研究动态
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RADIOLOGY
2023 Feb 28
AmirIravani,RoslynWa...
FDG PET/CT Prognostic Markers in Patients with Advanced Melanoma Treated with Ipilimumab and Nivolumab.
RADIOLOGY
背景:尽管联合应用伊匹单抗和尼伐单抗(以下简称IpiNivo)治疗晚期黑色素瘤的反应有所改善,但许多患者表现出原发性或获得性抗药性。加上免疫相关不良事件的高风险,因此需要确定预测结果的标记。 目的:研究在接受IpiNivo治疗的晚期黑色素瘤患者中,基线和作为响应监测的氟18(18F)脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描(FDG PET / CT)参数的预后价值。 材料和方法:这是一项单中心回顾性研究,纳入接受IpiNivo治疗的成年黑色素瘤患者。将包括代谢肿瘤体积(MTV)、肿瘤分期、突变状态、东部合作肿瘤组织绩效评分、乳酸脱氢酶水平和治疗线的基线FDG PET/CT参数与总生存期在单变量和多变量Cox回归分析中相关联。确定FDG PET/CT作为治疗响应的相关性与总生存期。 结果:总共纳入122例患者(年龄中位数为61岁[IQR,51-69岁]; 男性89人),其中78%(122中的95)的东部合作肿瘤组织绩效评分为0,52%(86中的45)患有高乳酸脱氢酶水平,39%(122中的48)为M1c转移期和45%(122中的55)为M1d转移期,45%(122中的55)具有BRAF V600E / K突变,中位数MTV为42 mL。在基线FDG PET/CT中具有高于中位数MTV的患者与低于中位数MTV的患者相比,12个月的生存率较低(43%[95%CI:32, 58] vs 66%[95%CI:55, 79],P <0.001)。在多变量分析中,高于中位数的MTV,东部合作肿瘤组织绩效评分1-2与0,以及后续与一线IpiNivo治疗与总生存期独立相关(风险比[HR]:1.68 [95%CI:1.02, 2.78],P = 0.04; 3.1 [95%CI:1.8,5.4],P <0.001;和11.2 [95%CI:3.4, 37.1],P = 0.002)。进展性疾病的患者的12个月总生存率低于没有进展的患者(35%[95%CI:24,51] vs 90%[95%CI:83, 99]; HR,7.3 [95%CI:3.9, 13.3]; P <0.001)。 结论:基线的氟18脱氧葡萄糖PET / CT代谢肿瘤体积是接受伊匹单抗和尼伐单抗治疗的晚期黑色素瘤患者的独立预后标记。 ©RSNA,2023本文有补充材料。
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PROTEOMICS
2023 Jan 02
SeanPonce,HuiZhang
Developing quantitative assays for six urinary glycoproteins using parallel reaction monitoring, data-independent acquisition, and TMT-based data-dependent acquisition.
PROTEOMICS
定量研究方法包括平行反应监测(PRM)、数据独立采集(DIA)和数据依赖采集(DDA),这些方法常用于探究蛋白质表达谱。然而,利用PRM、DIA和基于串联质谱标记(TMT)的DDA开发的分析测定法在定量蛋白质组学方面的性能尚未探究。在这里,我们开发了针对六种糖基化蛋白质的测定法,包括富含亮氨酸的α-2糖蛋白(LRG1)、前列腺素-H2 D异构酶(PTGDS)、氨肽酶N(ANPEP)、CD63抗原(CD63)、囊泡膜蛋白(CLU)和前列腺酸性磷酸酶(ACPP),使用PRM、DDA和DIA,并评估了不同采集模式下每个测定法的分析性能。我们还比较了三种轨道阱质谱仪中每种采集模式下的测定法:瑞典泰福飞世尔Q Exactive、Exploris 480和Lumos。我们发现DIA具有最大的线性范围、最高的灵敏度和最高的可再现性。随后,我们将我们开发的DIA测定法应用于非侵袭性(n=48)和侵袭性(n=35)前列腺癌患者的尿液样本中。总之,我们开发了六种糖基化蛋白质的测定法,评估了DIA、PRM和PRM采集模式下不同质谱仪的分析性能,并选择了DIA测定法对侵袭性和非侵袭性前列腺癌患者的尿液样本进行定量分析。©2023 The Authors. Proteomics由Wiley-VCH GmbH出版。
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PROTEOMICS
2023 Jan 09
YaojieWang,YingZhang...
