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Experimental Hematology & Oncology
2023 Jan 30

SannevanderHeijden,D...
In vitro expansion of Wilms' tumor protein 1 epitope-specific primary T cells from healthy human peripheral blood mononuclear cells.
Experimental Hematology & Oncology
威尔姆斯肿瘤蛋白1(WT1)是一种在各种癌症中过度表达的肿瘤相关抗原。作为一种自身抗原,负选择会减少WT1特异性T细胞受体(TCR)的数量。我们提供了一种使用健康人外周血单个核细胞制备WT137-45特异性TCR的方案。我们描述了通过两个连续的体外刺激,使用同源WT137-45脉冲树突状细胞和外周血淋巴细胞扩增WT1特异性T细胞克隆。然后我们详细介绍了使用人白细胞抗原/WT137-45四聚体进行检测的方法。 版权所有© 2023年作者。由Elsevier Inc.出版并保留所有权利。
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Mar 07

WiebkeWinkler,Carlot...
Mouse models of human multiple myeloma subgroups.
Experimental Hematology & Oncology
多发性骨髓瘤(MM)是一种来源于发生中心(GC)经历过的浆细胞的肿瘤,由t(11;14)/ CCND1和t(4;14)/ MMSET亚型等不同的遗传亚组成。我们通过小鼠Ccnd1或MMSET与一种构成性活性Ikk2突变体的GC B细胞特异性共激活,模仿了人类MM中经常出现的次级NF-κB活化,生成了基因定义的亚组特异性的MM模型。Ccnd1 / Ikk2ca和MMSET / Ikk2ca小鼠随着年龄的增长发展出明显的、克隆限制的浆细胞增殖,伴随有血清M蛋白的产生、骨髓不足和骨损伤。转基因浆细胞在体内可以传播,并显示出与其人类MM同伴相似的明显转录谱,因此我们证明了将涉及MM亚组特异染色体易位的基因表达定位在小鼠GC B细胞中可以转化成具有不同MM样疾病的能力,并重现了人类肿瘤的关键特征,这打开了对不同MM亚组的发病机理和治疗脆弱性的更好理解之路。
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Mar

VittorioGebbia,Feder...
Abemaciclib-associated Diarrhea: An Exploratory Analysis of Real-life Data.
Experimental Hematology & Oncology
Abemaciclib是一种cyclin-dependent kinase 4/6抑制剂,通过与内分泌治疗结合治疗荷尔蒙受体阳性和人表皮生长因子受体2阴性的早期和晚期乳腺癌患者获得批准。Abemaciclib的安全性以频繁的胃肠毒性,尤其是腹泻为特征。因此,我们对可能与接受abemaciclib加内分泌治疗的患者腹泻潜在相关的临床因素进行了探索性分析。我们选择了可能导致腹泻的因素,如年龄≥70岁,伴随用药和疾病,饮食和泻药的使用。这些变量与一组接受abemaciclib治疗的晚期乳腺癌患者的2/3级腹泻的发生进行了相关性分析。进行了单变量和多变量分析。使用ROC曲线测试了灵敏度和特异度。该研究包括了80名晚期乳腺癌女性。单变量分析发现,年龄≥70岁、多药并用和伴随胃肠疾病与2/3级腹泻之间存在显著统计学关联(p<0.05)。在多变量分析中,风险因素的数量与感兴趣的结果存在显著相关性(p<0.0001)。ROC分析显示我们模型的灵敏度为82%,特异度为75%。考虑到特定的既往因素,可以估计荷尔蒙受体阳性和人表皮生长因子受体2阴性-晚期乳腺癌患者接受abemaciclib加内分泌治疗的腹泻风险。在这些患者中,实施积极的预防措施和采用剂量逐步增加的策略可能是减少abemaciclib毒性负担的实用方法。版权所有© 2023 International Institute of Anticancer Research(George J. Delinasios博士),保留所有权利。
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Experimental Hematology & Oncology
2023 Feb 28

