蛋白激酶在广泛的细胞过程中扮演着至关重要的角色，抑制激酶活性的化合物成为靶向治疗发展的主要关注点，特别是在癌症方面。因此，为了表征激酶对抑制剂治疗的反应以及下游细胞反应的努力正在越来越大规模的进行。先前使用基线细胞系描述基线特征（baseline profiling）和有限的激酶组蛋白质组分析数据的研究尝试预测小分子对细胞生存能力的影响，但这些努力未使用多剂量激酶配置文件，且具有非常有限的外部验证，预测的准确率也较低。这项研究侧重于两种大规模的基础数据类型——激酶抑制剂剖面和基因表达，来预测细胞存活筛选的结果。我们描述了我们如何结合这些数据集，检查它们与细胞生存能力的关系，并最终开发了一组计算模型，能够达到相当高的预测准确度（R2为0.78，RMSE为0.154）。使用这些模型，我们鉴定了一组激酶，其中一些激酶尚未被充分研究，它们在细胞存活预测模型中有着重要的影响。此外，我们还测试了更广泛的多组学数据集能否改善模型结果，结果发现蛋白质组激酶抑制剂剖面是单一最有信息量的数据类型。最后，我们验证了一小部分模型预测在几个三阴性和HER2阳性的乳腺癌细胞系中，证明模型在未包括在训练数据集中的化合物和细胞系中表现良好。总的来说，这个结果表明，关于激酶组的通用知识能够预测非常具体的细胞表型，有潜力被整合到靶向治疗开发的管道中。版权所有：© 2023 Berginski等。本文是按照Creative Commons Attribution License（署名许可协议）开放获取的，可在任何媒体上传播、使用、分发和复制，但必须注明原作者和来源。

表观遗传调控机制使得多细胞生物能够在拥有相同基因组的条件下，发展出不同的细胞特化身份。细胞命运决定于基因表达计划和细胞在胚胎发育过程中经历的环境刺激，并通常在生物整个寿命中保持，即使面临新的环境刺激。进化上保守的Polycomb群蛋白(PcG)形成Polycomb抑制复合物，帮助协调这些发育选择。发育后，这些复合物积极维持产生的细胞命运，即使面临环境扰动。鉴于这些Polycomb机制在提供表型稳定性方面的关键作用，即维持细胞命运不变，我们假设它们在发育后的失调会导致表型稳定性降低，从而使失调的细胞可以持续地在环境变化的情况下切换其表型，称之为异常表型转换现象。我们引入了一种通用的计算进化模型，可以在无特定背景下检验我们的系统级表型可塑性假设。我们发现：1）表型稳定性是PcG样机制演化的一种新兴系统级属性；2）表型可塑性是这个机制失调后产生的一种新兴系统级属性。由于有证据表明转移性癌细胞表现出表型可塑性，我们假设肿瘤细胞的表型可塑性是由于PcG机制失调而导致的，从而推动了癌细胞向转移的进展。我们利用来自转移性癌症的单细胞RNA测序数据验证了我们的假设。我们发现，转移性癌细胞的表型可塑性与我们的模型预测的方式相同。版权： ©2023 Lambros等人。本文为开放获取文章，依照知识共享署名许可协议，允许任何人以任何方式使用、分发和再利用本文，但需注明原作者和出处。

深部下腹动脉穿支皮瓣（DIEP）是自体乳房重建的黄金标准。本研究调查了一个大型的现代队列中DIEP并发症的危险因素，以优化手术评估和规划。这项回顾性研究包括在一所学术机构进行DIEP乳房重建手术的患者，时间从2016年至2020年。单变量和多变量回归模型评估了人口统计学、治疗和结果与术后并发症的关系。 总共在524名患者中进行了802个DIEP皮瓣 (平均年龄51.2±9.6岁，平均BMI29.3±4.5）。大多数（87％）患者患有乳腺癌，15％为BRCA阳性。其中282名（53％）为延迟性重建，242名（46％）为即刻重建；278名（53％）为双侧重建，246名（47％）为单侧重建。总体并发症发生在81名（15.5％）患者中，包括静脉淤血（3.4％）、乳房血肿（3.6％）、感染（3.6％）、部分皮瓣丢失（3.2％）、完全皮瓣丢失（2.3％）和动脉血栓形成（1.3％）。手术时间延长与双侧即刻重建和较高的BMI显著相关。手术时间延长（OR=1.16，p=0.001）和即刻重建（OR=1.92，p=0.013）是总体并发症的显著预测因素。部分皮瓣丢失与双侧即刻重建、较高的BMI、目前吸烟状态和手术时间延长有关。 手术时间延长是DIEP乳房重建总体并发症和部分皮瓣丢失的显著危险因素。每增加一小时手术时间，发生总体并发症的风险增加16%。这些发现表明，通过联合外科医生、手术团队的一致性和将更多危险因素的患者咨询向延迟性重建，可以减少手术时间，从而减轻并发症。版权所有 ©2023年美国整形外科医师协会。

