研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
查看全部
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Mar 02
IbrahimHalilSahin,Ja...
Neoadjuvant Immune Checkpoint Inhibitor Therapy for Patients With Microsatellite Instability-High Colorectal Cancer: Shedding Light on the Future.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
免疫检查点抑制剂(ICIs)彻底改变了治疗缺失配对修复/微卫星不稳定性高(MMMR-D/MSI-H)结直肠癌(CRC)的范例。MMR-D/MSI-H CRC具有独特的分子特征,包括错位的突变(frameshift alterations),导致突变相关新抗原(MANA)生成,为MANA驱动的T细胞初步进行和抗肿瘤免疫提供了理想的分子框架。这些生物学特征催生出在MMR-D/MSI-H CRC患者中ICIs的快速药物开发。在晚期疾病中使用ICIs观察到深刻和持久的反应,刺激了对早期MMR-D/MSI-H CRC患者进行ICIs临床试验的开发。最近,中和抑制剂嗜铬细胞瘤抗原D(dostarlimab)单药治疗非手术处理MMR-D/MSI-H直肠癌以及nivolumab和ipilimumab的NICHE试验用于MMR-D/MSI-H结肠癌的新辅助治疗取得了开创性的成果。虽然ICIs在MMR-D/MSI-H直肠癌患者中的非手术治疗将有可能定义我们当前的治疗方法,但对于结肠癌,新辅助ICIs治疗的治疗目标可能有所不同,因为结肠癌的非手术治疗尚未得到很好的确认。在这里,我们概述了ICIs治疗MMR-D/MSI-H结肠癌和直肠癌早期患者的最新进展,并详细阐述了这个独特CRC亚组的未来治疗范例。
Visits: 67
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Mar
MihaelaAldea,MarcoTa...
Liquid Biopsies for Circulating Tumor DNA Detection May Reveal Occult Hematologic Malignancies in Patients With Solid Tumors.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
高风险的克隆性造血干细胞(Clonal Hematopoiesis, CH)在进行血浆无细胞DNA测序的实体肿瘤患者中常常被意外发现。因此,我们的研究目的是探讨如果利用液体活检意外检测到高风险 CH 是否能够揭示实体肿瘤患者的隐匿血液恶性肿瘤。在贡塞夫·鲁西癌症分型研究项目( ClinicalTrials.gov标识符: NCT04932525)中,我们招募了患有晚期实体癌的成年患者,并进行至少一次液体活检测试 (FoundationOne Liquid CDx)。分子学报告在贡塞夫·鲁西分子肿瘤委员会 (MTB) 中讨论。在 JAK2、MPL 或 MYD88 的致病性突变中,暴露的 CH 变异都将触发血液学咨询,而与变异等位基因频率(VAF)无关;当 DNMT3A、TET2、ASXL1、IDH1、IDH2、SF3B1 或 U2AF1 的 VAF 大于等于 10% 时,也将考虑患者癌症相关预后。目前文献中对于 TP53 突变还没有公认的分类方法,因此每个病例都会进行讨论。 研究时间为 2021 年 3 月至 10 月,共收集了 1,416 例患者。发现 110 例患者(占总样本比例的 7.7%)携带至少一种高风险 CH 突变:DNMT3A(n=32)、JAK2(n=28)、TET2(n=19)、ASXL1(n=18)、SF3B1(n=5)、IDH1(n=4)、IDH2(n=3)、MPL(n=3) 和 U2AF1(n=2)。在 MTB 的建议下,对其中的 45 例患者进行了血液学咨询。总体而言,实际上有 18 例患者接受了咨询,其中 9 例患者确诊了隐匿的血液恶性肿瘤:2 例患者患有骨髓增生异常综合征,2例实质性血小板增多症,1例边缘区淋巴瘤和1例 Waldenström 巨球蛋白血症。其余的 3 例患者已经在血液学方面接受了随访治疗。 液体活检的意外发现可能会引发诊断性的血液学检查,并揭示出隐匿的恶性血液肿瘤,在对患者进行多学科的情况分析后,需要进行个别化的治疗方案讨论。
Visits: 55
Epigenetics & Chromatin
2023 Mar 01
MatthewRLordo,Andrew...
Effects of Epigenetic Therapy on Natural Killer Cell Function and Development in Hematologic Malignancy.
