了对比。与正常前列腺腺体经手术阉割引起的消退相比,阉割只引起了部分前列腺体积的减小。与阉割引起的消退相比,抗雄激素finasteride引起的Pb-PRL前列腺体积减少要少一些。Pb-PRL老鼠前列腺体积退化的程度与基质组织的初始体积相关,表明上皮和基质组织对雄激素撤退的敏感度不同。事实上,二维形态学分析揭示出Pb-PRL老鼠基质组织的消退速度明显降低。Pb-PRL前列腺基质组织中的肌成纤维细胞成分看起来是正常的,但基质组织含有更多的成纤维细胞和胶原外基质沉积。与正常前列腺一样,Pb-PRL前列腺的退化速度部分依赖于TGFß和TNF信号,但与正常前列腺不同的是,阉割引起的消退程度不受TGFß或TNF阻断的影响。我们的研究表明,雄激素剥夺可以有效地减少过度增生的前列腺的总体积,但基质组织相对耐受,这表明可能需要采取额外措施以提供有效的治疗BPH临床表现的方法。AJCEU 版权所有 © 2023。
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Disease Models & Mechanisms
2023
JuAShim,JeongHaRyu,Y...
The role of gut microbiota in T cell immunity and immune mediated disorders.
Disease Models & Mechanisms
肠道微生物群曾被视为有益于消化的共生生物,但最近的研究揭示出微生物组在生理和病理免疫系统中都担任着关键作用。肠道微生物群的成分会被环境因素如饮食、卫生等因素改变,这种变化会对免疫细胞(尤其是T细胞)产生影响。微生物组研究中的先进基因组技术识别出特定微生物能够调节T细胞反应及免疫介导性疾病的发病机制。本文回顾特定微生物与T细胞的相互作用,讨论了微生物与癌症、自身免疫性疾病和过敏炎症等疾病的免疫发病学关系,同时探讨当前实验动物模型存在的局限性、尖端发展和该领域的挑战以及在新药开发中考虑肠道微生物群的可能性。 ©作者(们)。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Mar 15
ShirongLi,SaipingQi,...
MARVELD3 inhibits the epithelial-mesenchymal transition and cell migration by suppressing the Wnt/β-catenin signaling pathway in non-small cell lung cancer cells.
Disease Models & Mechanisms
上皮间充质转化(EMT)是一种表现为细胞间接触减少的现象,与导致非小细胞肺癌(NSCLC)恶化和诱导转移有关。间隙蛋白 MAL 和与囊泡运输和膜连接域 3(MARVELD3)相关的蛋白是一种新型的紧密连接蛋白,参与了 EMT。对于 MARVELD3 在 NSCLC 中的机制了解非常有限。在这个试验中,将讨论 MARVELD3 对人类 NSCLC 细胞的抑制作用。测量了 NSCLC 组织和癌旁组织中 MARVELD3 的表达。检测了转化生长因子(TGF)-β1 诱导的 NSCLC 细胞中 MARVELD3 和 EMT 相关基因的表达。建立了 MARVELD3 消除和过表达的 NSCLC 细胞以分析 MARVELD3 与 EMT 和细胞迁移的关系。在 NSCLC 细胞模型和临床物种中,分析了 Wnt/β-连环蛋白通路的表达。在 NSCLC 样本中观察到的 MARVELD3 蛋白水平较癌旁标本低,并且 NSCLC 标本中 MARVELD3 的表达降低与肿瘤转移有关。TGF-β1 处理的 NSCLC 细胞中 E-Cadherin 和 MARVELD3 的表达降低,而 Vimentin 的表达增加。MARVELD3 改变了 EMT 相关基因并诱导了细胞迁移。此外,MARVELD3 过表达的 NSCLC 细胞中,Wnt/β-连环蛋白途径和靶基因 MYC 和 CCND1 的表达也受到抑制。MARVELD3 通过 Wnt/β-连环蛋白信号通路抑制了 TGF-β1 诱导的人类 NSCLC 细胞中的 EMT。这些结果表明,MARVELD3 可能成为 NSCLC 治疗中潜在的治疗方法。© 2023 作者。《胸部肿瘤》由中国肺癌专业委员会和澳大利亚约翰·威立出版有限公司出版。
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Frontiers in Physiology
2023
ChaojieZhang,JiaGuo
Diverse functions of the inward-rectifying potassium channel Kir5.1 and its relationship with human diseases.
Frontiers in Physiology
Kir5.1是由Kcnj16编码的内向整流钾通道亚单位,可以与Kir4.1(由Kcnj10编码)或Kir4.2(由Kcnj15编码)形成功能性异源通道(Kir4.1/5.1和Kir4.2/5.1)。它在肾脏、胰腺、甲状腺、大脑和其他器官中均有表达。尽管Kir5.1在大多数情况下无法形成功能性同源通道,但近年来越来越多的研究发现,这个亚单位的功能不应被低估。Kir5.1可以为Kir4.1/5.1通道提供细胞内pH敏感性,在肾远曲小管段中充当细胞外钾离子传感器。该段在维持钾离子和酸碱平衡方面起着重要作用。本文总结了Kir5.1参与的各种病理生理过程,以及作为差异表达基因在各种癌症中表达变化,还描述了由Kir5.1功能不全引起的几种其他疾病表型。版权所有2023年张和郭。
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