Combination of size-exclusion chromatography and ion exchange adsorption for improving the proteomic analysis of plasma-derived extracellular vesicles.
PROTEOMICS
细胞外囊泡(EV)是由活细胞释放的脂质膜囊泡,携带各种生物分子,包括核酸、脂质和蛋白质。近年来,血浆来源的EV中的蛋白质已成为新型生物标志物,在人类疾病的诊断和预后中起着重要作用。然而,目前从血浆中分离EV的方法常常导致生物液中共同分离的杂质。因此,在执行任何研究方案之前,必须优化从血浆中提取EV进行蛋白质组学分析的过程。本研究比较了两种EV分离策略,尺寸排除色谱(SEC)和SEC与离子交换吸附(SEC + IEA)相结合,从纯度和EV蛋白质数量方面进行了比较。我们的结果表明,与单步SEC相比,SEC与IEA相结合能够通过降低脂蛋白的含量来产生纯度更高的血浆来源EV。此外,通过MS分析,我们证明了这种组合方法在许多血浆样本中保持了EV的稳定性和提高了纯度。此外,通过结合SEC和IEA,检测到更多与癌症相关的蛋白质。©2023 Wiley-VCH GmbH。
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PROTEOMICS
2023 Jan 10
Hao-WeiChu,Kai-PingC...
Identification of salivary autoantibodies as biomarkers of oral cancer with immunoglobulin A enrichment combined with affinity mass spectrometry.
PROTEOMICS
全球范围内,口腔鳞状细胞癌(OSCC)是最常见的致命疾病之一。其高死亡率归因于该疾病通常在晚期被诊断,这表明急需寻找早期检测OSCC的方法。使用唾液自身抗体(autoAbs)作为OSCC生物标志物有许多优点,例如易于获得唾液样本,并且利用成熟的二级试剂高效检测autoAbs。为了改善OSCC筛查,我们结合亲和质谱(MS)技术,通过富集唾液自身抗体来鉴定与OSCC相关的自身抗体。将健康个体和OSCC患者的唾液IgA用肽M偶联珠纯化,然后应用于OSCC细胞中免疫沉淀的抗原(Ags)。使用串联质谱分析和基于光谱计数的定量分析,10个抗原在OSCC组中的水平显著高于对照组。此外,通过多重串珠法测定了自身抗体对这10个抗原的唾液水平。其中,有七个在早期OSCC患者中显著高于健康个体。为了改善OSCC的早期诊断,进一步制定了由对LMAN2、PTGR1、RAB13和UQCRC2的自身抗体构成的标记板。© 2023年Wiley-VCH GmbH。
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PROTEOMICS
2023 Jan 10
HanHong,XiChen,Hongg...
Global profiling of protein lysine lactylation and potential target modified protein analysis in hepatocellular carcinoma.
PROTEOMICS
Hepatocellular carcinoma (HCC)是最常见的原发性肝癌类型,常转移至肺部。赖氨酸乳酸化(Kla)是一种新近识别的组蛋白翻译后修饰却其在HCC的病理学影响还不清楚。本文报道了HCC(随访3年期间未发生转移)、正常肝组织和HCC肺转移样本中这一特定修饰的第一次蛋白质组学调查。在960种蛋白质上检测到的2045个修饰位点中,772个蛋白上的1438个位点包含定量信息。随后,我们分析了不同组中的差异化修饰蛋白质。发现差异化乳酸化蛋白参与了多种生物学过程,其中包括但不限于氨基酸代谢、核糖体蛋白合成和脂肪酸代谢。此外,我们从文献中鉴定出了大量高价值的乳酸修饰蛋白质。其中,我们验证了以下两种与肿瘤相关的蛋白的乳酸修饰水平,并获得了相似的结果:USP14和ABCF1。这两种修饰蛋白将在我们未来的研究中进一步探究。本文是HCC乳酸组学的首次报告,为进一步研究HCC中Kla提供了可靠的基础。©2023 Wiley-VCH GmbH。
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PROTEOMICS
2023 Feb 14
WeimingNi,EdwardXHan...
Applying single-cell highly multiplexed secretome proteomics to characterize immunotherapeutic products and predict clinical responses.