Epigenetics & Chromatin
表观遗传治疗是治疗人类癌症,包括血液恶性肿瘤的新兴领域。这一类经FDA批准用于癌症治疗的治疗剂包括DNA去甲基化剂、组蛋白去乙酰化酶抑制剂、IDH1/2抑制剂、EZH2抑制剂和众多临床前目标/剂。大多数评估表观遗传治疗生物学效应的研究都专注于其对恶性细胞的直接细胞毒作用或其对修饰肿瘤细胞抗原表达的影响,使它们暴露于免疫监视机制中。然而,越来越多的证据表明表观遗传治疗也对免疫系统的发育和功能产生影响,包括自然杀伤(NK)细胞,这可以改变它们对癌细胞的反应。在本综述中,我们总结了研究不同类别表观遗传治疗对NK细胞发育和/或功能影响的文献。©作者2023。由牛津大学出版社代表白细胞生物学协会出版。版权所有。如需许可,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
Visits: 50
Epigenetics & Chromatin
2023 Mar 01
KyokoYamashita,Satok...
Clinicopathologic and genetic characterization of angiofibroma of soft tissue: a study of 12 cases including two cases with AHRR::NCOA3 gene fusion.
Epigenetics & Chromatin
软组织血管纤维瘤(AFST)是一种良性肿瘤,其特征为病变中突出的分枝状血管。约三分之二的AFST病例被报道具有AHRR::NCOA2融合,只有两例报道具有其他基因融合:GTF2I::NCOA2或GAB1::ABL1。尽管AFST被包括在世界卫生组织2020年分类的成纤维细胞和肌成纤维细胞肿瘤中,但已报道几乎所有病例中组织球标记物,特别是CD163阳性,仍然存在肿瘤纤维组织细胞的可能性。因此,我们旨在澄清AFST的遗传和病理谱,并确定是否组织球标记物阳性的细胞是真正的肿瘤细胞。我们评估了12例AFST病例,其中包括10例AHRR::NCOA2和两例AHRR::NCOA3融合的病例。病理上,在两例中检测到未报道的核柱状。此外,额外宽切除的一例肿瘤显示了严重的浸润性生长。免疫组化分析表明,9例中存在不同程度的desmin阳性细胞,而12例中CD163-和CD68阳性细胞被广泛分布。我们还对4例具有>10% desmin阳性肿瘤细胞的切除病例进行了双免疫荧光染色和免疫荧光原位杂交。结果表明,在所有四例病例中,CD163阳性细胞与AHRR::NCOA2融合的desmin阳性细胞不同。我们的发现表明,AHRR::NCOA3可能是第二常见的融合基因,AFST中组织球标记物阳性的细胞不是真正的肿瘤细胞。(241字)。本文受版权保护。保留所有权利。
Visits: 53
Epigenetics & Chromatin
2023
WeiYong,JiajiaWang,Y...
Role of Obesity in Female Reproduction.
Epigenetics & Chromatin
当代科学家对于肥胖症的普及和其带来的并发症非常清楚,无需“p值”和“相对危险度”等统计数字的支持。现今已经广泛认识到,肥胖与2型糖尿病、高血压、血管疾病、肿瘤和生殖障碍密切相关。肥胖女性显示出更低水平的促性腺激素、受孕率下降、更高的流产率和体外受精结果更差,这表明肥胖会影响女性的生殖能力。此外,脂肪组织包含特殊的免疫细胞,肥胖引发的炎症是一种慢性、低度的炎症反应。在此,我们主要回顾了肥胖对女性生殖全过程的不利影响,包括下丘脑-垂体-卵巢轴、卵子成熟、胚胎和胎儿发育。在后面一部分,我们探讨了肥胖引起的炎症及其对女性生殖相关的表观遗传影响。©作者
Visits: 50
Epigenetics & Chromatin
2023 Mar 01
SherienMEl-Daly,Mona...
Dynamic expression of H19 and MALAT1 and their correlation with tumor progression biomarkers in a multistage hepatocarcinogenesis model.