传统上，鼻中隔由于其独特的轮廓、邻近软组织的缺乏和脆弱的血管性而难以重建。当地区或区域组织不可用时，微型手术移植可以提供一种重建的方式。在这个回顾性研究中，我们报告了微型手术重建鼻中隔的经验。本研究共纳入了17名患者，分为两组：（第一组）单纯鼻中隔缺损和（第二组）鼻中隔和一些邻近软组织的缺损。第一组有10名患者。平均年龄为41.2岁。随访平均10.1年。致鼻中隔缺损的原因包括外伤、鼻重建的并发症和隆鼻手术的并发症。在这七例病例中，使用了第一掌跖动脉皮瓣7次和桡前臂皮瓣5次。两个皮瓣损失被用第二个自由皮瓣挽救。手术修正平均为1.5次。在第二组中，有7名患者。随访平均10.1年。鼻中隔缺损的原因包括可卡因伤害、癌症和隆鼻手术的并发症。手术修正平均为3.3次。在所有病例中都使用了桡前臂皮瓣。本研究无皮瓣损失。这个系列的所有17例都圆满结束。我们的经验表明，微型手术重建鼻中隔提供了一个可靠而美观的方法。这种技术避免了常常伴随使用局部皮瓣的面部毁容和明显瘢痕。此外，版权所有 © 2023 美国整形外科医师协会。

乳房减小术病理标本可偶然发现增生病变。然而，缺乏数据调查其比较发生率和危险因素。在都市大型医疗机构内，由两位整形外科医生在两年的时期内进行了所有连续进行的乳房减小术的回顾性评估。所有的乳房减小术，对称减小术和肿瘤整形减小术都纳入了研究，没有排除标准。共分析了632个乳房：342位患者进行了502次乳房减小术、85次对称减小术和45次肿瘤整形减小术。平均年龄为43.9±15.9岁，平均体重指数为29.2±5.7，平均减小重量为610.0±313.1克。接受乳房减小术治疗的良性巨乳症患者中，偶然发现乳腺癌和增生病变的发生率（3.6%）明显低于接受肿瘤整形减小术（13.3%）和对称减小术（17.6%）的患者（p<0.001）。在单变量分析中，个人患乳腺癌的病史（p<0.001）、一级亲属患乳腺癌的病史（p=0.008）、年龄（p<0.001）和使用烟草（p=0.033）均是显著的危险因素。使用后向淘汰法的逐步多元逻辑回归模型分析发现，年龄（p<0.001）是唯一的显著危险因素。乳房减小术病理标本中发现的增生病变和乳腺癌的发生率可能比以前报道的更常见。良性巨乳症患者中新的增生病变的发生率明显低于肿瘤整形减小术和对称减小术的发生率。版权所有 ©2023年美国整形外科医师协会。

增多的证据凸显细菌在促进肿瘤发生中所起的作用。其中的机制可能是多样的，且现在仍然不太清楚。在此，我们报道沙门氏菌感染导致宿主细胞蛋白质广泛的去乙酰化/乙酰化改变。哺乳动物细胞分裂周期42（CDC42）的乙酰化，在细菌感染后急剧下降，CDC42是Rho GTP酶家族的成员之一，参与了癌细胞中许多重要的信号通路。CDC42被SIRT2去乙酰化，被p300/CBP乙酰化。赖氨酸153处的非乙酰化CDC42显示其下游效应物PAK4的结合受损，p38和JNK的磷酸化受到抑制，从而导致细胞凋亡减少。K153乙酰化的减少还增强了结肠癌细胞的迁移和侵袭能力。结直肠癌患者的K153乙酰化水平降低，则预示着不良预后。综上所述，我们的发现表明，通过操纵CDC42的乙酰化调控CDC42-PAK轴，细菌感染诱导结直肠肿瘤发生的一种新机制。 版权所有：© 2023 Wang等人。这是一篇开放获取的文章，根据创作共用许可证，允许在任何媒介上自由使用、分发和复制，只要原作者和出处被标明。