PROTEOMICS
在遗传和表型上完全相同的免疫细胞种群在免疫功能和蛋白质分泌模式方面可能高度异质性。基于微流控芯片的单细胞高度多重分泌组蛋白质组学技术可以在不同的细胞和分子层面上对免疫应答的细胞异质性进行表征。越来越多的证据表明,在单个细胞水平上同时产生2种以上蛋白质的多功能T细胞是关键的效应细胞,对抗病原体和肿瘤的强大和持久的细胞免疫有贡献。这种功能性蛋白质组学技术提供了广泛的细胞功能评估,并可以唯一地确定从活体细胞中具有细胞因子标记的高度多功能细胞亚群。这种高维单细胞分析提供了对功能异质性的深入分析,并有助于确定预测性生物标志物和潜在相关因子,这对于免疫治疗产品设计的优化和个性化免疫治疗的发展至关重要,以实现更好的临床结果。 ©2023 Wiley-VCH GmbH。
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PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES
2022 Dec 08
JacobETallman,Christ...
Prostate volume, baseline urinary function, and their association with treatment choice and post-treatment urinary function in men treated for localized prostate cancer.
PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES
良性前列腺增生、下尿路症状和前列腺癌经常同时出现。它们对尿液功能的影响是关于前列腺癌治疗选择的重要考虑。虽然前列腺体积(PV)和尿液症状通常用于治疗选择决策,但它们与治疗后尿液功能的关联还不清楚。我们评估了局部前列腺癌男性患者中PV和基线尿液功能与治疗选择以及治疗后尿液功能之间的关联。我们从CEASAR识别了1647名患者,CEASAR是一项多中心人群基础前瞻性队列研究,研究男性患有局部前列腺癌。主要结果是治疗选择和健康相关生命质量(HRQOL),通过26项扩展前列腺指数组合(EPIC-26)在预定时间间隔内进行评估,最长时间为5年。进行多变量分析,控制人口特征和临床病理特征。中位基线PV为36毫升(IQR 27-48),基线尿液刺激性/梗阻性领域得分为87(IQR 75-100)。在PV和治疗选择或治疗后尿液功能之间没有发现临床上有意义的关联。在基础尿液功能较差的患者中,放射治疗或手术治疗与尿液功能的统计和临床显着改善有关,在6个月内能持续5年(放射治疗改善得分为20.4点,手术改善得分为24.5点)。在接受局部前列腺癌治疗的男性中,PV未被发现与治疗方式或治疗后尿液刺激性/梗阻性功能相关。基础尿液刺激性/梗阻性功能较差的男性在接受手术或放射治疗后有所改善。© 2022。作者(s),在Springer Nature Limited的独家许可下。
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PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES
2022 Dec 12
Jean-PaulNoujeim,Yas...
Optimizing multiparametric magnetic resonance imaging-targeted biopsy and detection of clinically significant prostate cancer: the role of perilesional sampling.
PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES
对于接受磁共振成像(MRI)-靶向活检(TB)的患者,系统活检(SB)的附加值尚不清楚,而与MRI病变相关的阳性核的空间分布鲜为人知。本研究旨在确定紧邻病变进行活检的实用性,以检测临床意义重大的前列腺癌(csPCa)。我们在2016年6月至2022年1月期间,在朱尔斯·博代特研究所招募了505名连续接受SB和TB检测可疑MRI病变(PI-RADS评分3-5)的患者。回顾患者特定的三维前列腺图以确定包含csPCa的系统核心与MRI索引病灶之间的距离。主要结果是每位患者的癌症检测率(CDR)和每个5毫米间隔的阳性核的累计癌症分布率,从MRI索引病灶开始。次要结果是使用卡方自动交互检测器(CHAID)机器学习算法识别超出10毫米范围内csPCa存在风险的群体。 总体而言,TB,SB和联合方法的csPCa CDR分别为32%,25%和37%。虽然联合方法相对于TB检测到更多的csPCa(37%与32%,p<0.001),但当TB与10毫米范围内的病变周围组织取样相关联时,未发现差异(37%与35%,p = 0.2)。累积的csPCa癌症分布率达到了10毫米的边缘的86%。CHAID算法确定了三个风险组:(1)PI-RADS3(“低风险”),(2)PI-RADS4或PI-RADS5和PSA密度<0.15 ng / ml(“中间风险”)和(3)PI-RADS5和PSA密度≥0.15 ng / ml(“高风险”)。错过csPCa的风险分别为低、中、高风险组的2%,8%和29%。避免超过10毫米范围的活检可避免检测到非csPCa的19%。 使用10毫米边缘的周围活检模板似乎是与联合方法相媲美的合理选择,可检测到相当数量的csPCa。我们的风险分层可能进一步改善患者的选择。 ©2022年。作者通过独家许可证授予SpringerNature有限公司使用。
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PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES
2022 Dec 12
TamásFazekas,ÁdámDSz...