GennaroBruno,Nicolet...
β3-adrenergic receptor on tumor-infiltrating lymphocytes sustains IFN-γ-dependent PD-L1 expression and impairs anti-tumor immunity in neuroblastoma.
Experimental Hematology & Oncology
神经母细胞瘤(NB)是一种儿童期发生的异质性颅外肿瘤。NB肿瘤的一种特殊特征是它们的神经内分泌能力,可以分泌儿茶酚胺,而这些激素通过β肾上腺素能受体的结合转导到肿瘤微环境(TME)中的不同信号通路中。之前曾证明特异性β3-肾上腺素能受体(β3-AR)的拮抗剂对NB肿瘤细胞影响了肿瘤生长和进展。在这里,我们研究了β3-AR调节对小鼠同种移植模型中宿主免疫反应对肿瘤的影响。结果表明,β3-AR拮抗剂导致免疫反应重新激活,并部分依赖于PD-1 / PD-L1信号通路的参与。实际上,肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)上的β3-AR阻断会减弱它们分泌IFN-γ的能力,从而减少由TILs浸润引起的NB肿瘤细胞PD-L1表达。通过对NB患者的基因组分析进一步研究表明,高ADRB3基因表达与低表达组相比相关性更差的临床结果,并且ADRB3基因表达影响不同的免疫相关途径。总的来说,结果表明NB TME中的β3-AR能够调节肿瘤与宿主免疫系统之间的相互作用,并且其拮抗影响多个促肿瘤信号通路。 © 2023年作者。
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npj Genomic Medicine
2022 Oct 27

GiyongJang,JaeikOh,E...
Direct cell-to-cell transfer in stressed tumor microenvironment aggravates tumorigenic or metastatic potential in pancreatic cancer.
npj Genomic Medicine
胰腺癌因强大的纤维化和缺氧表现出特征性的肿瘤微环境(TME),特别是对传统化疗有很强的耐药性。然而,在胰腺癌的TME相关治疗耐药性的分子机制尚不完全清楚。在这里,我们开发了一个体外TME模拟系统,包括胰腺癌细胞、成纤维细胞和免疫细胞,以及应激条件,包括缺氧和吉西他滨。在应激条件下存活率高的细胞表现出了生物分子的直接细胞间转移的增加迹象。所得到的衍生细胞(CD44高/SLC16A1高)类似于增强的无定形生长或侵袭性的癌干细胞样细胞(CSCs),并获得代谢重组。此外,CD24是肿瘤球形体形成或侵袭性转化的决定因素。相比其他群体,表达CD44low/SLC16A1low的胰腺癌患者有更好的预后。研究结果表明,直接细胞间转移的细胞成分的交互作用促进了化疗诱导的肿瘤演化,而定位CD44和MCT1(由SLC16A1编码)可能是预防吉西他滨接触后胰腺癌复发的有用策略。© 2022. 作者(们)发表。
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npj Genomic Medicine
2022 Dec 19

OlalekanHUsman,Litin...
Genomic heterogeneity in pancreatic cancer organoids and its stability with culture.
npj Genomic Medicine
近年来,患者源性胰腺癌器官结构培养的建立为研究人员提供了一种令人兴奋的机会,可以在一种紧密模拟肿瘤的模型上进行广泛的体外研究。胰腺癌生物学中的一个重要问题是疾病中观察到的基因组异质性的原因和后果。然而,要将胰腺癌组织器官用作研究基因组变异的模型,我们需要首先了解器官内基因组异质性的程度及其在器官内的稳定性。在这里,我们使用单细胞全基因组测序来研究两个独立的胰腺癌组织器官系列的基因组异质性,以及它们在延长培养期间的基因组稳定性。在器官内观察到具有相似拷贝数剖面的克隆群体,并且这些克隆群体的比例随着延长培养期而改变,表明一些克隆群体具有生长优势。然而,在每个克隆群体内也观察到亚克隆基因组异质性,表明胰腺癌细胞本身的基因组不稳定性。此外,我们的转录组分析还揭示了拷贝数改变和基因表达调控之间的正相关关系,表明这些拷贝数变化的"基因剂量效应"可以转化为基因表达调控。 ©2022年作者。
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npj Genomic Medicine
2022 Dec 24

IkShinChin,AmanKhan,...
Germline genetic variation and predicting immune checkpoint inhibitor induced toxicity.
npj Genomic Medicine
免疫检查点抑制剂(ICI)治疗已经彻底改变了对多种癌症的治疗方式。ICI通过恢复T细胞功能来诱发抗癌免疫反应。然而,由此产生的免疫反应可能会产生非靶向效应,表现为约10-55%的患者出现自身免疫类型的严重免疫相关不良事件(irAE)。目前很难预测谁会出现irAE以及严重程度如何。鉴定高危严重irAE患者将彻底革命化患者护理。虽然irAE发展的病理机制仍不明确,但主机遗传因素被提出为这些事件的关键决定因素。本综述介绍了支持主机基因组在决定irAE风险方面作用的当前证据。 我们总结了ICI治疗后出现的irAE的光谱和时间,并描述了目前报道的与免疫调节因子在癌症免疫周期内表达、自身免疫疾病和irAE发生有关的生殖细胞系遗传变异。我们认为,主机免疫功能和自身免疫疾病的生殖细胞系遗传因素也可以解释irAE发展的风险。我们还支持对正在接受ICI治疗的患者进行全基因组关联研究,以识别可用于多基因风险评分以预测irAE风险的遗传变异。©2022年作者。
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npj Genomic Medicine
2023 Jan 20