Epigenetics & Chromatin
肝细胞癌(HCC)呈逐步递进的阶梯状发展。长链非编码RNA(lncRNA)可以调节复杂的肝癌发生过程。本研究旨在阐明H19和MALAT1在肝癌发生不同阶段的表达谱及其与相关基因的关联性。我们使用化学诱导的小鼠肝癌模型模拟人类HCC发展的连续阶段。使用实时PCR分析了H19和MALAT1的表达模式以及表皮间充质转化(EMT)相关生物标志物的表达情况。使用免疫组化评估了介质标记物波形蛋白在逐步诱导阶段中的蛋白表达情况。肝组织切片的组织病理学评估显示实验期间有显着变化,最终形成肝癌。在不同阶段中,H19和MALAT1的表达与正常对照相比动态显著增加。然而,每个阶段与前一个阶段之间没有显着差异。肿瘤进展生物标志物(基质金属蛋白酶,波形蛋白和β-连环蛋白)表现出相同的稳定增长趋势。但是,在锌指E-box结合蛋白1和2(ZEB1和ZEB2)的情况下,显著的升高仅在诱导的最后阶段被检测到。lncRNAs和肿瘤进展生物标志物之间的相关性表明,H19和MALAT1的表达模式与基质金属蛋白酶2、9和波形蛋白呈强烈的正相关。我们的研究结果表明,遗传和表观遗传改变以逐步进展的方式影响HCC的发展。© 2023 John Wiley&Sons Ltd。
Visits: 54
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Mar 02
JohnELaMarca,RobertW...
A Drosophila chemical screen reveals targeting MEK and DGKa mitigates Ras-driven polarity-impaired tumour growth.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
升高的RAS信号在人类癌症中广泛存在,然而使用RAS信号通路抑制剂针对RAS驱动的癌症经常导致不良副作用和药物耐受性。因此,识别与RAS通路抑制剂协同作用的化合物将使低剂量的RAS通路抑制剂得以使用并降低药物耐受性。在这里,我们使用果蝇模型的RAS驱动癌症进行了精选化学药品筛选,发现一些化合物能够通过协同作用减小肿瘤的大小,与亚治疗剂量的RAS通路抑制剂Trametinib一起使用。对其中的一个命中物Ritanserin和相关化合物的分析显示,双酰氨基甘油激酶α(DGKa)是协同Trametinib所需的关键靶标。携带H-RAS癌基因和细胞极性基因SCRIB敲低的人类上皮细胞对Trametinib和DGKa抑制剂治疗也很敏感。机制上,DGKa抑制剂通过提高P38应激反应信号通路在H-RAS SCRIB-RNAi细胞中与Trametinib协同作用,可以导致细胞处于平静状态。我们的研究结果表明,使用RAS通路和DGKa抑制剂针对RAS驱动的人类癌症应该是一种有效的联合药物治疗。©2023。由生物学家有限公司发表。
Visits: 53
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Mar 02
JinyingChen,SarahLCu...
Monitoring the Implementation of Tobacco Cessation Support Tools: Using Novel Electronic Health Record Activity Metrics.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
电子健康记录(EHR)中的临床决策支持(CDS)工具通常用作支持临床设置中质量改进计划的核心策略。监测这些工具产生的预期和非预期影响对于方案评估和调整至关重要。现有监测方法通常依赖于医疗保健提供者的自我报告或对临床工作流程的直接观察,这需要大量的数据收集工作,并容易出现报告偏见。本研究旨在开发一种新的监测方法,利用EHR活动数据并展示其在监测由国家癌症研究所癌症中心戒烟计划(C3I)赞助的CDS工具的使用方面的应用。我们开发了基于EHR的度量标准,以监测两个CDS工具的实施:(1)筛查警报,提醒诊所工作人员完成吸烟评估,(2)支持警报,提示医疗保健提供者讨论支持和治疗选择,包括转诊到戒烟诊所。使用EHR活动数据,我们测量了CDS工具的完成情况(就诊级警报完成率)和负担(在完成前触发的警报次数和处理警报所花费的时间)。我们报告了在C3I中心的7个癌症诊所(2个诊所实施了筛查警报,5个诊所同时实施了两个警报)实施后的12个月跟踪的度量标准,并确定改善警报设计和采用的领域。在实施后的12个月中,筛查警报在5121次就诊中触发。就诊级警报完成率(诊所工作人员承认在EHR中完成筛查:0.55;诊所工作人员完成了筛查结果的EHR文件编写:0.32)随时间保持稳定但在不同诊所之间变化很大。支持警报在12个月中的1074个接触中触发。提供者在87.3%(n = 938)的接触中采取了行动(即未推迟支持警报),在12%(n = 129)的接触中发现做好准备戒烟的患者,并在2%(n = 22)的接触中要求转诊到戒烟诊所。就警报负担而言,平均而言,两个警报在完成前都触发了2次以上(筛查警报:2.7;支持警报:2.1),推迟筛查警报所花费的时间与完成警报所花费的时间相似(52秒对53秒),而推迟支持警报所花费的时间比完成所花费的时间长,每次接触的时间差为67和50秒。这些发现有助于改善四个方面的警报设计和使用:(1)通过本地适应改善警报采纳和完成情况,(2)通过额外策略包括提供者-患者沟通培训来提高支持警报效力,(3)提高有关警报完成情况的跟踪准确性,(4)平衡警报效力与负担。EHR活动度量标准能够监测戒烟警报的成功和负担,从而更加全面地了解警报实施可能存在的权衡。这些度量标准可用于指导实施调整,并可在不同环境中进行扩展。 ©Jinying Chen,Sarah L Cutrona,Ajay Dharod,Stephanie C Bunch,Kristie L Foley,Brian Ostasiewski,Erica R Hale,Aaron Bridges,Adam Moses,Eric C Donny,Erin L Sutfin,Thomas K Houston,iDAPT癌症控制实施科学中心。最初发表于《JMIR Medical Informatics》(https://medinform.jmir.org),2023年2月3日。
Visits: 53
Frontiers in Genetics
2023
XingyuLiu,JiaruiChen...