Therapeutic sensitivity to standard treatments in BRCA positive metastatic castration-resistant prostate cancer patients-a systematic review and meta-analysis.
PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES
近期肿瘤学指南推荐对广泛的前列腺癌(PCa)患者进行BRCA1/2检测。此外,在使用阿比特龙、恩扎鲁胺或多西他赛前治疗的突变阳性转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)患者中,PARP抑制剂也是有效的。然而,针对BRCA1/2阳性mCRPC患者哪种标准治疗最有效的问题仍然没有答案。本次荟萃分析的目的是评估阿比特龙、恩扎鲁胺和多西他赛治疗BRCA1/2突变阳性mCRPC患者在PSA反应(PSA50)、无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)方面的疗效。鉴于该主题没有介入性试验,因此我们利用比例和个体患者数据进行数据合成,以评估BRCA1/2阳性mCRPC患者。对于PSA50评估,我们汇总了具有95%信心区间(CI)的事件率,而对于时间至事件(PFS,OS)分析,我们使用了个体患者数据和随机效应Cox回归计算。本次荟萃分析共包括16个符合条件的研究,涉及348名BRCA1/2阳性mCRPC患者。在第一线治疗中,阿比特龙、恩扎鲁胺和多西他赛的反应率分别为52%(CI:25-79%)、64%(CI:43-80%)和55%(CI:36-73%)。个体患者数据分析显示,与阿比特龙治疗患者相比,恩扎鲁胺具有PFS(HR:0.47,CI:0.26-0.83,p = 0.010)但没有OS(HR:1.41,CI:0.82-2.42,p = 0.210)上的优势。我们的PSA50分析表明,这三种第一线治疗都能对BRCA1/2阳性mCRPC产生治疗效果;尽管如此,基于PSA50和PFS分析结果,BRCA阳性mCRPC患者可能更好地对恩扎鲁胺治疗做出反应。然而,基于分子标记驱动的介入性研究,直接比较这些药物是提供更高级别证据的关键。© 2022. 作者(们)。
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PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES
2022 Dec 14
StephenJFreedland,Ag...
Prostate-specific antigen response and clinical progression-free survival in Black and White men with chemotherapy-naïve metastatic castration-resistant prostate cancer treated with enzalutamide in a real-world setting.
PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES
在美国,黑人男性患前列腺癌(PC)相关死亡率比其他种族的男性更高。但是,几项真实世界的晚期PC研究表明,黑人男性对新型激素治疗的反应比白人男性更好。有关吗啡酮对种族的治疗反应的数据有限。我们评估了使用恩扎鲁胺治疗的化疗前PC的黑人和白人男性的真实世界前列腺特异性抗原(PSA)反应和临床无进展生存期(cPFS)。 这项回顾性队列研究包括在IntrinsiQ Specialty Solutions™数据库中从2014年到2018年开始接受恩扎鲁胺治疗的PC患者,这是一个来自社区泌尿科诊所的电子医疗记录收集。指数日期是第一张恩扎鲁胺处方的日期,用作代理转移性去势抗药性PC(mCRPC)。被化疗和/或阿比特龙治疗的患者被排除在外。用Kaplan-Meier和Cox模型根据基线特征来估计种族间的PSA反应和cPFS。 该研究包括214名黑人男性和1332名白人男性,他们患的化疗前PC被认为是有mCRPC的,因为在研究期间使用了恩扎鲁胺的指示。黑人男性年龄较小,基线中位PSA水平比白人男性高。种族之间使用恩扎鲁胺治疗的时间、随访时间和指标后的PSA检测次数相似。在多变量分析中,患者达到≥50% PSA下降的风险相似,而黑人男性观察到≥90% PSA下降的趋势更高(HR1.23; 95% CI 0.93-1.62 [P = 0.14])。在多变量分析中,黑人男性的cPFS显著更好(HR 0.82; 95% CI 0.68-0.98 [P = 0.03])。 使用恩扎鲁胺治疗的被认为未接受化疗的mCRPC黑人和白人男性的PSA反应相似,但是黑人男性的cPFS比白人男性更好。需要进一步研究来验证这些发现。 ©2022。作者(们)。
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