复杂的反转录病毒-人T细胞白血病病毒1型（HTLV-1）主要在体内感染CD4+ T细胞。细胞内感染的传播需要病毒感染细胞与靶细胞直接接触。最近研究表明，HTLV-1附属蛋白HBZ通过激活细胞内黏附分子1（ICAM-1）表达增强HTLV-1感染，从而促进感染细胞与靶细胞的结合和病毒学突触的形成。在这个研究中，我们展示了HBZ通过激活肌肥大蛋白（MyoF）的表达进一步增强了HTLV-1的感染，该蛋白在膜融合和修复以及小泡运输中发挥作用。来自ChIP分析和定量逆转录酶PCR的结果表明，HBZ在MYOF基因的两个增强剂位点与c-Jun或JunB形成复合物，并通过招募共激活剂p300/CBP激活转录。在HTLV-1感染的T细胞中，使用药物WJ460特异性抑制MyoF或使用shRNA介导的MyoF沉默能够降低感染效率。这种效应与细胞粘附的减少和HTLV-1包膜（Env）表面单元（SU）和跨膜区域（TM）的细胞内丰度减少有关。溶酶体蛋白酶抑制剂部分恢复了WJ460处理的细胞中的SU水平，并且MyoF沉默增加了SU定位到LAMP-2位点，表明MyoF限制了SU运输到溶酶体进行降解。与这些效应一致的是，与无细胞病毒颗粒相关的SU更少。这些数据表明，MyoF通过调节Env运输和细胞粘附有助于HTLV-1感染。 版权：©2023 Polakowski等人。这是一篇开放获取文章，根据创作公共许可证无限制使用，分发和再现任何媒介，只要原作者和来源得到贷记。

2型糖尿病的普遍性在年轻和老年人中都有增加。我们研究了与年龄特定的关联和人群可归因因素（PAFs）以及患有2型糖尿病的人群中所有因死亡和导致死亡的风险因素。我们分析了2000年1月至2019年12月期间参加香港全地域糖尿病并发症筛查计划的360,202名中国2型糖尿病患者的数据。我们比较了8种风险因素的危险比和PAFs，其中包括三种主要合并症（心血管疾病[CVD]，慢性肾脏疾病[CKD]，全身癌症）和五种可改变的风险因素（亚临床HbA1c，亚临床血压，亚临床低密度脂蛋白胆固醇，吸烟和亚临床体重），针对4个年龄组（18至54岁，55至64岁，65至74岁和≥75岁）进行死亡率的比较。随访期中位数为6.0年，共有44,396人死亡，癌症，CVD和肺炎是主要的死因。尽管老年人的绝对死亡风险更高（18至54岁人群每10,000人年的粗病死率为59.7，而≥75岁人群为596.2），但大多数风险因素与所有因和导致死亡的相对风险在年轻人中更高，在相互调整了8种风险因素和其他潜在混淆因素包括性别，糖尿病持续时间，脂质谱以及药物使用之后。这8种风险因素在年轻的时期（PAF：51.6％，95％置信区间[CI] [39.1％，64.0％]，p <0.001）中解释了更大的死亡事件比率，而不是在老年人群体中（PAF：35.3％，95％CI [27.2％，43.4％]，p <0.001）。亚临床血压（PAF：16.9％，95％ CI [14.7％，19.1％]，p <0.001）是最年轻的年龄组中所有因病死亡的主要可归因风险因素，而CKD（PAF：15.2％，95％ CI [14.0％，16.4％]，p <0.001）和CVD（PAF：9.2％，95％ CI [8.3％，10.1％]，p <0.001）则是最年长年龄组的主要可归因风险因素。分析仅限于中国人，可能会影响与不同风险特征的全球人群的一般性。此外，PAFs是在风险因素与死亡之间的因果关系的假设下估计的。然而，在观察性研究中可靠的因果关系很难建立。合并症和可改变的风险因素与2型糖尿病患者的死亡风险在年轻人中存在更大的相对风险，其与人口死亡负担的关系因年龄不同而差异较大。这些发现突显了早期控制血压的重要性，这可以减少年轻人患2型糖尿病的早期死亡，防止年龄增长后患上CKD，并导致相关死亡。 版权所有：© 2023 Wu等人。本文是根据创作共用许可证分发的开放获取文章，允许在任何媒介上无限制使用、分发和再制作，前提是原始作者和来源得到了认可。