Integrated analysis reveals common DNA methylation patterns of alcohol-associated cancers: A pan-cancer analysis.
Frontiers in Genetics
背景:近年来,酒精在癌症发生中的作用受到越来越多的关注。证据表明,它对多个方面产生影响,包括表观遗传学改变。酒精相关癌症的DNA甲基化模式尚未完全理解。 方法:我们基于Illumina HumanMethylation450 BeadChip,调查了四种酒精相关癌症中的异常DNA甲基化模式。鉴定了差异甲基化的CpG探针与注释基因之间的皮尔逊系数相关性。使用MEME Suite进行转录因子基序富集和聚类,并构建了一个调控网络。 结果:在每种癌症中,都鉴定出了差异甲基化的探针,并进一步检查了172个高甲基化和21个低甲基化的全癌症DMPs。调节PDMPs的显著注释基因进行了调查,并且在癌症中的转录调节失常中进行了富集。 CpG岛chr19:58220189-58220517在所有四种癌症中均高甲基化,并在转录因子ZNF154中沉默。被分为五个簇的33个高甲基化和七个低甲基化的转录因子基序具有各种生物学效应。鉴定了11个全癌症DMPs与四种酒精相关癌症的临床结果相关联,这可能为临床结果预测提供了潜在的视角。 结论:本研究提供了对酒精相关癌症中DNA甲基化模式的综合了解,并揭示了相应的特征、影响和潜在机制。版权所有©2023 Liu、Chen、Li、Zeng、Jiang、Gao、Huang、Wu、Gong和Xie。
Visits: 51
Frontiers in Genetics
2023
MagdaAssem,RadyEEl-A...
Promoter methylation might shift the balance of Galectin-3 & 12 expression in de novo adult acute myeloid leukemia patients.
Frontiers in Genetics
急性髓系白血病(AML)是成人中最常见的白血病类型。低亲和力半乳糖聚糖(galectins)是一类结合半乳糖的蛋白质家族,据报道在许多恶性肿瘤中发挥关键作用,包括AML。Galectin-3和-12是哺乳动物galectin家族的成员。为了了解galectin-3和-12启动子甲基化对它们的表达的影响,我们对未接受任何治疗的原发性白血病细胞进行了亚硫酸盐甲基化特异性(MSP)PCR和亚硫酸盐基因组测序(BGS)来进行研究。在这里,我们展示了与启动子甲基化相关的LGALS12基因表达的显著丧失。在甲基化(M)组中发现表达的最低程度,而未甲基化(U)组的表达程度最高,部分甲基化(P)组的表达处于两者之间。这在我们的样本中不适用于galectin-3,除非分析的CpG位点在所研究的片段框架之外。我们还能够确定galectin-12启动子区域中的四个CpG位点(CpG编号1、5、7和8)必须未甲基化,以便诱导表达。据作者所知,这些发现在早期研究中没有得出结论。版权所有©2023 Assem、El-Araby、Al-Karmalawy、Nabil、Kamal、Belal、Ghamry、Abourehab、Ghoneim、Alshahrani 和 El Leithy。
Visits: 55