JustinShaya,ShumeiKa...
Personalized matched targeted therapy in advanced pancreatic cancer: a pilot cohort analysis.
npj Genomic Medicine
尽管取得了进展,但胰腺癌2年存活率仍然令人沮丧。我们在18名患有晚期/转移性胰腺癌患者中参考了分子肿瘤委员会的生物标志物驱动的组合/N-of-one策略。每位患者均接受了2.5个(中值)靶向剂的治疗(范围为1-4个),其中5位患者进行第一线治疗,13位患者进行第二线治疗。通过比较高程度匹配和低程度匹配的患者(匹配分数≥50%和<50%, 反映匹配到的突变数量占致病突变总数的比例),发现高度匹配的患者存活时间显著较长(HR0.24, 95% CI, 0.078-0.76, P=0.016),临床受益率(稳定疾病时间≥6个月/部分或完全缓解的比例)趋向更高(45.5% vs 0.0%, P=0.10),无进展生存期是HR, 95% CI, 0.36 (0.12-1.10) (p=0.075)。进行第一线治疗的患者与进行≥二线治疗的患者相比,临床受益率更高(80.0% vs 7.7%, P=0.008)。没有发生3-4级的毒性反应。最长持续缓解期为17.5个月,通过联合作用MEK和CDK4/6突变(无需化疗)实现了部分缓解。因此,基因组匹配的靶向药物组合对这些晚期胰腺癌患者疗效显著,更大的前瞻性试验是必要的。©2023作者。
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npj Genomic Medicine
2023 Jan 25

DanQi,YiqunGeng,Jaco...
Transcriptomic analyses of patient peripheral blood with hemoglobin depletion reveal glioblastoma biomarkers.
npj Genomic Medicine
外周血作为一种非侵入性的组织活检替代方案,正在成为治疗恶性胶质瘤(GBM)生物标志物开发的重要手段。然而,由于缺乏强大的检测方法,在临床中广泛应用的血液生物标志物还未被确定。在此,我们描述了RNA测序中全血球蛋白还原(WBGR)的应用,并进行转录组分析以鉴定与GBM相关的转录组变化。通过使用WBGR,我们提高了信息读取的检测灵敏度,并在GBM血液中鉴定到差异基因表达。通过分析肿瘤组织,我们确定了GBM血液的转录组特征。进一步的功能富集分析把在GBM上变化最大的基因保留下来。随后的验证确定了一个由10个基因构成的面板,包括mRNA、长链非编码RNA和微小RNA(即GBM-Dx面板),具有在早期诊断或临床管理GBM方面的翻译潜力。在此,我们报道了一种综合分析能力强的整合方法WBGR,用于血液标记物的鉴定。©2023作者。
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npj Genomic Medicine
2023 Jan 26

WilliamPilcher,Beena...
Cross center single-cell RNA sequencing study of the immune microenvironment in rapid progressing multiple myeloma.
npj Genomic Medicine
尽管对多发性骨髓瘤(MM)发病生理学有了很多了解,但在一部分患者中导致快速进行的疾病的原因仍不清楚。 MM的进展是通过与周围骨髓(BM)细胞的复杂相互作用促进的,形成支持肿瘤生长和耐药性的微环境。了解免疫微环境对于识别促进MM快速进展的因素至关重要。为了实现这一目标,我们在18名患者中从48个CD138-BM样本中收集了102,207个单个细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,这些患者被诊断为快速进展(无进展生存期(PFS)<18个月)或非进展(PFS> 4年)的疾病。三个中心的数据的比较分析表明了相似的转录组文件和细胞类型分布,表明scRNA-seq中存在细微的技术差异,为扩大多中心试验开辟了途径。快速进展者的GZMK +和TIGIT + Exhausted CD8 + T细胞(P = 0.022)的富集显着高于其他人,同时细胞溶解标记(PRF1,GZMB,GNLY)的表达降低。我们还观察到快速进展者中M2忍受性巨噬细胞的富集度明显增加,并激活了促增殖信号通路,例如BAFF,CCL和IL16。另一方面,非进展患者显示了不成熟的B细胞(即Pre / Pro B细胞)的富集,并表达了B细胞发育的标记(IGLL1,SOX4,DNTT)。这项多中心研究确定了快速进展疾病中各种促进肿瘤的细胞群和信号通路的富集现象,并进一步验证了在不同研究中心产生的scRNA-seq数据的稳健性。©2023. 作者(们)。
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