免疫系统受损的患者在住院新冠肺炎（COVID-19）时死亡风险比免疫系统正常的患者更高，但既往研究结果不一致。本研究旨在确定免疫系统受损患者是否存在更高的住院死亡风险，以及这种风险在疫情中如何变化。我们招募符合ISARIC WHO UK前瞻性队列研究的社区获得性COVID-19症状患者，年龄≥19岁。我们将免疫系统受损定义为住院前免疫抑制剂药物使用、癌症治疗、器官移植、HIV或先天性免疫缺陷。我们使用逻辑回归比较两组死亡风险，并调整年龄、性别、贫困、种族、接种和共同疾病。我们使用贝叶斯逻辑回归探索时间内的死亡率。在2020年1月17日至2022年2月28日期间，我们招募了156,552名符合条件的患者，其中23,142名（14%）免疫系统受损。总共，29%（n = 6,499）免疫系统受损和21%（n = 28,608）免疫系统正常的患者在医院死亡。免疫系统受损患者住院死亡率升高（调整后OR1.44，95％CI [1.39、1.50]，p <0.001）。并非所有的免疫系统损伤状态风险相同，例如进行癌症治疗的患者不太可能将其护理提升到重症监护室（调整后OR 0.77，95％CI [0.7，0.85]，p <0.001）或机械通气（调整后OR 0.65，95 ％CI [0.56，0.76]，p <0.001）。然而，癌症患者死亡率更高（调整后OR 2.0，95％CI [1.87、2.15]，p <0.001）。分析结果已调整年龄、性别、社会经济贫困、共同疾病和接种状态。随着疫情的发展，在医院死亡率减少方面，免疫系统受损的患者比免疫系统正常的患者减少得更慢。随着年龄增长，这一趋势尤其明显：“50-69岁免疫系统受损男性减少住院死亡概率的可能性为88％，女性为83％；对于年龄大于80岁的免疫系统受损男性，住院死亡减少概率为99％，女性为98％。”此研究的局限性在于缺乏详细的住院前药物数据，包括类固醇剂量，意味着我们可能错误地将某些免疫系统受损患者归类为免疫系统正常。免疫系统受损的患者仍然面临着因COVID-19而导致的死亡风险较高。针对这一患者群体应持续推荐采取定向措施，如额外的疫苗接种、单克隆抗体以及非药物预防干预。ISRCTN 66726260。版权所有：© 2023 Turtle等。本文是根据创作共同授权许可下的开放获取文章。这意味着，只要保留原作者和出处，无论在什么媒介上，都可以自由地使用、分发和重制本文。

尽管证据表明在内镜检查活检结果为阴性（即正常黏膜）的个体中，结肠和直肠癌的风险可持续降低10年，但仍有人担心这些人在其他长期健康结果方面的影响。本研究旨在探讨内镜检查活检结果为正常黏膜后炎症性肠病（IBD）的长期风险。 在这项全国性队列研究中，我们确定了瑞典所有在1965年至2016年期间进行下消化道或上消化道正常黏膜活检的个体（暴露组，下消化道和上消化道活检人数分别为200495和257,192），与其配对的人口群体参照（下位组别人数为989,484和1,268,897），以及未暴露的兄弟姐妹（人数分别为221,179和274,529）。采用柔性参数模型估计风险比（HR）来衡量内镜检查活检结果为正常黏液膜和IBD之间的关联，估计IBD的累积发生率，同时估计95％置信区间（CI）。为避免检测偏差、监测偏差或逆因果效应，第一次内镜检查后6个月被排除在外。在约10年的中位随访时间内，下消化道正常黏膜活检的4,853个个体发展为IBD（2.4％），而人口参照组为0.4％。这相当于每10,000人年的患病率（IR）分别为20.39和3.39，或者是每37个检查正常内镜暴露的个体中，有1个额外的IBD病例在活检后30年内估计发生。暴露组患者的总体IBD风险持续较高（平均HR = 5.56；95％CI： 5.28至5.85），而溃疡性结肠炎（UC）(平均HR = 5.20；95％CI：4.85至5.59)和克罗恩病（CD）（平均HR = 6.99；95％CI：6.38至7.66）的风险也持续较高。在兄弟比较中，总体IBD的平均HR分别为3.27（3.05至3.51）、UC为3.27（2.96至3.61）和CD为3.77（3.34至4.26）。对于上消化道正常黏膜活检的个体，CD的平均HR分别为2.93（2.68至3.21）和2.39（2.10至2.73），与人口参照组和未暴露的兄弟姐妹相比。增加的IBD风险持续至少30年，研究结论受到检查指征数据的缺乏和IBD风险或保护因素的未测量残余混杂因素的影响。结束检查结果为正常黏膜的内镜活检与IBD发病率的升高相关，持续至少30年。这可能表明了IBD症状的可观察期和早期IBD患者的不完整诊断。版权所有：©2023 Sun等。本文是一篇开放获取文章，在注明原作者和来源的情况下，允许任何媒介进行无限制的使用、下载和再使用。